MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidimicrobidae bacterium YM16-304 DNA

Total Repeats: 108

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020520	CGACGC	2	12	10908	10919	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020520	GCCGCG	2	12	11064	11075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_020520	GAGCCG	2	12	26627	26638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020520	CCGCGT	2	12	38439	38450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020520	CGGTCC	2	12	122062	122073	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020520	GGACCG	2	12	125429	125440	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020520	AGCCCG	2	12	127967	127978	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020520	TCGGGC	2	12	156736	156747	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020520	CTCGAC	2	12	186240	186251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020520	GCCACT	2	12	267254	267265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_020520	GTGTCG	2	12	267340	267351	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020520	GACGGC	2	12	279013	279024	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020520	TCCCTC	2	12	299392	299403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_020520	TGTCGC	2	12	302669	302680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020520	GGTCAC	2	12	310257	310268	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020520	CCGTTG	2	12	379956	379967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020520	AACAGC	2	12	480655	480666	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020520	TGCTGG	2	12	607563	607574	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020520	TCATCT	2	12	661737	661748	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020520	CGAGAA	2	12	714276	714287	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020520	CGGTGC	2	12	765651	765662	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020520	GGCGGA	2	12	791905	791916	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020520	GTCGCT	2	12	880991	881002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020520	GCCTCC	2	12	881076	881087	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_020520	TCTGAT	2	12	943373	943384	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020520	GCCAAA	2	12	970516	970527	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020520	ACGAGA	2	12	978987	978998	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020520	CGTGGG	2	12	994915	994926	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020520	CGGGCG	2	12	1009772	1009783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020520	CGGCGC	2	12	1156989	1157000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020520	ATTTGC	2	12	1668542	1668553	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020520	GGCTCG	2	12	1814508	1814519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020520	CGGGCA	2	12	1886474	1886485	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020520	CCCTGA	2	12	1920413	1920424	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020520	GTCGTG	2	12	1930476	1930487	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020520	CGAGAA	2	12	1967628	1967639	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020520	GGTTGG	2	12	1969741	1969752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020520	TCACCG	2	12	2016313	2016324	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020520	GTGGGG	2	12	2017557	2017568	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020520	GGGACC	2	12	2053207	2053218	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020520	CGCCGA	2	12	2055400	2055411	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020520	TCGGTT	2	12	2087616	2087627	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020520	GCCTCT	2	12	2124911	2124922	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020520	GGCGGT	2	12	2149171	2149182	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_020520	GTAGCC	4	24	2218724	2218747	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020520	TCGGAG	2	12	2373509	2373520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020520	CCGCGT	2	12	2404442	2404453	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_020520	GGCGAC	2	12	2533156	2533167	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020520	CGCCGG	2	12	2664776	2664787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020520	AGGCCC	2	12	2791855	2791866	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020520	CACCGA	2	12	2939726	2939737	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020520	GACTGG	2	12	2973455	2973466	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020520	CGGCGC	2	12	2995990	2996001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_020520	TCATCG	2	12	3025680	3025691	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020520	ACGCCG	2	12	3060836	3060847	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020520	GGGTGG	2	12	3082328	3082339	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020520	AGGGTG	2	12	3089499	3089510	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020520	TTCGAC	2	12	3092840	3092851	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020520	CACACC	2	12	3101587	3101598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_020520	TCACCA	2	12	3233245	3233256	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020520	CGGAAT	2	12	3261820	3261831	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020520	CCAGCG	2	12	3290919	3290930	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020520	CGGTCC	2	12	3294635	3294646	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020520	CGGCTC	2	12	3326288	3326299	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020520	GGACCG	2	12	3331855	3331866	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020520	TCGGCT	2	12	3366274	3366285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020520	CTCGCC	2	12	3445076	3445087	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020520	GGTCCG	2	12	3459877	3459888	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020520	GTGTTC	2	12	3484492	3484503	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020520	CCCCCG	2	12	3513223	3513234	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
71	NC_020520	CACGAT	2	12	3524042	3524053	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020520	CCACCG	2	12	3562075	3562086	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020520	GCCGAC	2	12	3646212	3646223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020520	CAGGCT	2	12	3650811	3650822	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_020520	ACTCGC	2	12	3670025	3670036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020520	CGACCG	2	12	3677687	3677698	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_020520	CCAACC	2	12	3681936	3681947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_020520	CCCAAC	2	12	3681962	3681973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020520	GGCCGC	2	12	3707043	3707054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_020520	GGTGGG	2	12	3718049	3718060	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020520	ACTCAC	2	12	3802418	3802429	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020520	ACTCAC	2	12	3802540	3802551	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020520	GGGAGC	2	12	3866264	3866275	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020520	GCTGCG	2	12	3876591	3876602	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020520	CGAGAC	2	12	3952705	3952716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020520	CCCACA	2	12	4004817	4004828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020520	CCCACA	2	12	4004879	4004890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_020520	ACCGGC	2	12	4051286	4051297	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020520	CGTCGA	2	12	4083112	4083123	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020520	CACGAC	2	12	4186405	4186416	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_020520	CGAGAT	2	12	4190146	4190157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020520	GCGACG	2	12	4224500	4224511	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_020520	CGACCG	2	12	4227089	4227100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020520	GTCTCG	2	12	4232530	4232541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_020520	CAGAAC	2	12	4245096	4245107	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020520	CCACAA	2	12	4284219	4284230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020520	TACACA	2	12	4374428	4374439	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020520	TGGACC	2	12	4388546	4388557	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020520	CATCCA	2	12	4445001	4445012	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020520	CATCGT	2	12	4446701	4446712	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020520	TAATGA	2	12	4472023	4472034	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020520	CGGCGA	2	12	4575485	4575496	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020520	AAGAGC	2	12	4653602	4653613	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_020520	GACCGG	2	12	4729409	4729420	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020520	GGACCG	2	12	4749596	4749607	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020520	TCACCG	2	12	4779415	4779426	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020520	TCGTGA	2	12	4792794	4792805	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020520	CGCCGA	2	12	4826212	4826223	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.