MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 1282

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	478429025
2	NC_020509	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020509	TAAAA	2	10	4993	5002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020509	ATAAA	2	10	5011	5020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020509	GTTGA	2	10	5870	5879	20 %	40 %	40 %	0 %	478429029
6	NC_020509	TTTGA	2	10	6248	6257	20 %	60 %	20 %	0 %	478429029
7	NC_020509	TTTCT	2	10	8427	8436	0 %	80 %	0 %	20 %	478429030
8	NC_020509	TGAAC	2	10	11928	11937	40 %	20 %	20 %	20 %	478429033
9	NC_020509	TTTTG	2	10	11943	11952	0 %	80 %	20 %	0 %	478429033
10	NC_020509	TGGTG	2	10	12780	12789	0 %	40 %	60 %	0 %	478429034
11	NC_020509	GCTTT	2	10	13607	13616	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020509	CAAAA	2	10	18660	18669	80 %	0 %	0 %	20 %	478429039
13	NC_020509	GCTGG	2	10	18819	18828	0 %	20 %	60 %	20 %	478429039
14	NC_020509	CATCA	2	10	20036	20045	40 %	20 %	0 %	40 %	478429040
15	NC_020509	TGAAA	2	10	21003	21012	60 %	20 %	20 %	0 %	478429041
16	NC_020509	GCATG	2	10	22844	22853	20 %	20 %	40 %	20 %	478429043
17	NC_020509	CCATG	2	10	23147	23156	20 %	20 %	20 %	40 %	478429044
18	NC_020509	CTCTT	2	10	23177	23186	0 %	60 %	0 %	40 %	478429044
19	NC_020509	TTTAC	2	10	26022	26031	20 %	60 %	0 %	20 %	478429046
20	NC_020509	ATTTT	2	10	27478	27487	20 %	80 %	0 %	0 %	478429047
21	NC_020509	ATTTG	2	10	29559	29568	20 %	60 %	20 %	0 %	478429048
22	NC_020509	AAATT	2	10	30067	30076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020509	AGGGC	2	10	33795	33804	20 %	0 %	60 %	20 %	478429053
24	NC_020509	ATTGA	2	10	34459	34468	40 %	40 %	20 %	0 %	478429053
25	NC_020509	TTTTA	2	10	34765	34774	20 %	80 %	0 %	0 %	478429054
26	NC_020509	GCGCT	2	10	35217	35226	0 %	20 %	40 %	40 %	478429054
27	NC_020509	GTCTT	2	10	37076	37085	0 %	60 %	20 %	20 %	478429057
28	NC_020509	ATTTC	2	10	37329	37338	20 %	60 %	0 %	20 %	478429057
29	NC_020509	TGAAA	2	10	37875	37884	60 %	20 %	20 %	0 %	478429058
30	NC_020509	TGGCT	2	10	39382	39391	0 %	40 %	40 %	20 %	478429059
31	NC_020509	TTTAG	2	10	39737	39746	20 %	60 %	20 %	0 %	478429059
32	NC_020509	ATCAA	2	10	41874	41883	60 %	20 %	0 %	20 %	478429061
33	NC_020509	TTTGT	2	10	42540	42549	0 %	80 %	20 %	0 %	478429061
34	NC_020509	AGCAA	2	10	47984	47993	60 %	0 %	20 %	20 %	478429067
35	NC_020509	CTTAT	2	10	49733	49742	20 %	60 %	0 %	20 %	478429068
36	NC_020509	TGCCT	2	10	49856	49865	0 %	40 %	20 %	40 %	478429068
37	NC_020509	AAATG	2	10	54601	54610	60 %	20 %	20 %	0 %	478429074
38	NC_020509	TTGGC	2	10	55424	55433	0 %	40 %	40 %	20 %	478429076
39	NC_020509	AAAGA	2	10	56251	56260	80 %	0 %	20 %	0 %	478429077
40	NC_020509	ATTCA	2	10	56480	56489	40 %	40 %	0 %	20 %	478429077
41	NC_020509	AAAAT	2	10	59202	59211	80 %	20 %	0 %	0 %	478429079
42	NC_020509	TCTTT	2	10	59829	59838	0 %	80 %	0 %	20 %	478429080
43	NC_020509	AGAAA	2	10	60109	60118	80 %	0 %	20 %	0 %	478429080
44	NC_020509	TGCCT	2	10	60993	61002	0 %	40 %	20 %	40 %	478429081
45	NC_020509	TAAAA	2	10	64468	64477	80 %	20 %	0 %	0 %	478429084
46	NC_020509	ATTTC	2	10	64543	64552	20 %	60 %	0 %	20 %	478429084
47	NC_020509	TGAAA	2	10	66589	66598	60 %	20 %	20 %	0 %	478429087
48	NC_020509	TCAAA	2	10	66843	66852	60 %	20 %	0 %	20 %	478429087
