MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU888 complete genome

Total Repeats: 1993

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020512	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	478428136
2	NC_020512	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	478428136
3	NC_020512	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	478428136
4	NC_020512	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	478428139
5	NC_020512	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	478428139
6	NC_020512	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	478428140
7	NC_020512	TC	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	478428141
8	NC_020512	GA	3	6	5873	5878	50 %	0 %	50 %	0 %	478428141
9	NC_020512	AT	3	6	5977	5982	50 %	50 %	0 %	0 %	478428141
10	NC_020512	TG	3	6	6130	6135	0 %	50 %	50 %	0 %	478428141
11	NC_020512	AG	3	6	6538	6543	50 %	0 %	50 %	0 %	478428141
12	NC_020512	AG	3	6	7012	7017	50 %	0 %	50 %	0 %	478428142
13	NC_020512	AC	3	6	8247	8252	50 %	0 %	0 %	50 %	478428143
14	NC_020512	AG	3	6	8990	8995	50 %	0 %	50 %	0 %	478428144
15	NC_020512	CT	4	8	9109	9116	0 %	50 %	0 %	50 %	478428144
16	NC_020512	GT	3	6	9191	9196	0 %	50 %	50 %	0 %	478428144
17	NC_020512	GA	3	6	10467	10472	50 %	0 %	50 %	0 %	478428146
18	NC_020512	AG	3	6	10684	10689	50 %	0 %	50 %	0 %	478428146
19	NC_020512	AG	3	6	11910	11915	50 %	0 %	50 %	0 %	478428147
20	NC_020512	TA	3	6	12470	12475	50 %	50 %	0 %	0 %	478428147
21	NC_020512	TG	3	6	13373	13378	0 %	50 %	50 %	0 %	478428148
22	NC_020512	AG	3	6	13522	13527	50 %	0 %	50 %	0 %	478428148
23	NC_020512	TC	3	6	13656	13661	0 %	50 %	0 %	50 %	478428148
24	NC_020512	AG	4	8	13678	13685	50 %	0 %	50 %	0 %	478428148
25	NC_020512	AC	3	6	15007	15012	50 %	0 %	0 %	50 %	478428149
26	NC_020512	AG	3	6	16346	16351	50 %	0 %	50 %	0 %	478428150
27	NC_020512	TC	3	6	16386	16391	0 %	50 %	0 %	50 %	478428150
28	NC_020512	GA	3	6	16915	16920	50 %	0 %	50 %	0 %	478428151
29	NC_020512	AG	3	6	16986	16991	50 %	0 %	50 %	0 %	478428151
30	NC_020512	GA	3	6	17770	17775	50 %	0 %	50 %	0 %	478428151
31	NC_020512	GA	3	6	18373	18378	50 %	0 %	50 %	0 %	478428152
32	NC_020512	TC	3	6	18823	18828	0 %	50 %	0 %	50 %	478428152
33	NC_020512	TC	3	6	19251	19256	0 %	50 %	0 %	50 %	478428153
34	NC_020512	GA	3	6	19266	19271	50 %	0 %	50 %	0 %	478428153
35	NC_020512	GA	3	6	19365	19370	50 %	0 %	50 %	0 %	478428153
36	NC_020512	AG	3	6	19831	19836	50 %	0 %	50 %	0 %	478428153
37	NC_020512	AG	4	8	20117	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	478428153
38	NC_020512	GT	3	6	20380	20385	0 %	50 %	50 %	0 %	478428153
39	NC_020512	TG	3	6	20721	20726	0 %	50 %	50 %	0 %	478428154
40	NC_020512	CT	4	8	22518	22525	0 %	50 %	0 %	50 %	478428155
41	NC_020512	AT	3	6	22788	22793	50 %	50 %	0 %	0 %	478428155
42	NC_020512	AT	3	6	23112	23117	50 %	50 %	0 %	0 %	478428155
43	NC_020512	GA	3	6	24431	24436	50 %	0 %	50 %	0 %	478428155
44	NC_020512	GA	3	6	24523	24528	50 %	0 %	50 %	0 %	478428155
45	NC_020512	AG	3	6	24904	24909	50 %	0 %	50 %	0 %	478428155
46	NC_020512	GA	3	6	26321	26326	50 %	0 %	50 %	0 %	478428156
47	NC_020512	GT	3	6	26341	26346	0 %	50 %	50 %	0 %	478428156
48	NC_020512	GA	3	6	26989	26994	50 %	0 %	50 %	0 %	478428156
49	NC_020512	AT	3	6	27406	27411	50 %	50 %	0 %	0 %	478428157
50	NC_020512	GA	3	6	27620	27625	50 %	0 %	50 %	0 %	478428157
51	NC_020512	TG	3	6	28994	28999	0 %	50 %	50 %	0 %	478428159
