MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Escherichia coli str. K-12 substr. MDS42 DNA

Total Repeats: 51268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020518	CAC	2	6	204	209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332237
2	NC_020518	ACC	3	9	214	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332237
3	NC_020518	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332238
4	NC_020518	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332238
5	NC_020518	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
6	NC_020518	CGC	3	9	570	578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332238
7	NC_020518	TCG	2	6	614	619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
8	NC_020518	TTG	2	6	664	669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332238
9	NC_020518	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
10	NC_020518	CCG	2	6	849	854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332238
11	NC_020518	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332238
12	NC_020518	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332238
13	NC_020518	ACT	2	6	959	964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332238
14	NC_020518	CTG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
15	NC_020518	TTG	2	6	999	1004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332238
16	NC_020518	GTT	2	6	1068	1073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332238
17	NC_020518	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332238
18	NC_020518	TGA	2	6	1233	1238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
19	NC_020518	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332238
20	NC_020518	GTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332238
21	NC_020518	ATC	2	6	1389	1394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332238
22	NC_020518	AAG	2	6	1484	1489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332238
23	NC_020518	GGT	2	6	1536	1541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332238
24	NC_020518	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332238
25	NC_020518	GAT	2	6	1672	1677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
26	NC_020518	TCA	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332238
27	NC_020518	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
28	NC_020518	GAA	2	6	1903	1908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332238
29	NC_020518	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332238
30	NC_020518	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332238
31	NC_020518	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
32	NC_020518	TAC	2	6	2098	2103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332238
33	NC_020518	GCG	2	6	2119	2124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332238
34	NC_020518	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
35	NC_020518	TGA	2	6	2222	2227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
36	NC_020518	GAT	2	6	2350	2355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
37	NC_020518	TGC	2	6	2447	2452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332238
38	NC_020518	CGA	2	6	2511	2516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332238
39	NC_020518	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
40	NC_020518	TGA	2	6	2583	2588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332238
41	NC_020518	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332238
42	NC_020518	GCG	2	6	2864	2869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332239
43	NC_020518	GGC	2	6	2917	2922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332239
44	NC_020518	CAA	2	6	2938	2943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332239
45	NC_020518	GGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332239
46	NC_020518	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332239
47	NC_020518	GGT	2	6	3245	3250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332239
48	NC_020518	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332239
49	NC_020518	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332239
50	NC_020518	CAT	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332239
51	NC_020518	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332239
52	NC_020518	CGC	2	6	3386	3391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332239
53	NC_020518	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332239
54	NC_020518	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332239
55	NC_020518	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332240
56	NC_020518	TGA	2	6	3925	3930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332240
57	NC_020518	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332240
58	NC_020518	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332240
59	NC_020518	TGA	3	9	4324	4332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332240
60	NC_020518	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332240
61	NC_020518	CGG	2	6	4494	4499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332240
62	NC_020518	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332240
63	NC_020518	TGC	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332240
64	NC_020518	ACG	2	6	4584	4589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332240
65	NC_020518	AAC	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332240
66	NC_020518	GTT	2	6	4675	4680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332240
67	NC_020518	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332240
68	NC_020518	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332240
69	NC_020518	CCG	2	6	4974	4979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332240
70	NC_020518	TGC	2	6	4984	4989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332240
71	NC_020518	TGA	3	9	5001	5009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332240
72	NC_020518	ATC	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332240
73	NC_020518	GCA	2	6	5291	5296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332241
74	NC_020518	TGG	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332241
75	NC_020518	ACA	2	6	5407	5412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332241
76	NC_020518	CCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332241
77	NC_020518	CCG	2	6	5459	5464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332241
78	NC_020518	CCA	2	6	5467	5472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332241
79	NC_020518	CTC	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471332241
80	NC_020518	ATC	2	6	5490	5495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332241
81	NC_020518	CGG	2	6	5497	5502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332241
