MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Sulfuricurvum sp. RIFRC-1

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020505	CAATAT	2	12	30398	30409	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020505	TATAAA	2	12	39821	39832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020505	AGTGTA	2	12	45743	45754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020505	ACCTTA	2	12	55267	55278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020505	CCAATA	2	12	68874	68885	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020505	TAGATG	2	12	73610	73621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020505	TTTTCT	2	12	75408	75419	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_020505	AATAAA	2	12	124166	124177	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020505	ATATAA	2	12	288981	288992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020505	TAGCGT	2	12	316665	316676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_020505	AATTTG	2	12	362888	362899	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020505	TAATTG	2	12	480513	480524	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020505	AATCAA	2	12	633933	633944	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020505	AGGGCT	2	12	645264	645275	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020505	TTACTA	2	12	657560	657571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_020505	TGGTGA	2	12	686702	686713	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020505	TAGTTG	2	12	704870	704881	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020505	ATATTT	2	12	794719	794730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020505	TTTTTG	2	12	876221	876232	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020505	TTAGCG	2	12	899752	899763	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_020505	AATAGG	2	12	928800	928811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020505	AAAAAT	2	12	941073	941084	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020505	ATTCGT	2	12	957001	957012	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020505	CAAAAA	2	12	1002936	1002947	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020505	AGTTTG	2	12	1053524	1053535	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020505	AGGGCT	2	12	1056821	1056832	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_020505	ACAATC	2	12	1059143	1059154	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020505	TAAAGA	2	12	1129935	1129946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020505	TTTATT	2	12	1135162	1135173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020505	TAAAAT	2	12	1316363	1316374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020505	ATCCAA	2	12	1350668	1350679	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_020505	TTTAAA	2	12	1368611	1368622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020505	TTTTAA	2	12	1494672	1494683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020505	TAATGA	2	12	1512841	1512852	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020505	TTTGTA	2	12	1545436	1545447	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020505	AAAAAT	2	12	1548833	1548844	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020505	TTAGAA	2	12	1580031	1580042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020505	CATTAT	2	12	1588841	1588852	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_020505	GTCAAT	2	12	1786939	1786950	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_020505	TTTATG	2	12	1849464	1849475	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020505	ATAATT	2	12	1873493	1873504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020505	AGAATA	2	12	1951148	1951159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020505	AGATAA	2	12	2042116	2042127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020505	ATCTTC	2	12	2066950	2066961	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020505	ACGCTA	2	12	2068628	2068639	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020505	AAGCTT	2	12	2069709	2069720	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_020505	TTAAAA	2	12	2072992	2073003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020505	GGAGGC	2	12	2144622	2144633	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020505	TTTAAT	2	12	2201206	2201217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020505	GATAGA	2	12	2267931	2267942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020505	CAAACT	2	12	2311822	2311833	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.