MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium glutamicum K051 complete genome

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020519	GAAATT	2	12	2108	2119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020519	GGTCTT	2	12	24772	24783	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020519	TCGCTT	2	12	50809	50820	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020519	TTGTGG	2	12	81160	81171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020519	CTGGGG	2	12	86466	86477	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020519	TTGAGT	2	12	144646	144657	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020519	AAATAC	2	12	153002	153013	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020519	GGGGTG	2	12	192348	192359	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020519	CACTGG	2	12	223743	223754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020519	TTTCTG	2	12	346572	346583	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020519	TTCAAT	2	12	371783	371794	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020519	ATCACC	2	12	392226	392237	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020519	CGTCAC	2	12	416209	416220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020519	AAAGAC	2	12	450759	450770	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020519	TGGGTT	2	12	511051	511062	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020519	ACTTCA	2	12	532764	532775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020519	GTAAAC	2	12	555154	555165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020519	CTGTTT	2	12	580894	580905	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_020519	TTTCAT	2	12	627601	627612	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020519	CTGGTT	2	12	645120	645131	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020519	GAAAAA	2	12	666408	666419	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020519	TGGTCG	2	12	728397	728408	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020519	TATTGA	2	12	748612	748623	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020519	AGTCAA	2	12	784603	784614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020519	ATTTTC	2	12	788626	788637	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020519	CGAACA	2	12	801153	801164	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020519	CTTACG	2	12	805393	805404	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020519	CTAGAC	2	12	806026	806037	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020519	TCTGAA	2	12	848481	848492	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020519	CTTTTT	2	12	855511	855522	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020519	TTGTGG	2	12	860630	860641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020519	TTTAAG	2	12	881409	881420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020519	TTCACA	2	12	881484	881495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020519	TAACAA	2	12	885438	885449	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020519	TTGCTT	2	12	897350	897361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020519	GTGTGC	2	12	957567	957578	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020519	CCGGGC	2	12	984781	984792	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_020519	GAAAAC	2	12	1018193	1018204	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020519	AGTTCA	2	12	1087623	1087634	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020519	GACAGG	2	12	1089928	1089939	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020519	CAAGGA	2	12	1097204	1097215	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020519	TTTGGG	2	12	1099785	1099796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020519	CACTGC	2	12	1103828	1103839	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020519	AAGGAT	2	12	1209678	1209689	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020519	CCGGAA	2	12	1314289	1314300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020519	TTTGAA	2	12	1343715	1343726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020519	CGGTTT	2	12	1359794	1359805	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020519	TTATTG	2	12	1367540	1367551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020519	GGTCTT	2	12	1382615	1382626	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020519	GGGGAT	2	12	1422776	1422787	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020519	TTTTCA	2	12	1422855	1422866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020519	TTGGGG	2	12	1449095	1449106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020519	TTGTGG	2	12	1483881	1483892	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020519	GCCAGT	2	12	1535147	1535158	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020519	TGGGTA	2	12	1624854	1624865	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020519	AACGAA	2	12	1664356	1664367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020519	GTGCTT	2	12	1680276	1680287	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020519	CTGCCC	2	12	1695373	1695384	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020519	AGTGTT	2	12	1721762	1721773	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020519	CAGAAA	2	12	1794917	1794928	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020519	TTGACA	2	12	1809639	1809650	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020519	CAGCTT	2	12	1827002	1827013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020519	CCTTTA	2	12	1851059	1851070	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020519	ACCCTT	2	12	1856871	1856882	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020519	ACTGAA	2	12	1887065	1887076	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020519	CCCTTC	2	12	1933197	1933208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_020519	TAAATT	2	12	1936110	1936121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020519	CATACA	2	12	1940211	1940222	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020519	TGCTCA	2	12	1943022	1943033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_020519	ACCATG	2	12	1943835	1943846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020519	TTTTAC	2	12	1955457	1955468	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020519	TTAATG	2	12	1966266	1966277	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020519	TGTCAT	2	12	1986744	1986755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020519	GTTATA	2	12	2029161	2029172	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020519	CTTTTG	2	12	2046107	2046118	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020519	TTTTTA	2	12	2086845	2086856	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020519	AAACCA	2	12	2088990	2089001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020519	CGTTTC	2	12	2150046	2150057	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020519	AATCGG	2	12	2232767	2232778	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020519	CTTTTT	2	12	2238679	2238690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020519	GCCGAT	2	12	2261664	2261675	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020519	CCGGAT	2	12	2274696	2274707	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020519	GGATAC	2	12	2309795	2309806	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020519	TTAGCT	2	12	2334627	2334638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020519	TTTCGC	2	12	2344267	2344278	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020519	CTAAAG	2	12	2391069	2391080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_020519	AACTTG	2	12	2409105	2409116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020519	CCGGGC	2	12	2415250	2415261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020519	GCCTAA	2	12	2417204	2417215	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020519	ACAGTG	2	12	2470664	2470675	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_020519	ATCGTT	2	12	2503614	2503625	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_020519	CAAAAA	2	12	2503905	2503916	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020519	AAAACG	2	12	2545234	2545245	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_020519	GGGAAA	2	12	2558128	2558139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020519	CTGCCA	2	12	2612606	2612617	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_020519	CACAAA	2	12	2703585	2703596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020519	ACCACA	2	12	2704416	2704427	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020519	CCAACA	2	12	2707367	2707378	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020519	ACCACA	2	12	2713283	2713294	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020519	CCAACA	2	12	2716234	2716245	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020519	TTCCCA	2	12	2728945	2728956	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020519	GACCCC	2	12	2778788	2778799	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020519	GCCGGA	2	12	2888025	2888036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_020519	TATTTT	2	12	2945168	2945179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020519	CCACCT	2	12	2981714	2981725	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_020519	TGCTGG	2	12	3003298	3003309	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020519	AGTTGC	2	12	3008703	3008714	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020519	CCCCGT	2	12	3046050	3046061	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_020519	GGTAAT	2	12	3054251	3054262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020519	AACTTA	2	12	3067811	3067822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020519	GGTTCG	2	12	3101601	3101612	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020519	CCGATC	2	12	3127159	3127170	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020519	CACAAA	2	12	3145844	3145855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020519	ACCACA	2	12	3146671	3146682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020519	CCAACA	2	12	3149621	3149632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020519	ACCCTC	2	12	3155220	3155231	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_020519	CGCCGT	2	12	3171141	3171152	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020519	ATCTGA	2	12	3189278	3189289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_020519	GCGACC	2	12	3275207	3275218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.