82	NC_020518	GCT	2	6	5688	5693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332242
83	NC_020518	GGA	2	6	5725	5730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471332242
84	NC_020518	TCA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332242
85	NC_020518	AAG	2	6	5741	5746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332242
86	NC_020518	AAT	2	6	5800	5805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332242
87	NC_020518	TCA	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332242
88	NC_020518	TGA	2	6	5847	5852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332242
89	NC_020518	TTC	2	6	5867	5872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332242
90	NC_020518	TTC	2	6	5912	5917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332242
91	NC_020518	CAC	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332242
92	NC_020518	TGC	2	6	5977	5982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332242
93	NC_020518	TTG	2	6	5999	6004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332242
94	NC_020518	TGA	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332242
95	NC_020518	CTG	2	6	6361	6366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332242
96	NC_020518	GTG	2	6	6401	6406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332242
97	NC_020518	CAT	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332243
98	NC_020518	GCC	2	6	6760	6765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332243
99	NC_020518	GTT	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332243
100	NC_020518	AGA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332243
101	NC_020518	ATC	2	6	7058	7063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332243
102	NC_020518	CGC	2	6	7102	7107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332243
103	NC_020518	CGC	2	6	7204	7209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332243
104	NC_020518	GCC	2	6	7210	7215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332243
105	NC_020518	CAG	2	6	7387	7392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332243
106	NC_020518	AAT	2	6	7408	7413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332243
107	NC_020518	CGG	2	6	7701	7706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332243
108	NC_020518	CAA	2	6	7880	7885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332243
109	NC_020518	ACC	2	6	8271	8276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332244
110	NC_020518	CAG	2	6	8418	8423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332244
111	NC_020518	CAG	2	6	8439	8444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332244
112	NC_020518	TGC	2	6	8660	8665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332244
113	NC_020518	AAG	2	6	8680	8685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332244
114	NC_020518	CTG	2	6	8706	8711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332244
115	NC_020518	TTG	2	6	8770	8775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332244
116	NC_020518	AGA	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332244
117	NC_020518	TAC	2	6	8871	8876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332244
118	NC_020518	CTG	2	6	8979	8984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332244
119	NC_020518	GCA	2	6	9086	9091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332244
120	NC_020518	CTG	2	6	9183	9188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332244
121	NC_020518	TGA	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332245
122	NC_020518	GCG	2	6	9355	9360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332245
123	NC_020518	GAA	2	6	9390	9395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332245
124	NC_020518	ATC	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332245
125	NC_020518	TGG	2	6	9487	9492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332245
126	NC_020518	CAC	2	6	9518	9523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332245
127	NC_020518	CGT	2	6	9543	9548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332245
128	NC_020518	GCA	2	6	9849	9854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332245
129	NC_020518	GAT	2	6	10045	10050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332246
130	NC_020518	GCG	2	6	10052	10057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332246
131	NC_020518	CAG	2	6	10081	10086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332246
132	NC_020518	GAA	2	6	10150	10155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332246
133	NC_020518	CAG	2	6	10243	10248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332246
134	NC_020518	CAG	2	6	10327	10332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332246
135	NC_020518	GCC	2	6	10354	10359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332246
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139	NC_020518	AAT	2	6	10875	10880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332247
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144	NC_020518	CCA	2	6	11133	11138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332247
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150	NC_020518	GAG	2	6	11700	11705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	471332249
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158	NC_020518	CAT	2	6	12423	12428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332250
159	NC_020518	ATT	2	6	12439	12444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332250
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161	NC_020518	CCG	2	6	12496	12501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332250
162	NC_020518	CTG	2	6	12509	12514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332250
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232	NC_020518	CAT	2	6	17332	17337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332255
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238	NC_020518	ATC	2	6	17729	17734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332255
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247	NC_020518	ATC	2	6	18452	18457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332255
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251	NC_020518	CGA	2	6	18769	18774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332255
252	NC_020518	TGT	2	6	18844	18849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332255
253	NC_020518	CGC	2	6	19050	19055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332255
254	NC_020518	TGA	2	6	19062	19067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332255
255	NC_020518	TGC	2	6	19156	19161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