52	NC_020512	TC	3	6	29047	29052	0 %	50 %	0 %	50 %	478428159
53	NC_020512	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	478428159
54	NC_020512	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	478428159
55	NC_020512	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	478428160
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59	NC_020512	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	478428161
60	NC_020512	TC	3	6	32256	32261	0 %	50 %	0 %	50 %	478428163
61	NC_020512	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	478428163
62	NC_020512	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	478428163
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64	NC_020512	AG	3	6	34378	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	478428165
65	NC_020512	AG	3	6	34516	34521	50 %	0 %	50 %	0 %	478428166
66	NC_020512	AG	3	6	35209	35214	50 %	0 %	50 %	0 %	478428167
67	NC_020512	GA	4	8	35232	35239	50 %	0 %	50 %	0 %	478428167
68	NC_020512	TG	3	6	36057	36062	0 %	50 %	50 %	0 %	478428168
69	NC_020512	GA	3	6	37135	37140	50 %	0 %	50 %	0 %	478428169
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71	NC_020512	AG	3	6	38130	38135	50 %	0 %	50 %	0 %	478428169
72	NC_020512	AG	3	6	38676	38681	50 %	0 %	50 %	0 %	478428169
73	NC_020512	AG	3	6	39203	39208	50 %	0 %	50 %	0 %	478428169
74	NC_020512	GA	3	6	39987	39992	50 %	0 %	50 %	0 %	478428170
75	NC_020512	AG	3	6	40124	40129	50 %	0 %	50 %	0 %	478428170
76	NC_020512	AG	3	6	40224	40229	50 %	0 %	50 %	0 %	478428170
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82	NC_020512	GA	3	6	41629	41634	50 %	0 %	50 %	0 %	478428171
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85	NC_020512	GA	4	8	42615	42622	50 %	0 %	50 %	0 %	478428172
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91	NC_020512	GA	3	6	45956	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	478428177
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101	NC_020512	CA	3	6	53669	53674	50 %	0 %	0 %	50 %	478428183
102	NC_020512	GA	3	6	54090	54095	50 %	0 %	50 %	0 %	478428184
103	NC_020512	CT	3	6	54407	54412	0 %	50 %	0 %	50 %	478428184
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110	NC_020512	CT	3	6	58785	58790	0 %	50 %	0 %	50 %	478428187
111	NC_020512	GA	3	6	60346	60351	50 %	0 %	50 %	0 %	478428188
112	NC_020512	GT	3	6	60484	60489	0 %	50 %	50 %	0 %	478428188
113	NC_020512	TC	3	6	61232	61237	0 %	50 %	0 %	50 %	478428189
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119	NC_020512	GA	3	6	63331	63336	50 %	0 %	50 %	0 %	478428190
120	NC_020512	TC	3	6	63487	63492	0 %	50 %	0 %	50 %	478428190
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122	NC_020512	AG	3	6	63868	63873	50 %	0 %	50 %	0 %	478428190
123	NC_020512	CT	4	8	63876	63883	0 %	50 %	0 %	50 %	478428190
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126	NC_020512	AG	3	6	64490	64495	50 %	0 %	50 %	0 %	478428191
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128	NC_020512	GA	3	6	65972	65977	50 %	0 %	50 %	0 %	478428192
129	NC_020512	CT	3	6	66012	66017	0 %	50 %	0 %	50 %	478428192
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139	NC_020512	GA	3	6	71033	71038	50 %	0 %	50 %	0 %	478428196
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141	NC_020512	CT	3	6	71390	71395	0 %	50 %	0 %	50 %	478428196
142	NC_020512	GA	3	6	71411	71416	50 %	0 %	50 %	0 %	478428196
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