MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bifidobacterium breve UCC2003

Total Repeats: 5692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020517	TCGC	2	8	1292	1299	0 %	25 %	25 %	50 %	476417162
2	NC_020517	ATGC	2	8	1366	1373	25 %	25 %	25 %	25 %	476417162
3	NC_020517	ACTG	2	8	1434	1441	25 %	25 %	25 %	25 %	476417162
4	NC_020517	TCCA	2	8	1876	1883	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020517	TTAC	2	8	1919	1926	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_020517	CATA	2	8	1930	1937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020517	GCAA	2	8	1976	1983	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020517	AACC	3	12	1987	1998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020517	ACCG	2	8	2547	2554	25 %	0 %	25 %	50 %	476417163
10	NC_020517	CAAG	2	8	2822	2829	50 %	0 %	25 %	25 %	476417163
11	NC_020517	AAGG	2	8	3015	3022	50 %	0 %	50 %	0 %	476417163
12	NC_020517	TGCG	2	8	3799	3806	0 %	25 %	50 %	25 %	476417164
13	NC_020517	GCTG	2	8	3821	3828	0 %	25 %	50 %	25 %	476417164
14	NC_020517	GGAA	2	8	4986	4993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020517	GCTG	2	8	5244	5251	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
16	NC_020517	GCCA	2	8	5257	5264	25 %	0 %	25 %	50 %	476417166
17	NC_020517	CGTG	2	8	6108	6115	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
18	NC_020517	CGGT	2	8	6584	6591	0 %	25 %	50 %	25 %	476417166
19	NC_020517	AAAC	2	8	7274	7281	75 %	0 %	0 %	25 %	476417167
20	NC_020517	CCTA	2	8	7421	7428	25 %	25 %	0 %	50 %	476417167
21	NC_020517	CGCC	2	8	8457	8464	0 %	0 %	25 %	75 %	476417167
22	NC_020517	TCCA	2	8	9157	9164	25 %	25 %	0 %	50 %	476417167
23	NC_020517	CGCA	2	8	9807	9814	25 %	0 %	25 %	50 %	476417167
24	NC_020517	CGCC	2	8	10214	10221	0 %	0 %	25 %	75 %	476417168
25	NC_020517	TCAG	2	8	10357	10364	25 %	25 %	25 %	25 %	476417168
26	NC_020517	TTCT	2	8	11679	11686	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020517	ATGT	2	8	11747	11754	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020517	GAAT	2	8	11837	11844	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020517	TGCT	2	8	11878	11885	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_020517	ACTG	2	8	12357	12364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_020517	CGGC	2	8	12370	12377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020517	TTTA	2	8	12612	12619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020517	GCTT	2	8	13296	13303	0 %	50 %	25 %	25 %	476417170
34	NC_020517	GTAT	2	8	14251	14258	25 %	50 %	25 %	0 %	476417170
35	NC_020517	TGCC	2	8	14728	14735	0 %	25 %	25 %	50 %	476417170
36	NC_020517	CGTG	2	8	14744	14751	0 %	25 %	50 %	25 %	476417170
37	NC_020517	ACTG	2	8	14844	14851	25 %	25 %	25 %	25 %	476417170
38	NC_020517	CCGG	2	8	14856	14863	0 %	0 %	50 %	50 %	476417170
39	NC_020517	TTCG	2	8	14900	14907	0 %	50 %	25 %	25 %	476417170
40	NC_020517	GTCG	2	8	15179	15186	0 %	25 %	50 %	25 %	476417170
41	NC_020517	GCCG	2	8	15758	15765	0 %	0 %	50 %	50 %	476417170
42	NC_020517	ACGA	2	8	16232	16239	50 %	0 %	25 %	25 %	476417171
43	NC_020517	TACT	2	8	16312	16319	25 %	50 %	0 %	25 %	476417171
44	NC_020517	CTGG	2	8	16329	16336	0 %	25 %	50 %	25 %	476417171
45	NC_020517	GCCA	2	8	17932	17939	25 %	0 %	25 %	50 %	476417172
46	NC_020517	TGTA	2	8	19261	19268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020517	GCGA	2	8	19351	19358	25 %	0 %	50 %	25 %	476417173
48	NC_020517	GTGG	2	8	19678	19685	0 %	25 %	75 %	0 %	476417173
