MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Chlamydia trachomatis IU824 complete genome

Total Repeats: 1991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020511	GA	3	6	212	217	50 %	0 %	50 %	0 %	471328176
2	NC_020511	TC	3	6	825	830	0 %	50 %	0 %	50 %	471328176
3	NC_020511	AG	3	6	847	852	50 %	0 %	50 %	0 %	471328176
4	NC_020511	AG	3	6	2753	2758	50 %	0 %	50 %	0 %	471328179
5	NC_020511	GA	3	6	3421	3426	50 %	0 %	50 %	0 %	471328179
6	NC_020511	AT	3	6	5114	5119	50 %	50 %	0 %	0 %	471328180
7	NC_020511	TC	3	6	5862	5867	0 %	50 %	0 %	50 %	471328181
8	NC_020511	GA	3	6	5873	5878	50 %	0 %	50 %	0 %	471328181
9	NC_020511	AT	3	6	5977	5982	50 %	50 %	0 %	0 %	471328181
10	NC_020511	TG	3	6	6130	6135	0 %	50 %	50 %	0 %	471328181
11	NC_020511	AG	3	6	6538	6543	50 %	0 %	50 %	0 %	471328181
12	NC_020511	AG	3	6	7012	7017	50 %	0 %	50 %	0 %	471328182
13	NC_020511	AC	3	6	8247	8252	50 %	0 %	0 %	50 %	471328183
14	NC_020511	AG	3	6	8990	8995	50 %	0 %	50 %	0 %	471328184
15	NC_020511	CT	4	8	9109	9116	0 %	50 %	0 %	50 %	471328184
16	NC_020511	GT	3	6	9191	9196	0 %	50 %	50 %	0 %	471328184
17	NC_020511	GA	3	6	10467	10472	50 %	0 %	50 %	0 %	471328186
18	NC_020511	AG	3	6	10684	10689	50 %	0 %	50 %	0 %	471328186
19	NC_020511	AG	3	6	11910	11915	50 %	0 %	50 %	0 %	471328187
20	NC_020511	TA	3	6	12470	12475	50 %	50 %	0 %	0 %	471328187
21	NC_020511	TG	3	6	13373	13378	0 %	50 %	50 %	0 %	471328188
22	NC_020511	AG	3	6	13522	13527	50 %	0 %	50 %	0 %	471328188
23	NC_020511	TC	3	6	13656	13661	0 %	50 %	0 %	50 %	471328188
24	NC_020511	AG	4	8	13678	13685	50 %	0 %	50 %	0 %	471328188
25	NC_020511	AC	3	6	15007	15012	50 %	0 %	0 %	50 %	471328189
26	NC_020511	AG	3	6	16346	16351	50 %	0 %	50 %	0 %	471328190
27	NC_020511	TC	3	6	16386	16391	0 %	50 %	0 %	50 %	471328190
28	NC_020511	GA	3	6	16915	16920	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
29	NC_020511	AG	3	6	16986	16991	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
30	NC_020511	GA	3	6	17770	17775	50 %	0 %	50 %	0 %	471328191
31	NC_020511	GA	3	6	18373	18378	50 %	0 %	50 %	0 %	471328192
32	NC_020511	TC	3	6	18823	18828	0 %	50 %	0 %	50 %	471328192
33	NC_020511	TC	3	6	19251	19256	0 %	50 %	0 %	50 %	471328193
34	NC_020511	GA	3	6	19266	19271	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
35	NC_020511	GA	3	6	19365	19370	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
36	NC_020511	AG	3	6	19831	19836	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
37	NC_020511	AG	4	8	20117	20124	50 %	0 %	50 %	0 %	471328193
38	NC_020511	GT	3	6	20380	20385	0 %	50 %	50 %	0 %	471328193
39	NC_020511	TG	3	6	20721	20726	0 %	50 %	50 %	0 %	471328194
40	NC_020511	CT	4	8	22518	22525	0 %	50 %	0 %	50 %	471328195
41	NC_020511	AT	3	6	22788	22793	50 %	50 %	0 %	0 %	471328195
42	NC_020511	AT	3	6	23112	23117	50 %	50 %	0 %	0 %	471328195
43	NC_020511	GA	3	6	24431	24436	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
44	NC_020511	GA	3	6	24523	24528	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
45	NC_020511	AG	3	6	24904	24909	50 %	0 %	50 %	0 %	471328195
46	NC_020511	GA	3	6	26321	26326	50 %	0 %	50 %	0 %	471328196
47	NC_020511	GT	3	6	26341	26346	0 %	50 %	50 %	0 %	471328196
48	NC_020511	GA	3	6	26989	26994	50 %	0 %	50 %	0 %	471328196
49	NC_020511	AT	3	6	27406	27411	50 %	50 %	0 %	0 %	471328197
50	NC_020511	GA	3	6	27620	27625	50 %	0 %	50 %	0 %	471328197
51	NC_020511	TG	3	6	28994	28999	0 %	50 %	50 %	0 %	471328199
52	NC_020511	TC	3	6	29047	29052	0 %	50 %	0 %	50 %	471328199
53	NC_020511	GC	4	8	29461	29468	0 %	0 %	50 %	50 %	471328199
54	NC_020511	TA	3	6	29583	29588	50 %	50 %	0 %	0 %	471328199
55	NC_020511	GA	3	6	30534	30539	50 %	0 %	50 %	0 %	471328200
56	NC_020511	AG	3	6	30632	30637	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
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58	NC_020511	GA	3	6	31362	31367	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
59	NC_020511	GA	3	6	31830	31835	50 %	0 %	50 %	0 %	471328201
60	NC_020511	TC	3	6	32256	32261	0 %	50 %	0 %	50 %	471328203
