MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 plasmid

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020522	TTTATT	2	12	2789	2800	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470180514
2	NC_020522	CTAAAT	2	12	3555	3566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470180514
3	NC_020522	TTTTAC	2	12	8202	8213	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470180519
4	NC_020522	AATATG	2	12	8274	8285	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470180519
5	NC_020522	TTAATT	2	12	11306	11317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020522	TCTTGC	2	12	13669	13680	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470180531
7	NC_020522	CGATGC	2	12	15393	15404	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180532
8	NC_020522	ATAATG	2	12	19554	19565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470180536
9	NC_020522	CTTGTT	2	12	20911	20922	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470180536
10	NC_020522	ACCGCC	2	12	29951	29962	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180545
11	NC_020522	TGGTGA	2	12	33599	33610	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470180550
12	NC_020522	ATCTGC	2	12	34841	34852	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180551
13	NC_020522	ATTAGG	2	12	35500	35511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470180552
14	NC_020522	AGTTTG	2	12	40949	40960	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180559
15	NC_020522	TTAATT	2	12	43989	44000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470180564
16	NC_020522	TTAAAG	2	12	46005	46016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470180566
17	NC_020522	TATTGA	2	12	46406	46417	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020522	TATAAA	2	12	46603	46614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020522	TTATTT	2	12	50105	50116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020522	AAATCT	2	12	50147	50158	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020522	ATACCT	2	12	58279	58290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180581
22	NC_020522	TGTTTT	2	12	58327	58338	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180581
23	NC_020522	TTGTTT	2	12	58812	58823	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180581
24	NC_020522	AGTTCA	2	12	64053	64064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470180586
25	NC_020522	TTTTGT	2	12	64977	64988	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180587
26	NC_020522	GGTATT	2	12	66318	66329	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180588
27	NC_020522	ACAACC	2	12	67661	67672	50 %	0 %	0 %	50 %	470180588
28	NC_020522	TCAAGC	2	12	69201	69212	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180590

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.