MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1 plasmid

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020522	CG	3	6	193	198	0 %	0 %	50 %	50 %	470180511
2	NC_020522	AC	3	6	407	412	50 %	0 %	0 %	50 %	470180511
3	NC_020522	TG	3	6	1862	1867	0 %	50 %	50 %	0 %	470180512
4	NC_020522	TC	3	6	2217	2222	0 %	50 %	0 %	50 %	470180513
5	NC_020522	AT	3	6	2684	2689	50 %	50 %	0 %	0 %	470180514
6	NC_020522	TG	3	6	4006	4011	0 %	50 %	50 %	0 %	470180514
7	NC_020522	AG	3	6	6005	6010	50 %	0 %	50 %	0 %	470180516
8	NC_020522	CA	3	6	7575	7580	50 %	0 %	0 %	50 %	470180518
9	NC_020522	CT	3	6	7909	7914	0 %	50 %	0 %	50 %	470180519
10	NC_020522	TA	3	6	9474	9479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020522	TA	3	6	9879	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	470180523
12	NC_020522	AT	3	6	11157	11162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020522	AG	3	6	11193	11198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020522	TG	3	6	11327	11332	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020522	AC	3	6	11380	11385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_020522	AT	3	6	11569	11574	50 %	50 %	0 %	0 %	470180527
17	NC_020522	CT	3	6	16603	16608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020522	AT	3	6	17200	17205	50 %	50 %	0 %	0 %	470180533
19	NC_020522	CT	3	6	17697	17702	0 %	50 %	0 %	50 %	470180534
20	NC_020522	GA	3	6	19657	19662	50 %	0 %	50 %	0 %	470180536
21	NC_020522	TC	3	6	20087	20092	0 %	50 %	0 %	50 %	470180536
22	NC_020522	TG	3	6	20356	20361	0 %	50 %	50 %	0 %	470180536
23	NC_020522	CA	3	6	22715	22720	50 %	0 %	0 %	50 %	470180538
24	NC_020522	TC	3	6	23135	23140	0 %	50 %	0 %	50 %	470180539
25	NC_020522	TC	3	6	23525	23530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020522	CT	3	6	24321	24326	0 %	50 %	0 %	50 %	470180541
27	NC_020522	CA	3	6	24397	24402	50 %	0 %	0 %	50 %	470180541
28	NC_020522	AT	3	6	24771	24776	50 %	50 %	0 %	0 %	470180541
29	NC_020522	AG	3	6	25425	25430	50 %	0 %	50 %	0 %	470180541
30	NC_020522	TG	3	6	26308	26313	0 %	50 %	50 %	0 %	470180541
31	NC_020522	GT	3	6	27470	27475	0 %	50 %	50 %	0 %	470180543
32	NC_020522	TC	3	6	29548	29553	0 %	50 %	0 %	50 %	470180545
33	NC_020522	CG	3	6	32512	32517	0 %	0 %	50 %	50 %	470180548
34	NC_020522	AC	3	6	33384	33389	50 %	0 %	0 %	50 %	470180549
35	NC_020522	CA	3	6	34433	34438	50 %	0 %	0 %	50 %	470180550
36	NC_020522	TG	3	6	35280	35285	0 %	50 %	50 %	0 %	470180552
37	NC_020522	TC	3	6	37339	37344	0 %	50 %	0 %	50 %	470180552
38	NC_020522	CT	3	6	37756	37761	0 %	50 %	0 %	50 %	470180553
39	NC_020522	TC	3	6	37868	37873	0 %	50 %	0 %	50 %	470180553
40	NC_020522	TG	3	6	38793	38798	0 %	50 %	50 %	0 %	470180555
41	NC_020522	GT	3	6	39827	39832	0 %	50 %	50 %	0 %	470180557
42	NC_020522	CG	3	6	40348	40353	0 %	0 %	50 %	50 %	470180558
43	NC_020522	AT	3	6	40984	40989	50 %	50 %	0 %	0 %	470180559
44	NC_020522	GT	3	6	41038	41043	0 %	50 %	50 %	0 %	470180559
45	NC_020522	TG	3	6	41402	41407	0 %	50 %	50 %	0 %	470180559