49	NC_020517	GCCA	2	8	19854	19861	25 %	0 %	25 %	50 %	476417173
50	NC_020517	GGAC	2	8	20909	20916	25 %	0 %	50 %	25 %	476417174
51	NC_020517	CGGG	2	8	21192	21199	0 %	0 %	75 %	25 %	476417174
52	NC_020517	GCCT	2	8	21821	21828	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_020517	CCGC	2	8	21921	21928	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_020517	CCAA	2	8	22259	22266	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020517	CCAG	2	8	22268	22275	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020517	GACC	2	8	22284	22291	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_020517	GGCC	2	8	22333	22340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020517	CAGG	2	8	22401	22408	25 %	0 %	50 %	25 %	476417175
59	NC_020517	ACGA	2	8	23072	23079	50 %	0 %	25 %	25 %	476417175
60	NC_020517	GGCA	2	8	23089	23096	25 %	0 %	50 %	25 %	476417175
61	NC_020517	GATG	2	8	23142	23149	25 %	25 %	50 %	0 %	476417175
62	NC_020517	TATG	2	8	23836	23843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020517	TAGA	2	8	24477	24484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020517	CGCC	2	8	24816	24823	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
65	NC_020517	ATCC	2	8	26183	26190	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020517	GCCC	2	8	26191	26198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_020517	ACGT	2	8	26969	26976	25 %	25 %	25 %	25 %	476417178
68	NC_020517	GTCG	2	8	27465	27472	0 %	25 %	50 %	25 %	476417178
69	NC_020517	CGAG	2	8	27660	27667	25 %	0 %	50 %	25 %	476417178
70	NC_020517	TTCT	2	8	28287	28294	0 %	75 %	0 %	25 %	476417179
71	NC_020517	CGGA	2	8	28964	28971	25 %	0 %	50 %	25 %	476417179
72	NC_020517	AACG	2	8	29142	29149	50 %	0 %	25 %	25 %	476417179
73	NC_020517	AGCG	2	8	29307	29314	25 %	0 %	50 %	25 %	476417179
74	NC_020517	GTCT	2	8	29860	29867	0 %	50 %	25 %	25 %	476417180
75	NC_020517	ACAT	2	8	30513	30520	50 %	25 %	0 %	25 %	476417180
76	NC_020517	GCCA	2	8	30573	30580	25 %	0 %	25 %	50 %	476417180
77	NC_020517	GGCC	2	8	30746	30753	0 %	0 %	50 %	50 %	476417180
78	NC_020517	TGGT	2	8	32169	32176	0 %	50 %	50 %	0 %	476417181
79	NC_020517	CATC	2	8	32656	32663	25 %	25 %	0 %	50 %	476417181
80	NC_020517	CCTT	2	8	33870	33877	0 %	50 %	0 %	50 %	476417181
81	NC_020517	ATGC	2	8	34860	34867	25 %	25 %	25 %	25 %	476417182
82	NC_020517	CCGG	2	8	35089	35096	0 %	0 %	50 %	50 %	476417182
83	NC_020517	TGCG	2	8	35234	35241	0 %	25 %	50 %	25 %	476417182
84	NC_020517	CGGC	2	8	36387	36394	0 %	0 %	50 %	50 %	476417183
85	NC_020517	AAGC	2	8	36757	36764	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020517	GCTG	2	8	37079	37086	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020517	TGCG	2	8	37636	37643	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_020517	ACGG	2	8	38333	38340	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020517	CTGC	2	8	38387	38394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020517	GGGC	2	8	38605	38612	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020517	GCCA	2	8	39062	39069	25 %	0 %	25 %	50 %	476417184
92	NC_020517	ACGG	2	8	39297	39304	25 %	0 %	50 %	25 %	476417184
93	NC_020517	CACG	2	8	39586	39593	25 %	0 %	25 %	50 %	476417184
94	NC_020517	GTTG	2	8	40171	40178	0 %	50 %	50 %	0 %	476417185
95	NC_020517	CGTC	2	8	40590	40597	0 %	25 %	25 %	50 %	476417185
