MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Acidimicrobidae bacterium YM16-304 DNA

Total Repeats: 3718

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020520	CTCGGC	2	12	4523439	4523450	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180216
3502	NC_020520	TCGGCA	2	12	4524227	4524238	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180217
3503	NC_020520	CGGCGA	2	12	4525106	4525117	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180218
3504	NC_020520	CCGTGG	2	12	4525313	4525324	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180218
3505	NC_020520	CGTCGA	2	12	4526670	4526681	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180219
3506	NC_020520	GGAACC	2	12	4527030	4527041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180219
3507	NC_020520	CCTCGT	2	12	4527411	4527422	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470180219
3508	NC_020520	GAGCAC	2	12	4527601	4527612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180219
3509	NC_020520	GTCGGC	2	12	4527760	4527771	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180219
3510	NC_020520	GCCGGC	2	12	4527841	4527852	0 %	0 %	50 %	50 %	470180219
3511	NC_020520	ACGAGC	2	12	4527863	4527874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180219
3512	NC_020520	GCCGGT	2	12	4529047	4529058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180221
3513	NC_020520	ATCGGC	2	12	4533163	4533174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180224
3514	NC_020520	GCGATC	2	12	4535607	4535618	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180226
3515	NC_020520	GAAGTC	2	12	4537850	4537861	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180228
3516	NC_020520	GGCGTC	2	12	4538489	4538500	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180228
3517	NC_020520	TCGCCG	2	12	4539534	4539545	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180229
3518	NC_020520	CGGCGA	2	12	4539658	4539669	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180229
3519	NC_020520	CGCTGC	2	12	4540188	4540199	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180230
3520	NC_020520	TCGCCA	2	12	4540509	4540520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180230
3521	NC_020520	GAGGGC	2	12	4540963	4540974	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	470180230
3522	NC_020520	GTCGCC	2	12	4541101	4541112	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180231
3523	NC_020520	AGCACG	2	12	4541146	4541157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180231
3524	NC_020520	ACGGCG	2	12	4546199	4546210	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180236
3525	NC_020520	CGTCGA	2	12	4547232	4547243	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180238
3526	NC_020520	CGTCGA	2	12	4547703	4547714	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180238
3527	NC_020520	CGAGGC	2	12	4549216	4549227	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180239
3528	NC_020520	CGATGA	2	12	4551619	4551630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180241
3529	NC_020520	CGATGC	2	12	4552615	4552626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180242
3530	NC_020520	GTCGAG	2	12	4555150	4555161	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180244
3531	NC_020520	GACGGT	2	12	4557048	4557059	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180247
3532	NC_020520	CGTTGC	2	12	4557584	4557595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180247
3533	NC_020520	GCGATG	2	12	4557763	4557774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180247
3534	NC_020520	TCCAGC	2	12	4558653	4558664	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180249
3535	NC_020520	GCCCGA	2	12	4560112	4560123	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180251
3536	NC_020520	CCACGA	2	12	4560769	4560780	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180251
3537	NC_020520	GCGATG	2	12	4561889	4561900	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180252
3538	NC_020520	CCGTCG	2	12	4566286	4566297	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180256
3539	NC_020520	ACACGA	2	12	4567524	4567535	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470180257
3540	NC_020520	CCCGGC	2	12	4570289	4570300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470180261
3541	NC_020520	GATCTC	2	12	4570944	4570955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180262
3542	NC_020520	ACCGGC	2	12	4573598	4573609	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180266
3543	NC_020520	CGATGG	2	12	4573635	4573646	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180266
3544	NC_020520	TCATCG	2	12	4573890	4573901	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180266
3545	NC_020520	GCCGAG	2	12	4574159	4574170	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180266
3546	NC_020520	ACCGCC	2	12	4574573	4574584	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180266
3547	NC_020520	GATGCG	2	12	4576515	4576526	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180267
3548	NC_020520	CGATCG	2	12	4579545	4579556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180269
3549	NC_020520	CGAGAC	2	12	4580290	4580301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180269
3550	NC_020520	CTACGA	2	12	4581075	4581086	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180270
3551	NC_020520	TCGGCA	2	12	4581997	4582008	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180271
3552	NC_020520	GCGTGC	2	12	4582308	4582319	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180271
3553	NC_020520	GCGCTC	2	12	4583242	4583253	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180272
3554	NC_020520	GGGTGT	2	12	4585190	4585201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470180274
3555	NC_020520	CCGGCT	2	12	4587669	4587680	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180275
3556	NC_020520	ACAGCA	2	12	4587765	4587776	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470180275
3557	NC_020520	ATGTCG	2	12	4589053	4589064	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180276
3558	NC_020520	CGAGCG	2	12	4593969	4593980	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180279
