MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 1671

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	CGTTT	2	10	3536	3545	0 %	60 %	20 %	20 %	476417164
2	NC_020517	AAGGC	2	10	6839	6848	40 %	0 %	40 %	20 %	476417166
3	NC_020517	GCCGC	2	10	7032	7041	0 %	0 %	40 %	60 %	476417166
4	NC_020517	TCAGC	2	10	12690	12699	20 %	20 %	20 %	40 %	476417170
5	NC_020517	TTCCG	2	10	13362	13371	0 %	40 %	20 %	40 %	476417170
6	NC_020517	ACCAC	2	10	13432	13441	40 %	0 %	0 %	60 %	476417170
7	NC_020517	ACGAA	2	10	13945	13954	60 %	0 %	20 %	20 %	476417170
8	NC_020517	ACCGC	2	10	14053	14062	20 %	0 %	20 %	60 %	476417170
9	NC_020517	AGGCG	2	10	15317	15326	20 %	0 %	60 %	20 %	476417170
10	NC_020517	GCCAC	2	10	18086	18095	20 %	0 %	20 %	60 %	476417172
11	NC_020517	GGCCG	2	10	18112	18121	0 %	0 %	60 %	40 %	476417172
12	NC_020517	CCGCG	2	10	21021	21030	0 %	0 %	40 %	60 %	476417174
13	NC_020517	CGTCC	2	10	24764	24773	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_020517	CGGCG	2	10	26325	26334	0 %	0 %	60 %	40 %	476417177
15	NC_020517	GTCAC	2	10	26381	26390	20 %	20 %	20 %	40 %	476417177
16	NC_020517	AAATC	2	10	28052	28061	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020517	ACAAT	2	10	28065	28074	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020517	CACGC	2	10	32344	32353	20 %	0 %	20 %	60 %	476417181
19	NC_020517	GCGCC	2	10	34664	34673	0 %	0 %	40 %	60 %	476417182
20	NC_020517	CACGC	2	10	35439	35448	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_020517	CGGCG	2	10	35995	36004	0 %	0 %	60 %	40 %	476417183
22	NC_020517	TCCTC	2	10	36594	36603	0 %	40 %	0 %	60 %	476417183
23	NC_020517	TGGCC	2	10	37352	37361	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020517	TACCA	2	10	40851	40860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020517	CGGAT	2	10	44213	44222	20 %	20 %	40 %	20 %	476417186
26	NC_020517	GCTCG	2	10	44842	44851	0 %	20 %	40 %	40 %	476417186
27	NC_020517	ACGGC	2	10	45596	45605	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_020517	CCGAG	2	10	45904	45913	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_020517	CTCGC	2	10	47023	47032	0 %	20 %	20 %	60 %	476417187
30	NC_020517	ATGTG	2	10	48178	48187	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020517	ATCCG	2	10	48277	48286	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020517	CGGTC	2	10	50455	50464	0 %	20 %	40 %	40 %	476417189
33	NC_020517	CCGAC	2	10	54728	54737	20 %	0 %	20 %	60 %	476417193
34	NC_020517	ATGGC	2	10	54779	54788	20 %	20 %	40 %	20 %	476417193
35	NC_020517	CGTGG	2	10	55543	55552	0 %	20 %	60 %	20 %	476417194
36	NC_020517	CGAAG	2	10	56151	56160	40 %	0 %	40 %	20 %	476417194
37	NC_020517	TCTCG	2	10	56829	56838	0 %	40 %	20 %	40 %	476417194
38	NC_020517	CGCAT	2	10	59552	59561	20 %	20 %	20 %	40 %	476417195
39	NC_020517	TTGCA	2	10	60042	60051	20 %	40 %	20 %	20 %	476417196
40	NC_020517	TGCGT	2	10	60379	60388	0 %	40 %	40 %	20 %	476417196
41	NC_020517	ATTCT	2	10	61396	61405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020517	ACGGT	2	10	61441	61450	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020517	CGGTG	2	10	63216	63225	0 %	20 %	60 %	20 %	476417197
44	NC_020517	GTGTT	2	10	64181	64190	0 %	60 %	40 %	0 %	476417198
45	NC_020517	ACAAT	2	10	65304	65313	60 %	20 %	0 %	20 %	476417198
46	NC_020517	GTGGC	2	10	65869	65878	0 %	20 %	60 %	20 %	476417199
47	NC_020517	ATGAT	2	10	68049	68058	40 %	40 %	20 %	0 %	476417201
48	NC_020517	TACCG	2	10	68309	68318	20 %	20 %	20 %	40 %	476417201
49	NC_020517	AATGC	2	10	68850	68859	40 %	20 %	20 %	20 %	476417202
50	NC_020517	TTCGG	2	10	69254	69263	0 %	40 %	40 %	20 %	476417202
51	NC_020517	GATGC	2	10	70223	70232	20 %	20 %	40 %	20 %	476417202
52	NC_020517	GTGCA	2	10	70788	70797	20 %	20 %	40 %	20 %	476417202
53	NC_020517	TGGCC	2	10	73887	73896	0 %	20 %	40 %	40 %	476417205
54	NC_020517	GGCCG	2	10	74590	74599	0 %	0 %	60 %	40 %	476417205
55	NC_020517	GATCG	2	10	76030	76039	20 %	20 %	40 %	20 %	476417205
