MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1

Total Repeats: 977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020521	TGATTT	2	12	285	296	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180669
2	NC_020521	GCGCTT	2	12	840	851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180671
3	NC_020521	GATTTT	2	12	1230	1241	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180671
4	NC_020521	TGGCTA	2	12	11699	11710	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180679
5	NC_020521	AAGGAT	2	12	13063	13074	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470180679
6	NC_020521	AATTAC	2	12	15209	15220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470180683
7	NC_020521	AGTTGG	2	12	17743	17754	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470180688
8	NC_020521	AAAACC	2	12	29741	29752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470180698
9	NC_020521	GATAAA	2	12	30326	30337	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470180698
10	NC_020521	GATGGT	3	18	34243	34260	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470180700
11	NC_020521	TATGCC	2	12	47337	47348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180713
12	NC_020521	GATCAA	2	12	48053	48064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470180714
13	NC_020521	CCTTTT	2	12	54242	54253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470180720
14	NC_020521	ATTTCC	2	12	63595	63606	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470180731
15	NC_020521	CGGCTA	2	12	68130	68141	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180735
16	NC_020521	ATAATC	2	12	69382	69393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470180736
17	NC_020521	TTTTTA	2	12	76618	76629	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470180744
18	NC_020521	TGGTTT	2	12	76977	76988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470180745
19	NC_020521	CAAAGA	2	12	81388	81399	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470180750
20	NC_020521	GACAAT	2	12	103654	103665	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	470180773
21	NC_020521	CGGATG	2	12	107154	107165	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180779
22	NC_020521	GGAAGC	2	12	110966	110977	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470180784
23	NC_020521	ATAATT	2	12	115962	115973	50 %	50 %	0 %	0 %	470180793
24	NC_020521	TGTTTT	2	12	121018	121029	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180797
25	NC_020521	TTTGTC	2	12	122172	122183	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470180798
26	NC_020521	AATTCC	2	12	122390	122401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180799
27	NC_020521	AAATCC	2	12	126824	126835	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470180804
28	NC_020521	TTGCAA	2	12	128339	128350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470180805
29	NC_020521	TGGTTT	2	12	128935	128946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470180805
30	NC_020521	AAGATG	2	12	132904	132915	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470180809
31	NC_020521	TGATTA	2	12	134696	134707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470180811
32	NC_020521	GATTTG	2	12	135528	135539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180811
33	NC_020521	AGAAAA	2	12	136028	136039	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	470180811
34	NC_020521	GCCAAC	2	12	143259	143270	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180818
35	NC_020521	TCGATA	2	12	146637	146648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470180821
36	NC_020521	GAAGCA	2	12	163147	163158	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470180835
37	NC_020521	GTGACT	2	12	171682	171693	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180844
38	NC_020521	AAACAG	2	12	171716	171727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470180844
39	NC_020521	TGCTTT	2	12	174439	174450	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470180848
40	NC_020521	AAACCA	2	12	178417	178428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470180852
41	NC_020521	CAGTAG	2	12	179061	179072	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180852
42	NC_020521	GGCTCA	2	12	179209	179220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180852
43	NC_020521	GGTATT	2	12	181718	181729	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180854
44	NC_020521	ATTTTA	2	12	183797	183808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470180857
45	NC_020521	TCATTA	2	12	187353	187364	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470180860
46	NC_020521	TATTTG	2	12	188573	188584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180860
47	NC_020521	TTTGTT	2	12	192248	192259	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180863
48	NC_020521	GGGATG	2	12	194049	194060	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	470180865
49	NC_020521	AAAGCA	2	12	206655	206666	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470180871
50	NC_020521	ATTTCA	2	12	209371	209382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470180873
51	NC_020521	CTCGAA	2	12	214768	214779	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180877
52	NC_020521	TGAGTT	2	12	217020	217031	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180879
53	NC_020521	TTTTAT	2	12	225203	225214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470180886
54	NC_020521	GCACAC	2	12	227251	227262	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180887
55	NC_020521	AAAGGA	2	12	231734	231745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470180889
56	NC_020521	CAGGCT	2	12	237336	237347	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180894
57	NC_020521	TTGTTT	2	12	244942	244953	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470180899
58	NC_020521	GAGGAA	2	12	248676	248687	50 %	0 %	50 %	0 %	470180902
59	NC_020521	GAATAA	2	12	249625	249636	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470180903
60	NC_020521	ATTGGT	2	12	250706	250717	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470180904
61	NC_020521	AGATTC	2	12	253003	253014	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470180905
62	NC_020521	ATGAGA	2	12	253658	253669	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470180905
63	NC_020521	TTCAAC	2	12	254764	254775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470180905
64	NC_020521	TTTGAT	2	12	260467	260478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180914
65	NC_020521	TTCATA	2	12	261978	261989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470180915
