MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 plasmid

Total Repeats: 31

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020522	ATGAC	2	10	3251	3260	40 %	20 %	20 %	20 %	470180514
2	NC_020522	TAAAA	2	10	3721	3730	80 %	20 %	0 %	0 %	470180514
3	NC_020522	AAATT	2	10	4548	4557	60 %	40 %	0 %	0 %	470180515
4	NC_020522	ATTTT	2	10	5282	5291	20 %	80 %	0 %	0 %	470180516
5	NC_020522	GCCAA	2	10	7047	7056	40 %	0 %	20 %	40 %	470180517
6	NC_020522	CATTA	2	10	12263	12272	40 %	40 %	0 %	20 %	470180528
7	NC_020522	TCTTT	2	10	12456	12465	0 %	80 %	0 %	20 %	470180529
8	NC_020522	AATTC	2	10	13210	13219	40 %	40 %	0 %	20 %	470180530
9	NC_020522	TTTCC	2	10	14348	14357	0 %	60 %	0 %	40 %	470180532
10	NC_020522	GTTGG	2	10	27625	27634	0 %	40 %	60 %	0 %	470180543
11	NC_020522	CCATA	2	10	30602	30611	40 %	20 %	0 %	40 %	470180545
12	NC_020522	TCCAT	2	10	36036	36045	20 %	40 %	0 %	40 %	470180552
13	NC_020522	CAATA	2	10	38156	38165	60 %	20 %	0 %	20 %	470180554
14	NC_020522	GAGTT	2	10	40575	40584	20 %	40 %	40 %	0 %	470180559
15	NC_020522	CATTT	2	10	41438	41447	20 %	60 %	0 %	20 %	470180559
16	NC_020522	TAATT	2	10	41943	41952	40 %	60 %	0 %	0 %	470180560
17	NC_020522	TTAAA	2	10	45774	45783	60 %	40 %	0 %	0 %	470180566
18	NC_020522	TTAAA	2	10	49916	49925	60 %	40 %	0 %	0 %	470180570
19	NC_020522	AAAAT	2	10	50878	50887	80 %	20 %	0 %	0 %	470180572
20	NC_020522	CAAGC	2	10	51872	51881	40 %	0 %	20 %	40 %	470180572
21	NC_020522	AAAAT	2	10	55492	55501	80 %	20 %	0 %	0 %	470180577
22	NC_020522	TTTTA	2	10	57336	57345	20 %	80 %	0 %	0 %	470180581
23	NC_020522	CCAGA	2	10	58193	58202	40 %	0 %	20 %	40 %	470180581
24	NC_020522	TATTG	2	10	60478	60487	20 %	60 %	20 %	0 %	470180584
25	NC_020522	ATTGA	2	10	60532	60541	40 %	40 %	20 %	0 %	470180584
26	NC_020522	ATTAA	2	10	62327	62336	60 %	40 %	0 %	0 %	470180585
27	NC_020522	GAAGA	2	10	62471	62480	60 %	0 %	40 %	0 %	470180585
28	NC_020522	TTAAA	2	10	62865	62874	60 %	40 %	0 %	0 %	470180585
29	NC_020522	TAACC	2	10	67292	67301	40 %	20 %	0 %	40 %	470180588
30	NC_020522	CCTAT	2	10	69741	69750	20 %	40 %	0 %	40 %	470180590
31	NC_020522	GGCCT	2	10	69982	69991	0 %	20 %	40 %	40 %	470180590

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.