MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 1326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	TAAAA	2	10	1601	1610	80 %	20 %	0 %	0 %	470164403
2	NC_020508	GATTA	2	10	2248	2257	40 %	40 %	20 %	0 %	470164404
3	NC_020508	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020508	AATTA	2	10	2924	2933	60 %	40 %	0 %	0 %	470164405
5	NC_020508	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020508	CCATG	2	10	5362	5371	20 %	20 %	20 %	40 %	470164407
7	NC_020508	TTTGA	2	10	6251	6260	20 %	60 %	20 %	0 %	470164407
8	NC_020508	GTCTT	2	10	7544	7553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020508	TTTCT	2	10	8424	8433	0 %	80 %	0 %	20 %	470164408
10	NC_020508	TTGAA	2	10	11925	11934	40 %	40 %	20 %	0 %	470164411
11	NC_020508	TTTTG	2	10	11941	11950	0 %	80 %	20 %	0 %	470164411
12	NC_020508	TGGTG	2	10	12781	12790	0 %	40 %	60 %	0 %	470164412
13	NC_020508	GCTTT	2	10	13608	13617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020508	TGGTG	2	10	16276	16285	0 %	40 %	60 %	0 %	470164415
15	NC_020508	GTTTT	2	10	16656	16665	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020508	CAAAA	2	10	18663	18672	80 %	0 %	0 %	20 %	470164417
17	NC_020508	TGAAA	2	10	21007	21016	60 %	20 %	20 %	0 %	470164419
18	NC_020508	CCATG	2	10	23239	23248	20 %	20 %	20 %	40 %	470164421
19	NC_020508	CTCTT	2	10	23269	23278	0 %	60 %	0 %	40 %	470164421
20	NC_020508	AAAGC	2	10	27076	27085	60 %	0 %	20 %	20 %	470164424
21	NC_020508	ATTTT	2	10	27672	27681	20 %	80 %	0 %	0 %	470164424
22	NC_020508	GATTT	2	10	28932	28941	20 %	60 %	20 %	0 %	470164424
23	NC_020508	ATTTG	2	10	29780	29789	20 %	60 %	20 %	0 %	470164425
24	NC_020508	AAATT	2	10	30288	30297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020508	TTTAG	2	10	30601	30610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020508	CAAAA	2	10	31536	31545	80 %	0 %	0 %	20 %	470164427
27	NC_020508	TTTTA	2	10	32475	32484	20 %	80 %	0 %	0 %	470164428
28	NC_020508	GGCGT	2	10	32497	32506	0 %	20 %	60 %	20 %	470164428
29	NC_020508	GATTT	2	10	33674	33683	20 %	60 %	20 %	0 %	470164429
30	NC_020508	AGGGC	2	10	34024	34033	20 %	0 %	60 %	20 %	470164430
31	NC_020508	ATTGA	2	10	34688	34697	40 %	40 %	20 %	0 %	470164430
32	NC_020508	TTTTA	2	10	34994	35003	20 %	80 %	0 %	0 %	470164431
33	NC_020508	GCGCT	2	10	35446	35455	0 %	20 %	40 %	40 %	470164431
34	NC_020508	GTCTT	2	10	37300	37309	0 %	60 %	20 %	20 %	470164434
35	NC_020508	ATTTC	2	10	37553	37562	20 %	60 %	0 %	20 %	470164434
36	NC_020508	ATTTA	2	10	37922	37931	40 %	60 %	0 %	0 %	470164435
37	NC_020508	TGAAA	2	10	38099	38108	60 %	20 %	20 %	0 %	470164435
38	NC_020508	TGGCT	2	10	39606	39615	0 %	40 %	40 %	20 %	470164436
39	NC_020508	TTTAG	2	10	39961	39970	20 %	60 %	20 %	0 %	470164436
40	NC_020508	TTTGT	2	10	42758	42767	0 %	80 %	20 %	0 %	470164438
