MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Agromonas oligotrophica S58 DNA

Total Repeats: 5031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_020453	TAGTCG	2	12	8211953	8211964	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459293631
5002	NC_020453	GATAGC	2	12	8214092	8214103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	459293632
5003	NC_020453	GGTACC	2	12	8223121	8223132	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293640
5004	NC_020453	CGCCCC	2	12	8223361	8223372	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	459293640
5005	NC_020453	CTTGGT	2	12	8223447	8223458	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	459293641
5006	NC_020453	GCATCG	2	12	8223789	8223800	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293641
5007	NC_020453	GCGGCC	2	12	8227451	8227462	0 %	0 %	50 %	50 %	459293644
5008	NC_020453	GGCGAA	2	12	8227927	8227938	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	459293644
5009	NC_020453	GCTGAT	2	12	8231092	8231103	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459293648
5010	NC_020453	ATCGAA	2	12	8231543	8231554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	459293648
5011	NC_020453	GGCGCT	2	12	8232121	8232132	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	459293648
5012	NC_020453	CGCTGC	2	12	8232839	8232850	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	459293649
5013	NC_020453	GCGCCG	2	12	8232959	8232970	0 %	0 %	50 %	50 %	459293649
5014	NC_020453	TGCGCC	2	12	8234387	8234398	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	459293651
5015	NC_020453	GCTCGC	2	12	8236235	8236246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	459293653
5016	NC_020453	CGATCA	2	12	8237858	8237869	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459293654
5017	NC_020453	CGACCG	2	12	8239568	8239579	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	459293654
5018	NC_020453	CGCCAG	2	12	8241451	8241462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	459293657
5019	NC_020453	GCTCCG	2	12	8241981	8241992	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	459293657
5020	NC_020453	GCAGAC	2	12	8243887	8243898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459293659
5021	NC_020453	AGCCAT	2	12	8245417	8245428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459293660
5022	NC_020453	GCTGCA	2	12	8245858	8245869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293660
5023	NC_020453	GACCTG	2	12	8249037	8249048	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293665
5024	NC_020453	GCGATC	2	12	8252195	8252206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293668
5025	NC_020453	CGGCCT	2	12	8254066	8254077	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	459293670
5026	NC_020453	CTTGCC	2	12	8257369	8257380	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	459293672
5027	NC_020453	TGGCGT	2	12	8258232	8258243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	459293672
5028	NC_020453	GCGACC	2	12	8258252	8258263	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	459293672
5029	NC_020453	GGTCAC	2	12	8258905	8258916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293672
5030	NC_020453	ATCGCG	2	12	8261303	8261314	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	459293676
5031	NC_020453	GACGCC	3	18	8262066	8262083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	459293677

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.