MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 2483

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020511	GGAT	2	8	57	64	25 %	25 %	50 %	0 %	471328176
2	NC_020511	AGTG	2	8	547	554	25 %	25 %	50 %	0 %	471328176
3	NC_020511	TGGC	2	8	581	588	0 %	25 %	50 %	25 %	471328176
4	NC_020511	AATG	2	8	1066	1073	50 %	25 %	25 %	0 %	471328176
5	NC_020511	CTAT	2	8	1400	1407	25 %	50 %	0 %	25 %	471328176
6	NC_020511	AGTA	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	471328177
7	NC_020511	ATGA	2	8	2493	2500	50 %	25 %	25 %	0 %	471328178
8	NC_020511	GATA	2	8	2531	2538	50 %	25 %	25 %	0 %	471328178
9	NC_020511	TTTC	2	8	2828	2835	0 %	75 %	0 %	25 %	471328179
10	NC_020511	CATG	2	8	3709	3716	25 %	25 %	25 %	25 %	471328179
11	NC_020511	TTCC	2	8	4014	4021	0 %	50 %	0 %	50 %	471328179
12	NC_020511	TTTA	2	8	4412	4419	25 %	75 %	0 %	0 %	471328180
13	NC_020511	ATCC	2	8	4712	4719	25 %	25 %	0 %	50 %	471328180
14	NC_020511	GACG	2	8	5459	5466	25 %	0 %	50 %	25 %	471328180
15	NC_020511	TTGG	2	8	5562	5569	0 %	50 %	50 %	0 %	471328180
16	NC_020511	TGGA	2	8	5921	5928	25 %	25 %	50 %	0 %	471328181
17	NC_020511	CTTT	2	8	6298	6305	0 %	75 %	0 %	25 %	471328181
18	NC_020511	GGGA	2	8	6813	6820	25 %	0 %	75 %	0 %	471328181
19	NC_020511	GGTG	2	8	7116	7123	0 %	25 %	75 %	0 %	471328182
20	NC_020511	AAAT	2	8	7182	7189	75 %	25 %	0 %	0 %	471328182
21	NC_020511	AAGC	2	8	8420	8427	50 %	0 %	25 %	25 %	471328183
22	NC_020511	ATTG	2	8	8818	8825	25 %	50 %	25 %	0 %	471328184
23	NC_020511	AGCG	2	8	9285	9292	25 %	0 %	50 %	25 %	471328184
24	NC_020511	AAAG	2	8	9306	9313	75 %	0 %	25 %	0 %	471328184
25	NC_020511	CTTT	2	8	9646	9653	0 %	75 %	0 %	25 %	471328184
26	NC_020511	TTCG	2	8	10020	10027	0 %	50 %	25 %	25 %	471328185
27	NC_020511	AATT	2	8	10125	10132	50 %	50 %	0 %	0 %	471328185
28	NC_020511	ATGG	2	8	10184	10191	25 %	25 %	50 %	0 %	471328185
29	NC_020511	CTTT	2	8	10809	10816	0 %	75 %	0 %	25 %	471328186
30	NC_020511	GCAA	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	471328186
31	NC_020511	AGCC	2	8	11256	11263	25 %	0 %	25 %	50 %	471328186
32	NC_020511	GAAA	2	8	11399	11406	75 %	0 %	25 %	0 %	471328186
33	NC_020511	AATG	2	8	12142	12149	50 %	25 %	25 %	0 %	471328187
34	NC_020511	GTTT	2	8	13174	13181	0 %	75 %	25 %	0 %	471328188
35	NC_020511	ATGC	2	8	13604	13611	25 %	25 %	25 %	25 %	471328188
36	NC_020511	TTGT	2	8	14640	14647	0 %	75 %	25 %	0 %	471328189
37	NC_020511	TTCT	2	8	14811	14818	0 %	75 %	0 %	25 %	471328189
38	NC_020511	ATTT	2	8	15017	15024	25 %	75 %	0 %	0 %	471328189
39	NC_020511	TTTC	2	8	15679	15686	0 %	75 %	0 %	25 %	471328190
40	NC_020511	AAAT	2	8	16161	16168	75 %	25 %	0 %	0 %	471328190
41	NC_020511	GTAA	2	8	17003	17010	50 %	25 %	25 %	0 %	471328191
42	NC_020511	CTAA	2	8	17196	17203	50 %	25 %	0 %	25 %	471328191
43	NC_020511	AGAA	2	8	17459	17466	75 %	0 %	25 %	0 %	471328191
44	NC_020511	ATTT	2	8	17605	17612	25 %	75 %	0 %	0 %	471328191
45	NC_020511	GAAG	2	8	20111	20118	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
46	NC_020511	TTTG	2	8	20137	20144	0 %	75 %	25 %	0 %	471328193
47	NC_020511	TGTA	2	8	20829	20836	25 %	50 %	25 %	0 %	471328194