66	NC_020521	TGATTT	2	12	264384	264395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180916
67	NC_020521	TGATAT	2	12	264988	264999	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470180917
68	NC_020521	AGCTGA	2	12	265353	265364	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180918
69	NC_020521	ACATTG	2	12	265442	265453	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470180918
70	NC_020521	GGGTAT	2	12	275006	275017	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470180925
71	NC_020521	ATTGGC	2	12	277270	277281	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180927
72	NC_020521	GTAAAT	2	12	281936	281947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470180932
73	NC_020521	GGTTAC	2	12	319924	319935	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180965
74	NC_020521	AAATAA	2	12	326806	326817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470180973
75	NC_020521	AATTAA	2	12	337332	337343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470180983
76	NC_020521	TTAAAA	2	12	337541	337552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470180983
77	NC_020521	GATAAT	2	12	344877	344888	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470180993
78	NC_020521	GGCAAG	2	12	346717	346728	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	470180994
79	NC_020521	AAGCCA	2	12	347381	347392	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470180995
80	NC_020521	CTTTGT	2	12	348729	348740	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470180996
81	NC_020521	TTATTG	2	12	349802	349813	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470180998
82	NC_020521	AAAGCA	2	12	350380	350391	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470180998
83	NC_020521	TTGATT	2	12	355843	355854	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470181002
84	NC_020521	TATCTT	2	12	362523	362534	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470181010
85	NC_020521	AAATTC	2	12	368562	368573	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470181016
86	NC_020521	TAGGGG	2	12	380908	380919	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	470181028
87	NC_020521	TTCTCA	2	12	385829	385840	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	470181034
88	NC_020521	TTTCAT	2	12	388113	388124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470181036
89	NC_020521	TTTCAT	2	12	390346	390357	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470181039
90	NC_020521	TAAAAG	2	12	395381	395392	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470181044
91	NC_020521	GATTAA	2	12	395969	395980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470181044
92	NC_020521	TCTTGC	2	12	408749	408760	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470181059
93	NC_020521	CGGTAT	2	12	409346	409357	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470181059
94	NC_020521	TGAAAA	2	12	411315	411326	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470181060
95	NC_020521	TGGTGT	2	12	415384	415395	0 %	50 %	50 %	0 %	470181062
96	NC_020521	AAAATA	2	12	417532	417543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	470181063
97	NC_020521	TAGAAA	2	12	422447	422458	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470181068
98	NC_020521	GTAATG	2	12	427003	427014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470181073
99	NC_020521	CAAAGC	2	12	435400	435411	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470181080
100	NC_020521	AAATTT	2	12	439071	439082	50 %	50 %	0 %	0 %	470181082
101	NC_020521	TTAAAT	2	12	439099	439110	50 %	50 %	0 %	0 %	470181082
102	NC_020521	GTTTTT	2	12	447136	447147	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	470181089
103	NC_020521	TGGTTT	2	12	457013	457024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470181098
104	NC_020521	ATTTAT	2	12	461398	461409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470181105
105	NC_020521	CTTGTG	2	12	465500	465511	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470181107
106	NC_020521	CTTGTT	2	12	465539	465550	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470181107
107	NC_020521	ATGAGC	2	12	467350	467361	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470181109
108	NC_020521	AATTCA	2	12	468151	468162	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470181110
109	NC_020521	GTGCTT	2	12	477088	477099	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470181119
110	NC_020521	ATTGAT	2	12	486173	486184	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470181126
111	NC_020521	ACGTGC	2	12	491207	491218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470181133
112	NC_020521	TGCTTT	2	12	501386	501397	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470181147
113	NC_020521	AAGATG	2	12	505955	505966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	470181153
114	NC_020521	AATGTT	2	12	506071	506082	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470181153
115	NC_020521	AAACTC	2	12	507409	507420	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470181154
116	NC_020521	CAAAAA	2	12	512532	512543	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	470181158
117	NC_020521	TGTGAA	2	12	515948	515959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470181162
118	NC_020521	TGAAAA	2	12	522500	522511	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	470181173
119	NC_020521	GAACCA	2	12	525247	525258	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470181176
120	NC_020521	GTCCCT	2	12	529660	529671	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470181181
121	NC_020521	TCATTA	2	12	539904	539915	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470181194
122	NC_020521	ACTACA	2	12	543051	543062	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470181195
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124	NC_020521	CATTTA	2	12	548021	548032	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470181198
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138	NC_020521	GGCGCC	2	12	579117	579128	0 %	0 %	50 %	50 %	470181222
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144	NC_020521	TCTTGC	2	12	591406	591417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470181238
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146	NC_020521	AATCGT	2	12	598309	598320	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470181244
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153	NC_020521	TTGTTA	2	12	618833	618844	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470181265
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201	NC_020521	AAGACG	2	12	793468	793479	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470181460
