MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 14869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	GAT	3	9	122	130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164401
2	NC_020508	TTC	2	6	356	361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164401
3	NC_020508	ACA	2	6	382	387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164401
4	NC_020508	ACC	2	6	393	398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164401
5	NC_020508	AAT	2	6	457	462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164402
6	NC_020508	TTA	2	6	493	498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164402
7	NC_020508	TAA	2	6	650	655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164402
8	NC_020508	AAC	2	6	697	702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164402
9	NC_020508	CTT	2	6	800	805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164402
10	NC_020508	TGA	2	6	818	823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164402
11	NC_020508	CTA	2	6	941	946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164403
12	NC_020508	CCA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164403
13	NC_020508	GCT	2	6	1212	1217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164403
14	NC_020508	GGC	2	6	1403	1408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164403
15	NC_020508	GTT	2	6	1623	1628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164403
16	NC_020508	TAG	2	6	1646	1651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164403
17	NC_020508	CTT	2	6	1657	1662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164403
18	NC_020508	TTC	2	6	1762	1767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164404
19	NC_020508	ATG	2	6	1823	1828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164404
20	NC_020508	GTT	2	6	1897	1902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164404
21	NC_020508	TTC	2	6	1984	1989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164404
22	NC_020508	TGG	2	6	2043	2048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164404
23	NC_020508	CAT	2	6	2052	2057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164404
24	NC_020508	AAT	2	6	2104	2109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164404
25	NC_020508	TAG	2	6	2157	2162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164404
26	NC_020508	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164405
27	NC_020508	GTG	2	6	2967	2972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164405
28	NC_020508	AGA	2	6	3065	3070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164405
29	NC_020508	GTG	2	6	3126	3131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164405
30	NC_020508	GCC	2	6	3133	3138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164405
31	NC_020508	GTT	2	6	3579	3584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164406
32	NC_020508	ATC	2	6	3663	3668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164406
33	NC_020508	GCA	2	6	3774	3779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164406
34	NC_020508	ATT	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164406
35	NC_020508	GGC	2	6	3980	3985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164406
36	NC_020508	ATT	2	6	5480	5485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164407
37	NC_020508	TGG	2	6	5578	5583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164407
38	NC_020508	GTT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
39	NC_020508	TAA	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164407
40	NC_020508	TTA	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164407
41	NC_020508	GTG	2	6	5976	5981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164407
42	NC_020508	GTT	2	6	5996	6001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
43	NC_020508	TGT	2	6	6097	6102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
44	NC_020508	AGA	2	6	6329	6334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164407
45	NC_020508	TCA	2	6	6522	6527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164407
46	NC_020508	GTT	2	6	6638	6643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
47	NC_020508	TAC	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164407
48	NC_020508	CCG	2	6	6702	6707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164407
49	NC_020508	CAG	2	6	6715	6720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164407
50	NC_020508	TGT	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
51	NC_020508	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164407
52	NC_020508	CAC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164407
53	NC_020508	CCG	2	6	7015	7020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164407
54	NC_020508	GCA	2	6	7110	7115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164407
55	NC_020508	GCT	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164407
56	NC_020508	CAT	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
57	NC_020508	GCC	2	6	7651	7656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164408
58	NC_020508	TCT	2	6	7712	7717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
59	NC_020508	AAT	2	6	7810	7815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164408
60	NC_020508	CTT	2	6	7818	7823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
61	NC_020508	CAT	2	6	7908	7913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
62	NC_020508	ATG	2	6	7961	7966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164408
63	NC_020508	TCA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
64	NC_020508	CCG	2	6	8039	8044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164408
65	NC_020508	CTT	2	6	8058	8063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
66	NC_020508	TCA	2	6	8093	8098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
67	NC_020508	CAT	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164408
68	NC_020508	GTG	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164408
69	NC_020508	TTC	2	6	8374	8379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
70	NC_020508	TAA	2	6	8382	8387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164408
71	NC_020508	CCG	2	6	8393	8398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	470164408
72	NC_020508	CAC	2	6	8494	8499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164408
73	NC_020508	GAT	2	6	8536	8541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164408
74	NC_020508	TAG	2	6	8575	8580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164408
75	NC_020508	CTT	2	6	8748	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
76	NC_020508	TCT	2	6	8858	8863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
77	NC_020508	GCA	2	6	9032	9037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164408
78	NC_020508	CTT	2	6	9057	9062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164408
79	NC_020508	ACA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164409
80	NC_020508	TCT	2	6	9413	9418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164409
81	NC_020508	CTT	2	6	9495	9500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164409
82	NC_020508	GAT	3	9	9583	9591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164409
83	NC_020508	TCT	2	6	9611	9616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164409
84	NC_020508	CTA	2	6	9627	9632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164409
