MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azoarcus sp. KH32C DNA

Total Repeats: 3585

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_020516	CGCGT	2	10	4990331	4990340	0 %	20 %	40 %	40 %	470172896
3502	NC_020516	GACGG	2	10	4990364	4990373	20 %	0 %	60 %	20 %	470172896
3503	NC_020516	GCCGC	2	10	4991486	4991495	0 %	0 %	40 %	60 %	470172896
3504	NC_020516	CGCGC	2	10	4994155	4994164	0 %	0 %	40 %	60 %	470172899
3505	NC_020516	CACTG	2	10	4994316	4994325	20 %	20 %	20 %	40 %	470172900
3506	NC_020516	TCGCA	2	10	4995370	4995379	20 %	20 %	20 %	40 %	470172900
3507	NC_020516	TGCAA	2	10	4996789	4996798	40 %	20 %	20 %	20 %	470172901
3508	NC_020516	CAGCG	2	10	4997795	4997804	20 %	0 %	40 %	40 %	470172903
3509	NC_020516	CGAAC	2	10	5000033	5000042	40 %	0 %	20 %	40 %	470172905
3510	NC_020516	TGGGG	2	10	5000770	5000779	0 %	20 %	80 %	0 %	470172907
3511	NC_020516	GGAAA	2	10	5002041	5002050	60 %	0 %	40 %	0 %	470172907
3512	NC_020516	GCGCG	2	10	5002617	5002626	0 %	0 %	60 %	40 %	470172907
3513	NC_020516	CGCGG	2	10	5004445	5004454	0 %	0 %	60 %	40 %	470172908
3514	NC_020516	GCATC	2	10	5005955	5005964	20 %	20 %	20 %	40 %	470172910
3515	NC_020516	CGGCG	2	10	5006599	5006608	0 %	0 %	60 %	40 %	470172911
3516	NC_020516	CCGAT	2	10	5006856	5006865	20 %	20 %	20 %	40 %	470172911
3517	NC_020516	CGCGG	2	10	5007495	5007504	0 %	0 %	60 %	40 %	470172912
3518	NC_020516	CCGGC	2	10	5008340	5008349	0 %	0 %	40 %	60 %	470172912
3519	NC_020516	GCGCT	2	10	5008981	5008990	0 %	20 %	40 %	40 %	470172912
3520	NC_020516	GCGTG	2	10	5009670	5009679	0 %	20 %	60 %	20 %	470172913
3521	NC_020516	AAGCG	2	10	5010137	5010146	40 %	0 %	40 %	20 %	470172914
3522	NC_020516	GCCGC	2	10	5010274	5010283	0 %	0 %	40 %	60 %	470172914
3523	NC_020516	ACCGG	2	10	5011830	5011839	20 %	0 %	40 %	40 %	470172915
3524	NC_020516	CTCGG	2	10	5012233	5012242	0 %	20 %	40 %	40 %	470172916
3525	NC_020516	TGCTG	2	10	5014922	5014931	0 %	40 %	40 %	20 %	470172920
3526	NC_020516	AGCGC	2	10	5015630	5015639	20 %	0 %	40 %	40 %	470172920
3527	NC_020516	CGCGT	2	10	5015947	5015956	0 %	20 %	40 %	40 %	470172920
3528	NC_020516	GAAAG	2	10	5016282	5016291	60 %	0 %	40 %	0 %	470172920
3529	NC_020516	TCCCG	2	10	5016797	5016806	0 %	20 %	20 %	60 %	470172922
3530	NC_020516	CGACG	2	10	5017055	5017064	20 %	0 %	40 %	40 %	470172922
3531	NC_020516	TGCGC	2	10	5018738	5018747	0 %	20 %	40 %	40 %	470172922
3532	NC_020516	CGCAA	2	10	5019031	5019040	40 %	0 %	20 %	40 %	470172923
3533	NC_020516	GCCGC	2	10	5019978	5019987	0 %	0 %	40 %	60 %	470172923
3534	NC_020516	CTCGC	2	10	5020783	5020792	0 %	20 %	20 %	60 %	470172923
3535	NC_020516	CGCGG	2	10	5024596	5024605	0 %	0 %	60 %	40 %	470172925
3536	NC_020516	CCTGC	2	10	5025168	5025177	0 %	20 %	20 %	60 %	470172926
3537	NC_020516	CGCGC	2	10	5026188	5026197	0 %	0 %	40 %	60 %	470172926
3538	NC_020516	GCGCG	2	10	5027273	5027282	0 %	0 %	60 %	40 %	470172927
3539	NC_020516	CGACC	2	10	5029114	5029123	20 %	0 %	20 %	60 %	470172928
3540	NC_020516	TCCGC	2	10	5029251	5029260	0 %	20 %	20 %	60 %	470172928
3541	NC_020516	CCCGA	2	10	5029499	5029508	20 %	0 %	20 %	60 %	470172928
3542	NC_020516	CCGCC	2	10	5030201	5030210	0 %	0 %	20 %	80 %	470172929
