MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis 6051-HGW

Total Repeats: 142

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020507	TTTCCC	2	12	3136	3147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_020507	ATAAAT	2	12	45538	45549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020507	AAGTAA	2	12	155006	155017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020507	CTGTTT	2	12	238545	238556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020507	AGGAAA	2	12	249908	249919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020507	GTTTTT	2	12	283774	283785	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020507	AAATGA	2	12	308215	308226	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020507	TTCATT	2	12	338222	338233	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020507	TTTTTA	2	12	369702	369713	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020507	ATTTTT	2	12	376522	376533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020507	ATGATA	2	12	432273	432284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020507	TTTTTA	2	12	449561	449572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020507	TCCTTT	2	12	493448	493459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020507	GATGTG	2	12	524387	524398	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020507	GAAACA	2	12	524422	524433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020507	ATTTTT	2	12	529057	529068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020507	TAGCTG	2	12	553467	553478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020507	TGTTTT	2	12	581581	581592	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020507	ATAAAT	2	12	598645	598656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020507	CATTTT	2	12	658545	658556	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020507	TTTTGA	2	12	697367	697378	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020507	CTTTCT	2	12	706908	706919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020507	TCTCCT	2	12	728580	728591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020507	TATTCA	2	12	786418	786429	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020507	ACATAT	2	12	787920	787931	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_020507	TACTTT	2	12	854343	854354	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020507	CAATGG	2	12	905778	905789	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_020507	ATTTAA	2	12	909922	909933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020507	GAACAA	2	12	943788	943799	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_020507	GTGTTT	2	12	952972	952983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020507	CTTTTT	2	12	954160	954171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020507	GCGGAA	2	12	962164	962175	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020507	TAAAAA	2	12	989663	989674	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020507	CTTTTT	2	12	1008552	1008563	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020507	AATGAA	2	12	1018817	1018828	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020507	TCTTTT	2	12	1073730	1073741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020507	CGGAAG	2	12	1074615	1074626	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020507	GAAAAA	2	12	1093847	1093858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020507	TTTCTT	2	12	1094789	1094800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020507	GAATTT	2	12	1103044	1103055	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020507	CTTTTT	2	12	1113969	1113980	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020507	CGGACC	2	12	1153161	1153172	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_020507	TTTAAG	2	12	1214163	1214174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020507	GGTTAA	2	12	1228960	1228971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020507	CTGAAG	2	12	1235856	1235867	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_020507	GAAAAA	2	12	1249347	1249358	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020507	AAAAAG	2	12	1252704	1252715	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020507	TTTGCA	2	12	1258357	1258368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020507	TATACT	2	12	1270571	1270582	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020507	GTTAAC	2	12	1300404	1300415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_020507	AATTCA	2	12	1385944	1385955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020507	ATTTGA	2	12	1443731	1443742	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020507	TACATA	2	12	1444041	1444052	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020507	ATAATT	2	12	1451218	1451229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020507	AAAGGA	2	12	1461747	1461758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020507	ATCATT	2	12	1483538	1483549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020507	ATCATT	2	12	1486972	1486983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020507	TTTGCT	2	12	1495460	1495471	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_020507	CTTTTT	2	12	1576011	1576022	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020507	AATATG	2	12	1722814	1722825	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020507	TCCTTC	2	12	1741574	1741585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_020507	AACATG	2	12	1783667	1783678	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_020507	TTATGA	2	12	1861310	1861321	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020507	CATCAC	2	12	1896158	1896169	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_020507	TGAAAT	2	12	1917230	1917241	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020507	TTTTAA	2	12	1933121	1933132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020507	AATTTC	2	12	1942473	1942484	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020507	AAGAGA	2	12	2002604	2002615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020507	ATCATT	2	12	2033659	2033670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_020507	GAAAAA	2	12	2055743	2055754	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020507	GTATAA	2	12	2057051	2057062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020507	TAAAAT	2	12	2058614	2058625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020507	ATTTTC	2	12	2061581	2061592	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_020507	TAATGC	2	12	2069901	2069912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_020507	CTTATC	2	12	2148484	2148495	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_020507	TTGCCG	2	12	2161165	2161176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020507	AAACGT	2	12	2162090	2162101	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020507	TTGTTT	2	12	2163582	2163593	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020507	TTTAGA	2	12	2167537	2167548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020507	ATTTAA	2	12	2186950	2186961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020507	TTTATT	2	12	2190807	2190818	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020507	TAATTT	2	12	2202766	2202777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020507	TGGTCT	2	12	2204017	2204028	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_020507	ATTTTC	2	12	2221943	2221954	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_020507	ACAAAT	2	12	2222287	2222298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_020507	TTTTTA	2	12	2240310	2240321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020507	TAATGA	2	12	2273612	2273623	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020507	GAAAAT	2	12	2279807	2279818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020507	TTATGT	2	12	2306436	2306447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020507	TTATTT	2	12	2308418	2308429	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020507	ATCTTC	2	12	2432951	2432962	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_020507	TTTCGA	2	12	2445017	2445028	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_020507	CTTTTC	2	12	2525696	2525707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020507	TTCTAA	2	12	2599909	2599920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_020507	TGACTT	2	12	2626008	2626019	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_020507	ACAGAC	2	12	2652902	2652913	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_020507	ATGCTT	2	12	2678809	2678820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_020507	AAAGAA	2	12	2706932	2706943	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020507	GATTTT	2	12	2814694	2814705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020507	GTTCAC	2	12	2817958	2817969	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_020507	CAAAAA	2	12	2857694	2857705	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_020507	GCCGGA	2	12	2865277	2865288	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020507	CCCTCT	2	12	2908084	2908095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_020507	CTCTTT	2	12	2955641	2955652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_020507	TTTAAG	2	12	2982432	2982443	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020507	TATTCA	2	12	2983077	2983088	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_020507	CTTATC	2	12	3045180	3045191	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_020507	CATTAT	2	12	3054621	3054632	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_020507	TAAAAA	2	12	3061548	3061559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020507	AAAAGA	2	12	3088339	3088350	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020507	ACAAGA	2	12	3119307	3119318	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_020507	CTTATA	2	12	3171709	3171720	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_020507	ATATTT	2	12	3255027	3255038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020507	AGAATA	2	12	3255361	3255372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020507	ATTATC	2	12	3292367	3292378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_020507	CGCTGA	2	12	3312795	3312806	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020507	GCCTCC	2	12	3327132	3327143	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_020507	GAAAAA	2	12	3360905	3360916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020507	AAAAAC	2	12	3441071	3441082	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_020507	CAAAAA	2	12	3491260	3491271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_020507	GAAGTT	2	12	3492720	3492731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020507	CTCAGT	2	12	3509752	3509763	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020507	AAACAT	2	12	3562283	3562294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_020507	TCTTTT	2	12	3568200	3568211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_020507	CAGTAC	2	12	3615572	3615583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_020507	AAAAAC	2	12	3630939	3630950	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_020507	GTATAT	2	12	3631698	3631709	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020507	ATATTT	2	12	3671755	3671766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020507	ATTTAA	2	12	3681239	3681250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020507	GTATAC	2	12	3712499	3712510	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_020507	TTTTAT	2	12	3717131	3717142	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.