MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	AAACAC	2	12	18345	18356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020509	TTTGTT	2	12	25826	25837	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020509	GGATTA	2	12	66224	66235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020509	TACAAA	2	12	104430	104441	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020509	ATAAAA	2	12	118301	118312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020509	GTTTTA	2	12	141679	141690	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020509	TTGTTT	2	12	163320	163331	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020509	TAAAAA	2	12	177847	177858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020509	ATTCTT	2	12	194945	194956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020509	TATAAT	2	12	220956	220967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020509	ATTAAA	2	12	234956	234967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020509	AGTGAG	2	12	236251	236262	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020509	TATAAG	2	12	236519	236530	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020509	ATTTTA	2	12	258306	258317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020509	CAAAGC	2	12	264468	264479	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020509	GATTTA	2	12	332475	332486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020509	AAGAGC	2	12	358861	358872	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020509	AAAATA	2	12	443737	443748	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020509	TAAAAA	2	12	457772	457783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020509	TATTTT	2	12	482738	482749	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020509	AGTTTT	2	12	521277	521288	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020509	TAAGTT	2	12	550105	550116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020509	GGGGGT	2	12	595251	595262	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020509	TTAATT	2	12	639486	639497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020509	AAGAAA	2	12	686424	686435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020509	AATGAG	2	12	686460	686471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020509	AAAAAT	2	12	693455	693466	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020509	ACGAGA	2	12	749460	749471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_020509	TTTGAT	2	12	777892	777903	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020509	TTAAAA	2	12	784996	785007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020509	TTTAAA	2	12	818018	818029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020509	TATTAA	2	12	837679	837690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020509	TTACAA	2	12	843290	843301	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_020509	CCAAAC	2	12	866939	866950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020509	ATTAAA	2	12	880698	880709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020509	AAAAAG	2	12	902906	902917	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020509	ATTATA	2	12	926344	926355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020509	ATTGAA	2	12	933769	933780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020509	TCAAAT	2	12	956270	956281	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020509	ATTTTT	2	12	958282	958293	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020509	TAAAAT	2	12	965309	965320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020509	AATGAA	2	12	1126066	1126077	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020509	ATCCTT	2	12	1175778	1175789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020509	TTGTAT	2	12	1178199	1178210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020509	ACTTAA	2	12	1195192	1195203	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020509	TCATTT	2	12	1218705	1218716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020509	AAACTT	2	12	1218728	1218739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_020509	TTTTAA	2	12	1219084	1219095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020509	AAAAAG	2	12	1234120	1234131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020509	ATTTTT	2	12	1250446	1250457	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020509	AGTTTT	2	12	1341137	1341148	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020509	TTTTTC	2	12	1350973	1350984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020509	GTTTTA	2	12	1361999	1362010	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020509	ATGGTG	2	12	1363161	1363172	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020509	CTTAAA	2	12	1368477	1368488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020509	CTAAGT	2	12	1374094	1374105	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020509	ATAGGG	2	12	1376934	1376945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020509	AATGAA	2	12	1379316	1379327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020509	TGTTTA	2	12	1383329	1383340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020509	AAAAAC	2	12	1470803	1470814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_020509	TTGGTT	2	12	1474198	1474209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020509	AACTTA	2	12	1483403	1483414	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020509	ATAAAA	2	12	1527201	1527212	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.