3543	NC_020516	GCGCC	2	10	5031330	5031339	0 %	0 %	40 %	60 %	470172929
3544	NC_020516	GCGCC	2	10	5032993	5033002	0 %	0 %	40 %	60 %	470172930
3545	NC_020516	CCCGC	2	10	5034574	5034583	0 %	0 %	20 %	80 %	470172931
3546	NC_020516	CCCGA	2	10	5034694	5034703	20 %	0 %	20 %	60 %	470172931
3547	NC_020516	GCGCC	2	10	5034734	5034743	0 %	0 %	40 %	60 %	470172931
3548	NC_020516	CGACC	2	10	5035191	5035200	20 %	0 %	20 %	60 %	470172931
3549	NC_020516	GCCTC	2	10	5035307	5035316	0 %	20 %	20 %	60 %	470172931
3550	NC_020516	CCAGC	2	10	5037075	5037084	20 %	0 %	20 %	60 %	470172931
3551	NC_020516	GCCCA	2	10	5037637	5037646	20 %	0 %	20 %	60 %	470172931
3552	NC_020516	CTTCA	2	10	5040161	5040170	20 %	40 %	0 %	40 %	470172935
3553	NC_020516	GCGCT	2	10	5040439	5040448	0 %	20 %	40 %	40 %	470172935
3554	NC_020516	TGCGC	2	10	5042533	5042542	0 %	20 %	40 %	40 %	470172938
3555	NC_020516	CGCAC	2	10	5044055	5044064	20 %	0 %	20 %	60 %	470172939
3556	NC_020516	CGCGC	2	10	5046373	5046382	0 %	0 %	40 %	60 %	470172942
3557	NC_020516	GCCGA	2	10	5047356	5047365	20 %	0 %	40 %	40 %	470172942
3558	NC_020516	TCGCG	2	10	5051003	5051012	0 %	20 %	40 %	40 %	470172945
3559	NC_020516	CGCCC	2	10	5052363	5052372	0 %	0 %	20 %	80 %	470172947
3560	NC_020516	CCGAC	2	10	5052545	5052554	20 %	0 %	20 %	60 %	470172947
3561	NC_020516	ACTTC	2	10	5054466	5054475	20 %	40 %	0 %	40 %	470172948
3562	NC_020516	GCGAC	2	10	5055645	5055654	20 %	0 %	40 %	40 %	470172951
3563	NC_020516	CGCAG	2	10	5060959	5060968	20 %	0 %	40 %	40 %	470172956
3564	NC_020516	GATCA	2	10	5061122	5061131	40 %	20 %	20 %	20 %	470172956
3565	NC_020516	GCCAC	2	10	5061791	5061800	20 %	0 %	20 %	60 %	470172957
3566	NC_020516	CGGTG	2	10	5062440	5062449	0 %	20 %	60 %	20 %	470172957
3567	NC_020516	CTGGT	2	10	5062486	5062495	0 %	40 %	40 %	20 %	470172957
3568	NC_020516	TCCCT	2	10	5063152	5063161	0 %	40 %	0 %	60 %	470172958
3569	NC_020516	GCAGC	2	10	5064430	5064439	20 %	0 %	40 %	40 %	470172959
3570	NC_020516	CCGGC	2	10	5067423	5067432	0 %	0 %	40 %	60 %	470172961
3571	NC_020516	GCGCC	2	10	5068503	5068512	0 %	0 %	40 %	60 %	470172962
3572	NC_020516	TCGAC	2	10	5070932	5070941	20 %	20 %	20 %	40 %	470172964
3573	NC_020516	AGCGC	2	10	5072662	5072671	20 %	0 %	40 %	40 %	470172965
3574	NC_020516	GCGCC	2	10	5073387	5073396	0 %	0 %	40 %	60 %	470172966
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3576	NC_020516	GCACC	2	10	5075939	5075948	20 %	0 %	20 %	60 %	470172968
3577	NC_020516	CACGG	2	10	5075993	5076002	20 %	0 %	40 %	40 %	470172968
3578	NC_020516	ACCGC	2	10	5078077	5078086	20 %	0 %	20 %	60 %	470172970
3579	NC_020516	GGCGC	2	10	5078171	5078180	0 %	0 %	60 %	40 %	470172970
3580	NC_020516	CCGGA	2	10	5078431	5078440	20 %	0 %	40 %	40 %	470172970
3581	NC_020516	GGATC	2	10	5078666	5078675	20 %	20 %	40 %	20 %	470172971
3582	NC_020516	GGCCG	2	10	5079471	5079480	0 %	0 %	60 %	40 %	470172971
3583	NC_020516	GTGCG	2	10	5079739	5079748	0 %	20 %	60 %	20 %	470172971
3584	NC_020516	CGCGC	2	10	5080439	5080448	0 %	0 %	40 %	60 %	470172973
3585	NC_020516	GAAGC	2	10	5080486	5080495	40 %	0 %	40 %	20 %	470172973

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.