46	NC_020522	TA	4	8	41595	41602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020522	TA	3	6	42065	42070	50 %	50 %	0 %	0 %	470180560
48	NC_020522	TA	3	6	42523	42528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020522	TA	3	6	43329	43334	50 %	50 %	0 %	0 %	470180563
50	NC_020522	AG	3	6	43337	43342	50 %	0 %	50 %	0 %	470180563
51	NC_020522	AT	3	6	43496	43501	50 %	50 %	0 %	0 %	470180563
52	NC_020522	AT	3	6	44045	44050	50 %	50 %	0 %	0 %	470180564
53	NC_020522	AT	3	6	44067	44072	50 %	50 %	0 %	0 %	470180564
54	NC_020522	AT	3	6	46119	46124	50 %	50 %	0 %	0 %	470180566
55	NC_020522	TA	3	6	46983	46988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020522	AG	3	6	47915	47920	50 %	0 %	50 %	0 %	470180567
57	NC_020522	GA	3	6	48357	48362	50 %	0 %	50 %	0 %	470180568
58	NC_020522	AT	3	6	49642	49647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020522	AT	3	6	49736	49741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020522	CT	3	6	51732	51737	0 %	50 %	0 %	50 %	470180572
61	NC_020522	GT	3	6	52185	52190	0 %	50 %	50 %	0 %	470180573
62	NC_020522	GA	3	6	52860	52865	50 %	0 %	50 %	0 %	470180574
63	NC_020522	AC	4	8	53546	53553	50 %	0 %	0 %	50 %	470180574
64	NC_020522	TC	3	6	53877	53882	0 %	50 %	0 %	50 %	470180574
65	NC_020522	CT	3	6	54529	54534	0 %	50 %	0 %	50 %	470180575
66	NC_020522	GC	3	6	55883	55888	0 %	0 %	50 %	50 %	470180578
67	NC_020522	CT	3	6	56345	56350	0 %	50 %	0 %	50 %	470180578
68	NC_020522	TG	3	6	57053	57058	0 %	50 %	50 %	0 %	470180580
69	NC_020522	GA	3	6	57562	57567	50 %	0 %	50 %	0 %	470180581
70	NC_020522	AT	3	6	59264	59269	50 %	50 %	0 %	0 %	470180582
71	NC_020522	TC	3	6	59295	59300	0 %	50 %	0 %	50 %	470180582
72	NC_020522	TA	3	6	59730	59735	50 %	50 %	0 %	0 %	470180582
73	NC_020522	GT	3	6	59780	59785	0 %	50 %	50 %	0 %	470180582
74	NC_020522	TA	3	6	60352	60357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020522	CG	3	6	60505	60510	0 %	0 %	50 %	50 %	470180584
76	NC_020522	AG	3	6	60751	60756	50 %	0 %	50 %	0 %	470180585
77	NC_020522	GT	3	6	61128	61133	0 %	50 %	50 %	0 %	470180585
78	NC_020522	CG	3	6	61865	61870	0 %	0 %	50 %	50 %	470180585
79	NC_020522	CT	3	6	62390	62395	0 %	50 %	0 %	50 %	470180585
80	NC_020522	AC	3	6	62430	62435	50 %	0 %	0 %	50 %	470180585
81	NC_020522	TG	3	6	62964	62969	0 %	50 %	50 %	0 %	470180586
82	NC_020522	GC	3	6	63226	63231	0 %	0 %	50 %	50 %	470180586
83	NC_020522	AG	3	6	63262	63267	50 %	0 %	50 %	0 %	470180586
84	NC_020522	CT	3	6	66971	66976	0 %	50 %	0 %	50 %	470180588
85	NC_020522	CT	3	6	67248	67253	0 %	50 %	0 %	50 %	470180588
86	NC_020522	GT	3	6	67492	67497	0 %	50 %	50 %	0 %	470180588
87	NC_020522	CG	3	6	67638	67643	0 %	0 %	50 %	50 %	470180588
88	NC_020522	GA	3	6	68002	68007	50 %	0 %	50 %	0 %	470180588
89	NC_020522	TC	3	6	69265	69270	0 %	50 %	0 %	50 %	470180590
90	NC_020522	GA	3	6	70138	70143	50 %	0 %	50 %	0 %	470180590
91	NC_020522	AT	3	6	71191	71196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020522	AG	3	6	71619	71624	50 %	0 %	50 %	0 %	470180594
93	NC_020522	AT	3	6	73187	73192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.