MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 2135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020518	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	471332238
2	NC_020518	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	471332239
3	NC_020518	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	471332244
4	NC_020518	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	471332245
5	NC_020518	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	471332247
6	NC_020518	CAGTA	2	10	21498	21507	40 %	20 %	20 %	20 %	471332258
7	NC_020518	GCGCT	2	10	23299	23308	0 %	20 %	40 %	40 %	471332260
8	NC_020518	CGATG	2	10	26352	26361	20 %	20 %	40 %	20 %	471332262
9	NC_020518	GCGAA	2	10	27293	27302	40 %	0 %	40 %	20 %	471332262
10	NC_020518	CCGTT	2	10	28187	28196	0 %	40 %	20 %	40 %	471332262
11	NC_020518	CACGG	2	10	28564	28573	20 %	0 %	40 %	40 %	471332262
12	NC_020518	CGAAT	2	10	31274	31283	40 %	20 %	20 %	20 %	471332266
13	NC_020518	CCATG	2	10	32812	32821	20 %	20 %	20 %	40 %	471332267
14	NC_020518	TTCAG	2	10	32994	33003	20 %	40 %	20 %	20 %	471332267
15	NC_020518	CCGTA	2	10	34458	34467	20 %	20 %	20 %	40 %	471332268
16	NC_020518	TTAAA	2	10	35196	35205	60 %	40 %	0 %	0 %	471332268
17	NC_020518	ACCCA	2	10	35939	35948	40 %	0 %	0 %	60 %	471332269
18	NC_020518	TGATC	2	10	37566	37575	20 %	40 %	20 %	20 %	471332270
19	NC_020518	CGGCG	2	10	37815	37824	0 %	0 %	60 %	40 %	471332270
20	NC_020518	AATCA	2	10	38097	38106	60 %	20 %	0 %	20 %	471332271
21	NC_020518	CGGTT	2	10	39052	39061	0 %	40 %	40 %	20 %	471332272
22	NC_020518	TGGCG	2	10	40742	40751	0 %	20 %	60 %	20 %	471332274
23	NC_020518	TGCAC	2	10	42504	42513	20 %	20 %	20 %	40 %	471332275
24	NC_020518	AGGGC	2	10	43589	43598	20 %	0 %	60 %	20 %	471332276
25	NC_020518	GGCGC	2	10	43623	43632	0 %	0 %	60 %	40 %	471332276
26	NC_020518	GAAAC	2	10	44436	44445	60 %	0 %	20 %	20 %	471332276
27	NC_020518	AACGT	2	10	46348	46357	40 %	20 %	20 %	20 %	471332279
28	NC_020518	GCGTC	2	10	49332	49341	0 %	20 %	40 %	40 %	471332282
29	NC_020518	ATGTT	2	10	50146	50155	20 %	60 %	20 %	0 %	471332283
30	NC_020518	CTTCG	2	10	50579	50588	0 %	40 %	20 %	40 %	471332283
31	NC_020518	TGCGT	2	10	50865	50874	0 %	40 %	40 %	20 %	471332283
32	NC_020518	AAAGT	2	10	57990	57999	60 %	20 %	20 %	0 %	471332288
33	NC_020518	GGTGA	2	10	60238	60247	20 %	20 %	60 %	0 %	471332289
34	NC_020518	CAGCG	2	10	61691	61700	20 %	0 %	40 %	40 %	471332291
35	NC_020518	TCGCG	2	10	62961	62970	0 %	20 %	40 %	40 %	471332291
36	NC_020518	GCTGA	2	10	63340	63349	20 %	20 %	40 %	20 %	471332292
37	NC_020518	GATGG	2	10	71327	71336	20 %	20 %	60 %	0 %	471332298
38	NC_020518	CTGGA	2	10	73227	73236	20 %	20 %	40 %	20 %	471332299
39	NC_020518	CTGGT	2	10	76520	76529	0 %	40 %	40 %	20 %	471332302
40	NC_020518	GACCG	2	10	77068	77077	20 %	0 %	40 %	40 %	471332303
41	NC_020518	ATGTT	2	10	79617	79626	20 %	60 %	20 %	0 %	471332305
42	NC_020518	AAAAC	2	10	80032	80041	80 %	0 %	0 %	20 %	471332305
