MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 16069

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429023
2	NC_020509	GTT	2	6	305	310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429023
3	NC_020509	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429023
4	NC_020509	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429023
5	NC_020509	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429023
6	NC_020509	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429024
7	NC_020509	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429024
8	NC_020509	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429024
9	NC_020509	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429024
10	NC_020509	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429025
11	NC_020509	AAC	2	6	1024	1029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429025
12	NC_020509	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429025
13	NC_020509	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
14	NC_020509	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429025
15	NC_020509	GCT	2	6	1447	1452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429025
16	NC_020509	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429025
17	NC_020509	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429025
18	NC_020509	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
19	NC_020509	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
20	NC_020509	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429026
21	NC_020509	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429026
22	NC_020509	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429026
23	NC_020509	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429026
24	NC_020509	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429026
25	NC_020509	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429026
26	NC_020509	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020509	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429027
28	NC_020509	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429027
29	NC_020509	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429027
30	NC_020509	TGC	2	6	3218	3223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429028
31	NC_020509	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429028
32	NC_020509	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429028
33	NC_020509	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429028
34	NC_020509	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020509	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020509	TGG	2	6	4179	4184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020509	TGG	2	6	4299	4304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020509	GTG	2	6	4415	4420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020509	ACC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_020509	GGT	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020509	AAT	2	6	4622	4627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020509	TTA	2	6	4862	4867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020509	TCC	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_020509	TCT	2	6	4888	4893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020509	CCG	2	6	4967	4972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_020509	AAT	2	6	4984	4989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020509	TTA	2	6	5068	5073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020509	ACC	2	6	5139	5144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_020509	ATT	2	6	5477	5482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
50	NC_020509	TGG	2	6	5575	5580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
51	NC_020509	GTT	2	6	5777	5782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
52	NC_020509	TAA	2	6	5846	5851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429029
53	NC_020509	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
54	NC_020509	GTG	2	6	5973	5978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429029
55	NC_020509	GTT	2	6	5993	5998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
56	NC_020509	TCT	2	6	6117	6122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429029
57	NC_020509	AGT	2	6	6205	6210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429029
58	NC_020509	AGA	2	6	6326	6331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429029
59	NC_020509	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429029
60	NC_020509	CTG	2	6	6577	6582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	478429029
61	NC_020509	TGT	2	6	6637	6642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
62	NC_020509	ACC	2	6	6647	6652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429029
63	NC_020509	TTA	2	6	6669	6674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429029
64	NC_020509	CCG	2	6	6690	6695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429029
65	NC_020509	GTT	2	6	6752	6757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
66	NC_020509	TTG	2	6	6794	6799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429029
67	NC_020509	TGT	2	6	7462	7467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020509	TGT	2	6	7558	7563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020509	CAT	2	6	7648	7653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
70	NC_020509	GCC	2	6	7654	7659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
71	NC_020509	TCT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
72	NC_020509	AAT	2	6	7813	7818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
73	NC_020509	CTT	2	6	7821	7826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
74	NC_020509	CAT	2	6	7911	7916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
75	NC_020509	ATG	2	6	7964	7969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
76	NC_020509	TCA	2	6	7988	7993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
77	NC_020509	CCG	2	6	8042	8047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
78	NC_020509	CTT	2	6	8061	8066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
79	NC_020509	TCA	2	6	8096	8101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
80	NC_020509	CAT	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429030
81	NC_020509	TTC	2	6	8377	8382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
82	NC_020509	CCG	2	6	8396	8401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	478429030
83	NC_020509	CAC	2	6	8497	8502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429030
84	NC_020509	GAT	2	6	8539	8544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
85	NC_020509	TAG	2	6	8578	8583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429030
86	NC_020509	GAA	2	6	8586	8591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429030
87	NC_020509	CTT	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
88	NC_020509	TCT	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
89	NC_020509	TAA	2	6	8904	8909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429030
90	NC_020509	CTT	2	6	8982	8987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
91	NC_020509	GCA	2	6	9035	9040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429030
92	NC_020509	CTT	2	6	9060	9065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429030
93	NC_020509	TAA	3	9	9296	9304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020509	ACA	2	6	9382	9387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429031
95	NC_020509	TCT	2	6	9416	9421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
96	NC_020509	CTT	2	6	9498	9503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
97	NC_020509	GAT	3	9	9586	9594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429031
98	NC_020509	TCT	2	6	9614	9619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	478429031
99	NC_020509	CTA	2	6	9630	9635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429031
100	NC_020509	TAA	2	6	9777	9782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020509	ATT	2	6	9796	9801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020509	GAA	2	6	9925	9930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020509	TTG	2	6	10045	10050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
104	NC_020509	GAA	2	6	10061	10066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
105	NC_020509	TTA	2	6	10240	10245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
106	NC_020509	AGA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
107	NC_020509	ACC	2	6	10263	10268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	478429032
108	NC_020509	AAG	2	6	10296	10301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
109	NC_020509	ATT	2	6	10329	10334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
110	NC_020509	CAT	2	6	10510	10515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429032
111	NC_020509	GTG	2	6	10544	10549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429032
112	NC_020509	ATG	2	6	10824	10829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429032
113	NC_020509	AGG	2	6	10889	10894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	478429032
114	NC_020509	AAC	2	6	10916	10921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429032
115	NC_020509	AGA	2	6	11302	11307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429032
116	NC_020509	TTG	2	6	11315	11320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
117	NC_020509	GAC	2	6	11402	11407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	478429032
118	NC_020509	TTA	3	9	11423	11431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429032
119	NC_020509	TTG	2	6	11480	11485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429032
120	NC_020509	TGT	2	6	11666	11671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429033
121	NC_020509	TGT	2	6	11834	11839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429033
122	NC_020509	AAG	2	6	11993	11998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
123	NC_020509	TAA	2	6	12303	12308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429033
124	NC_020509	CAA	2	6	12390	12395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429033
125	NC_020509	TGG	3	9	12404	12412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429033
126	NC_020509	GAA	3	9	12421	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
127	NC_020509	ATT	2	6	12474	12479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429033
128	NC_020509	AGA	2	6	12525	12530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429033
129	NC_020509	AGG	2	6	12749	12754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020509	TTA	2	6	12836	12841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
131	NC_020509	GAA	2	6	12853	12858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429034
132	NC_020509	GTT	2	6	12920	12925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	478429034
133	NC_020509	ATT	2	6	12943	12948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
134	NC_020509	AAT	2	6	13225	13230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	478429034
135	NC_020509	CAA	2	6	13324	13329	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	478429034
136	NC_020509	CTA	2	6	13382	13387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429034
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138	NC_020509	ATT	2	6	13468	13473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	478429034
139	NC_020509	AGA	3	9	13521	13529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	478429034
140	NC_020509	ATA	2	6	13685	13690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020509	GTG	2	6	13945	13950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	478429035
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167	NC_020509	CTG	2	6	16732	16737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_020509	GAT	2	6	16799	16804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_020509	GTT	2	6	25330	25335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_020509	TAG	2	6	25453	25458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	478429045
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251	NC_020509	TTA	2	6	25893	25898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_020509	ATT	2	6	26007	26012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_020509	CAT	2	6	26016	26021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_020509	ATC	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	478429046
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256	NC_020509	GCG	2	6	26521	26526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	478429046
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