3559	NC_020520	AGGTCG	2	12	4595694	4595705	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180279
3560	NC_020520	GGCGAT	2	12	4595820	4595831	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180280
3561	NC_020520	GTCGGT	2	12	4595832	4595843	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470180280
3562	NC_020520	GGACGT	2	12	4597657	4597668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180281
3563	NC_020520	GAAGTC	2	12	4601810	4601821	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180284
3564	NC_020520	CAAGGC	2	12	4602897	4602908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470180286
3565	NC_020520	CGTCGG	2	12	4606751	4606762	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180286
3566	NC_020520	TCGACC	2	12	4611177	4611188	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180288
3567	NC_020520	CAAACT	2	12	4612279	4612290	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	470180288
3568	NC_020520	GGCAGC	2	12	4613392	4613403	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180288
3569	NC_020520	TCGTAC	2	12	4614140	4614151	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180289
3570	NC_020520	GAACTC	2	12	4614790	4614801	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180289
3571	NC_020520	CGAGCC	2	12	4616352	4616363	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180289
3572	NC_020520	CTCGTC	2	12	4618178	4618189	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470180291
3573	NC_020520	GAGCTG	2	12	4618769	4618780	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180291
3574	NC_020520	TCGATC	2	12	4624844	4624855	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180294
3575	NC_020520	CGCACC	2	12	4630022	4630033	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180295
3576	NC_020520	TCGAGA	2	12	4630683	4630694	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180295
3577	NC_020520	GTCGAC	2	12	4631141	4631152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180295
3578	NC_020520	AAGACC	2	12	4632919	4632930	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470180296
3579	NC_020520	GCCACC	2	12	4640107	4640118	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180303
3580	NC_020520	TCGACG	2	12	4643273	4643284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180307
3581	NC_020520	GACCAC	2	12	4644698	4644709	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180309
3582	NC_020520	CCATGC	2	12	4645625	4645636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180310
3583	NC_020520	GACAAC	2	12	4647463	4647474	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	470180311
3584	NC_020520	CGACAT	2	12	4648040	4648051	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180312
3585	NC_020520	GTCGAG	2	12	4653114	4653125	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180316
3586	NC_020520	CGATGG	2	12	4654347	4654358	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180317
3587	NC_020520	CCCGAA	2	12	4656373	4656384	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180318
3588	NC_020520	GACCTC	2	12	4656477	4656488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180319
3589	NC_020520	CCGAAC	2	12	4658641	4658652	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180321
3590	NC_020520	GTCGAC	2	12	4660407	4660418	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180321
3591	NC_020520	GCGATC	2	12	4661209	4661220	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180322
3592	NC_020520	CGTCGG	2	12	4664431	4664442	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180325
3593	NC_020520	TCGGTC	2	12	4664712	4664723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180325
3594	NC_020520	TCGGCG	2	12	4667731	4667742	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180327
3595	NC_020520	GTCGGC	2	12	4667817	4667828	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180327
3596	NC_020520	TTGCAG	2	12	4669941	4669952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180330
3597	NC_020520	GCCGAG	2	12	4672381	4672392	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180333
3598	NC_020520	ACTCGG	2	12	4674013	4674024	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180335
3599	NC_020520	GGCTTC	2	12	4675231	4675242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180336
3600	NC_020520	ACTGCG	2	12	4675689	4675700	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180337
3601	NC_020520	TCGACG	2	12	4677010	4677021	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180338
3602	NC_020520	TCCCGA	2	12	4678968	4678979	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180340
3603	NC_020520	GTCGGC	2	12	4679594	4679605	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180340
3604	NC_020520	CCTCGA	2	12	4679949	4679960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180341
3605	NC_020520	CGACCT	2	12	4681141	4681152	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180342
3606	NC_020520	TCGAAG	2	12	4681191	4681202	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180342
3607	NC_020520	CGTCGC	2	12	4682276	4682287	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180343
3608	NC_020520	CGTGGG	2	12	4683181	4683192	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470180344
3609	NC_020520	TCGGCG	2	12	4684315	4684326	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180345
3610	NC_020520	GCTCGG	2	12	4687627	4687638	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180349
3611	NC_020520	TCCTGC	2	12	4690953	4690964	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470180352
3612	NC_020520	TCGACA	2	12	4692854	4692865	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	470180355
3613	NC_020520	TCGGTG	2	12	4693367	4693378	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	470180355
3614	NC_020520	GCCTCG	2	12	4693880	4693891	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180355
3615	NC_020520	GATCCG	2	12	4694980	4694991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180357
3616	NC_020520	CTCGAC	2	12	4696889	4696900	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180359
3617	NC_020520	CTCGAC	2	12	4697238	4697249	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180359
3618	NC_020520	CATCGG	3	18	4699181	4699198	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180361
