MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila str. Philadelphia 1

Total Repeats: 477

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020521	ACAAT	2	10	33607	33616	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020521	TTCAA	2	10	37615	37624	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020521	TTTTA	2	10	37752	37761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020521	TTTTA	2	10	49759	49768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020521	AAAAT	2	10	52909	52918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020521	ATATT	2	10	55135	55144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020521	AAGTA	2	10	58845	58854	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020521	TAAAT	2	10	68620	68629	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020521	TAGCA	2	10	75140	75149	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020521	AAAAC	2	10	76050	76059	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020521	ATTCA	2	10	76762	76771	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020521	CCATT	2	10	81764	81773	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_020521	TTAAT	2	10	91075	91084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020521	TACAA	2	10	100994	101003	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020521	CTAAT	2	10	122198	122207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020521	CAAAT	2	10	132490	132499	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020521	AATTT	2	10	134170	134179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020521	TATAA	2	10	158412	158421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020521	TTTTA	2	10	161548	161557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020521	GTTAA	2	10	170698	170707	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020521	ATTAT	2	10	181862	181871	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020521	AATTT	2	10	195869	195878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020521	TAGAA	2	10	196124	196133	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020521	TTTCA	2	10	203688	203697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020521	ACCAA	2	10	206384	206393	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_020521	ATTGA	2	10	208330	208339	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020521	CAGAA	2	10	208426	208435	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020521	ATAGT	2	10	230151	230160	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020521	TTAAT	2	10	230172	230181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020521	TTTTA	2	10	234991	235000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020521	TTAAA	2	10	235092	235101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020521	TTCTT	2	10	235106	235115	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020521	TTAAT	2	10	238170	238179	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020521	GTTTT	2	10	239767	239776	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020521	TAAAT	2	10	243824	243833	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020521	AAATA	2	10	243871	243880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020521	TTATT	2	10	281301	281310	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020521	CATTT	2	10	282280	282289	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020521	ATAAA	2	10	291902	291911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020521	ATCCA	2	10	294832	294841	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_020521	TCGTG	2	10	296308	296317	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020521	CTATA	2	10	304718	304727	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020521	TACTT	2	10	328724	328733	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020521	TAAAA	2	10	333573	333582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020521	ATTTT	2	10	334670	334679	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020521	AATTA	2	10	352558	352567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020521	AGGTG	2	10	369210	369219	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020521	GAATC	2	10	374022	374031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020521	AATTC	2	10	384833	384842	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020521	ATGAG	2	10	402562	402571	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020521	TTAAA	2	10	410927	410936	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020521	CATTT	2	10	410965	410974	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020521	GAACC	2	10	419296	419305	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020521	GAATT	2	10	425428	425437	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020521	TCAAG	2	10	434718	434727	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020521	AACGT	2	10	475955	475964	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020521	GGGTT	2	10	480852	480861	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020521	GACTG	2	10	484536	484545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020521	TTAAT	2	10	493128	493137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020521	AGTCT	2	10	496372	496381	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020521	TGAAG	2	10	499816	499825	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020521	TTGAT	2	10	510226	510235	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020521	TAGCT	2	10	521980	521989	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020521	ATGAA	2	10	523174	523183	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020521	AAAGA	2	10	529209	529218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020521	TAAAA	2	10	532312	532321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020521	TAAAA	2	10	535659	535668	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020521	TATTG	2	10	539716	539725	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020521	ATTCA	2	10	545847	545856	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020521	ATTAA	2	10	551868	551877	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020521	TTTTC	2	10	552642	552651	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020521	ACTTA	2	10	570683	570692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020521	TTTAA	2	10	573006	573015	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020521	AATAC	2	10	573079	573088	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020521	TGTTA	2	10	580180	580189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020521	AATTA	2	10	586582	586591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020521	GCGAG	2	10	587621	587630	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020521	TATCT	2	10	618459	618468	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020521	CTTTT	2	10	620537	620546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020521	TTTAT	2	10	621333	621342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020521	TTCTC	2	10	623892	623901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_020521	ATTAT	2	10	624043	624052	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020521	AAAGA	2	10	638366	638375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020521	TTAAC	2	10	638376	638385	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020521	GCTTT	2	10	638509	638518	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020521	AATTT	2	10	649625	649634	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020521	ATAGT	2	10	655664	655673	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020521	TACTT	2	10	657187	657196	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020521	TTATC	2	10	658619	658628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020521	TAAAC	2	10	663691	663700	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020521	GTTTT	2	10	676067	676076	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020521	AAATA	2	10	677071	677080	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020521	ATTTT	2	10	677128	677137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020521	TCTCA	2	10	679175	679184	