MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Sulfuricurvum sp. RIFRC-1

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020505	ATATA	2	10	2633	2642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020505	AATAA	2	10	5093	5102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020505	TAAAA	2	10	6591	6600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020505	TGTAA	2	10	25117	25126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020505	AGTAT	2	10	29660	29669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020505	TTTAT	2	10	37121	37130	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020505	GATTC	2	10	59564	59573	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020505	AATCA	2	10	60365	60374	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020505	ATAAA	2	10	80518	80527	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020505	TCTAT	2	10	86430	86439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020505	CCTCT	2	10	153242	153251	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_020505	GAATT	2	10	153475	153484	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020505	TGCAA	2	10	178470	178479	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020505	ATTGT	2	10	204868	204877	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020505	ATAAA	2	10	238294	238303	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020505	CTTAA	2	10	246032	246041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020505	TATCA	2	10	249741	249750	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020505	AGATA	2	10	297948	297957	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020505	TTTAG	2	10	306302	306311	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020505	CGTAT	2	10	338210	338219	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020505	GTAGC	2	10	376884	376893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020505	TGATA	2	10	377195	377204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020505	CATTG	2	10	383275	383284	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020505	TAAGG	2	10	441780	441789	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020505	TTTTA	2	10	467964	467973	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020505	ATTAT	2	10	474196	474205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020505	TATAG	2	10	512437	512446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020505	TAAAA	2	10	514663	514672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020505	TTGTT	2	10	521364	521373	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020505	ATTGC	2	10	549344	549353	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020505	TTAAA	2	10	570102	570111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020505	TTCTT	2	10	582283	582292	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_020505	AAAAT	2	10	584221	584230	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020505	AAATC	2	10	591500	591509	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020505	AAAAG	2	10	595071	595080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020505	GAATA	2	10	627431	627440	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020505	TCGTG	2	10	643304	643313	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020505	CCGTA	2	10	646003	646012	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_020505	ATTGA	2	10	646283	646292	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020505	ATTAC	2	10	659940	659949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020505	ATACA	2	10	725377	725386	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020505	TACTC	2	10	726465	726474	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020505	GTATC	2	10	759812	759821	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_020505	TCTTA	2	10	766762	766771	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020505	TTTTA	2	10	766920	766929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020505	ATTAA	2	10	775751	775760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020505	AATAC	2	10	786782	786791	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020505	GAGAG	2	10	793251	793260	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020505	AAAAG	2	10	808629	808638	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020505	AAGAA	2	10	815760	815769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020505	GTGTA	2	10	835039	835048	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020505	AATTT	2	10	855024	855033	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020505	AAGGA	2	10	860522	860531	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020505	GTATT	2	10	868999	869008	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020505	TGTGT	2	10	893648	893657	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020505	ATTAA	2	10	899669	899678	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020505	TGAGT	2	10	901764	901773	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020505	CTCTA	2	10	916969	916978	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_020505	CGATG	2	10	928113	928122	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020505	TCAGC	2	10	928742	928751	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_020505	CAAAC	2	10	967191	967200	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_020505	TTGCA	2	10	976654	976663	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020505	CAAAC	2	10	999356	999365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_020505	TTTAT	2	10	1020107	1020116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020505	AAAGA	2	10	1041758	1041767	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020505	TGGGT	2	10	1042473	1042482	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020505	TCGTG	2	10	1054767	1054776	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020505	CCGTA	2	10	1057560	1057569	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020505	ATTGA	2	10	1057840	1057849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020505	AATAT	2	10	1087634	1087643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020505	TTTTC	2	10	1087742	1087751	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020505	GAAAT	2	10	1094818	1094827	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020505	AATAT	2	10	1120317	1120326	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020505	GCAAA	2	10	1129804	1129813	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020505	GATTC	2	10	1135041	1135050	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020505	GCAAA	2	10	1135325	1135334	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020505	AGAAA	2	10	1140650	1140659	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020505	GGAAG	2	10	1149949	1149958	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020505	GTTTA	2	10	1167279	1167288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020505	AAATT	2	10	1190108	1190117	