41	NC_020508	AATTG	2	10	47034	47043	40 %	40 %	20 %	0 %	470164444
42	NC_020508	AAAGC	2	10	48219	48228	60 %	0 %	20 %	20 %	470164444
43	NC_020508	TCAAT	2	10	49279	49288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020508	CTTAT	2	10	49954	49963	20 %	60 %	0 %	20 %	470164445
45	NC_020508	GCCAA	2	10	49967	49976	40 %	0 %	20 %	40 %	470164445
46	NC_020508	TGCCT	2	10	50077	50086	0 %	40 %	20 %	40 %	470164445
47	NC_020508	AAAAC	2	10	51543	51552	80 %	0 %	0 %	20 %	470164447
48	NC_020508	TGCCT	2	10	52418	52427	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020508	AAATG	2	10	55120	55129	60 %	20 %	20 %	0 %	470164449
50	NC_020508	TTGGC	2	10	55952	55961	0 %	40 %	40 %	20 %	470164451
51	NC_020508	AAAGA	2	10	56779	56788	80 %	0 %	20 %	0 %	470164452
52	NC_020508	ATTCA	2	10	57008	57017	40 %	40 %	0 %	20 %	470164452
53	NC_020508	AAAAT	2	10	59711	59720	80 %	20 %	0 %	0 %	470164454
54	NC_020508	TCTTT	2	10	60338	60347	0 %	80 %	0 %	20 %	470164455
55	NC_020508	AGAAA	2	10	60618	60627	80 %	0 %	20 %	0 %	470164455
56	NC_020508	AGGCT	2	10	61133	61142	20 %	20 %	40 %	20 %	470164456
57	NC_020508	TGCCT	2	10	61508	61517	0 %	40 %	20 %	40 %	470164456
58	NC_020508	GCTTT	2	10	63797	63806	0 %	60 %	20 %	20 %	470164458
59	NC_020508	TAAAA	2	10	64896	64905	80 %	20 %	0 %	0 %	470164459
60	NC_020508	ATTTC	2	10	64971	64980	20 %	60 %	0 %	20 %	470164459
61	NC_020508	TGAAA	2	10	66876	66885	60 %	20 %	20 %	0 %	470164462
62	NC_020508	TCAAA	2	10	67130	67139	60 %	20 %	0 %	20 %	470164462
63	NC_020508	TCGCC	2	10	69873	69882	0 %	20 %	20 %	60 %	470164463
64	NC_020508	TCAAA	2	10	70885	70894	60 %	20 %	0 %	20 %	470164463
65	NC_020508	TTAAA	2	10	71908	71917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020508	ACAAA	2	10	71936	71945	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020508	AAAGA	2	10	72525	72534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020508	ATGCG	2	10	74358	74367	20 %	20 %	40 %	20 %	470164467
69	NC_020508	TATCC	2	10	75029	75038	20 %	40 %	0 %	40 %	470164468
70	NC_020508	TCATA	2	10	75584	75593	40 %	40 %	0 %	20 %	470164468
71	NC_020508	CAATA	2	10	77837	77846	60 %	20 %	0 %	20 %	470164472
72	NC_020508	GGTGG	2	10	80432	80441	0 %	20 %	80 %	0 %	470164476
73	NC_020508	TCAAT	2	10	83624	83633	40 %	40 %	0 %	20 %	470164479
74	NC_020508	TGCCT	2	10	84544	84553	0 %	40 %	20 %	40 %	470164480
75	NC_020508	TCCAA	2	10	84956	84965	40 %	20 %	0 %	40 %	470164481
76	NC_020508	CAAAA	2	10	85273	85282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020508	TTTTA	2	10	88209	88218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020508	TTTTG	2	10	88240	88249	0 %	80 %	20 %	0 %	470164484
79	NC_020508	ACGCC	2	10	88546	88555	20 %	0 %	20 %	60 %	470164484
80	NC_020508	AAAGC	2	10	89312	89321	60 %	0 %	20 %	20 %	470164485