56	NC_020517	TTACG	2	10	76613	76622	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020517	AACAT	2	10	78787	78796	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020517	CCGAT	2	10	79205	79214	20 %	20 %	20 %	40 %	476417207
59	NC_020517	TTGGC	2	10	80641	80650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020517	GCGCC	2	10	82944	82953	0 %	0 %	40 %	60 %	476417209
61	NC_020517	CGGCG	2	10	84822	84831	0 %	0 %	60 %	40 %	476417210
62	NC_020517	CTCAT	2	10	85751	85760	20 %	40 %	0 %	40 %	476417210
63	NC_020517	CCGCT	2	10	89743	89752	0 %	20 %	20 %	60 %	476417213
64	NC_020517	GGCGC	2	10	93196	93205	0 %	0 %	60 %	40 %	476417218
65	NC_020517	CTTGT	2	10	98638	98647	0 %	60 %	20 %	20 %	476417222
66	NC_020517	ATCCC	2	10	100851	100860	20 %	20 %	0 %	60 %	476417223
67	NC_020517	TTGCG	2	10	102243	102252	0 %	40 %	40 %	20 %	476417224
68	NC_020517	CGCGG	2	10	102951	102960	0 %	0 %	60 %	40 %	476417225
69	NC_020517	GTCTT	2	10	103537	103546	0 %	60 %	20 %	20 %	476417226
70	NC_020517	GGGCG	2	10	104765	104774	0 %	0 %	80 %	20 %	476417227
71	NC_020517	ACGTC	2	10	105043	105052	20 %	20 %	20 %	40 %	476417227
72	NC_020517	CTGGT	2	10	107931	107940	0 %	40 %	40 %	20 %	476417228
73	NC_020517	GTGAA	2	10	108791	108800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020517	AGCTT	2	10	109455	109464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020517	GGTGC	2	10	110700	110709	0 %	20 %	60 %	20 %	476417230
76	NC_020517	CGGGC	2	10	112715	112724	0 %	0 %	60 %	40 %	476417232
77	NC_020517	CGGTC	2	10	116995	117004	0 %	20 %	40 %	40 %	476417234
78	NC_020517	TGCCG	2	10	117805	117814	0 %	20 %	40 %	40 %	476417235
79	NC_020517	GGATG	2	10	117856	117865	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020517	GCGTG	2	10	118698	118707	0 %	20 %	60 %	20 %	476417236
81	NC_020517	AGTCG	2	10	119181	119190	20 %	20 %	40 %	20 %	476417237
82	NC_020517	ATTTC	2	10	120474	120483	20 %	60 %	0 %	20 %	476417238
83	NC_020517	CGATG	2	10	121246	121255	20 %	20 %	40 %	20 %	476417238
84	NC_020517	TGGCG	2	10	122188	122197	0 %	20 %	60 %	20 %	476417238
85	NC_020517	CGGAA	2	10	122734	122743	40 %	0 %	40 %	20 %	476417238
86	NC_020517	CATGC	2	10	126668	126677	20 %	20 %	20 %	40 %	476417241
87	NC_020517	GCCCA	2	10	127945	127954	20 %	0 %	20 %	60 %	476417242
88	NC_020517	GGCCC	2	10	128188	128197	0 %	0 %	40 %	60 %	476417242
89	NC_020517	GCGCC	2	10	132067	132076	0 %	0 %	40 %	60 %	476417243
90	NC_020517	GCCGC	2	10	132169	132178	0 %	0 %	40 %	60 %	476417243
91	NC_020517	CATCG	2	10	134389	134398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_020517	AATGA	2	10	135636	135645	60 %	20 %	20 %	0 %	476417245
93	NC_020517	CTCGG	2	10	137997	138006	0 %	20 %	40 %	40 %	476417247
94	NC_020517	AAGGC	2	10	138240	138249	40 %	0 %	40 %	20 %	476417248
95	NC_020517	CGGCC	2	10	138589	138598	0 %	0 %	40 %	60 %	476417248
96	NC_020517	GGACC	2	10	138739	138748	20 %	0 %	40 %	40 %	476417248
97	NC_020517	GACCA	2	10	142835	142844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_020517	TCGAG	2	10	147210	147219	20 %	20 %	40 %	20 %	476417254
99	NC_020517	GGAAC	2	10	147490	147499	40 %	0 %	40 %	20 %	476417254
100	NC_020517	CGGCA	2	10	147586	147595	20 %	0 %	40 %	40 %	476417254
101	NC_020517	ACCCG	2	10	147688	147697	20 %	0 %	20 %	60 %	476417254
102	NC_020517	CGATC	2	10	148415	148424	20 %	20 %	20 %	40 %	476417255
103	NC_020517	AACAG	2	10	149921	149930	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020517	GCCGG	2	10	153647	153656	0 %	0 %	60 %	40 %	476417258
105	NC_020517	ACGGC	2	10	155654	155663	20 %	0 %	40 %	40 %	476417260
106	NC_020517	GCCAA	2	10	155673	155682	40 %	0 %	20 %	40 %	476417260
107	NC_020517	CGTTC	2	10	156339	156348	0 %	40 %	20 %	40 %	476417260
108	NC_020517	CATCG	2	10	156992	157001	20 %	20 %	20 %	40 %	476417261
109	NC_020517	GCACT	2	10	157048	157057	20 %	20 %	20 %	40 %	476417261
110	NC_020517	GCCTT	2	10	157383	157392	0 %	40 %	20 %	40 %	476417261
111	NC_020517	CGGTG	2	10	157709	157718	0 %	20 %	60 %	20 %	476417261
112	NC_020517	TGGAC	2	10	159338	159347	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020517	GGCCG	2	10	162083	162092	0 %	0 %	60 %	40 %	476417264
