MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020508	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020508	GTCTT	2	10	7544	7553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020508	GCTTT	2	10	13608	13617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020508	GTTTT	2	10	16656	16665	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020508	AAATT	2	10	30288	30297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020508	TTTAG	2	10	30601	30610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020508	TCAAT	2	10	49279	49288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020508	TGCCT	2	10	52418	52427	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_020508	TTAAA	2	10	71908	71917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020508	ACAAA	2	10	71936	71945	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020508	AAAGA	2	10	72525	72534	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020508	CAAAA	2	10	85273	85282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020508	TTTTA	2	10	88209	88218	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020508	TAAGA	2	10	104137	104146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020508	AATTT	2	10	113310	113319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020508	CAAAA	2	10	119993	120002	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020508	TTAAT	2	10	128876	128885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020508	CAAAT	2	10	168879	168888	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020508	AACAA	2	10	176128	176137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020508	TTTAA	2	10	193034	193043	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020508	TTCTT	2	10	198089	198098	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020508	TTCAA	2	10	206161	206170	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020508	AATGA	2	10	208820	208829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020508	AAACA	2	10	217273	217282	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020508	TGCTA	2	10	224167	224176	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020508	TTGGT	2	10	224633	224642	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020508	AAGCG	2	10	235123	235132	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020508	TTTAG	2	10	235499	235508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020508	ATTAG	2	10	241931	241940	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020508	ATGAT	2	10	241959	241968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020508	TAAAA	2	10	249270	249279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020508	TAAAA	2	10	249588	249597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020508	AAATT	2	10	260585	260594	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020508	CATTT	2	10	276229	276238	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020508	AAATA	2	10	288347	288356	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020508	GTTTT	2	10	293961	293970	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020508	TTATA	2	10	337175	337184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020508	TTATT	2	10	342660	342669	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020508	AAGTT	2	10	344091	344100	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020508	AATTA	2	10	349925	349934	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020508	AATCA	2	10	372236	372245	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020508	TAAAA	2	10	383815	383824	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020508	AAAGG	2	10	436093	436102	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020508	TTAAT	2	10	437704	437713	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020508	ATAAA	2	10	447883	447892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020508	AAAAT	2	10	447917	447926	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020508	AAAGC	2	10	460842	460851	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020508	TAACA	2	10	468452	468461	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020508	AATAA	2	10	469841	469850	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020508	TAAAA	2	10	469935	469944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020508	AAAAT	2	10	474568	474577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020508	AGTTT	2	10	490695	490704	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020508	TAACT	2	10	495032	495041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020508	AGGCT	2	10	504374	504383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020508	AATTC	2	10	509910	509919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020508	TAAAA	2	10	510123	510132	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020508	ATTGA	2	10	511996	512005	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020508	TGCTA	2	10	515223	515232	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020508	TTAAA	2	10	515257	515266	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020508	AAGAC	2	10	517553	517562	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020508	AATTT	2	10	518235	518244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020508	GTTTC	2	10	519652	519661	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_020508	CTTTT	2	10	521588	521597	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020508	GAAAG	2	10	540172	540181	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020508	AACAA	2	10	552987	552996	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020508	AGTTT	2	10	553152	553161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020508	TTTTG	2	10	556646	556655	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020508	GTTTT	2	10	571551	571560	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020508	ATTTA	2	10	581305	581314	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020508	TTTGT	2	10	581781	581790	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020508	GTTTT	2	10	581901	581910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020508	AAATA	2	10	584250	584259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020508	ATTTG	2	10	584472	584481	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020508	AACCA	2	10	607639	607648	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_020508	TTGTA	2	10	608007	608016	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020508	TTATT	2	10	608218	608227	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020508	CTTAT	2	10	639784	639793	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020508	TAAGG	2	10	643616	643625	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020508	CGCTT	2	10	643728	643737	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_020508	ATTTT	2	10	643843	643852	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020508	ATGGT	2	10	650140	650149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020508	AACAC	2	10	650443	650452	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_020508	TTTAA	2	10	675263	675272	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020508	TTAAC	2	10	689380	689389	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020508	AATAA	2	10	692250	692259	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020508	AAAAC	2	10	700212	700221	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020508	ATTGA	2	10	737110	737119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020508	AAAAG	2	10	737300	737309	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020508	CTTAT	2	10	746227	746236	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020508	TAAAT	2	10	749461	749470	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020508	AAAAC	2	10	755288	755297	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020508	TTCTA	2	10	765800	765809	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020508	GGAAT	2	10	774698	774707	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020508	AAGAT	2	10	775598	775607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020508	ATCAA	2	10	778562	778571	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020508	ACCCA	2	10	781085	781094	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_020508	GTCAA	2	10	781158	781167	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020508	ATTTA	2	10	786831	786840	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020508	TATAG	2	10	788700	788709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020508	ACAGC	2	10	828342	828351	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020508	TAAAA	2	10	830873	830882	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020508	TTTTA	2	10	840560	840569	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020508	ATACG	2	10	846768	846777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020508	TTTTA	2	10	849809	849818	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020508	TCTAT	2	10	853955	853964	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020508	AATAA	2	10	868572	868581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020508	ATTAA	2	10	873707	873716	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020508	TTTTA	2	10	898329	898338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020508	ATAAA	2	10	898536	898545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020508	TTAAA	2	10	898616	898625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020508	TTTAA	2	10	930031	930040	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020508	ATTTG	2	10	934530	934539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020508	ATTTT	2	10	934713	934722	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020508	CAATC	2	10	938631	938640	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_020508	CTAAA	2	10	942229	942238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020508	TATAA	2	10	944686	944695	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020508	AAAAG	2	10	955991	956000	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020508	ATTGA	2	10	958397	958406	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020508	TAAAA	2	10	964897	964906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020508	TAATA	2	10	986089	986098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020508	TCAAG	2	10	995922	995931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020508	AAAAT	2	10	1050389	1050398	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020508	TTCAA	2	10	1053876	1053885	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_020508	CTCAT	2	10	1054106	1054115	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020508	TCACT	2	10	1055586	1055595	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_020508	TACTT	2	10	1055884	1055893	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020508	TTAAA	2	10	1056277	1056286	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020508	AAACT	2	10	1061499	1061508	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_020508	ATAAA	2	10	1102597	1102606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020508	TAAAA	2	10	1113607	1113616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020508	TGAAA	2	10	1127791	1127800	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020508	AAATC	2	10	1141840	1141849	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020508	AAAAC	2	10	1146676	1146685	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020508	ATTAA	2	10	1146704	1146713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020508	ATAAA	2	10	1150625	1150634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020508	AAACT	2	10	1157027	1157036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020508	AAAAC	2	10	1157044	1157053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_020508	GATTT	2	10	1175960	1175969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020508	AATTT	2	10	1175987	1175996	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020508	CAAAA	2	10	1176634	1176643	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020508	CACGA	2	10	1177203	1177212	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_020508	TTACC	2	10	1178001	1178010	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_020508	TTTTA	2	10	1178331	1178340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020508	TTAAA	2	10	1186389	1186398	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020508	AAAAG	2	10	1187982	1187991	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020508	TAAAA	2	10	1197212	1197221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_020508	TTAAA	2	10	1615537	1615546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.