MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Agromonas oligotrophica S58 DNA

Total Repeats: 3526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020453	AGCG	2	8	507	514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_020453	GGTC	2	8	12430	12437	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020453	ATCT	2	8	13898	13905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_020453	GCTT	2	8	13949	13956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020453	ACTC	2	8	23265	23272	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_020453	TCGC	2	8	23381	23388	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_020453	GATC	2	8	23640	23647	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020453	CCCT	2	8	23761	23768	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_020453	AGCA	2	8	24043	24050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020453	GGCA	2	8	27547	27554	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020453	GGAA	2	8	30343	30350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020453	GCTC	2	8	33524	33531	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_020453	ATCG	2	8	33686	33693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020453	GAGC	2	8	35910	35917	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_020453	TGAA	2	8	38003	38010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020453	TTCG	2	8	38127	38134	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_020453	GGCC	2	8	42697	42704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_020453	AGCG	2	8	43644	43651	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_020453	AAGC	2	8	48727	48734	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020453	GTTG	2	8	52180	52187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020453	TGAA	2	8	56124	56131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020453	TTGA	2	8	62487	62494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020453	GACC	2	8	67006	67013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020453	TGCG	2	8	67718	67725	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020453	GCTG	2	8	71571	71578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020453	CGGT	2	8	71732	71739	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020453	GACC	2	8	72600	72607	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_020453	CTGT	2	8	73998	74005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_020453	CGCC	2	8	74752	74759	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_020453	TCGC	2	8	76334	76341	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_020453	GATC	2	8	80151	80158	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_020453	GACC	2	8	82178	82185	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_020453	TTAT	2	8	82198	82205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020453	CGGC	2	8	83715	83722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_020453	CTGC	2	8	84865	84872	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020453	CATT	2	8	90149	90156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020453	TTGA	2	8	92227	92234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020453	ACCG	2	8	97065	97072	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_020453	GGGT	2	8	98238	98245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020453	CGGC	2	8	105637	105644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020453	GCCG	2	8	105651	105658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020453	GCCC	3	12	105703	105714	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_020453	GCCG	2	8	109854	109861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_020453	GCTC	2	8	113079	113086	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020453	TGGC	2	8	113128	113135	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020453	TCAT	2	8	113547	113554	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020453	ATCA	2	8	114695	114702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020453	CCGG	2	8	115280	115287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_020453	CAAC	2	8	121858	121865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020453	CCCA	2	8	123162	123169	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
51	NC_020453	TCCC	2	8	124644	124651	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_020453	CAGG	2	8	127590	127597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020453	ACCC	2	8	127626	127633	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_020453	ACCG	2	8	133524	133531	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_020453	CGAT	2	8	133681	133688	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020453	TAGA	2	8	133789	133796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020453	CCGG	2	8	136152	136159	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020453	GCTT	2	8	141252	141259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020453	CCAT	2	8	141275	141282	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_020453	TGCA	2	8	144644	144651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_020453	AACG	2	8	145503	145510	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_020453	GGCC	2	8	146050	146057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_020453	GTCA	2	8	148153	148160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_020453	CGTT	2	8	148463	148470	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_020453	GGCG	2	8	148618	148625	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020453	GCAC	2	8	150015	150022	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_020453	GACC	2	8	151031	151038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_020453	TCGT	2	8	153290	153297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020453	GACC	2	8	155992	155999	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020453	GGGT	2	8	157459	157466	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020453	CAAC	2	8	157493	157500	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020453	GCGG	2	8	157538	157545	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020453	TTGC	2	8	158286	158293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020453	GACC	2	8	163180	163187	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020453	CGGA	2	8	164252	164259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_020453	GCCC	2	8	164276	164283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_020453	AGCG	2	8	167381	167388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_020453	GCCC	2	8	169863	169870	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
79	NC_020453	GCGG	2	8	173886	173893	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020453	TGAA	2	8	176945	176952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020453	GTGC	2	8	180228	180235	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_020453	CGTT	2	8	180530	180537	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_020453	AACG	2	8	180591	180598	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020453	GATG	2	8	181270	181277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020453	ACGC	2	8	185168	185175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_020453	TCGC	2	8	185387	185394	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_020453	CCCG	2	8	186569	186576	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_020453	GGCC	2	8	193280	193287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_020453	CAAA	2	8	194098	194105	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_020453	CGGG	2	8	194821	194828	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_020453	AACG	2	8	194866	194873	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020453	GGCG	2	8	198679	198686	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_020453	TTCG	2	8	199902	199909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_020453	CCGA	2	8	202577	202584	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_020453	GTTG	2	8	203502	203509	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020453	CGTC	2	8	207164	207171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020453	GCCG	2	8	210157	210164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_020453	CATC	2	8	214799	214806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020453	GATG	2	8	214831	214838	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020453	GCCT	2	8	215867	215874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_020453	TGGC	2	8	219518	219525	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020453	CGAT	2	8	219632	219639	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_020453	AAAG	2	8	221053	221060	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020453	ACAA	2	8	221144	221151	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_020453	GGGA	2	8	222493	222500	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020453	GCCG	2	8	223485	223492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020453	GGGC	2	8	227084	227091	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_020453	TGGC	2	8	227099	227106	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020453	CTAG	2	8	233114	233121	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_020453	CCTC	2	8	235112	235119	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
