MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 1394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020512	AAG	2	6	1820	1825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020512	TGG	2	6	1836	1841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020512	CTT	2	6	1843	1848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020512	TAA	2	6	2251	2256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020512	GCA	2	6	5655	5660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020512	AGA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020512	CTT	2	6	6960	6965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020512	TTA	2	6	7752	7757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020512	GAA	2	6	7801	7806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020512	ATG	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020512	TTC	3	9	9775	9783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020512	ATC	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020512	GAA	2	6	9829	9834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020512	CCT	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_020512	TAG	2	6	11793	11798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020512	CTT	2	6	11843	11848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020512	TCA	2	6	11880	11885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020512	ATT	2	6	13974	13979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020512	AAG	2	6	13991	13996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020512	TTA	2	6	14017	14022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020512	AAG	2	6	14051	14056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020512	AAC	2	6	14135	14140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020512	CTT	2	6	15558	15563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020512	GTT	2	6	18231	18236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020512	AGA	2	6	18977	18982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020512	AAT	3	9	19039	19047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020512	TCT	2	6	19067	19072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020512	CTT	3	9	20493	20501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020512	GAA	2	6	21018	21023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020512	GGA	2	6	21212	21217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020512	AGA	3	9	21252	21260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020512	TGG	2	6	21471	21476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020512	AAC	2	6	21510	21515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020512	AGC	2	6	21527	21532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020512	TGA	2	6	21728	21733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020512	TCC	2	6	21845	21850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_020512	AAT	2	6	22021	22026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020512	TTA	2	6	25174	25179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020512	ACT	2	6	27128	27133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020512	TAA	2	6	28481	28486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020512	AGA	2	6	28593	28598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020512	CTG	2	6	33722	33727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020512	CTT	2	6	37079	37084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020512	TAA	2	6	39417	39422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020512	AAG	2	6	39458	39463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020512	CAT	2	6	40611	40616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020512	CTC	2	6	40736	40741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020512	AAG	2	6	40821	40826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020512	AAG	2	6	42868	42873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020512	ATG	2	6	42978	42983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020512	GAG	2	6	42992	42997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020512	ACC	2	6	43135	43140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_020512	GAT	2	6	43276	43281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020512	AAG	2	6	43282	43287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020512	GGA	2	6	43334	43339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020512	TAA	2	6	43432	43437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020512	ACT	2	6	44664	44669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020512	AAG	2	6	46515	46520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020512	TAA	2	6	48588	48593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020512	TGT	2	6	48663	48668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020512	GTC	2	6	49347	49352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020512	AAG	2	6	49369	49374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020512	TAT	2	6	49398	49403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020512	AGA	2	6	50168	50173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020512	AAG	2	6	50230	50235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020512	TCT	2	6	50244	50249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020512	ACT	2	6	50285	50290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020512	AAT	2	6	50320	50325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020512	TGT	2	6	50342	50347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020512	GCC	2	6	50389	50394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_020512	ATT	2	6	50438	50443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020512	CAA	2	6	50457	50462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_020512	TAA	2	6	52014	52019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020512	AGT	3	9	52082	52090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020512	GCA	2	6	52138	52143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020512	CTG	2	6	52153	52158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020512	GTA	2	6	52170	52175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020512	AAG	2	6	52191	52196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020512	AAG	2	6	52236	52241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020512	AGC	2	6	52277	52282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020512	AAG	2	6	52560	52565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020512	AGC	2	6	52601	52606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020512	CAA	2	6	52636	52641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020512	GCT	2	6	52716	52721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_020512	CAA	2	6	52800	52805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020512	GAT	2	6	52843	52848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020512	AAG	2	6	52921	52926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020512	AAT	2	6	52948	52953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020512	ATT	2	6	52960	52965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020512	TAA	2	6	61473	61478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020512	AAG	2	6	61535	61540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020512	AGG	2	6	61543	61548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020512	ACA	2	6	69343	69348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020512	AGA	2	6	72538	72543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020512	CGT	2	6	72586	72591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_020512	AAG	2	6	75379	75384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020512	ACT	2	6	75394	75399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020512	AGT	2	6	75430	75435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020512	CTT	2	6	77399	77404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_020512	GAG	3	9	79159	79167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020512	AGG	2	6	79190	79195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020512	ACC	2	6	79241	79246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_020512	TTA	2	6	79892	79897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020512	CAT	2	6	80093	80098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020512	TAG	2	6	80109	80114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020512	TTC	2	6	80143	80148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_020512	GTT	2	6	80161	80166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020512	GTT	2	6	80203	80208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020512	ATT	2	6	80212	80217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020512	AGG	2	6	80342	80347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020512	TAG	2	6	80414	80419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020512	GTG	2	6	85760	85765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020512	GTA	2	6	85784	85789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020512	AGC	2	6	85856	85861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020512	ATT	2	6	88720	88725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020512	AAC	2	6	88811	88816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020512	ATT	2	6	91226	91231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020512	GAA	2	6	91245	91250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020512	AAG	3	9	91285	91293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020512	GTT	2	6	93585	93590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020512	TGA	2	6	93635	93640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020512	AGA	2	6	93653	93658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020512	GAA	2	6	94150	94155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020512	TGA	2	6	94161	94166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020512	TAA	2	6	94287	94292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020512	TAA	2	6	94709	94714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020512	TAA	2	6	94782	94787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020512	ATT	3	9	95000	95008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020512	GTT	2	6	98362	98367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020512	GAA	2	6	100691	100696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020512	TTA	2	6	102799	102804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020512	TCT	2	6	104085	104090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020512	TAA	3	9	107511	107519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020512	CTT	2	6	107555	107560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020512	CTC	2	6	114635	114640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020512	ATT	2	6	114731	114736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020512	ATG	2	6	116460	116465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020512	AGT	2	6	116494	116499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020512	TAA	2	6	116546	116551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020512	TAA	2	6	118650	118655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020512	CTT	2	6	119207	119212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020512	TCT	2	6	121014	121019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020512	TAT	2	6	121045	121050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020512	ATA	2	6	121066	121071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_020512	AAG	2	6	192623	192628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_020512	GAG	2	6	192715	192720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_020512	GAA	2	6	192891	192896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_020512	AAT	2	6	192964	192969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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400	NC_020512	TAA	2	6	318823	318828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
401	NC_020512	CAT	2	6	318931	318936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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