81	NC_020508	CAAGC	2	10	93087	93096	40 %	0 %	20 %	40 %	470164492
82	NC_020508	ATCTT	2	10	97234	97243	20 %	60 %	0 %	20 %	470164494
83	NC_020508	TGGCT	2	10	97775	97784	0 %	40 %	40 %	20 %	470164494
84	NC_020508	ATGCC	2	10	98196	98205	20 %	20 %	20 %	40 %	470164495
85	NC_020508	TTGAT	2	10	99124	99133	20 %	60 %	20 %	0 %	470164497
86	NC_020508	GGCGT	2	10	100938	100947	0 %	20 %	60 %	20 %	470164499
87	NC_020508	TGTTT	2	10	104041	104050	0 %	80 %	20 %	0 %	470164500
88	NC_020508	TAAGA	2	10	104137	104146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020508	CTTTC	2	10	104492	104501	0 %	60 %	0 %	40 %	470164501
90	NC_020508	ATTTT	2	10	106727	106736	20 %	80 %	0 %	0 %	470164503
91	NC_020508	TTTGA	2	10	107277	107286	20 %	60 %	20 %	0 %	470164504
92	NC_020508	GGCTT	2	10	108595	108604	0 %	40 %	40 %	20 %	470164506
93	NC_020508	CGGCA	2	10	111266	111275	20 %	0 %	40 %	40 %	470164509
94	NC_020508	TCTTT	2	10	112429	112438	0 %	80 %	0 %	20 %	470164510
95	NC_020508	AATTT	2	10	113310	113319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020508	ACGAT	2	10	113758	113767	40 %	20 %	20 %	20 %	470164511
97	NC_020508	TTTTC	2	10	113953	113962	0 %	80 %	0 %	20 %	470164511
98	NC_020508	AATTG	2	10	115600	115609	40 %	40 %	20 %	0 %	470164512
99	NC_020508	TCGTT	2	10	117403	117412	0 %	60 %	20 %	20 %	470164513
100	NC_020508	CAAAA	2	10	119993	120002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020508	TCTTT	2	10	120709	120718	0 %	80 %	0 %	20 %	470164516
102	NC_020508	AAAGC	2	10	123491	123500	60 %	0 %	20 %	20 %	470164518
103	NC_020508	GAATG	2	10	124712	124721	40 %	20 %	40 %	0 %	470164520
104	NC_020508	TGTCT	2	10	125536	125545	0 %	60 %	20 %	20 %	470164521
105	NC_020508	CAAAT	2	10	125929	125938	60 %	20 %	0 %	20 %	470164521
106	NC_020508	ACCCT	2	10	127358	127367	20 %	20 %	0 %	60 %	470164522
107	NC_020508	ATGCC	2	10	127490	127499	20 %	20 %	20 %	40 %	470164522
108	NC_020508	TTAAT	2	10	128876	128885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020508	TGATT	2	10	129494	129503	20 %	60 %	20 %	0 %	470164524
110	NC_020508	CTAAA	2	10	129981	129990	60 %	20 %	0 %	20 %	470164526
111	NC_020508	GAATT	2	10	130130	130139	40 %	40 %	20 %	0 %	470164526
112	NC_020508	GATCG	2	10	134007	134016	20 %	20 %	40 %	20 %	470164528
113	NC_020508	AGCTC	2	10	134026	134035	20 %	20 %	20 %	40 %	470164528
114	NC_020508	AGCCA	2	10	135915	135924	40 %	0 %	20 %	40 %	470164529
115	NC_020508	GTTTG	2	10	137285	137294	0 %	60 %	40 %	0 %	470164530
116	NC_020508	TTGAT	2	10	137792	137801	20 %	60 %	20 %	0 %	470164530
117	NC_020508	TTTGA	2	10	139039	139048	20 %	60 %	20 %	0 %	470164531
118	NC_020508	ATCTC	2	10	140324	140333	20 %	40 %	0 %	40 %	470164531
119	NC_020508	CGCTT	2	10	140482	140491	0 %	40 %	20 %	40 %	470164531
