MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 268

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	GA	11	22	7304	7325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020509	TA	3	6	9811	9816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020509	AC	3	6	13637	13642	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020509	CA	3	6	16711	16716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_020509	TC	3	6	29355	29360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020509	AG	3	6	35770	35775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020509	CT	3	6	63535	63540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020509	GA	3	6	63612	63617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020509	TC	3	6	64906	64911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020509	AT	3	6	71969	71974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020509	GC	3	6	73525	73530	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020509	AG	3	6	73745	73750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020509	AG	3	6	85544	85549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020509	AG	3	6	96208	96213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020509	GA	3	6	96268	96273	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020509	AG	3	6	104457	104462	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020509	TA	3	6	104505	104510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020509	TA	3	6	107781	107786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020509	GT	3	6	109878	109883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020509	CT	3	6	126513	126518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020509	AC	5	10	126561	126570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_020509	CA	3	6	142880	142885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020509	AG	3	6	143853	143858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020509	TA	3	6	143892	143897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020509	GC	3	6	145164	145169	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_020509	GC	3	6	148347	148352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_020509	GA	3	6	150170	150175	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020509	TG	3	6	172250	172255	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020509	CA	3	6	173393	173398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_020509	GC	3	6	173850	173855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020509	TC	3	6	175679	175684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_020509	AC	3	6	184363	184368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020509	GT	3	6	186898	186903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020509	GA	3	6	190082	190087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020509	AG	3	6	195033	195038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020509	AG	3	6	195186	195191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020509	AG	3	6	195249	195254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020509	GC	3	6	195258	195263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020509	TA	3	6	195741	195746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020509	GC	3	6	218068	218073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020509	AT	3	6	220925	220930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020509	AC	3	6	221511	221516	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020509	TG	3	6	233484	233489	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020509	TG	3	6	236537	236542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020509	AG	3	6	237768	237773	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020509	GT	3	6	241433	241438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020509	AT	3	6	273935	273940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020509	GA	3	6	300898	300903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020509	AG	3	6	311208	311213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020509	AG	3	6	341759	341764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020509	CT	3	6	350356	350361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020509	AG	3	6	350388	350393	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020509	AG	3	6	352585	352590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020509	CT	3	6	368043	368048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020509	AC	3	6	368176	368181	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_020509	TA	3	6	386877	386882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020509	TC	3	6	386978	386983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020509	AT	3	6	387061	387066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020509	AG	3	6	388745	388750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020509	AG	3	6	390207	390212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020509	GA	4	8	398294	398301	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020509	GA	3	6	414548	414553	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020509	TG	3	6	416698	416703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020509	AT	3	6	438476	438481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020509	GA	3	6	438543	438548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020509	TA	3	6	451269	451274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020509	GC	3	6	451361	451366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020509	AG	3	6	451399	451404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020509	AT	4	8	465975	465982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020509	AG	3	6	469263	469268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020509	GT	4	8	479756	479763	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020509	AG	3	6	484366	484371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020509	CA	3	6	512961	512966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_020509	AG	3	6	526687	526692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020509	CT	3	6	535995	536000	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_020509	AT	3	6	538936	538941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020509	AT	3	6	538960	538965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020509	TG	3	6	550017	550022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020509	GA	3	6	564123	564128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020509	GA	3	6	566790	566795	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020509	GA	3	6	595905	595910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020509	CT	3	6	617623	617628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020509	TC	3	6	623071	623076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_020509	CT	3	6	635696	635701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_020509	TA	3	6	638397	638402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020509	AG	3	6	644660	644665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020509	TA	3	6	674926	674931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020509	CA	3	6	678590	678595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020509	TC	3	6	680149	680154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_020509	TA	3	6	680386	680391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020509	TA	3	6	695494	695499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020509	TA	3	6	695546	695551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020509	CA	3	6	701771	701776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_020509	AG	3	6	718343	718348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020509	TA	3	6	722934	722939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020509	AG	3	6	750320	750325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020509	TC	3	6	750817	750822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020509	TG	3	6	760871	760876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020509	AT	3	6	778325	778330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020509	GA	3	6	780091	780096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020509	AG	3	6	781996	782001	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020509	GT	3	6	804947	804952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020509	GT	3	6	808044	808049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020509	TA	3	6	809474	809479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020509	TG	3	6	813570	813575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020509	CT	3	6	813670	813675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020509	TA	3	6	813793	813798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020509	TA	3	6	813913	813918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020509	TG	3	6	814294	814299	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020509	AG	3	6	820476	820481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020509	AC	3	6	824556	824561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_020509	AC	3	6	825053	825058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_020509	AG	3	6	826124	826129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020509	CA	3	6	830384	830389	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020509	TA	3	6	830393	830398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020509	TC	3	6	836171	836176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020509	AG	3	6	836771	836776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020509	TC	3	6	837081	837086	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_020509	AG	3	6	837503	837508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020509	CT	3	6	837907	837912	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020509	CA	3	6	838227	838232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_020509	CT	3	6	839083	839088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020509	CT	3	6	839106	839111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020509	TC	4	8	840681	840688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020509	AT	3	6	850617	850622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020509	TG	3	6	854589	854594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020509	AT	3	6	854770	854775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020509	AT	3	6	854789	854794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020509	TG	3	6	856957	856962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020509	AG	3	6	866588	866593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020509	CA	3	6	867082	867087	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_020509	TG	3	6	872817	872822	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020509	TC	3	6	872885	872890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_020509	CT	3	6	873363	873368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020509	CT	3	6	901467	901472	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020509	AT	3	6	901526	901531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020509	AG	3	6	903012	903017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020509	CA	3	6	911830	911835	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_020509	TG	3	6	920954	920959	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020509	TG	3	6	924608	924613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020509	AT	3	6	926479	926484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020509	AC	3	6	951071	951076	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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144	NC_020509	AG	3	6	962708	962713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020509	AG	3	6	963236	963241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020509	CT	3	6	963645	963650	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_020509	CT	3	6	976696	976701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_020509	AG	3	6	978725	978730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_020509	CA	3	6	998366	998371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_020509	AT	3	6	999474	999479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.