MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	AAAAAG	2	12	5151	5162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020508	AAACAC	2	12	18348	18359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020508	TTTCTT	2	12	22979	22990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020508	TACAAA	2	12	106231	106242	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020508	ATAAAA	2	12	120099	120110	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020508	GTTTTA	2	12	144087	144098	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020508	TTAAAA	2	12	152771	152782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020508	TTGTTT	2	12	165894	165905	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020508	TAAAAA	2	12	180402	180413	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020508	ACTCAA	2	12	217245	217256	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020508	TATAAT	2	12	224063	224074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020508	ATTAAA	2	12	237036	237047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020508	AGTGAG	2	12	238345	238356	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020508	ATTTTA	2	12	260545	260556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020508	CAAAGC	2	12	266704	266715	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020508	GATTTA	2	12	334633	334644	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020508	ATTCAA	2	12	353966	353977	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020508	AAAATA	2	12	447853	447864	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020508	TAAAAA	2	12	461659	461670	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020508	TATTTT	2	12	484729	484740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020508	ACAAAA	2	12	517670	517681	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020508	CTTTTT	2	12	517965	517976	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020508	AAAACT	2	12	536263	536274	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020508	TTGTAA	2	12	578789	578800	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020508	AATAGA	2	12	581627	581638	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020508	AAAACT	2	12	581855	581866	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020508	CCAAAT	2	12	597415	597426	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020508	TTTAAA	2	12	603837	603848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020508	ATTTTA	2	12	636808	636819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020508	TAAAAT	2	12	643906	643917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020508	AAACAA	2	12	670612	670623	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020508	CTCAAT	2	12	692303	692314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020508	TTAGAA	2	12	737434	737445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020508	AAGAAA	2	12	743681	743692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020508	AAAAAT	3	18	749532	749549	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020508	ATTTTT	2	12	855665	855676	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020508	ATTTTT	2	12	934795	934806	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020508	CAAAAA	2	12	955867	955878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020508	ATTATA	2	12	978748	978759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020508	TAAAAT	2	12	978773	978784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020508	ATTGAA	2	12	986138	986149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020508	ATTATA	2	12	1023180	1023191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020508	TTAAAA	2	12	1033203	1033214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020508	TTTTTA	2	12	1056046	1056057	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020508	CAAACA	2	12	1176493	1176504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020508	TTTATT	2	12	1179414	1179425	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020508	AACGCT	2	12	1179899	1179910	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020508	ATCCTT	2	12	1226982	1226993	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020508	TTGTAT	2	12	1229403	1229414	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020508	ACTTAA	2	12	1246499	1246510	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020508	CCCTAA	2	12	1263030	1263041	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_020508	AAACTT	2	12	1270067	1270078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_020508	ATTTTT	2	12	1300873	1300884	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020508	TAAAAA	2	12	1328948	1328959	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020508	AAAGAA	2	12	1382938	1382949	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020508	AGTTTT	2	12	1396778	1396789	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020508	TTTTTA	2	12	1403134	1403145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020508	GTTTTA	2	12	1418171	1418182	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020508	TAAAAA	2	12	1418996	1419007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020508	AAGCCA	2	12	1419147	1419158	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020508	CTAAGT	2	12	1430278	1430289	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020508	CAATTT	2	12	1432390	1432401	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020508	TGTTTA	2	12	1438522	1438533	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.