85	NC_020508	TTG	2	6	10043	10048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164410
86	NC_020508	GAA	2	6	10059	10064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164410
87	NC_020508	TTA	2	6	10238	10243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164410
88	NC_020508	AGA	2	6	10253	10258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164410
89	NC_020508	ACC	2	6	10261	10266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164410
90	NC_020508	AAG	2	6	10294	10299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164410
91	NC_020508	ATT	2	6	10327	10332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164410
92	NC_020508	CAT	2	6	10508	10513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164410
93	NC_020508	GTG	2	6	10542	10547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164410
94	NC_020508	ATG	2	6	10822	10827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164410
95	NC_020508	AGG	2	6	10887	10892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470164410
96	NC_020508	AAC	2	6	10914	10919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164410
97	NC_020508	AGA	2	6	11300	11305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164410
98	NC_020508	TTG	2	6	11313	11318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164410
99	NC_020508	GAC	2	6	11400	11405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470164410
100	NC_020508	TTA	3	9	11421	11429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164410
101	NC_020508	TTG	2	6	11478	11483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164410
102	NC_020508	TGT	2	6	11664	11669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164411
103	NC_020508	TGT	2	6	11832	11837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164411
104	NC_020508	AAG	2	6	11991	11996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164411
105	NC_020508	TTG	2	6	12168	12173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164411
106	NC_020508	TAA	2	6	12301	12306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164411
107	NC_020508	TGG	3	9	12402	12410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164411
108	NC_020508	GAA	3	9	12419	12427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164411
109	NC_020508	AGA	2	6	12523	12528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164411
110	NC_020508	TTA	2	6	12837	12842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164412
111	NC_020508	GAA	2	6	12854	12859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164412
112	NC_020508	GTT	2	6	12921	12926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164412
113	NC_020508	ATT	2	6	12944	12949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164412
114	NC_020508	AAT	2	6	13226	13231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164412
115	NC_020508	CAA	2	6	13325	13330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164412
116	NC_020508	CTA	2	6	13383	13388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164412
117	NC_020508	GGT	2	6	13462	13467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164412
118	NC_020508	ATT	2	6	13469	13474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164412
119	NC_020508	AGA	3	9	13522	13530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164412
120	NC_020508	GTG	2	6	13946	13951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164413
121	NC_020508	GAA	2	6	14037	14042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164414
122	NC_020508	ATT	3	9	14224	14232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164414
123	NC_020508	GAA	2	6	14363	14368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
124	NC_020508	AAC	2	6	14369	14374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470164415
125	NC_020508	ATG	2	6	14388	14393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164415
126	NC_020508	GTG	2	6	14534	14539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164415
127	NC_020508	AAG	2	6	14634	14639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
128	NC_020508	TAG	2	6	14901	14906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164415
129	NC_020508	ATT	2	6	14958	14963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164415
130	NC_020508	ACC	2	6	15396	15401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470164415
131	NC_020508	ATT	2	6	15519	15524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164415
132	NC_020508	AAG	2	6	15552	15557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
133	NC_020508	ATG	2	6	15656	15661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470164415
134	NC_020508	CTT	2	6	15826	15831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164415
135	NC_020508	AAG	2	6	15867	15872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
136	NC_020508	AGA	2	6	15877	15882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
137	NC_020508	TAT	2	6	16130	16135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164415
138	NC_020508	AGA	2	6	16153	16158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164415
139	NC_020508	TAT	2	6	16991	16996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164416
140	NC_020508	GAA	2	6	16997	17002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470164416
141	NC_020508	CTT	2	6	17115	17120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164416
142	NC_020508	ATT	2	6	17262	17267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164416
143	NC_020508	TAT	2	6	17363	17368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164416
144	NC_020508	CGG	2	6	17517	17522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470164416
145	NC_020508	GTT	2	6	17539	17544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164416
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150	NC_020508	ATA	2	6	18246	18251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164416
151	NC_020508	TTG	2	6	18468	18473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470164417
152	NC_020508	GTG	2	6	18534	18539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164417
153	NC_020508	ATC	2	6	18561	18566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164417
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155	NC_020508	CTG	2	6	18838	18843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470164417
156	NC_020508	GTG	2	6	18897	18902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470164417
157	NC_020508	TTA	2	6	19098	19103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164417
158	NC_020508	TTC	2	6	19247	19252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470164417
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162	NC_020508	TAT	2	6	19681	19686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164418
163	NC_020508	AGG	2	6	19881	19886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470164418
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167	NC_020508	ATA	2	6	20112	20117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470164418
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251	NC_020508	ATT	2	6	29232	29237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164424
252	NC_020508	CAT	2	6	29371	29376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470164424
253	NC_020508	ATT	2	6	29474	29479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470164424
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