MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 1354

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020518	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020518	GGCG	2	8	8087	8094	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020518	CTGT	2	8	9240	9247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020518	GAAT	2	8	10516	10523	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020518	ATTC	2	8	11912	11919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020518	AGTG	2	8	12054	12061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020518	TCAT	2	8	23058	23065	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020518	TCCC	2	8	23088	23095	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_020518	TGGC	2	8	23129	23136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020518	CATG	2	8	24298	24305	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020518	AGTG	2	8	24448	24455	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020518	GGGC	2	8	32683	32690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020518	ATTT	2	8	36783	36790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020518	GTTT	2	8	36800	36807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020518	TGTT	2	8	44491	44498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020518	TATT	2	8	53246	53253	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020518	TCCA	2	8	64882	64889	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020518	ATTA	2	8	78902	78909	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020518	ATTA	2	8	80236	80243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020518	AGGC	2	8	80446	80453	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020518	CCCG	2	8	83979	83986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_020518	TTAA	2	8	83987	83994	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020518	AACA	2	8	84083	84090	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020518	TTGG	2	8	112392	112399	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020518	CCGC	2	8	112543	112550	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_020518	GAAT	2	8	116617	116624	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020518	TCAA	2	8	116808	116815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020518	GATA	2	8	117823	117830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020518	CGGC	2	8	122431	122438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020518	TAAG	2	8	122642	122649	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020518	GCGA	2	8	131785	131792	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020518	AATT	2	8	136089	136096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020518	GAAT	2	8	136154	136161	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020518	TTAA	2	8	151045	151052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020518	ATTC	2	8	151094	151101	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020518	ATTT	2	8	151961	151968	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020518	ATAA	2	8	152069	152076	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020518	TTAC	2	8	155595	155602	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020518	GGTT	2	8	159360	159367	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020518	CTTT	2	8	162160	162167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020518	GAGC	2	8	179554	179561	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020518	GAAA	2	8	180707	180714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020518	ATAA	2	8	181454	181461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020518	AGTT	2	8	186761	186768	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020518	AAGG	2	8	198514	198521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020518	AAAC	2	8	204856	204863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020518	ATCA	2	8	211607	211614	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020518	GCTT	2	8	212713	212720	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020518	CCGG	2	8	213767	213774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020518	GTAG	2	8	214066	214073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020518	TAAA	2	8	214450	214457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020518	CTGA	2	8	215056	215063	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020518	GTAC	2	8	215140	215147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020518	CGTC	2	8	215581	215588	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020518	AAAG	2	8	215704	215711	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020518	GCTG	2	8	216383	216390	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020518	CCTG	2	8	217817	217824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020518	CCGT	2	8	217852	217859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_020518	ATTT	2	8	219780	219787	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020518	CCTG	2	8	225820	225827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020518	CCGT	2	8	225855	225862	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020518	TCAT	2	8	226002	226009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020518	AATG	2	8	226079	226086	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020518	TGTT	2	8	226105	226112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020518	TGTT	2	8	227098	227105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020518	GTAA	2	8	227381	227388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020518	GAAA	2	8	227564	227571	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020518	AATC	2	8	233139	233146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020518	TATT	2	8	235386	235393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020518	CGAA	2	8	237545	237552	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_020518	ACTG	2	8	238065	238072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020518	TAAA	2	8	239013	239020	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020518	CTCG	2	8	239335	239342	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020518	CGCC	2	8	242046	242053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_020518	TAAG	2	8	242263	242270	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020518	GAAC	2	8	242281	242288	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020518	AGTA	2	8	245364	245371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020518	CGTT	2	8	248429	248436	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020518	GTAA	2	8	251103	251110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020518	TTGT	2	8	251301	251308	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020518	TGCC	2	8	251456	251463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020518	ATTG	2	8	255569	255576	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020518	GAGC	2	8	258406	258413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020518	AGAT	2	8	260687	260694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020518	TTCA	2	8	268942	268949	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020518	GTTA	2	8	270279	270286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020518	GTTG	2	8	271402	271409	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020518	CTGA	2	8	272599	272606	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020518	GTGG	2	8	272632	272639	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020518	TCAT	2	8	281002	281009	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020518	ATTC	2	8	283788	283795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020518	AGAC	2	8	284969	284976	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020518	ATTG	2	8	288106	288113	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020518	TGAG	2	8	292584	292591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020518	TGCA	2	8	306087	306094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_020518	GCGG	2	8	306241	306248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_020518	CAAA	2	8	309011	309018	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020518	AAGT	2	8	315098	315105	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020518	CAGC	2	8	315859	315866	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_020518	CTTT	2	8	316250	316257	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020518	TATT	2	8	324862	324869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020518	TGGT	2	8	327078	327085	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020518	ACTG	2	8	327176	327183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_020518	CGGG	2	8	339928	339935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020518	GAAG	2	8	342379	342386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020518	ACTT	2	8	345949	345956	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020518	AATG	2	8	349087	349094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020518	GGGC	2	8	359557	359564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020518	TTTA	2	8	359755	359762	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020518	GATG	2	8	362177	362184	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020518	TGAT	2	8	362780	362787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020518	TGGC	2	8	369114	369121	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020518	AACA	2	8	371659	371666	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020518	GGAA	2	8	384243	384250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020518	CCCA	2	8	384298	384305	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
116	NC_020518	GGCT	2	8	386414	386421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020518	AGGA	2	8	388599	388606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020518	GAAT	2	8	388758	388765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020518	TAAC	2	8	388846	388853	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020518	TACA	2	8	393452	393459	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020518	ATGT	2	8	393467	393474	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020518	TTCA	2	8	394269	394276	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_020518	ATTT	2	8	397844	397851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020518	ATTC	2	8	405666	405673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020518	GAAG	2	8	412526	412533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020518	AAGC	2	8	414856	414863	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020518	TGTC	2	8	434282	434289	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020518	AATA	2	8	434349	434356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020518	TCCT	2	8	443566	443573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020518	ATTT	2	8	446920	446927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020518	CTGG	2	8	448877	448884	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020518	GCGT	2	8	448992	448999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_020518	TGCG	2	8	449404	449411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020518	GATG	2	8	449531	449538	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020518	GCAG	2	8	449556	449563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020518	ATTT	2	8	458384	458391	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020518	TAAA	2	8	458606	458613	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020518	GTTT	2	8	465040	465047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020518	AAAT	2	8	465060	465067	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020518	CTGA	2	8	465452	465459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020518	CAGC	2	8	465462	465469	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_020518	ACTT	2	8	476437	476444	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020518	TTAA	2	8	486127	486134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020518	CAAT	2	8	486213	486220	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020518	TTTG	2	8	491607	491614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020518	GGAA	2	8	491668	491675	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020518	ATTA	2	8	495727	495734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020518	CAGC	2	8	498133	498140	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_020518	TTTA	2	8	507013	507020	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020518	AATA	2	8	510190	510197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020518	CTGT	2	8	510215	510222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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485	NC_020518	AGCA	2	8	1460905	1460912	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
486	NC_020518	TGCT	2	8	1471129	1471136	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
487	NC_020518	TTAG	2	8	1476822	1476829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020518	ATAA	2	8	1500138	1500145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

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