49	NC_020509	TCGCC	2	10	69586	69595	0 %	20 %	20 %	60 %	478429088
50	NC_020509	TTAAA	2	10	71621	71630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020509	ACAAA	2	10	71638	71647	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020509	AAAGA	2	10	74171	74180	80 %	0 %	20 %	0 %	478429094
53	NC_020509	TTATC	2	10	74851	74860	20 %	60 %	0 %	20 %	478429095
54	NC_020509	TCATA	2	10	75408	75417	40 %	40 %	0 %	20 %	478429095
55	NC_020509	CAATA	2	10	77647	77656	60 %	20 %	0 %	20 %	478429099
56	NC_020509	GGTGG	2	10	80542	80551	0 %	20 %	80 %	0 %	478429103
57	NC_020509	TCAAT	2	10	83753	83762	40 %	40 %	0 %	20 %	478429107
58	NC_020509	CTTCT	2	10	84605	84614	0 %	60 %	0 %	40 %	478429108
59	NC_020509	TCCAA	2	10	85094	85103	40 %	20 %	0 %	40 %	478429109
60	NC_020509	CAAAA	2	10	85411	85420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020509	TTTTA	2	10	88358	88367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020509	TTTTG	2	10	88389	88398	0 %	80 %	20 %	0 %	478429112
63	NC_020509	ACGCC	2	10	88695	88704	20 %	0 %	20 %	60 %	478429112
64	NC_020509	AAAGC	2	10	89461	89470	60 %	0 %	20 %	20 %	478429113
65	NC_020509	TTACA	2	10	90243	90252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_020509	ATCTT	2	10	95472	95481	20 %	60 %	0 %	20 %	478429117
67	NC_020509	TGGCT	2	10	96013	96022	0 %	40 %	40 %	20 %	478429117
68	NC_020509	ATGCC	2	10	96427	96436	20 %	20 %	20 %	40 %	478429118
69	NC_020509	TTGAT	2	10	97341	97350	20 %	60 %	20 %	0 %	478429120
70	NC_020509	GGCGT	2	10	99155	99164	0 %	20 %	60 %	20 %	478429122
71	NC_020509	TGTTT	2	10	102237	102246	0 %	80 %	20 %	0 %	478429123
72	NC_020509	TAAGA	2	10	102336	102345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020509	TAAAA	2	10	102407	102416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020509	CTTTC	2	10	102691	102700	0 %	60 %	0 %	40 %	478429124
75	NC_020509	GAAAT	2	10	104641	104650	60 %	20 %	20 %	0 %	478429126
76	NC_020509	TTTGA	2	10	105482	105491	20 %	60 %	20 %	0 %	478429127
77	NC_020509	GGCTT	2	10	106802	106811	0 %	40 %	40 %	20 %	478429128
78	NC_020509	CGGCA	2	10	109471	109480	20 %	0 %	40 %	40 %	478429131
79	NC_020509	AATTT	2	10	111504	111513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020509	ACGAT	2	10	111952	111961	40 %	20 %	20 %	20 %	478429133
81	NC_020509	TTTTC	2	10	112147	112156	0 %	80 %	0 %	20 %	478429133
82	NC_020509	GAATT	2	10	113793	113802	40 %	40 %	20 %	0 %	478429134
83	NC_020509	TCGTT	2	10	115611	115620	0 %	60 %	20 %	20 %	478429135
84	NC_020509	CAAAA	2	10	118195	118204	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020509	AAAGC	2	10	121674	121683	60 %	0 %	20 %	20 %	478429140
86	NC_020509	TGTCT	2	10	123140	123149	0 %	60 %	20 %	20 %	478429142
87	NC_020509	CAAAT	2	10	123533	123542	60 %	20 %	0 %	20 %	478429142
88	NC_020509	ACCCT	2	10	124962	124971	20 %	20 %	0 %	60 %	478429143
89	NC_020509	ATGCC	2	10	125094	125103	20 %	20 %	20 %	40 %	478429143
90	NC_020509	TTAAT	2	10	126480	126489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020509	TGATT	2	10	127099	127108	20 %	60 %	20 %	0 %	478429145
92	NC_020509	CTAAA	2	10	127571	127580	60 %	20 %	0 %	20 %	478429147
93	NC_020509	GAATT	2	10	127720	127729	40 %	40 %	20 %	0 %	478429147
94	NC_020509	GGATC	2	10	131596	131605	20 %	20 %	40 %	20 %	478429149
95	NC_020509	AGCTC	2	10	131616	131625	20 %	20 %	20 %	40 %	478429149