43	NC_020518	ATTCC	2	10	80729	80738	20 %	40 %	0 %	40 %	471332306
44	NC_020518	AGTTC	2	10	85822	85831	20 %	40 %	20 %	20 %	471332310
45	NC_020518	CGTGG	2	10	87195	87204	0 %	20 %	60 %	20 %	471332312
46	NC_020518	TATCG	2	10	87702	87711	20 %	40 %	20 %	20 %	471332312
47	NC_020518	GCCTG	2	10	92034	92043	0 %	20 %	40 %	40 %	471332316
48	NC_020518	ACCGT	2	10	93947	93956	20 %	20 %	20 %	40 %	471332317
49	NC_020518	ATCAG	2	10	95720	95729	40 %	20 %	20 %	20 %	471332319
50	NC_020518	AGCCG	2	10	97488	97497	20 %	0 %	40 %	40 %	471332320
51	NC_020518	GCGCA	2	10	99816	99825	20 %	0 %	40 %	40 %	471332322
52	NC_020518	TGGCG	2	10	100810	100819	0 %	20 %	60 %	20 %	471332323
53	NC_020518	CCGGC	2	10	103780	103789	0 %	0 %	40 %	60 %	471332326
54	NC_020518	CGCGG	2	10	107105	107114	0 %	0 %	60 %	40 %	471332329
55	NC_020518	ATCCC	2	10	109349	109358	20 %	20 %	0 %	60 %	471332332
56	NC_020518	CATCG	2	10	109362	109371	20 %	20 %	20 %	40 %	471332332
57	NC_020518	TAACG	2	10	110056	110065	40 %	20 %	20 %	20 %	471332332
58	NC_020518	ATGCC	2	10	110515	110524	20 %	20 %	20 %	40 %	471332332
59	NC_020518	AATGC	2	10	111798	111807	40 %	20 %	20 %	20 %	471332333
60	NC_020518	TCTGT	2	10	112744	112753	0 %	60 %	20 %	20 %	471332335
61	NC_020518	GCATG	2	10	113837	113846	20 %	20 %	40 %	20 %	471332336
62	NC_020518	AGCAG	2	10	115175	115184	40 %	0 %	40 %	20 %	471332338
63	NC_020518	TCAGC	2	10	116043	116052	20 %	20 %	20 %	40 %	471332338
64	NC_020518	CGAAG	2	10	117090	117099	40 %	0 %	40 %	20 %	471332339
65	NC_020518	ACACG	2	10	117223	117232	40 %	0 %	20 %	40 %	471332339
66	NC_020518	TCGCG	2	10	117484	117493	0 %	20 %	40 %	40 %	471332339
67	NC_020518	GCATC	2	10	117574	117583	20 %	20 %	20 %	40 %	471332339
68	NC_020518	GACTG	2	10	118892	118901	20 %	20 %	40 %	20 %	471332340
69	NC_020518	AGAGC	2	10	119302	119311	40 %	0 %	40 %	20 %	471332340
70	NC_020518	AGGCG	2	10	124574	124583	20 %	0 %	60 %	20 %	471332343
71	NC_020518	AGGCG	2	10	124670	124679	20 %	0 %	60 %	20 %	471332343
72	NC_020518	GGTTG	2	10	125327	125336	0 %	40 %	60 %	0 %	471332343
73	NC_020518	TCTGG	2	10	127973	127982	0 %	40 %	40 %	20 %	471332344
74	NC_020518	GGGCA	2	10	129385	129394	20 %	0 %	60 %	20 %	471332345
75	NC_020518	CAGCG	2	10	129664	129673	20 %	0 %	40 %	40 %	471332346
76	NC_020518	GCGCG	2	10	135858	135867	0 %	0 %	60 %	40 %	471332350
77	NC_020518	CCGTC	2	10	136649	136658	0 %	20 %	20 %	60 %	471332351
78	NC_020518	GTGAA	2	10	136659	136668	40 %	20 %	40 %	0 %	471332351
79	NC_020518	GTTCA	2	10	137046	137055	20 %	40 %	20 %	20 %	471332352
80	NC_020518	ATCCA	2	10	137372	137381	40 %	20 %	0 %	40 %	471332352
81	NC_020518	CTTTA	2	10	138635	138644	20 %	60 %	0 %	20 %	471332354
82	NC_020518	TGGCG	2	10	138862	138871	0 %	20 %	60 %	20 %	471332354
83	NC_020518	TTTCA	2	10	141175	141184	20 %	60 %	0 %	20 %	471332357
84	NC_020518	GGGAG	2	10	142500	142509	20 %	0 %	80 %	0 %	471332358
85	NC_020518	GAAAA	2	10	145294	145303	80 %	0 %	20 %	0 %	471332361
86	NC_020518	CAGAC	2	10	145370	145379	40 %	0 %	20 %	40 %	471332361
