MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 9537

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020518	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020518	CAGG	2	8	420	427	25 %	0 %	50 %	25 %	471332238
3	NC_020518	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	471332238
4	NC_020518	GCTG	2	8	975	982	0 %	25 %	50 %	25 %	471332238
5	NC_020518	GGAC	2	8	1013	1020	25 %	0 %	50 %	25 %	471332238
6	NC_020518	GCTG	2	8	1802	1809	0 %	25 %	50 %	25 %	471332238
7	NC_020518	CCAG	2	8	2003	2010	25 %	0 %	25 %	50 %	471332238
8	NC_020518	TTCT	2	8	2240	2247	0 %	75 %	0 %	25 %	471332238
9	NC_020518	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	471332239
10	NC_020518	CAGC	2	8	3283	3290	25 %	0 %	25 %	50 %	471332239
11	NC_020518	TTCA	2	8	3428	3435	25 %	50 %	0 %	25 %	471332239
12	NC_020518	AGCG	2	8	3565	3572	25 %	0 %	50 %	25 %	471332239
13	NC_020518	CTGA	2	8	3851	3858	25 %	25 %	25 %	25 %	471332240
14	NC_020518	CAGT	2	8	5766	5773	25 %	25 %	25 %	25 %	471332242
15	NC_020518	GCGG	2	8	6099	6106	0 %	0 %	75 %	25 %	471332242
16	NC_020518	AGCG	2	8	6270	6277	25 %	0 %	50 %	25 %	471332242
17	NC_020518	GCCA	2	8	7227	7234	25 %	0 %	25 %	50 %	471332243
18	NC_020518	GCAT	2	8	7956	7963	25 %	25 %	25 %	25 %	471332243
19	NC_020518	GGCG	2	8	8087	8094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020518	CAAC	2	8	8335	8342	50 %	0 %	0 %	50 %	471332244
21	NC_020518	TTGA	2	8	8388	8395	25 %	50 %	25 %	0 %	471332244
22	NC_020518	CGAC	2	8	8455	8462	25 %	0 %	25 %	50 %	471332244
23	NC_020518	AAGA	2	8	8811	8818	75 %	0 %	25 %	0 %	471332244
24	NC_020518	CTGT	2	8	9240	9247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020518	AGAT	2	8	9995	10002	50 %	25 %	25 %	0 %	471332246
26	NC_020518	AGAA	2	8	10269	10276	75 %	0 %	25 %	0 %	471332246
27	NC_020518	GAAT	2	8	10516	10523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020518	GCAG	2	8	10672	10679	25 %	0 %	50 %	25 %	471332247
29	NC_020518	CATT	2	8	11350	11357	25 %	50 %	0 %	25 %	471332247
30	NC_020518	CAGT	2	8	11497	11504	25 %	25 %	25 %	25 %	471332249
31	NC_020518	ATTC	2	8	11912	11919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020518	AGTG	2	8	12054	12061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020518	ATGG	2	8	12217	12224	25 %	25 %	50 %	0 %	471332250
34	NC_020518	ACCG	2	8	12675	12682	25 %	0 %	25 %	50 %	471332250
35	NC_020518	CAAC	2	8	12821	12828	50 %	0 %	0 %	50 %	471332250
36	NC_020518	AAGA	2	8	12895	12902	75 %	0 %	25 %	0 %	471332250
37	NC_020518	CCAT	2	8	13472	13479	25 %	25 %	0 %	50 %	471332250
38	NC_020518	CATA	2	8	16249	16256	50 %	25 %	0 %	25 %	471332254
39	NC_020518	TGCG	2	8	16505	16512	0 %	25 %	50 %	25 %	471332254
40	NC_020518	CCGC	2	8	17136	17143	0 %	0 %	25 %	75 %	471332254
41	NC_020518	CTGG	2	8	17493	17500	0 %	25 %	50 %	25 %	471332255
42	NC_020518	CTGC	2	8	17954	17961	0 %	25 %	25 %	50 %	471332255
43	NC_020518	TGCG	2	8	18504	18511	0 %	25 %	50 %	25 %	471332255
44	NC_020518	GTGG	2	8	19709	19716	0 %	25 %	75 %	0 %	471332255
45	NC_020518	GCTG	2	8	20063	20070	0 %	25 %	50 %	25 %	471332256
46	NC_020518	ATGG	2	8	20960	20967	25 %	25 %	50 %	0 %	471332257
47	NC_020518	TTGA	2	8	21831	21838	25 %	50 %	25 %	0 %	471332258
