MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C DNA

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020516	CTGCCT	2	12	1777	1788	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020516	GCGGTG	2	12	17053	17064	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_020516	ACATCC	2	12	34767	34778	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020516	TTTAAA	2	12	43606	43617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020516	TAAAGA	2	12	43972	43983	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020516	ACGGAC	2	12	105937	105948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020516	AGTCGT	2	12	106961	106972	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020516	GCGCGA	2	12	110575	110586	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020516	GCCACA	2	12	118239	118250	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020516	CAGCGA	2	12	168833	168844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020516	GAAGCC	2	12	173537	173548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020516	GCCGGT	2	12	184780	184791	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020516	TCGCGC	2	12	254407	254418	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_020516	GTTCGG	2	12	322415	322426	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020516	ATACCA	2	12	326052	326063	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020516	GGGGTC	2	12	446703	446714	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020516	CCGGCG	2	12	462803	462814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020516	CGACCG	2	12	465385	465396	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020516	GCAAAA	2	12	498896	498907	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020516	GTGACT	2	12	510887	510898	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020516	GAAAAT	2	12	552788	552799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020516	ACGTAA	2	12	578154	578165	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020516	TCAAAA	2	12	578166	578177	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020516	TGTGGC	2	12	578759	578770	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020516	CCCCGA	2	12	584377	584388	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_020516	GCAGTG	2	12	648839	648850	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020516	AAAAGC	2	12	701257	701268	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020516	GGGGGC	2	12	705886	705897	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020516	GCCTTG	2	12	737713	737724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020516	TGATGT	2	12	798792	798803	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020516	GCAAAA	2	12	813822	813833	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020516	CCCCGC	2	12	867723	867734	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
33	NC_020516	AAAAAG	2	12	885299	885310	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020516	CTACGT	2	12	889991	890002	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020516	GTTTTT	2	12	894298	894309	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020516	GCGTCG	2	12	923645	923656	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020516	ACGTCA	2	12	924893	924904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020516	TTTTCT	2	12	958228	958239	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020516	AACCGA	2	12	1064274	1064285	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020516	GGAGTG	2	12	1123325	1123336	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020516	GTAGAC	2	12	1207816	1207827	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020516	GGGGAA	2	12	1208992	1209003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020516	CAAAAA	2	12	1210229	1210240	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020516	AGGGGG	2	12	1246524	1246535	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020516	TGGGTA	2	12	1292127	1292138	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020516	GTTGGG	2	12	1315702	1315713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020516	ATCGTT	2	12	1340397	1340408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020516	CACCAG	2	12	1369396	1369407	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020516	CGTTCT	2	12	1380083	1380094	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020516	GAGGGA	2	12	1401731	1401742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020516	GCGAAA	2	12	1424015	1424026	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020516	ACGATT	2	12	1487183	1487194	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020516	GATGTG	2	12	1562797	1562808	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020516	ACGGTC	2	12	1629048	1629059	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020516	CTGCCG	2	12	1630819	1630830	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020516	GCTTCG	2	12	1721141	1721152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020516	CGCAGC	2	12	1724413	1724424	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020516	CTTCGA	2	12	1743102	1743113	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_020516	GGCGCC	2	12	1750134	1750145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020516	CCGGCC	2	12	1755983	1755994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_020516	GAGGGA	2	12	1926787	1926798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020516	GCCGGA	2	12	1941252	1941263	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020516	CGTGGG	2	12	1965562	1965573	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020516	CCCCAA	2	12	2060721	2060732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_020516	CGCAGG	2	12	2098578	2098589	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020516	CAGGAG	2	12	2100290	2100301	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_020516	GTGCTT	2	12	2251432	2251443	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020516	TGGCGT	2	12	2348864	2348875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_020516	TCCCGG	2	12	2420109	2420120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020516	AACCAG	2	12	2430512	2430523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020516	GAACCG	2	12	2463306	2463317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_020516	GACTTC	2	12	2561710	2561721	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020516	GGGTGG	5	30	2567195	2567224	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020516	AACAAA	2	12	2593274	2593285	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020516	TGGCGA	2	12	2683182	2683193	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020516	GATGAC	2	12	2683678	2683689	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_020516	TCAAAT	2	12	2685682	2685693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020516	CCCCAA	2	12	2799571	2799582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_020516	AGCGGC	2	12	2852727	2852738	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020516	TCGATT	2	12	2926669	2926680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020516	TGCGGC	2	12	3010983	3010994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_020516	CCATCG	2	12	3019500	3019511	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020516	GTCGCT	2	12	3033813	3033824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020516	CGCCCC	2	12	3054167	3054178	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
85	NC_020516	GATTAT	2	12	3058131	3058142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020516	CATCGC	2	12	3068452	3068463	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020516	GCGAAT	2	12	3098806	3098817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_020516	TCGCCG	2	12	3122486	3122497	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020516	CGACGC	2	12	3264940	3264951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020516	AGAAAA	2	12	3296059	3296070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020516	CACCCC	2	12	3377369	3377380	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
92	NC_020516	GCGGCC	2	12	3421525	3421536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_020516	GCCTAC	2	12	3500323	3500334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020516	CCGCTG	2	12	3513441	3513452	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020516	TGGTCT	2	12	3531034	3531045	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020516	GAAGGC	2	12	3569710	3569721	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_020516	CTCCTG	2	12	3595902	3595913	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020516	AAACGG	2	12	3605369	3605380	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_020516	ACGTCA	2	12	3606266	3606277	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020516	AAGCAC	2	12	3609279	3609290	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020516	CTTCGT	2	12	3628844	3628855	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_020516	TTCGCC	2	12	3631735	3631746	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_020516	AAAGTT	2	12	3653865	3653876	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020516	CCGCAG	2	12	3730222	3730233	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_020516	CCGCAG	2	12	3740053	3740064	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_020516	GGCAAG	2	12	3770283	3770294	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020516	ACAGGA	2	12	3770900	3770911	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_020516	GACGGT	2	12	3778481	3778492	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020516	GCGGGC	2	12	3816312	3816323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_020516	CGGCAG	2	12	3823335	3823346	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_020516	AGGACC	2	12	3859332	3859343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020516	TCGCCG	2	12	3902998	3903009	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020516	CCCGCT	2	12	3925455	3925466	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_020516	CTCAAT	2	12	3935242	3935253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020516	CGTCGG	2	12	3970690	3970701	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_020516	TGAAGC	2	12	4027529	4027540	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_020516	AGATAA	2	12	4043811	4043822	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020516	CGTGGC	2	12	4048696	4048707	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_020516	CCCTCC	2	12	4052677	4052688	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
120	NC_020516	ACCGCC	2	12	4241196	4241207	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_020516	CATCGC	2	12	4296779	4296790	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020516	CCTTTG	2	12	4387381	4387392	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020516	CTCCCT	2	12	4548426	4548437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020516	ACACGA	2	12	4559635	4559646	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_020516	GCAGGA	2	12	4611140	4611151	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_020516	CGCCCC	2	12	4626049	4626060	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
127	NC_020516	GATGAA	2	12	4663811	4663822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020516	CGAAGC	2	12	4727166	4727177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020516	CCGCAG	2	12	4733404	4733415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_020516	CGTCGC	2	12	4759323	4759334	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020516	GCTGAT	2	12	4821635	4821646	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_020516	ACAGGT	2	12	4825412	4825423	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_020516	AAAGGC	2	12	4884194	4884205	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_020516	CCCATC	2	12	4964008	4964019	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_020516	GAAGGG	2	12	4964034	4964045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020516	ATAACG	2	12	4994253	4994264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.