111	NC_020453	GCGG	2	8	246288	246295	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020453	CGTT	2	8	250107	250114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_020453	CGGG	2	8	250179	250186	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020453	GCCG	2	8	256171	256178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020453	GGCC	2	8	258114	258121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_020453	GCCG	2	8	258140	258147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_020453	TTCC	2	8	258358	258365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_020453	TAAA	2	8	258485	258492	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020453	GACG	2	8	275666	275673	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_020453	GTCG	2	8	276954	276961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_020453	GCGG	2	8	277339	277346	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020453	TCAC	2	8	280745	280752	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_020453	GCCG	2	8	282326	282333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_020453	GCTC	2	8	287934	287941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020453	AATC	2	8	293557	293564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020453	TTCG	2	8	296841	296848	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_020453	GGGT	2	8	299299	299306	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020453	GCCG	2	8	300254	300261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_020453	GAGC	2	8	301377	301384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_020453	AAGC	2	8	301395	301402	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_020453	AGGC	2	8	302255	302262	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020453	GGCC	2	8	302968	302975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020453	GAGG	2	8	305908	305915	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020453	CCCG	2	8	305928	305935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_020453	TCAT	2	8	307386	307393	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020453	CCGG	2	8	307477	307484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020453	TTCA	2	8	307524	307531	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020453	GGAC	2	8	307549	307556	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020453	TCCC	2	8	312731	312738	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_020453	CGGC	2	8	312783	312790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_020453	ATCG	2	8	314759	314766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020453	GCCG	2	8	314783	314790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_020453	CCCG	2	8	317195	317202	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
144	NC_020453	CGGG	2	8	317304	317311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_020453	AGGA	2	8	320812	320819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020453	ACGG	2	8	321620	321627	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020453	TGGA	2	8	322828	322835	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020453	TCAA	2	8	324043	324050	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020453	GAAG	2	8	325261	325268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020453	GAAG	2	8	325296	325303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020453	GGAC	2	8	326416	326423	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
152	NC_020453	TTCT	2	8	327696	327703	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_020453	TTCT	2	8	327709	327716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
154	NC_020453	AAAG	2	8	327908	327915	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020453	AGGC	2	8	332019	332026	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_020453	CGGG	2	8	333976	333983	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
157	NC_020453	CATA	2	8	337117	337124	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
158	NC_020453	TTGC	2	8	337558	337565	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
159	NC_020453	TCTT	2	8	337579	337586	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
160	NC_020453	CTTT	2	8	337595	337602	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
161	NC_020453	TTCT	2	8	337608	337615	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_020453	TCGC	2	8	337670	337677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
163	NC_020453	TGGA	2	8	340806	340813	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020453	ATTT	2	8	343322	343329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020453	ACGC	2	8	346135	346142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_020453	TCGA	2	8	346199	346206	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_020453	CCCG	2	8	346360	346367	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
168	NC_020453	GGGC	2	8	352695	352702	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
169	NC_020453	GGTC	2	8	363093	363100	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
170	NC_020453	GCCG	2	8	363106	363113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
171	NC_020453	TCCA	2	8	364828	364835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
172	NC_020453	CGAT	2	8	364909	364916	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_020453	GCGA	2	8	365094	365101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
174	NC_020453	CGCT	2	8	375144	375151	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_020453	GCCT	2	8	375670	375677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_020453	CCGG	2	8	375732	375739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_020453	CGAT	2	8	379401	379408	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
178	NC_020453	GCAA	2	8	379782	379789	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
179	NC_020453	GGCC	2	8	379958	379965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
180	NC_020453	GACC	2	8	380016	380023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
181	NC_020453	GAGC	2	8	380878	380885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
182	NC_020453	AACG	2	8	380959	380966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_020453	GGCA	2	8	382543	382550	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
184	NC_020453	CGGC	2	8	383991	383998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
185	NC_020453	CGTC	2	8	385357	385364	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
186	NC_020453	TGGT	2	8	385747	385754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_020453	ACGG	2	8	388445	388452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_020453	ACCA	2	8	389720	389727	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_020453	ACGA	2	8	390065	390072	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
191	NC_020453	AGGG	2	8	390218	390225	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020453	GCGA	2	8	390404	390411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
193	NC_020453	ATCC	2	8	390416	390423	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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195	NC_020453	GCGA	2	8	390571	390578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
196	NC_020453	GGGC	2	8	391205	391212	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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225	NC_020453	CCGG	2	8	471267	471274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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231	NC_020453	CGAT	2	8	476548	476555	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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233	NC_020453	CGGC	2	8	476610	476617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
234	NC_020453	CTCA	2	8	476654	476661	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
235	NC_020453	AGGG	2	8	477454	477461	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_020453	CTCC	2	8	489635	489642	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
243	NC_020453	AGGG	2	8	489980	489987	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_020453	TTTG	2	8	600535	600542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
282	NC_020453	CAAT	2	8	600884	600891	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
283	NC_020453	CAGT	2	8	601786	601793	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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287	NC_020453	CGAT	2	8	622518	622525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
288	NC_020453	GCGA	2	8	624946	624953	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_020453	CCCA	2	8	634179	634186	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
295	NC_020453	CCCT	2	8	634205	634212	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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442	NC_020453	CCGG	2	8	907263	907270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
443	NC_020453	ACCG	2	8	907471	907478	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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495	NC_020453	GATG	2	8	998930	998937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_020453	GCTC	2	8	1003670	1003677	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

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