87	NC_020518	TTTGC	2	10	151440	151449	0 %	60 %	20 %	20 %	471332367
88	NC_020518	GCGAG	2	10	153248	153257	20 %	0 %	60 %	20 %	471332369
89	NC_020518	GGCGT	2	10	153686	153695	0 %	20 %	60 %	20 %	471332369
90	NC_020518	ATCAG	2	10	154324	154333	40 %	20 %	20 %	20 %	471332370
91	NC_020518	ACCAC	2	10	156589	156598	40 %	0 %	0 %	60 %	471332373
92	NC_020518	GGCGT	2	10	158292	158301	0 %	20 %	60 %	20 %	471332374
93	NC_020518	CGACG	2	10	159331	159340	20 %	0 %	40 %	40 %	471332374
94	NC_020518	CTGCG	2	10	161467	161476	0 %	20 %	40 %	40 %	471332375
95	NC_020518	GGTCC	2	10	166666	166675	0 %	20 %	40 %	40 %	471332380
96	NC_020518	ACGGG	2	10	168583	168592	20 %	0 %	60 %	20 %	471332382
97	NC_020518	GTGAT	2	10	170742	170751	20 %	40 %	40 %	0 %	471332383
98	NC_020518	GTGAT	2	10	171033	171042	20 %	40 %	40 %	0 %	471332383
99	NC_020518	CCACG	2	10	173180	173189	20 %	0 %	20 %	60 %	471332386
100	NC_020518	GCCAG	2	10	175465	175474	20 %	0 %	40 %	40 %	471332388
101	NC_020518	GTTCT	2	10	176906	176915	0 %	60 %	20 %	20 %	471332388
102	NC_020518	CTGAA	2	10	178898	178907	40 %	20 %	20 %	20 %	471332390
103	NC_020518	AAGCG	2	10	178962	178971	40 %	0 %	40 %	20 %	471332390
104	NC_020518	TGGTG	2	10	180868	180877	0 %	40 %	60 %	0 %	471332392
105	NC_020518	TGCAC	2	10	180994	181003	20 %	20 %	20 %	40 %	471332392
106	NC_020518	TGCGC	2	10	181387	181396	0 %	20 %	40 %	40 %	471332392
107	NC_020518	CATGG	2	10	183230	183239	20 %	20 %	40 %	20 %	471332394
108	NC_020518	CAGAT	2	10	184269	184278	40 %	20 %	20 %	20 %	471332395
109	NC_020518	ACTTT	2	10	184402	184411	20 %	60 %	0 %	20 %	471332395
110	NC_020518	GACGT	2	10	188322	188331	20 %	20 %	40 %	20 %	471332398
111	NC_020518	CGACG	2	10	190149	190158	20 %	0 %	40 %	40 %	471332400
112	NC_020518	ATGCC	2	10	192717	192726	20 %	20 %	20 %	40 %	471332403
113	NC_020518	GGATG	2	10	192979	192988	20 %	20 %	60 %	0 %	471332403
114	NC_020518	TGGCC	2	10	194043	194052	0 %	20 %	40 %	40 %	471332405
115	NC_020518	GTAAC	2	10	194786	194795	40 %	20 %	20 %	20 %	471332405
116	NC_020518	AGCCG	2	10	195414	195423	20 %	0 %	40 %	40 %	471332405
117	NC_020518	GGTGG	2	10	195523	195532	0 %	20 %	80 %	0 %	471332405
118	NC_020518	ACGGT	2	10	206579	206588	20 %	20 %	40 %	20 %	471332416
119	NC_020518	TGATT	2	10	209421	209430	20 %	60 %	20 %	0 %	471332419
120	NC_020518	TAATT	2	10	221216	221225	40 %	60 %	0 %	0 %	471332426
121	NC_020518	CGCGG	2	10	225199	225208	0 %	0 %	60 %	40 %	471332431
122	NC_020518	CAAAA	2	10	241174	241183	80 %	0 %	0 %	20 %	471332447
123	NC_020518	AATGG	2	10	242328	242337	40 %	20 %	40 %	0 %	471332449
124	NC_020518	GATGC	2	10	245998	246007	20 %	20 %	40 %	20 %	471332453
125	NC_020518	TCGCG	2	10	246183	246192	0 %	20 %	40 %	40 %	471332453
126	NC_020518	GTGAT	2	10	249201	249210	20 %	40 %	40 %	0 %	471332456
127	NC_020518	AGCGA	2	10	249763	249772	40 %	0 %	40 %	20 %	471332457
128	NC_020518	TCGCT	2	10	249974	249983	0 %	40 %	20 %	40 %	471332457