3619	NC_020520	GTCGAC	2	12	4700161	4700172	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180362
3620	NC_020520	GACGTC	2	12	4701729	4701740	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180364
3621	NC_020520	GGTCGA	2	12	4702226	4702237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180364
3622	NC_020520	CACGGC	2	12	4703976	4703987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180365
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3625	NC_020520	TCGACC	2	12	4706241	4706252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180368
3626	NC_020520	CGACGG	2	12	4707212	4707223	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180369
3627	NC_020520	TCACCG	2	12	4707229	4707240	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180369
3628	NC_020520	GACGCC	2	12	4708232	4708243	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180371
3629	NC_020520	CCGTCA	2	12	4711873	4711884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180374
3630	NC_020520	TGGAAC	2	12	4712570	4712581	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180375
3631	NC_020520	TCGACG	2	12	4712919	4712930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180375
3632	NC_020520	AACACC	2	12	4716584	4716595	50 %	0 %	0 %	50 %	470180379
3633	NC_020520	GGCGAT	2	12	4719442	4719453	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180382
3634	NC_020520	TCGACG	2	12	4720797	4720808	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180382
3635	NC_020520	GTCGAG	2	12	4722673	4722684	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180384
3636	NC_020520	TGCCGA	2	12	4723876	4723887	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180386
3637	NC_020520	CTCGCG	2	12	4724872	4724883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	470180387
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3639	NC_020520	CGGCGA	2	12	4730275	4730286	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	470180394
3640	NC_020520	GCCCCA	2	12	4731872	4731883	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180396
3641	NC_020520	GCCGAT	2	12	4732658	4732669	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180396
3642	NC_020520	ATGGTG	2	12	4732785	4732796	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	470180396
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3644	NC_020520	CCTCGA	2	12	4733254	4733265	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180396
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3646	NC_020520	CGTCGG	2	12	4737218	4737229	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180399
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3654	NC_020520	TCGGCT	2	12	4748573	4748584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470180408
3655	NC_020520	CACGCT	2	12	4750878	4750889	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180412
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3662	NC_020520	CGGCGC	2	12	4762008	4762019	0 %	0 %	50 %	50 %	470180422
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3664	NC_020520	CCCGAC	2	12	4766139	4766150	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	470180427
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3672	NC_020520	GCCTTC	2	12	4770960	4770971	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	470180430
3673	NC_020520	TCGACC	2	12	4771545	4771556	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180431
3674	NC_020520	CCTTGA	2	12	4773421	4773432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470180432
3675	NC_020520	CCGACA	2	12	4774685	4774696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180433
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3680	NC_020520	GACGGT	2	12	4783411	4783422	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180444
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3683	NC_020520	GTCGAG	2	12	4787445	4787456	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180449
3684	NC_020520	GCCGTG	2	12	4788312	4788323	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180451
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3690	NC_020520	TGGGCG	2	12	4794602	4794613	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	470180458
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3700	NC_020520	GTCGAG	2	12	4809486	4809497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180478
3701	NC_020520	GAGATC	2	12	4811878	4811889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180479
3702	NC_020520	ACGACC	2	12	4813169	4813180	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180481
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3704	NC_020520	CCATCG	2	12	4815644	4815655	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	470180482
3705	NC_020520	GCGGCC	2	12	4815667	4815678	0 %	0 %	50 %	50 %	470180482
3706	NC_020520	GACCGC	2	12	4817162	4817173	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180483
3707	NC_020520	CAGTCG	2	12	4817577	4817588	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180483
3708	NC_020520	CGACCA	2	12	4817637	4817648	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	470180483
3709	NC_020520	CGGTCG	2	12	4817730	4817741	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	470180483
3710	NC_020520	CGAGCC	2	12	4818123	4818134	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180483
3711	NC_020520	GCAGCC	2	12	4819291	4819302	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180485
3712	NC_020520	CGCCGA	2	12	4819704	4819715	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	470180485
3713	NC_020520	TTCGAG	2	12	4824508	4824519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180492
3714	NC_020520	CGTAGT	2	12	4825702	4825713	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	470180493
3715	NC_020520	TCAGCG	2	12	4826872	4826883	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	470180494
3716	NC_020520	ACGATG	2	12	4827056	4827067	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	470180495
3717	NC_020520	TCTCGT	2	12	4827510	4827521	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	470180495
3718	NC_020520	TGAGCG	2	12	4829049	4829060	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	470180496

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