96	NC_020509	GCAAT	2	10	133466	133475	40 %	20 %	20 %	20 %	478429150
97	NC_020509	AAGCC	2	10	133504	133513	40 %	0 %	20 %	40 %	478429150
98	NC_020509	TTGAT	2	10	135395	135404	20 %	60 %	20 %	0 %	478429151
99	NC_020509	TTTGA	2	10	136647	136656	20 %	60 %	20 %	0 %	478429152
100	NC_020509	GACTT	2	10	137181	137190	20 %	40 %	20 %	20 %	478429152
101	NC_020509	ATCTC	2	10	137932	137941	20 %	40 %	0 %	40 %	478429152
102	NC_020509	CGCTT	2	10	138090	138099	0 %	40 %	20 %	40 %	478429152
103	NC_020509	TTTGT	2	10	138446	138455	0 %	80 %	20 %	0 %	478429153
104	NC_020509	TGCGT	2	10	140479	140488	0 %	40 %	40 %	20 %	478429155
105	NC_020509	GAAAA	2	10	140640	140649	80 %	0 %	20 %	0 %	478429155
106	NC_020509	GAAAA	2	10	140958	140967	80 %	0 %	20 %	0 %	478429155
107	NC_020509	ATTTT	2	10	143924	143933	20 %	80 %	0 %	0 %	478429160
108	NC_020509	ATGTT	2	10	144006	144015	20 %	60 %	20 %	0 %	478429160
109	NC_020509	AAAAG	2	10	144418	144427	80 %	0 %	20 %	0 %	478429160
110	NC_020509	AAATC	2	10	146671	146680	60 %	20 %	0 %	20 %	478429161
111	NC_020509	AAAAT	2	10	148143	148152	80 %	20 %	0 %	0 %	478429162
112	NC_020509	TTTTC	2	10	150493	150502	0 %	80 %	0 %	20 %	478429165
113	NC_020509	GTAAA	2	10	151045	151054	60 %	20 %	20 %	0 %	478429166
114	NC_020509	TCTTT	2	10	152943	152952	0 %	80 %	0 %	20 %	478429168
115	NC_020509	TTTTG	2	10	154106	154115	0 %	80 %	20 %	0 %	478429169
116	NC_020509	GCGAT	2	10	154899	154908	20 %	20 %	40 %	20 %	478429169
117	NC_020509	GCTTG	2	10	155155	155164	0 %	40 %	40 %	20 %	478429169
118	NC_020509	TTTTG	2	10	155815	155824	0 %	80 %	20 %	0 %	478429170
119	NC_020509	CCAAA	2	10	157655	157664	60 %	0 %	0 %	40 %	478429171
120	NC_020509	ACGCC	2	10	161177	161186	20 %	0 %	20 %	60 %	478429173
121	NC_020509	TTATT	2	10	163073	163082	20 %	80 %	0 %	0 %	478429177
122	NC_020509	GCGTT	2	10	163431	163440	0 %	40 %	40 %	20 %	478429178
123	NC_020509	ATTTG	2	10	164406	164415	20 %	60 %	20 %	0 %	478429179
124	NC_020509	CAAAT	2	10	166306	166315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020509	AAAAC	2	10	167030	167039	80 %	0 %	0 %	20 %	478429182
126	NC_020509	GGGGA	2	10	167130	167139	20 %	0 %	80 %	0 %	478429182
127	NC_020509	TTTGG	2	10	168760	168769	0 %	60 %	40 %	0 %	478429184
128	NC_020509	AAGCC	2	10	170267	170276	40 %	0 %	20 %	40 %	478429187
129	NC_020509	ATTTT	2	10	172318	172327	20 %	80 %	0 %	0 %	478429189
130	NC_020509	GGGTG	2	10	172674	172683	0 %	20 %	80 %	0 %	478429189
131	NC_020509	ATAAA	2	10	173501	173510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020509	CAAAA	2	10	173580	173589	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020509	ATTCA	2	10	174069	174078	40 %	40 %	0 %	20 %	478429190
134	NC_020509	ATCTT	2	10	177472	177481	20 %	60 %	0 %	20 %	478429193
135	NC_020509	AGGCT	2	10	182427	182436	20 %	20 %	40 %	20 %	478429201
136	NC_020509	CGCAC	2	10	184628	184637	20 %	0 %	20 %	60 %	478429203
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262	NC_020509	AATTA	2	10	347516	347525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_020509	TTGTG	2	10	349885	349894	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_020509	TTATA	2	10	350159	350168	40 %	60 %	0 %	0 %	478429362
265	NC_020509	CGTGG	2	10	350887	350896	0 %	20 %	60 %	20 %	478429364
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