48	NC_020518	TGGC	2	8	22374	22381	0 %	25 %	50 %	25 %	471332259
49	NC_020518	CTGG	2	8	22834	22841	0 %	25 %	50 %	25 %	471332259
50	NC_020518	AGCC	2	8	22947	22954	25 %	0 %	25 %	50 %	471332259
51	NC_020518	TCAT	2	8	23058	23065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020518	TCCC	2	8	23088	23095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_020518	TGGC	2	8	23129	23136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020518	CGTG	2	8	23828	23835	0 %	25 %	50 %	25 %	471332260
55	NC_020518	CATG	2	8	24298	24305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020518	AGTG	2	8	24448	24455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020518	TCCT	2	8	24610	24617	0 %	50 %	0 %	50 %	471332261
58	NC_020518	CTTA	2	8	24638	24645	25 %	50 %	0 %	25 %	471332261
59	NC_020518	AGCC	2	8	25540	25547	25 %	0 %	25 %	50 %	471332261
60	NC_020518	GACC	2	8	25806	25813	25 %	0 %	25 %	50 %	471332262
61	NC_020518	TGAT	2	8	26255	26262	25 %	50 %	25 %	0 %	471332262
62	NC_020518	CGCA	2	8	26806	26813	25 %	0 %	25 %	50 %	471332262
63	NC_020518	CTGT	2	8	26980	26987	0 %	50 %	25 %	25 %	471332262
64	NC_020518	GGCG	2	8	27156	27163	0 %	0 %	75 %	25 %	471332262
65	NC_020518	ACCG	2	8	27310	27317	25 %	0 %	25 %	50 %	471332262
66	NC_020518	CGTC	2	8	27784	27791	0 %	25 %	25 %	50 %	471332262
67	NC_020518	GGCG	2	8	27993	28000	0 %	0 %	75 %	25 %	471332262
68	NC_020518	TGGC	2	8	28247	28254	0 %	25 %	50 %	25 %	471332262
69	NC_020518	GCTG	2	8	28260	28267	0 %	25 %	50 %	25 %	471332262
70	NC_020518	GCAC	2	8	28845	28852	25 %	0 %	25 %	50 %	471332262
71	NC_020518	GGTG	2	8	29192	29199	0 %	25 %	75 %	0 %	471332263
72	NC_020518	AAGA	2	8	29427	29434	75 %	0 %	25 %	0 %	471332263
73	NC_020518	CCAT	2	8	29880	29887	25 %	25 %	0 %	50 %	471332264
74	NC_020518	ATTT	2	8	31094	31101	25 %	75 %	0 %	0 %	471332265
75	NC_020518	TTCT	2	8	31106	31113	0 %	75 %	0 %	25 %	471332266
76	NC_020518	TTCA	2	8	31237	31244	25 %	50 %	0 %	25 %	471332266
77	NC_020518	CAGC	2	8	31450	31457	25 %	0 %	25 %	50 %	471332266
78	NC_020518	TCGG	2	8	32085	32092	0 %	25 %	50 %	25 %	471332266
79	NC_020518	GGCG	2	8	32364	32371	0 %	0 %	75 %	25 %	471332266
80	NC_020518	GGGC	2	8	32683	32690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_020518	CCAT	2	8	32898	32905	25 %	25 %	0 %	50 %	471332267
82	NC_020518	TGAT	2	8	32920	32927	25 %	50 %	25 %	0 %	471332267
83	NC_020518	GCCA	2	8	33039	33046	25 %	0 %	25 %	50 %	471332267
84	NC_020518	AGGC	2	8	33451	33458	25 %	0 %	50 %	25 %	471332267
85	NC_020518	CCGA	2	8	34537	34544	25 %	0 %	25 %	50 %	471332268
86	NC_020518	CCCG	2	8	34933	34940	0 %	0 %	25 %	75 %	471332268
87	NC_020518	TCCA	2	8	34985	34992	25 %	25 %	0 %	50 %	471332268
88	NC_020518	TTAA	2	8	35238	35245	50 %	50 %	0 %	0 %	471332269
89	NC_020518	TATC	2	8	35631	35638	25 %	50 %	0 %	25 %	471332269
90	NC_020518	CACC	2	8	35782	35789	25 %	0 %	0 %	75 %	471332269
91	NC_020518	AGCC	2	8	36349	36356	25 %	0 %	25 %	50 %	471332269
92	NC_020518	CCAG	2	8	36549	36556	25 %	0 %	25 %	50 %	471332269
93	NC_020518	AACC	2	8	36557	36564	50 %	0 %	0 %	50 %	471332269
