MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidimicrobidae bacterium YM16-304 DNA

Total Repeats: 1157

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020520	TGAG	2	8	4209349	4209356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020520	CCGC	2	8	4209570	4209577	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1003	NC_020520	CTCC	2	8	4217582	4217589	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1004	NC_020520	GTTT	2	8	4219172	4219179	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_020520	GCGT	2	8	4224540	4224547	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1006	NC_020520	GCTG	2	8	4226364	4226371	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1007	NC_020520	CCGA	2	8	4230393	4230400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_020520	CCGA	2	8	4230441	4230448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1009	NC_020520	GCAC	2	8	4235862	4235869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_020520	GGTT	2	8	4252926	4252933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020520	CGAG	2	8	4267328	4267335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_020520	CGAC	2	8	4273511	4273518	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1013	NC_020520	CCGT	2	8	4281758	4281765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1014	NC_020520	CACT	2	8	4283839	4283846	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1015	NC_020520	GCCC	2	8	4283847	4283854	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1016	NC_020520	GCCG	2	8	4283902	4283909	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1017	NC_020520	CACT	2	8	4283960	4283967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_020520	GCCC	2	8	4283968	4283975	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1019	NC_020520	GCCG	2	8	4284022	4284029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_020520	CACT	2	8	4284056	4284063	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_020520	GCCG	2	8	4284118	4284125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1022	NC_020520	CACT	2	8	4284152	4284159	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_020520	CACT	2	8	4284298	4284305	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1024	NC_020520	AACG	2	8	4291345	4291352	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_020520	TACC	2	8	4304255	4304262	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_020520	GGTA	2	8	4304263	4304270	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_020520	CCGG	2	8	4305921	4305928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1030	NC_020520	CGTC	2	8	4320776	4320783	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1031	NC_020520	TCAC	2	8	4333194	4333201	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_020520	GATG	2	8	4337800	4337807	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_020520	TTCG	2	8	4340516	4340523	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_020520	GATC	2	8	4340545	4340552	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1036	NC_020520	CCAG	2	8	4345772	4345779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_020520	CTGG	2	8	4346530	4346537	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_020520	GATG	2	8	4346542	4346549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_020520	ACCG	2	8	4349078	4349085	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1041	NC_020520	CCCG	2	8	4350017	4350024	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1042	NC_020520	CGGC	2	8	4355258	4355265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_020520	CCGC	2	8	4355996	4356003	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_020520	CCCG	2	8	4358646	4358653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1045	NC_020520	GATC	2	8	4366898	4366905	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1049	NC_020520	TCGC	2	8	4374720	4374727	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_020520	CGCC	2	8	4374925	4374932	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1051	NC_020520	ATCG	2	8	4396050	4396057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1054	NC_020520	TCGC	2	8	4416086	4416093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1061	NC_020520	CCGA	2	8	4468679	4468686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_020520	CGGC	2	8	4469858	4469865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_020520	CGAC	2	8	4469930	4469937	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1064	NC_020520	CGGA	2	8	4472117	4472124	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_020520	GCTG	2	8	4479258	4479265	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1070	NC_020520	GGGT	2	8	4493113	4493120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_020520	CCCG	2	8	4493615	4493622	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1073	NC_020520	ACGA	2	8	4493754	4493761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1074	NC_020520	GACC	2	8	4496362	4496369	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1075	NC_020520	GACA	2	8	4496520	4496527	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1102	NC_020520	TCGA	2	8	4621061	4621068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1104	NC_020520	ATCG	2	8	4635425	4635432	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_020520	CCGT	2	8	4635589	4635596	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_020520	TGCG	2	8	4638028	4638035	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1107	NC_020520	CAGG	2	8	4641887	4641894	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_020520	GCCC	2	8	4645442	4645449	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1109	NC_020520	CGTT	2	8	4647820	4647827	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_020520	ACGA	2	8	4653678	4653685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_020520	GGCG	2	8	4662519	4662526	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_020520	CACC	2	8	4675592	4675599	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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1114	NC_020520	TTCC	2	8	4698583	4698590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1115	NC_020520	CGAG	2	8	4702656	4702663	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_020520	CGCT	2	8	4702724	4702731	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_020520	CGTC	2	8	4708594	4708601	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_020520	GCCG	2	8	4711379	4711386	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_020520	GACG	2	8	4711392	4711399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1120	NC_020520	CAGT	2	8	4711508	4711515	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_020520	GCCG	2	8	4711999	4712006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_020520	GCCG	2	8	4714990	4714997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1123	NC_020520	CGAT	2	8	4716751	4716758	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1124	NC_020520	GCCA	2	8	4716808	4716815	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_020520	CAGT	2	8	4724708	4724715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1126	NC_020520	CCCG	2	8	4725562	4725569	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1127	NC_020520	CGGC	2	8	4733757	4733764	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_020520	CGCT	2	8	4735568	4735575	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_020520	CGAA	2	8	4745756	4745763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_020520	GGGA	2	8	4756322	4756329	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_020520	ACGA	2	8	4756845	4756852	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_020520	GCCC	2	8	4756853	4756860	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1133	NC_020520	CGAG	2	8	4756991	4756998	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_020520	CGGC	3	12	4759211	4759222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1135	NC_020520	TGCT	2	8	4762256	4762263	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1136	NC_020520	TTCC	2	8	4770020	4770027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1137	NC_020520	CGCC	2	8	4786355	4786362	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1138	NC_020520	CGAC	2	8	4791510	4791517	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_020520	CCGA	2	8	4791587	4791594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1140	NC_020520	TCGT	2	8	4792776	4792783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1141	NC_020520	TCCC	2	8	4792958	4792965	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1142	NC_020520	CGGC	2	8	4794242	4794249	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_020520	GGCT	2	8	4796778	4796785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1144	NC_020520	TCGG	2	8	4798602	4798609	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1145	NC_020520	ACCG	2	8	4798624	4798631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1146	NC_020520	GGCC	2	8	4798647	4798654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1147	NC_020520	TCGC	2	8	4799427	4799434	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1148	NC_020520	GCAC	2	8	4801708	4801715	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1149	NC_020520	AGCC	2	8	4801906	4801913	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1150	NC_020520	TCGA	2	8	4802977	4802984	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1151	NC_020520	CGGT	2	8	4805370	4805377	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1152	NC_020520	TGCA	2	8	4818280	4818287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1153	NC_020520	GAGC	2	8	4820176	4820183	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_020520	GGCG	2	8	4823256	4823263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1155	NC_020520	GGCC	2	8	4823367	4823374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_020520	CGGG	2	8	4826194	4826201	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1157	NC_020520	CTTC	2	8	4827960	4827967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.