120	NC_020508	TTTGT	2	10	140838	140847	0 %	80 %	20 %	0 %	470164532
121	NC_020508	TGCGT	2	10	142887	142896	0 %	40 %	40 %	20 %	470164534
122	NC_020508	GAAAA	2	10	143048	143057	80 %	0 %	20 %	0 %	470164534
123	NC_020508	ATTTT	2	10	146317	146326	20 %	80 %	0 %	0 %	470164539
124	NC_020508	ATGTT	2	10	146399	146408	20 %	60 %	20 %	0 %	470164539
125	NC_020508	AAAAG	2	10	146811	146820	80 %	0 %	20 %	0 %	470164539
126	NC_020508	AAATC	2	10	149046	149055	60 %	20 %	0 %	20 %	470164540
127	NC_020508	AAAAT	2	10	150518	150527	80 %	20 %	0 %	0 %	470164541
128	NC_020508	TTTTC	2	10	153075	153084	0 %	80 %	0 %	20 %	470164544
129	NC_020508	GTAAA	2	10	153627	153636	60 %	20 %	20 %	0 %	470164545
130	NC_020508	TTCTT	2	10	155031	155040	0 %	80 %	0 %	20 %	470164546
131	NC_020508	TCTTT	2	10	155525	155534	0 %	80 %	0 %	20 %	470164547
132	NC_020508	TTTTG	2	10	156688	156697	0 %	80 %	20 %	0 %	470164548
133	NC_020508	GCGAT	2	10	157481	157490	20 %	20 %	40 %	20 %	470164548
134	NC_020508	GCTTG	2	10	157737	157746	0 %	40 %	40 %	20 %	470164548
135	NC_020508	TTTTG	2	10	158389	158398	0 %	80 %	20 %	0 %	470164549
136	NC_020508	CCAAA	2	10	160229	160238	60 %	0 %	0 %	40 %	470164550
137	NC_020508	ACGCC	2	10	163751	163760	20 %	0 %	20 %	60 %	470164552
138	NC_020508	TTATT	2	10	165647	165656	20 %	80 %	0 %	0 %	470164556
139	NC_020508	GCGTT	2	10	166005	166014	0 %	40 %	40 %	20 %	470164557
140	NC_020508	ATGCT	2	10	166661	166670	20 %	40 %	20 %	20 %	470164558
141	NC_020508	CAAAT	2	10	168879	168888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_020508	AAAAG	2	10	193820	193829	80 %	0 %	20 %	0 %	470164589
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172	NC_020508	TATTT	2	10	212654	212663	20 %	80 %	0 %	0 %	470164610
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178	NC_020508	TGCTA	2	10	224167	224176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
179	NC_020508	TTGGT	2	10	224633	224642	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_020508	ATTAG	2	10	241931	241940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_020508	ATGAT	2	10	241959	241968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_020508	AACAT	2	10	316158	316167	60 %	20 %	0 %	20 %	470164703
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261	NC_020508	ACACT	2	10	327226	327235	40 %	20 %	0 %	40 %	470164713
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263	NC_020508	AAAAT	2	10	330400	330409	80 %	20 %	0 %	0 %	470164716
264	NC_020508	CAAAT	2	10	330433	330442	60 %	20 %	0 %	20 %	470164717
265	NC_020508	TAGCA	2	10	333044	333053	40 %	20 %	20 %	20 %	470164720
266	NC_020508	TGGCG	2	10	335286	335295	0 %	20 %	60 %	20 %	470164723
267	NC_020508	ATGGA	2	10	335712	335721	40 %	20 %	40 %	0 %	470164723
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