114	NC_020517	TGCGC	2	10	163911	163920	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
115	NC_020517	TTTCG	2	10	164970	164979	0 %	60 %	20 %	20 %	476417266
116	NC_020517	GTGGC	2	10	165919	165928	0 %	20 %	60 %	20 %	476417266
117	NC_020517	AGCAA	2	10	166704	166713	60 %	0 %	20 %	20 %	476417266
118	NC_020517	GGTCG	2	10	173746	173755	0 %	20 %	60 %	20 %	476417269
119	NC_020517	GCCTT	2	10	174347	174356	0 %	40 %	20 %	40 %	476417269
120	NC_020517	AGCGA	2	10	176510	176519	40 %	0 %	40 %	20 %	476417270
121	NC_020517	GGTCA	2	10	176713	176722	20 %	20 %	40 %	20 %	476417270
122	NC_020517	CCAAC	2	10	178542	178551	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
123	NC_020517	GCAAG	2	10	179105	179114	40 %	0 %	40 %	20 %	476417272
124	NC_020517	GGCCG	2	10	182478	182487	0 %	0 %	60 %	40 %	476417275
125	NC_020517	ACCAC	2	10	183891	183900	40 %	0 %	0 %	60 %	476417276
126	NC_020517	CGACG	2	10	184936	184945	20 %	0 %	40 %	40 %	476417276
127	NC_020517	GACCA	2	10	187325	187334	40 %	0 %	20 %	40 %	476417276
128	NC_020517	TCGCT	2	10	191530	191539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_020517	AGGCC	2	10	192364	192373	20 %	0 %	40 %	40 %	476417279
130	NC_020517	TCGGC	2	10	193586	193595	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_020517	TGAGA	2	10	194107	194116	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020517	CATCC	2	10	195811	195820	20 %	20 %	0 %	60 %	476417282
133	NC_020517	TCGCC	2	10	195836	195845	0 %	20 %	20 %	60 %	476417282
134	NC_020517	GCTGC	2	10	196542	196551	0 %	20 %	40 %	40 %	476417283
135	NC_020517	ATGTG	2	10	197103	197112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020517	TCCCC	2	10	197307	197316	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_020517	ATCCG	2	10	198090	198099	20 %	20 %	20 %	40 %	476417284
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264	NC_020517	CGCGG	2	10	364916	364925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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266	NC_020517	GCACG	2	10	367667	367676	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
267	NC_020517	CGATG	2	10	368395	368404	20 %	20 %	40 %	20 %	476417412
268	NC_020517	GGGGT	2	10	368577	368586	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_020517	ATCGC	2	10	538040	538049	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
385	NC_020517	AGTCC	2	10	542076	542085	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
386	NC_020517	CCGCT	2	10	542892	542901	0 %	20 %	20 %	60 %	476417550
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389	NC_020517	CGACA	2	10	544640	544649	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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392	NC_020517	GGGGA	2	10	545769	545778	20 %	0 %	80 %	0 %	476417552
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394	NC_020517	TGCTG	2	10	545923	545932	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
395	NC_020517	TTTGC	2	10	545973	545982	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
396	NC_020517	GCGCG	2	10	553981	553990	0 %	0 %	60 %	40 %	476417555
397	NC_020517	CGTTA	2	10	554091	554100	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
398	NC_020517	GCAAT	2	10	554207	554216	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
399	NC_020517	AACGC	2	10	554283	554292	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
400	NC_020517	GGGGA	2	10	555009	555018	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020517	CCGAC	2	10	556466	556475	20 %	0 %	20 %	60 %	476417556
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403	NC_020517	CGAGC	2	10	557713	557722	20 %	0 %	40 %	40 %	476417557
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499	NC_020517	GACGT	2	10	694447	694456	20 %	20 %	40 %	20 %	476417648
500	NC_020517	GTTGC	2	10	700275	700284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding

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