94	NC_020518	ATTT	2	8	36783	36790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020518	GTTT	2	8	36800	36807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020518	GTGC	2	8	37251	37258	0 %	25 %	50 %	25 %	471332270
97	NC_020518	TGAT	2	8	37487	37494	25 %	50 %	25 %	0 %	471332270
98	NC_020518	CTGC	2	8	37747	37754	0 %	25 %	25 %	50 %	471332270
99	NC_020518	GTCG	2	8	38613	38620	0 %	25 %	50 %	25 %	471332271
100	NC_020518	ATGG	2	8	38720	38727	25 %	25 %	50 %	0 %	471332271
101	NC_020518	GTTA	2	8	39097	39104	25 %	50 %	25 %	0 %	471332272
102	NC_020518	CACC	2	8	39648	39655	25 %	0 %	0 %	75 %	471332272
103	NC_020518	GTTG	2	8	39877	39884	0 %	50 %	50 %	0 %	471332272
104	NC_020518	ATTG	2	8	39895	39902	25 %	50 %	25 %	0 %	471332272
105	NC_020518	GGTG	2	8	40153	40160	0 %	25 %	75 %	0 %	471332272
106	NC_020518	TGTT	2	8	40933	40940	0 %	75 %	25 %	0 %	471332274
107	NC_020518	TGTT	2	8	41178	41185	0 %	75 %	25 %	0 %	471332274
108	NC_020518	TGTT	2	8	41368	41375	0 %	75 %	25 %	0 %	471332274
109	NC_020518	CTGG	2	8	41633	41640	0 %	25 %	50 %	25 %	471332274
110	NC_020518	TGCG	2	8	42838	42845	0 %	25 %	50 %	25 %	471332276
111	NC_020518	ATGA	2	8	42993	43000	50 %	25 %	25 %	0 %	471332276
112	NC_020518	GGCG	2	8	43334	43341	0 %	0 %	75 %	25 %	471332276
113	NC_020518	GGAT	2	8	43948	43955	25 %	25 %	50 %	0 %	471332276
114	NC_020518	AACC	2	8	44018	44025	50 %	0 %	0 %	50 %	471332276
115	NC_020518	CAGG	2	8	44115	44122	25 %	0 %	50 %	25 %	471332276
116	NC_020518	TGGC	2	8	44381	44388	0 %	25 %	50 %	25 %	471332276
117	NC_020518	TGTT	2	8	44491	44498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020518	CCTG	2	8	44716	44723	0 %	25 %	25 %	50 %	471332277
119	NC_020518	TAAA	2	8	44754	44761	75 %	25 %	0 %	0 %	471332277
120	NC_020518	AATC	2	8	44790	44797	50 %	25 %	0 %	25 %	471332277
121	NC_020518	GCAG	2	8	45279	45286	25 %	0 %	50 %	25 %	471332278
122	NC_020518	AAGA	2	8	45592	45599	75 %	0 %	25 %	0 %	471332278
123	NC_020518	AATG	2	8	46056	46063	50 %	25 %	25 %	0 %	471332279
124	NC_020518	GGCA	2	8	47504	47511	25 %	0 %	50 %	25 %	471332281
125	NC_020518	GTCA	2	8	48628	48635	25 %	25 %	25 %	25 %	471332282
126	NC_020518	GCTT	2	8	49797	49804	0 %	50 %	25 %	25 %	471332283
127	NC_020518	ACCT	2	8	49877	49884	25 %	25 %	0 %	50 %	471332283
128	NC_020518	AGTA	2	8	50095	50102	50 %	25 %	25 %	0 %	471332283
129	NC_020518	CACC	2	8	51271	51278	25 %	0 %	0 %	75 %	471332283
130	NC_020518	CTAC	2	8	51381	51388	25 %	25 %	0 %	50 %	471332283
131	NC_020518	GTAC	2	8	51627	51634	25 %	25 %	25 %	25 %	471332283
132	NC_020518	GCCA	2	8	52426	52433	25 %	0 %	25 %	50 %	471332284
133	NC_020518	GAAT	2	8	52445	52452	50 %	25 %	25 %	0 %	471332284
134	NC_020518	TATT	2	8	53246	53253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020518	GATG	2	8	54858	54865	25 %	25 %	50 %	0 %	471332287
136	NC_020518	CTGC	2	8	55000	55007	0 %	25 %	25 %	50 %	471332287
137	NC_020518	AACC	2	8	55127	55134	50 %	0 %	0 %	50 %	471332287
138	NC_020518	CCTG	2	8	55229	55236	0 %	25 %	25 %	50 %	471332288
139	NC_020518	ATCA	2	8	55378	55385	50 %	25 %	0 %	25 %	471332288
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141	NC_020518	TGAT	2	8	55901	55908	25 %	50 %	25 %	0 %	471332288
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