MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bibersteinia trehalosi USDA-ARS-USMARC-192

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020515	AGATTG	2	12	26336	26347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020515	TAATGA	2	12	47138	47149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020515	CGAAGG	2	12	63207	63218	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020515	TGAAAT	2	12	66485	66496	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020515	TGGTTT	2	12	78063	78074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020515	CGGCGA	2	12	94214	94225	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020515	AAAGTA	2	12	103725	103736	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020515	AAAATT	2	12	110601	110612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020515	CTTTGG	2	12	140788	140799	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020515	AAAATC	2	12	147723	147734	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020515	AGTAAT	2	12	164439	164450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020515	ATTATG	2	12	187694	187705	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020515	GTTTTT	2	12	201493	201504	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020515	CGAAGG	2	12	217044	217055	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020515	TGAAAT	2	12	220417	220428	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020515	AAAACA	2	12	221328	221339	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020515	AGAAAA	2	12	221715	221726	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020515	ATTTTT	2	12	325319	325330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020515	AAGTGA	2	12	347759	347770	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020515	CGAAGG	2	12	348975	348986	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020515	TGAAAT	2	12	352348	352359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020515	AAAACA	2	12	353259	353270	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020515	GGCATA	2	12	367808	367819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020515	CGAAGG	2	12	375394	375405	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020515	TGAAAT	2	12	378682	378693	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020515	TAAGGT	2	12	452303	452314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020515	ATTTTA	2	12	490714	490725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020515	AAGATA	2	12	498780	498791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020515	TGCTTT	2	12	500649	500660	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020515	CACAAA	2	12	547992	548003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020515	TGGGTT	2	12	548091	548102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020515	TTTAAA	2	12	582692	582703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020515	CGAAGG	2	12	599679	599690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020515	TGAAAT	2	12	602967	602978	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020515	TTATTT	2	12	636619	636630	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020515	AACTTT	2	12	648529	648540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020515	TAATTT	2	12	727516	727527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020515	AAAAGA	2	12	733421	733432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020515	AGGGGG	2	12	735749	735760	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020515	AGAAAA	2	12	781932	781943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020515	TGAGGA	2	12	816250	816261	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020515	ATTTAA	2	12	821206	821217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020515	TCCCCC	2	12	827862	827873	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
44	NC_020515	ATTTTT	2	12	835766	835777	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020515	ACAATC	2	12	843779	843790	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020515	CAAAAT	2	12	849297	849308	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020515	CGAAGG	2	12	864619	864630	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020515	TGAAAT	2	12	867992	868003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020515	AAAACA	2	12	868903	868914	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020515	AATTTA	2	12	959409	959420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020515	ACAACG	2	12	985485	985496	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_020515	TTATTT	2	12	997700	997711	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020515	AATTTT	2	12	1095571	1095582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020515	TAGAAA	2	12	1100516	1100527	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020515	TTCTGA	2	12	1110787	1110798	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020515	AGATTC	2	12	1169983	1169994	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020515	AGAAAA	2	12	1172334	1172345	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020515	TAGTTT	2	12	1243425	1243436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020515	TAAATG	2	12	1244435	1244446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020515	TAAAAA	2	12	1406830	1406841	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020515	AATAAA	2	12	1468957	1468968	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020515	TTAAAT	2	12	1474442	1474453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020515	CTTTGA	2	12	1524106	1524117	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020515	ATGCAA	2	12	1531346	1531357	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_020515	TTTTTC	2	12	1541369	1541380	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_020515	ACCGAA	2	12	1553093	1553104	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020515	TCCCTC	2	12	1655915	1655926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_020515	GGATAA	2	12	1811777	1811788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020515	AAAAGC	2	12	1918368	1918379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020515	CTTTTA	2	12	1984512	1984523	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020515	AGGGAG	2	12	1996240	1996251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020515	CTCATT	2	12	2023400	2023411	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020515	TGATCG	2	12	2069833	2069844	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020515	TGAATT	2	12	2154865	2154876	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020515	TTACAA	2	12	2193380	2193391	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_020515	TATTTT	2	12	2199959	2199970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020515	CTTGTT	2	12	2204923	2204934	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020515	ACAGTC	2	12	2210083	2210094	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020515	TATTCA	2	12	2221624	2221635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_020515	AACATC	2	12	2248228	2248239	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020515	TTTTCT	2	12	2249830	2249841	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_020515	TAAAAA	2	12	2255093	2255104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020515	CCTACA	2	12	2265229	2265240	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020515	AAAAAT	2	12	2375802	2375813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.