129	NC_020518	GCAGG	2	10	252482	252491	20 %	0 %	60 %	20 %	471332458
130	NC_020518	ACCGC	2	10	257191	257200	20 %	0 %	20 %	60 %	471332461
131	NC_020518	TTATT	2	10	262673	262682	20 %	80 %	0 %	0 %	471332466
132	NC_020518	ATGGC	2	10	262919	262928	20 %	20 %	40 %	20 %	471332466
133	NC_020518	CGGCG	2	10	263497	263506	0 %	0 %	60 %	40 %	471332467
134	NC_020518	GGGCA	2	10	264631	264640	20 %	0 %	60 %	20 %	471332468
135	NC_020518	CCGGC	2	10	265505	265514	0 %	0 %	40 %	60 %	471332468
136	NC_020518	TCGCC	2	10	266847	266856	0 %	20 %	20 %	60 %	471332470
137	NC_020518	GCGAA	2	10	267435	267444	40 %	0 %	40 %	20 %	471332471
138	NC_020518	TGGCG	2	10	267520	267529	0 %	20 %	60 %	20 %	471332471
139	NC_020518	GGCCG	2	10	269585	269594	0 %	0 %	60 %	40 %	471332472
140	NC_020518	CACGG	2	10	272916	272925	20 %	0 %	40 %	40 %	471332476
141	NC_020518	GTGGC	2	10	275010	275019	0 %	20 %	60 %	20 %	471332478
142	NC_020518	GTGGC	2	10	279570	279579	0 %	20 %	60 %	20 %	471332481
143	NC_020518	TGATG	2	10	281878	281887	20 %	40 %	40 %	0 %	471332482
144	NC_020518	TGCGC	2	10	283520	283529	0 %	20 %	40 %	40 %	471332483
145	NC_020518	AATTC	2	10	289656	289665	40 %	40 %	0 %	20 %	471332490
146	NC_020518	CGCAG	2	10	289674	289683	20 %	0 %	40 %	40 %	471332490
147	NC_020518	AGACC	2	10	290670	290679	40 %	0 %	20 %	40 %	471332490
148	NC_020518	TGACC	2	10	291393	291402	20 %	20 %	20 %	40 %	471332490
149	NC_020518	TTTTC	2	10	292719	292728	0 %	80 %	0 %	20 %	471332491
150	NC_020518	TACGT	2	10	295903	295912	20 %	40 %	20 %	20 %	471332493
151	NC_020518	GCGAA	2	10	296022	296031	40 %	0 %	40 %	20 %	471332493
152	NC_020518	GCGCA	2	10	299942	299951	20 %	0 %	40 %	40 %	471332497
153	NC_020518	TGGCG	2	10	300668	300677	0 %	20 %	60 %	20 %	471332498
154	NC_020518	GTTTG	2	10	301914	301923	0 %	60 %	40 %	0 %	471332499
155	NC_020518	GGCGC	2	10	302098	302107	0 %	0 %	60 %	40 %	471332499
156	NC_020518	CTTAC	2	10	302970	302979	20 %	40 %	0 %	40 %	471332500
157	NC_020518	TGTGT	2	10	305218	305227	0 %	60 %	40 %	0 %	471332502
158	NC_020518	GCACA	2	10	306977	306986	40 %	0 %	20 %	40 %	471332504
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160	NC_020518	CGCTG	2	10	310023	310032	0 %	20 %	40 %	40 %	471332507
161	NC_020518	CAACA	2	10	311274	311283	60 %	0 %	0 %	40 %	471332508
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165	NC_020518	TCTTT	2	10	322077	322086	0 %	80 %	0 %	20 %	471332520
166	NC_020518	CGTCG	2	10	329702	329711	0 %	20 %	40 %	40 %	471332525
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168	NC_020518	CAAAG	2	10	330303	330312	60 %	0 %	20 %	20 %	471332526
169	NC_020518	TGGCT	2	10	331134	331143	0 %	40 %	40 %	20 %	471332526
170	NC_020518	CCTGG	2	10	331675	331684	0 %	20 %	40 %	40 %	471332526
171	NC_020518	TGGCG	2	10	336112	336121	0 %	20 %	60 %	20 %	471332531
172	NC_020518	CTTGC	2	10	336756	336765	0 %	40 %	20 %	40 %	471332531
173	NC_020518	TGACC	2	10	337832	337841	20 %	20 %	20 %	40 %	471332532
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176	NC_020518	CTCGT	2	10	340791	340800	0 %	40 %	20 %	40 %	471332536
