MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020518	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020518	TAAAAA	2	12	53202	53213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020518	ACGCGT	2	12	70405	70416	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020518	AAGGGA	2	12	79156	79167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020518	TCTCCC	2	12	159369	159380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_020518	TCACCC	2	12	159420	159431	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_020518	GTAGTG	2	12	189241	189252	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020518	TCCGCC	2	12	238319	238330	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_020518	TGCGCC	2	12	238784	238795	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020518	TGGAGA	2	12	239199	239210	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020518	TAAATT	2	12	270230	270241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020518	TTTATT	2	12	270339	270350	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020518	AACAAT	2	12	315010	315021	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020518	TATTGA	2	12	317856	317867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020518	TTTTCA	2	12	380221	380232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020518	CAGGCG	2	12	399064	399075	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020518	TGCAAA	2	12	486169	486180	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020518	ATTTTT	2	12	580603	580614	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020518	TTTTCT	2	12	657683	657694	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020518	AATATT	2	12	683492	683503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020518	CAGAAA	2	12	695723	695734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020518	TAACCG	2	12	785618	785629	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020518	AAATAA	2	12	817345	817356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020518	CTGGAA	2	12	826909	826920	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020518	AAAGAT	2	12	849876	849887	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020518	TGTCCA	2	12	870509	870520	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020518	TAAGGA	2	12	892777	892788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020518	ATAATG	2	12	894191	894202	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020518	ACGCTT	2	12	1045554	1045565	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020518	ACTCGA	2	12	1045574	1045585	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020518	CAGGCT	2	12	1045706	1045717	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020518	CTTATT	2	12	1097853	1097864	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020518	CAAAAG	2	12	1104749	1104760	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020518	GGGGGT	2	12	1112969	1112980	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020518	CTGATC	2	12	1115227	1115238	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020518	CTATAA	2	12	1161494	1161505	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020518	ATAACG	2	12	1195148	1195159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020518	AAAAAC	2	12	1262588	1262599	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020518	TTCATA	2	12	1274179	1274190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020518	ACCGTT	2	12	1277452	1277463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020518	TGGTTA	2	12	1286282	1286293	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020518	ATACTT	2	12	1422717	1422728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020518	AAAATA	2	12	1436373	1436384	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020518	TGTTTT	2	12	1437006	1437017	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020518	AAGACT	2	12	1437266	1437277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020518	GAACAG	2	12	1485046	1485057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020518	TATTAC	2	12	1553494	1553505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020518	TTTCTT	2	12	1570072	1570083	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020518	ATAAAC	2	12	1574015	1574026	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020518	ACTGTC	2	12	1617673	1617684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020518	TTAATG	2	12	1642900	1642911	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020518	AATTCA	2	12	1650025	1650036	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020518	ATATTT	2	12	1670670	1670681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020518	CGACTT	2	12	1671492	1671503	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020518	ATTTTT	2	12	1694788	1694799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020518	TCCCCC	2	12	1739536	1739547	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
57	NC_020518	GAAAAA	2	12	1772165	1772176	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020518	ATACCG	2	12	1772542	1772553	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020518	TCTTCC	2	12	1837984	1837995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020518	CGCAGG	2	12	1900789	1900800	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020518	CCATGC	2	12	1901359	1901370	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020518	CAGCGT	2	12	1901851	1901862	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020518	GCAGTT	2	12	1903356	1903367	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020518	CCACTA	2	12	1919993	1920004	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020518	TAAATG	2	12	1977268	1977279	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020518	TGTCAC	2	12	1990902	1990913	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020518	AGAAAA	2	12	2001182	2001193	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020518	CTGATG	2	12	2055738	2055749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020518	CAAGTG	2	12	2083724	2083735	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020518	TCCTTC	2	12	2184915	2184926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_020518	TGGACA	2	12	2235185	2235196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_020518	CAGTTT	2	12	2249772	2249783	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020518	TCAGCC	2	12	2319909	2319920	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020518	ATCTTA	2	12	2367377	2367388	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020518	GGTTTT	2	12	2428563	2428574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020518	ACAAGA	2	12	2432894	2432905	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020518	TTTGTT	2	12	2457830	2457841	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020518	ATATCA	2	12	2542245	2542256	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020518	ATCGCG	2	12	2547812	2547823	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020518	GTAAGG	2	12	2563507	2563518	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020518	ACTGAG	2	12	2588496	2588507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020518	AGTTGT	2	12	2684362	2684373	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020518	CTTTTT	2	12	2689039	2689050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020518	AATGAT	2	12	2689874	2689885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020518	TCTCCC	2	12	2712929	2712940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_020518	GTAACC	2	12	2739395	2739406	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020518	AGACAA	2	12	2741015	2741026	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020518	TGCATT	2	12	2750266	2750277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_020518	TTTTAT	2	12	2752163	2752174	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020518	ATATAA	2	12	2760626	2760637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020518	TTTTTA	2	12	2835289	2835300	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020518	AGCGTT	2	12	2886212	2886223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020518	AATTTA	2	12	2998269	2998280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020518	ATGCTG	2	12	3011862	3011873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020518	AGATGC	2	12	3093445	3093456	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020518	ATACCG	2	12	3102675	3102686	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020518	TGAAAA	2	12	3108317	3108328	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020518	TTTGCC	2	12	3144971	3144982	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_020518	ACTCTT	2	12	3159351	3159362	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020518	TTTATC	2	12	3205855	3205866	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_020518	GCCCTG	2	12	3245592	3245603	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
102	NC_020518	CTTTTT	2	12	3370552	3370563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_020518	AGGGAG	2	12	3388695	3388706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020518	GCGTAA	2	12	3489612	3489623	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_020518	GGGAGT	2	12	3515095	3515106	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020518	ATAAAA	2	12	3530759	3530770	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020518	TTTTCT	2	12	3561654	3561665	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020518	TCATTT	2	12	3652871	3652882	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020518	TAACCA	2	12	3665424	3665435	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020518	GTCTTT	2	12	3707179	3707190	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_020518	AATATC	2	12	3733546	3733557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020518	GGGAGA	2	12	3743338	3743349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020518	GGCCGA	2	12	3751933	3751944	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020518	GATGGT	2	12	3752315	3752326	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020518	CTGATA	2	12	3769804	3769815	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020518	TTCAAT	2	12	3803651	3803662	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020518	TTTTTA	2	12	3821999	3822010	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020518	TTTAAT	2	12	3853948	3853959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020518	TTTCAC	2	12	3901828	3901839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_020518	AATAAA	2	12	3908650	3908661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020518	AATGAT	2	12	3940225	3940236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020518	TTATCA	2	12	3940318	3940329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_020518	AGTAAA	2	12	3965163	3965174	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.