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020505	ATTAG	2	10	1223960	1223969	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020505	ATGAA	2	10	1243323	1243332	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020505	TGAGT	2	10	1245126	1245135	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020505	ACAGT	2	10	1245139	1245148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020505	TATTG	2	10	1261089	1261098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020505	AAGTG	2	10	1261143	1261152	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020505	TAATT	2	10	1268834	1268843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020505	ATTAT	2	10	1277846	1277855	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020505	TTCTT	2	10	1309476	1309485	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_020505	AGAAA	2	10	1324426	1324435	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020505	TTATA	2	10	1333479	1333488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020505	TGTAC	2	10	1333522	1333531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020505	AATTT	2	10	1360500	1360509	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020505	TAAAA	2	10	1376511	1376520	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020505	AAAAT	2	10	1379360	1379369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020505	TGTAT	2	10	1388417	1388426	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020505	ATTTT	2	10	1400179	1400188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020505	GGAGC	2	10	1404943	1404952	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_020505	GGAGT	2	10	1405151	1405160	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020505	AAATT	2	10	1466435	1466444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020505	TACCT	2	10	1491346	1491355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_020505	TTATA	2	10	1518341	1518350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020505	TAATA	2	10	1523687	1523696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020505	AAATC	2	10	1523712	1523721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020505	TGATT	2	10	1545111	1545120	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020505	AGATG	2	10	1548866	1548875	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020505	AGTTA	2	10	1549005	1549014	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020505	GAAGA	2	10	1549070	1549079	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020505	GAATA	2	10	1572364	1572373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020505	CTTCA	2	10	1593346	1593355	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020505	AAGGA	2	10	1603394	1603403	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020505	TCCTT	2	10	1640151	1640160	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_020505	ACACC	2	10	1681155	1681164	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
114	NC_020505	TTTTA	2	10	1735865	1735874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020505	TCTAA	2	10	1735907	1735916	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020505	GCGGG	2	10	1765376	1765385	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020505	GTAGT	2	10	1765441	1765450	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020505	ATTTT	2	10	1793142	1793151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020505	TCAAA	2	10	1822169	1822178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020505	TAAAA	2	10	1836395	1836404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020505	TTCAA	2	10	1850797	1850806	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020505	TACGG	2	10	1851078	1851087	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020505	CACGA	2	10	1853777	1853786	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_020505	GAAAA	2	10	1870733	1870742	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020505	TAAAT	2	10	1875100	1875109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020505	CTAAG	2	10	1887368	1887377	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020505	GTTTA	2	10	1907745	1907754	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020505	CTTTC	2	10	1913573	1913582	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
129	NC_020505	CTCTC	2	10	1949200	1949209	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
130	NC_020505	AAGGT	2	10	1949321	1949330	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020505	ACACT	2	10	1951160	1951169	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_020505	GCCCC	2	10	1951225	1951234	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
133	NC_020505	TTGGA	2	10	1952092	1952101	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020505	TATAA	2	10	1966486	1966495	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020505	ACCCA	2	10	1970203	1970212	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_020505	TCCTC	2	10	2017610	2017619	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
137	NC_020505	AAAAG	2	10	2021600	2021609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020505	TTTAA	2	10	2031337	2031346	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020505	TCTCG	2	10	2032311	2032320	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_020505	TATGA	2	10	2034530	2034539	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020505	TCTTT	2	10	2036677	2036686	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020505	ATCAT	2	10	2044582	2044591	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_020505	ATATT	2	10	2050915	2050924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020505	ATGAA	2	10	2065834	2065843	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020505	TAAAA	2	10	2075124	2075133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020505	TATAA	2	10	2129314	2129323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020505	CGCTA	2	10	2155080	2155089	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
148	NC_020505	ATCGA	2	10	2186126	2186135	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_020505	ATTTT	2	10	2212503	2212512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020505	TATTT	2	10	2235221	2235230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020505	TTCTT	2	10	2262781	2262790	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_020505	TTAAA	2	10	2305992	2306001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020505	TTCAA	2	10	2307601	2307610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_020505	TACGG	2	10	2307882	2307891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_020505	CACGA	2	10	2310581	2310590	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_020505	TTTTA	2	10	2334902	2334911	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020505	ATTGT	2	10	2352483	2352492	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020505	AATTA	2	10	2353886	2353895	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.