177	NC_020518	GCGCT	2	10	344136	344145	0 %	20 %	40 %	40 %	471332540
178	NC_020518	AAGGC	2	10	348189	348198	40 %	0 %	40 %	20 %	471332544
179	NC_020518	TGCCG	2	10	351828	351837	0 %	20 %	40 %	40 %	471332548
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181	NC_020518	CACAA	2	10	353523	353532	60 %	0 %	0 %	40 %	471332550
182	NC_020518	GGGCA	2	10	353702	353711	20 %	0 %	60 %	20 %	471332550
183	NC_020518	GTGAT	2	10	354820	354829	20 %	40 %	40 %	0 %	471332551
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185	NC_020518	TCGAT	2	10	365015	365024	20 %	40 %	20 %	20 %	471332560
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187	NC_020518	CGCAG	2	10	373621	373630	20 %	0 %	40 %	40 %	471332568
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189	NC_020518	CGACC	2	10	377345	377354	20 %	0 %	20 %	60 %	471332571
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191	NC_020518	TGCTG	2	10	383316	383325	0 %	40 %	40 %	20 %	471332576
192	NC_020518	TCCGG	2	10	383819	383828	0 %	20 %	40 %	40 %	471332577
193	NC_020518	CCGCA	2	10	389240	389249	20 %	0 %	20 %	60 %	471332584
194	NC_020518	TGACA	2	10	389822	389831	40 %	20 %	20 %	20 %	471332584
195	NC_020518	TTAAG	2	10	392164	392173	40 %	40 %	20 %	0 %	471332585
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197	NC_020518	CGCTG	2	10	401166	401175	0 %	20 %	40 %	40 %	471332592
198	NC_020518	TTGAT	2	10	407253	407262	20 %	60 %	20 %	0 %	471332598
199	NC_020518	AAATA	2	10	407448	407457	80 %	20 %	0 %	0 %	471332598
200	NC_020518	CTTCT	2	10	409752	409761	0 %	60 %	0 %	40 %	471332600
201	NC_020518	CCAGC	2	10	410646	410655	20 %	0 %	20 %	60 %	471332600
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229	NC_020518	TATTT	2	10	459463	459472	20 %	80 %	0 %	0 %	471332646
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236	NC_020518	CGGCG	2	10	471841	471850	0 %	0 %	60 %	40 %	471332654
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244	NC_020518	CGCCA	2	10	485635	485644	20 %	0 %	20 %	60 %	471332663
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249	NC_020518	TGTTT	2	10	490875	490884	0 %	80 %	20 %	0 %	471332666
250	NC_020518	TAATC	2	10	491859	491868	40 %	40 %	0 %	20 %	471332667
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252	NC_020518	GGCGC	2	10	496902	496911	0 %	0 %	60 %	40 %	471332671
253	NC_020518	ATTTG	2	10	497462	497471	20 %	60 %	20 %	0 %	471332672
254	NC_020518	CATTC	2	10	499591	499600	20 %	40 %	0 %	40 %	471332674
255	NC_020518	TGAAC	2	10	499915	499924	40 %	20 %	20 %	20 %	471332674
256	NC_020518	GATCT	2	10	500828	500837	20 %	40 %	20 %	20 %	471332674
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259	NC_020518	GCGGG	2	10	502429	502438	0 %	0 %	80 %	20 %	471332676
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261	NC_020518	GTTTG	2	10	506837	506846	0 %	60 %	40 %	0 %	471332680
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