48	NC_020511	TGGG	2	8	22247	22254	0 %	25 %	75 %	0 %	471328195
49	NC_020511	CATT	2	8	23304	23311	25 %	50 %	0 %	25 %	471328195
50	NC_020511	GCTT	2	8	23647	23654	0 %	50 %	25 %	25 %	471328195
51	NC_020511	GGTT	2	8	23695	23702	0 %	50 %	50 %	0 %	471328195
52	NC_020511	TTCT	2	8	24065	24072	0 %	75 %	0 %	25 %	471328195
53	NC_020511	TAAC	2	8	24167	24174	50 %	25 %	0 %	25 %	471328195
54	NC_020511	CATT	2	8	24290	24297	25 %	50 %	0 %	25 %	471328195
55	NC_020511	GGTA	2	8	24660	24667	25 %	25 %	50 %	0 %	471328195
56	NC_020511	TTGA	2	8	25655	25662	25 %	50 %	25 %	0 %	471328196
57	NC_020511	TTCG	2	8	25800	25807	0 %	50 %	25 %	25 %	471328196
58	NC_020511	TAGG	2	8	25879	25886	25 %	25 %	50 %	0 %	471328196
59	NC_020511	TTCC	2	8	26003	26010	0 %	50 %	0 %	50 %	471328196
60	NC_020511	TAGG	2	8	26117	26124	25 %	25 %	50 %	0 %	471328196
61	NC_020511	TTTC	2	8	26552	26559	0 %	75 %	0 %	25 %	471328196
62	NC_020511	GCTT	2	8	26889	26896	0 %	50 %	25 %	25 %	471328196
63	NC_020511	GGAA	2	8	27472	27479	50 %	0 %	50 %	0 %	471328197
64	NC_020511	TTAA	2	8	27545	27552	50 %	50 %	0 %	0 %	471328197
65	NC_020511	AAAG	2	8	27595	27602	75 %	0 %	25 %	0 %	471328197
66	NC_020511	GGGC	2	8	27875	27882	0 %	0 %	75 %	25 %	471328197
67	NC_020511	GTTT	2	8	28158	28165	0 %	75 %	25 %	0 %	471328198
68	NC_020511	CAGA	2	8	28180	28187	50 %	0 %	25 %	25 %	471328198
69	NC_020511	CTTT	2	8	30152	30159	0 %	75 %	0 %	25 %	471328200
70	NC_020511	TTTG	2	8	30167	30174	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
71	NC_020511	TTGT	2	8	30202	30209	0 %	75 %	25 %	0 %	471328200
72	NC_020511	TGGC	2	8	30365	30372	0 %	25 %	50 %	25 %	471328200
73	NC_020511	AAAG	2	8	30925	30932	75 %	0 %	25 %	0 %	471328201
74	NC_020511	AAAC	2	8	30995	31002	75 %	0 %	0 %	25 %	471328201
75	NC_020511	GATG	2	8	31138	31145	25 %	25 %	50 %	0 %	471328201
76	NC_020511	GATA	2	8	32247	32254	50 %	25 %	25 %	0 %	471328203
77	NC_020511	TGAT	2	8	34742	34749	25 %	50 %	25 %	0 %	471328206
78	NC_020511	AAGA	3	12	34870	34881	75 %	0 %	25 %	0 %	471328206
79	NC_020511	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	471328207
80	NC_020511	GTTC	2	8	35123	35130	0 %	50 %	25 %	25 %	471328207
81	NC_020511	GGCA	2	8	35502	35509	25 %	0 %	50 %	25 %	471328208
82	NC_020511	TCGA	2	8	35759	35766	25 %	25 %	25 %	25 %	471328208
83	NC_020511	TGCT	2	8	35912	35919	0 %	50 %	25 %	25 %	471328208
84	NC_020511	TTGG	2	8	36144	36151	0 %	50 %	50 %	0 %	471328208
85	NC_020511	AGAT	2	8	36864	36871	50 %	25 %	25 %	0 %	471328208
86	NC_020511	CTTT	2	8	37237	37244	0 %	75 %	0 %	25 %	471328209
87	NC_020511	ATGA	2	8	37727	37734	50 %	25 %	25 %	0 %	471328209
88	NC_020511	TAGG	2	8	37886	37893	25 %	25 %	50 %	0 %	471328209
89	NC_020511	CAAT	2	8	38070	38077	50 %	25 %	0 %	25 %	471328209
90	NC_020511	AATG	2	8	38857	38864	50 %	25 %	25 %	0 %	471328209
91	NC_020511	AGAA	2	8	39694	39701	75 %	0 %	25 %	0 %	471328210
92	NC_020511	AAGA	2	8	39746	39753	75 %	0 %	25 %	0 %	471328210
93	NC_020511	ATCC	2	8	39754	39761	25 %	25 %	0 %	50 %	471328210
94	NC_020511	TAAT	2	8	39965	39972	50 %	50 %	0 %	0 %	471328210
95	NC_020511	GTGC	2	8	42054	42061	0 %	25 %	50 %	25 %	471328212