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218	NC_020521	TATCAA	2	12	846377	846388	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470181510
219	NC_020521	CCATGC	2	12	848937	848948	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470181512
220	NC_020521	TTATTT	2	12	850169	850180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	470181513
221	NC_020521	TCTGTT	2	12	862235	862246	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470181521
222	NC_020521	CAAAGA	2	12	865239	865250	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470181523
223	NC_020521	TATGTT	2	12	869823	869834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470181527
224	NC_020521	GCTTTG	2	12	879660	879671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470181537
225	NC_020521	CATTTT	2	12	885750	885761	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	470181542
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227	NC_020521	TTGCAA	2	12	896361	896372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470181550
228	NC_020521	TTCACC	2	12	906662	906673	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	470181559
229	NC_020521	AATTTT	2	12	909074	909085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470181562
230	NC_020521	ACAATT	2	12	910446	910457	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	470181563
231	NC_020521	GATATG	2	12	911932	911943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470181565
232	NC_020521	TTATTG	2	12	913748	913759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470181566
233	NC_020521	TGTCTT	2	12	921138	921149	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	470181574
234	NC_020521	TTTCTT	2	12	921915	921926	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470181575
235	NC_020521	GATTCT	2	12	923383	923394	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470181576
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258	NC_020521	AAGAGG	2	12	973220	973231	50 %	0 %	50 %	0 %	470181608
259	NC_020521	TTTCCT	2	12	976002	976013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470181610
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331	NC_020521	GTCATC	2	12	1233517	1233528	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470181852
332	NC_020521	CGTTAA	2	12	1239295	1239306	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470181858
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341	NC_020521	CTTTTT	2	12	1292217	1292228	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	470181905
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343	NC_020521	TTTTGG	2	12	1302164	1302175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470181914
344	NC_020521	GCCATT	2	12	1305194	1305205	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470181916
345	NC_020521	TGGGAT	2	12	1310927	1310938	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470181920
346	NC_020521	CAGGAA	2	12	1325964	1325975	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	470181935
347	NC_020521	TTTGGA	2	12	1326850	1326861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470181935
348	NC_020521	ACAAAG	2	12	1328931	1328942	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	470181938
349	NC_020521	GTTATG	2	12	1330107	1330118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	470181939
350	NC_020521	TCAATG	2	12	1337834	1337845	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470181946
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362	NC_020521	TGGTTC	2	12	1386313	1386324	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	470181993
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372	NC_020521	TGCTAA	2	12	1421763	1421774	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470182025
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442	NC_020521	AACAGC	2	12	1678220	1678231	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470182240
443	NC_020521	ATTGCT	2	12	1683487	1683498	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470182246
444	NC_020521	ATGACT	2	12	1688403	1688414	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470182250
445	NC_020521	CAGCGC	2	12	1689957	1689968	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470182251
446	NC_020521	TTATCG	2	12	1691023	1691034	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	470182252
447	NC_020521	AAATGT	2	12	1694909	1694920	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470182257
448	NC_020521	TGGAAC	2	12	1697949	1697960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470182260
449	NC_020521	ATCCTG	2	12	1701485	1701496	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470182263
450	NC_020521	CATGGG	2	12	1709028	1709039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470182268
451	NC_020521	TTGCCT	2	12	1709331	1709342	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470182268
452	NC_020521	TATAAA	2	12	1709625	1709636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470182268
453	NC_020521	GTACAT	2	12	1714054	1714065	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470182276
454	NC_020521	TCAAAA	2	12	1716491	1716502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	470182278
455	NC_020521	TGTAAT	2	12	1718755	1718766	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	470182281
456	NC_020521	TGTTAT	2	12	1720530	1720541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470182283
457	NC_020521	TCATAT	2	12	1724392	1724403	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470182285
458	NC_020521	CTGAAG	2	12	1724421	1724432	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470182285
459	NC_020521	AATTGC	2	12	1732311	1732322	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	470182295
460	NC_020521	TGCTGA	2	12	1733474	1733485	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470182296
461	NC_020521	TAATGA	2	12	1738604	1738615	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470182301
462	NC_020521	AGTTTT	2	12	1757915	1757926	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	470182320
463	NC_020521	ACTGGC	2	12	1762565	1762576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470182326
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480	NC_020521	ATCATT	2	12	1833764	1833775	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	470182386
481	NC_020521	GCCCAT	2	12	1835442	1835453	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470182388
482	NC_020521	CATAAC	2	12	1836251	1836262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470182389
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