256	NC_020518	TCG	2	6	19171	19176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
257	NC_020518	CTG	2	6	19199	19204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
258	NC_020518	TGG	2	6	19257	19262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332255
259	NC_020518	CAT	2	6	19402	19407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332255
260	NC_020518	CGT	2	6	19448	19453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
261	NC_020518	TGA	2	6	19528	19533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332255
262	NC_020518	ACG	2	6	19836	19841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332255
263	NC_020518	CTG	2	6	19845	19850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
264	NC_020518	CAG	2	6	19856	19861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332255
265	NC_020518	GCT	2	6	19923	19928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332255
266	NC_020518	TGA	2	6	20030	20035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332255
267	NC_020518	TGG	2	6	20075	20080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332256
268	NC_020518	GCA	2	6	20105	20110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332256
269	NC_020518	TCC	2	6	20120	20125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471332256
270	NC_020518	GCG	2	6	20197	20202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332256
271	NC_020518	GCG	2	6	20222	20227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332256
272	NC_020518	TGA	2	6	20285	20290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332256
273	NC_020518	ATT	2	6	20341	20346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332256
274	NC_020518	GGC	2	6	20347	20352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332256
275	NC_020518	AAT	2	6	20522	20527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332256
276	NC_020518	CGA	2	6	20707	20712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332257
277	NC_020518	CAC	2	6	20716	20721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332257
278	NC_020518	CAA	2	6	20737	20742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332257
279	NC_020518	ACC	2	6	20831	20836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332257
280	NC_020518	GCG	2	6	20855	20860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332257
281	NC_020518	CCG	2	6	20899	20904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332257
282	NC_020518	TTG	2	6	21163	21168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332258
283	NC_020518	GAA	2	6	21441	21446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332258
284	NC_020518	TGG	2	6	21754	21759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332258
285	NC_020518	CTC	2	6	21773	21778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471332258
286	NC_020518	TGG	2	6	21934	21939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332258
287	NC_020518	GCA	2	6	21947	21952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332258
288	NC_020518	GGT	2	6	21960	21965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332258
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290	NC_020518	GCC	2	6	22175	22180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	471332259
291	NC_020518	TGA	2	6	22212	22217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332259
292	NC_020518	CTG	2	6	22271	22276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332259
293	NC_020518	TTG	2	6	22389	22394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	471332259
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325	NC_020518	ACG	2	6	25557	25562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332261
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333	NC_020518	GAA	2	6	26049	26054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332262
334	NC_020518	GAA	2	6	26098	26103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332262
335	NC_020518	ATT	2	6	26140	26145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	471332262
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338	NC_020518	GTG	2	6	26299	26304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332262
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341	NC_020518	GGT	2	6	26479	26484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332262
342	NC_020518	GTC	2	6	26519	26524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332262
343	NC_020518	TTC	2	6	26559	26564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	471332262
344	NC_020518	GGC	2	6	26607	26612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332262
345	NC_020518	CGA	2	6	26637	26642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332262
346	NC_020518	TGA	2	6	26645	26650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	471332262
347	NC_020518	CCT	2	6	26678	26683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	471332262
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350	NC_020518	ACT	2	6	27377	27382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332262
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361	NC_020518	GCG	2	6	28177	28182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332262
362	NC_020518	GGC	2	6	28233	28238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332262
363	NC_020518	AAG	2	6	28283	28288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	471332262
364	NC_020518	TAC	2	6	28300	28305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332262
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366	NC_020518	GCA	2	6	28442	28447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332262
367	NC_020518	CCA	2	6	28451	28456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	471332262
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369	NC_020518	GCT	2	6	28476	28481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332262
370	NC_020518	GTG	2	6	28510	28515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	471332262
371	NC_020518	GGC	2	6	28521	28526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	471332262
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373	NC_020518	CAT	2	6	28677	28682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	471332262
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375	NC_020518	CGT	2	6	28699	28704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	471332262
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379	NC_020518	ATA	2	6	28860	28865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	471332262
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499	NC_020518	CAA	2	6	36677	36682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	471332269
500	NC_020518	CGA	2	6	36690	36695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	471332269

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