61	NC_020511	CT	3	6	32736	32741	0 %	50 %	0 %	50 %	471328203
62	NC_020511	AG	3	6	32868	32873	50 %	0 %	50 %	0 %	471328203
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64	NC_020511	AG	3	6	34378	34383	50 %	0 %	50 %	0 %	471328205
65	NC_020511	AG	3	6	34516	34521	50 %	0 %	50 %	0 %	471328206
66	NC_020511	AG	3	6	35209	35214	50 %	0 %	50 %	0 %	471328207
67	NC_020511	GA	4	8	35232	35239	50 %	0 %	50 %	0 %	471328207
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69	NC_020511	GA	3	6	37135	37140	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
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71	NC_020511	AG	3	6	38130	38135	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
72	NC_020511	AG	3	6	38676	38681	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
73	NC_020511	AG	3	6	39203	39208	50 %	0 %	50 %	0 %	471328209
74	NC_020511	GA	3	6	39987	39992	50 %	0 %	50 %	0 %	471328210
75	NC_020511	AG	3	6	40124	40129	50 %	0 %	50 %	0 %	471328210
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81	NC_020511	GC	3	6	41489	41494	0 %	0 %	50 %	50 %	471328211
82	NC_020511	GA	3	6	41629	41634	50 %	0 %	50 %	0 %	471328211
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84	NC_020511	GA	3	6	42605	42610	50 %	0 %	50 %	0 %	471328212
85	NC_020511	GA	4	8	42615	42622	50 %	0 %	50 %	0 %	471328212
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89	NC_020511	TA	3	6	44561	44566	50 %	50 %	0 %	0 %	471328215
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91	NC_020511	GA	3	6	45956	45961	50 %	0 %	50 %	0 %	471328217
92	NC_020511	TG	3	6	46174	46179	0 %	50 %	50 %	0 %	471328217
93	NC_020511	AG	3	6	46185	46190	50 %	0 %	50 %	0 %	471328217
94	NC_020511	AG	4	8	46627	46634	50 %	0 %	50 %	0 %	471328218
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101	NC_020511	CA	3	6	53669	53674	50 %	0 %	0 %	50 %	471328223
102	NC_020511	GA	3	6	54090	54095	50 %	0 %	50 %	0 %	471328224
103	NC_020511	CT	3	6	54407	54412	0 %	50 %	0 %	50 %	471328224
104	NC_020511	CT	3	6	55070	55075	0 %	50 %	0 %	50 %	471328225
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108	NC_020511	GT	3	6	57263	57268	0 %	50 %	50 %	0 %	471328226
109	NC_020511	TG	3	6	57901	57906	0 %	50 %	50 %	0 %	471328226
110	NC_020511	CT	3	6	58785	58790	0 %	50 %	0 %	50 %	471328227
111	NC_020511	GA	3	6	60346	60351	50 %	0 %	50 %	0 %	471328228
112	NC_020511	GT	3	6	60484	60489	0 %	50 %	50 %	0 %	471328228
113	NC_020511	TC	3	6	61232	61237	0 %	50 %	0 %	50 %	471328229
114	NC_020511	CA	3	6	61858	61863	50 %	0 %	0 %	50 %	471328230
115	NC_020511	AT	3	6	62108	62113	50 %	50 %	0 %	0 %	471328230
116	NC_020511	GA	3	6	62131	62136	50 %	0 %	50 %	0 %	471328230
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118	NC_020511	GA	3	6	63072	63077	50 %	0 %	50 %	0 %	471328230
119	NC_020511	GA	3	6	63331	63336	50 %	0 %	50 %	0 %	471328230
120	NC_020511	TC	3	6	63487	63492	0 %	50 %	0 %	50 %	471328230
121	NC_020511	AT	3	6	63668	63673	50 %	50 %	0 %	0 %	471328230
122	NC_020511	AG	3	6	63868	63873	50 %	0 %	50 %	0 %	471328230
123	NC_020511	CT	4	8	63876	63883	0 %	50 %	0 %	50 %	471328230
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125	NC_020511	AG	3	6	64362	64367	50 %	0 %	50 %	0 %	471328230
126	NC_020511	AG	3	6	64490	64495	50 %	0 %	50 %	0 %	471328231
127	NC_020511	AG	3	6	65786	65791	50 %	0 %	50 %	0 %	471328232
128	NC_020511	GA	3	6	65972	65977	50 %	0 %	50 %	0 %	471328232
129	NC_020511	CT	3	6	66012	66017	0 %	50 %	0 %	50 %	471328232
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134	NC_020511	GA	3	6	67607	67612	50 %	0 %	50 %	0 %	471328233
135	NC_020511	CT	3	6	68691	68696	0 %	50 %	0 %	50 %	471328234
136	NC_020511	AT	3	6	69872	69877	50 %	50 %	0 %	0 %	471328236
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139	NC_020511	GA	3	6	71033	71038	50 %	0 %	50 %	0 %	471328236
140	NC_020511	GT	3	6	71309	71314	0 %	50 %	50 %	0 %	471328236
141	NC_020511	CT	3	6	71390	71395	0 %	50 %	0 %	50 %	471328236
142	NC_020511	GA	3	6	71411	71416	50 %	0 %	50 %	0 %	471328236
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