96	NC_020517	TCCT	2	8	40909	40916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020517	TCGT	2	8	41490	41497	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_020517	CAGG	2	8	42653	42660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020517	GTTT	2	8	43685	43692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020517	ACAG	2	8	43820	43827	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020517	AGAC	2	8	43928	43935	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020517	GGCG	2	8	43996	44003	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020517	CGAT	2	8	44124	44131	25 %	25 %	25 %	25 %	476417186
104	NC_020517	GCAG	2	8	45006	45013	25 %	0 %	50 %	25 %	476417186
105	NC_020517	TTCC	2	8	45161	45168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020517	TTCG	2	8	45755	45762	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_020517	TCGG	2	8	45924	45931	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020517	AGGT	2	8	45975	45982	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020517	GTTC	2	8	46531	46538	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020517	CCGG	2	8	47257	47264	0 %	0 %	50 %	50 %	476417187
111	NC_020517	ATGC	2	8	47557	47564	25 %	25 %	25 %	25 %	476417187
112	NC_020517	CCAT	2	8	47618	47625	25 %	25 %	0 %	50 %	476417187
113	NC_020517	TCAA	2	8	48248	48255	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020517	GCTG	2	8	48446	48453	0 %	25 %	50 %	25 %	476417188
115	NC_020517	CTGA	2	8	48738	48745	25 %	25 %	25 %	25 %	476417188
116	NC_020517	CGGC	2	8	48979	48986	0 %	0 %	50 %	50 %	476417188
117	NC_020517	CGCA	2	8	49866	49873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020517	CCGT	2	8	51146	51153	0 %	25 %	25 %	50 %	476417190
119	NC_020517	GATG	2	8	51183	51190	25 %	25 %	50 %	0 %	476417190
120	NC_020517	GCTG	2	8	52139	52146	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020517	GCAA	2	8	52337	52344	50 %	0 %	25 %	25 %	476417191
122	NC_020517	ATGG	2	8	54067	54074	25 %	25 %	50 %	0 %	476417192
123	NC_020517	TGCA	2	8	54235	54242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020517	AACC	2	8	55083	55090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020517	CGCT	2	8	55236	55243	0 %	25 %	25 %	50 %	476417194
126	NC_020517	CGTG	2	8	55677	55684	0 %	25 %	50 %	25 %	476417194
127	NC_020517	TGCC	2	8	55895	55902	0 %	25 %	25 %	50 %	476417194
128	NC_020517	CGCC	2	8	56601	56608	0 %	0 %	25 %	75 %	476417194
129	NC_020517	TTTG	2	8	57261	57268	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020517	ACGT	2	8	57715	57722	25 %	25 %	25 %	25 %	476417195
131	NC_020517	GCAC	2	8	57777	57784	25 %	0 %	25 %	50 %	476417195
132	NC_020517	GCGT	2	8	59002	59009	0 %	25 %	50 %	25 %	476417195
133	NC_020517	GTGC	2	8	59124	59131	0 %	25 %	50 %	25 %	476417195
134	NC_020517	GCTG	2	8	59216	59223	0 %	25 %	50 %	25 %	476417195
135	NC_020517	GCTG	2	8	59471	59478	0 %	25 %	50 %	25 %	476417195
136	NC_020517	CGCA	2	8	60361	60368	25 %	0 %	25 %	50 %	476417196
137	NC_020517	AGCA	2	8	60410	60417	50 %	0 %	25 %	25 %	476417196
138	NC_020517	GCCG	2	8	61717	61724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020517	TACA	2	8	61853	61860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_020517	GCAC	2	8	61980	61987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020517	TTGG	2	8	62077	62084	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020517	TCCG	2	8	63008	63015	0 %	25 %	25 %	50 %	476417197
143	NC_020517	CGTG	2	8	63509	63516	0 %	25 %	50 %	25 %	476417197
144	NC_020517	TCGT	2	8	64684	64691	0 %	50 %	25 %	25 %	476417198
145	NC_020517	GCTG	2	8	64753	64760	0 %	25 %	50 %	25 %	476417198
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