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020521	ACTTC	2	10	679196	679205	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_020521	CTTTT	2	10	690411	690420	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020521	GTGCT	2	10	692888	692897	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020521	TGATC	2	10	696064	696073	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020521	AGGGC	2	10	696084	696093	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020521	AAATT	2	10	712056	712065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020521	ATTGA	2	10	715638	715647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020521	TATTG	2	10	717403	717412	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020521	GCTTT	2	10	717971	717980	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020521	AACTT	2	10	719439	719448	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020521	TGGGG	2	10	726365	726374	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020521	TTTGA	2	10	727231	727240	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020521	TTTAA	2	10	733411	733420	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020521	CTCTT	2	10	735400	735409	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020521	CAGGG	2	10	740121	740130	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020521	TTAAT	2	10	741177	741186	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020521	TCTCT	2	10	748345	748354	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
112	NC_020521	AATTT	2	10	752485	752494	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020521	AATTG	2	10	752534	752543	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020521	AAGAT	2	10	764923	764932	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020521	GTATT	3	15	767376	767390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020521	TAAGG	2	10	774180	774189	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020521	GCCTT	2	10	774203	774212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_020521	CCTAT	2	10	776682	776691	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_020521	TAGGT	2	10	789612	789621	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020521	TAAAA	2	10	798657	798666	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020521	ATAAG	2	10	810606	810615	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020521	TTAAA	2	10	826522	826531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020521	TTAAT	2	10	837875	837884	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020521	TGAAT	2	10	837943	837952	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020521	ATTTT	2	10	849526	849535	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020521	TGCTT	2	10	849666	849675	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020521	ACATC	2	10	854292	854301	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_020521	TTGAG	2	10	863151	863160	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020521	CAAGA	2	10	900774	900783	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_020521	AGTCT	2	10	903201	903210	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020521	TCAAT	2	10	904809	904818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020521	ATATC	2	10	914029	914038	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020521	ACTTT	2	10	916323	916332	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020521	TTATT	2	10	916396	916405	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020521	TAAAT	2	10	922435	922444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020521	ATATT	2	10	942285	942294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020521	TGCCT	2	10	967457	967466	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
138	NC_020521	TTGAT	2	10	968336	968345	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020521	AATAA	2	10	968501	968510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020521	TAAAT	2	10	975202	975211	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020521	TTTTA	2	10	975261	975270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020521	TTAAA	2	10	990076	990085	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020521	TAACA	2	10	998682	998691	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020521	TAATT	2	10	999251	999260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020521	CGATT	2	10	1000625	1000634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020521	TTTAA	2	10	1005374	1005383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020521	GAGAA	2	10	1031636	1031645	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020521	AGACC	2	10	1035460	1035469	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
149	NC_020521	TCTAG	2	10	1037627	1037636	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_020521	ATGAA	2	10	1039632	1039641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_020521	ATTAA	2	10	1272990	1272999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_020521	CTTTT	2	10	1915127	1915136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_020521	AAAGT	2	10	1915886	1915895	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
272	NC_020521	GATCA	2	10	1920812	1920821	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
273	NC_020521	ATTGA	2	10	1922374	1922383	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_020521	TTAAT	2	10	1946295	1946304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_020521	TTTTA	2	10	1955282	1955291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_020521	TACTA	2	10	1967319	1967328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
278	NC_020521	TCGCT	2	10	1967416	1967425	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
279	NC_020521	TTTAA	2	10	1971126	1971135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_020521	CAAAA	2	10	1971207	1971216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
281	NC_020521	AATAA	2	10	1997647	1997656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020521	AATCA	2	10	2004012	2004021	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
283	NC_020521	TAAAA	2	10	2008541	2008550	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_020521	ATTTA	2	10	2021271	2021280	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_020521	TAAAA	2	10	2047239	2047248	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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412	NC_020521	TCTAC	2	10	2970265	2970274	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
413	NC_020521	AAATG	2	10	2977627	2977636	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_020521	ATATT	2	10	3023709	3023718	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_020521	ACTTA	2	10	3026638	3026647	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
422	NC_020521	TAGTT	2	10	3043423	3043432	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_020521	ATTTA	2	10	3066231	3066240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_020521	CTTCT	2	10	3069424	3069433	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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462	NC_020521	GTTGA	2	10	3312505	3312514	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
463	NC_020521	TACAA	2	10	3315968	3315977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
464	NC_020521	CTAAT	2	10	3316669	3316678	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
465	NC_020521	ATCGC	2	10	3347044	3347053	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
466	NC_020521	TATAT	2	10	3357094	3357103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_020521	AAGAT	2	10	3364543	3364552	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_020521	AAACC	2	10	3387315	3387324	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
471	NC_020521	TTAAC	2	10	3389375	3389384	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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473	NC_020521	TTTCA	2	10	3392641	3392650	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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477	NC_020521	AAAAT	2	10	3433970	3433979	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.