96	NC_020511	AGAA	2	8	42473	42480	75 %	0 %	25 %	0 %	471328212
97	NC_020511	GGAT	2	8	42625	42632	25 %	25 %	50 %	0 %	471328212
98	NC_020511	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	471328214
99	NC_020511	CAAT	2	8	44037	44044	50 %	25 %	0 %	25 %	471328214
100	NC_020511	ATTT	2	8	44794	44801	25 %	75 %	0 %	0 %	471328216
101	NC_020511	GCTC	2	8	45102	45109	0 %	25 %	25 %	50 %	471328216
102	NC_020511	TTCT	2	8	45244	45251	0 %	75 %	0 %	25 %	471328216
103	NC_020511	TTGA	2	8	45844	45851	25 %	50 %	25 %	0 %	471328217
104	NC_020511	TGTT	2	8	46016	46023	0 %	75 %	25 %	0 %	471328217
105	NC_020511	CTAT	2	8	46046	46053	25 %	50 %	0 %	25 %	471328217
106	NC_020511	TGTT	2	8	46075	46082	0 %	75 %	25 %	0 %	471328217
107	NC_020511	CTAT	2	8	46371	46378	25 %	50 %	0 %	25 %	471328217
108	NC_020511	AAGA	2	8	46867	46874	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
109	NC_020511	AAGA	2	8	46924	46931	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
110	NC_020511	AAAG	2	8	46964	46971	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
111	NC_020511	AAGA	2	8	47079	47086	75 %	0 %	25 %	0 %	471328218
112	NC_020511	ACTT	2	8	47340	47347	25 %	50 %	0 %	25 %	471328218
113	NC_020511	ATGG	2	8	47966	47973	25 %	25 %	50 %	0 %	471328218
114	NC_020511	AGGA	2	8	47997	48004	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
115	NC_020511	GAAC	2	8	48544	48551	50 %	0 %	25 %	25 %	471328218
116	NC_020511	AACA	2	8	48788	48795	75 %	0 %	0 %	25 %	471328219
117	NC_020511	CTTT	2	8	48984	48991	0 %	75 %	0 %	25 %	471328219
118	NC_020511	CTTT	2	8	49875	49882	0 %	75 %	0 %	25 %	471328220
119	NC_020511	GTAG	2	8	49893	49900	25 %	25 %	50 %	0 %	471328220
120	NC_020511	GAAG	2	8	51321	51328	50 %	0 %	50 %	0 %	471328221
121	NC_020511	TTCA	2	8	51743	51750	25 %	50 %	0 %	25 %	471328221
122	NC_020511	TCTA	2	8	51960	51967	25 %	50 %	0 %	25 %	471328221
123	NC_020511	GGAA	2	8	53125	53132	50 %	0 %	50 %	0 %	471328223
124	NC_020511	TTAA	2	8	53866	53873	50 %	50 %	0 %	0 %	471328223
125	NC_020511	CCTT	2	8	54073	54080	0 %	50 %	0 %	50 %	471328224
126	NC_020511	TTTA	2	8	54240	54247	25 %	75 %	0 %	0 %	471328224
127	NC_020511	AAAG	2	8	54464	54471	75 %	0 %	25 %	0 %	471328224
128	NC_020511	GATT	2	8	54601	54608	25 %	50 %	25 %	0 %	471328224
129	NC_020511	AATC	2	8	54656	54663	50 %	25 %	0 %	25 %	471328224
130	NC_020511	TATT	2	8	54717	54724	25 %	75 %	0 %	0 %	471328224
131	NC_020511	TCGA	2	8	55105	55112	25 %	25 %	25 %	25 %	471328225
132	NC_020511	CTTC	2	8	55199	55206	0 %	50 %	0 %	50 %	471328225
133	NC_020511	GAAT	2	8	55234	55241	50 %	25 %	25 %	0 %	471328225
134	NC_020511	TGAT	2	8	55305	55312	25 %	50 %	25 %	0 %	471328225
135	NC_020511	GGAA	2	8	55660	55667	50 %	0 %	50 %	0 %	471328225
136	NC_020511	GAGT	2	8	56229	56236	25 %	25 %	50 %	0 %	471328225
137	NC_020511	CTGG	3	12	56571	56582	0 %	25 %	50 %	25 %	471328226
138	NC_020511	TTGC	2	8	56708	56715	0 %	50 %	25 %	25 %	471328226
139	NC_020511	CGAG	2	8	56750	56757	25 %	0 %	50 %	25 %	471328226
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141	NC_020511	GTTG	2	8	57911	57918	0 %	50 %	50 %	0 %	471328226
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