MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 1530

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	AACTG	2	10	258	267	40 %	20 %	20 %	20 %	459284226
2	NC_020450	ATAAA	2	10	7044	7053	80 %	20 %	0 %	0 %	459284229
3	NC_020450	AAGAT	2	10	9830	9839	60 %	20 %	20 %	0 %	459284230
4	NC_020450	AGTAA	2	10	9973	9982	60 %	20 %	20 %	0 %	459284231
5	NC_020450	TAATA	2	10	10157	10166	60 %	40 %	0 %	0 %	459284231
6	NC_020450	ATGGT	2	10	13047	13056	20 %	40 %	40 %	0 %	459284234
7	NC_020450	ATTTT	2	10	16048	16057	20 %	80 %	0 %	0 %	459284237
8	NC_020450	AAATG	2	10	16286	16295	60 %	20 %	20 %	0 %	459284237
9	NC_020450	TACTT	2	10	17948	17957	20 %	60 %	0 %	20 %	459284237
10	NC_020450	TTTAG	2	10	20020	20029	20 %	60 %	20 %	0 %	459284240
11	NC_020450	ATGGA	2	10	20721	20730	40 %	20 %	40 %	0 %	459284242
12	NC_020450	AGTGG	2	10	20783	20792	20 %	20 %	60 %	0 %	459284242
13	NC_020450	GGGTT	2	10	21316	21325	0 %	40 %	60 %	0 %	459284242
14	NC_020450	ATTTT	2	10	22953	22962	20 %	80 %	0 %	0 %	459284243
15	NC_020450	TTTGG	2	10	23807	23816	0 %	60 %	40 %	0 %	459284244
16	NC_020450	TGGTA	2	10	25747	25756	20 %	40 %	40 %	0 %	459284245
17	NC_020450	TTTTA	2	10	28295	28304	20 %	80 %	0 %	0 %	459284246
18	NC_020450	GATTG	2	10	34136	34145	20 %	40 %	40 %	0 %	459284251
19	NC_020450	AAAAG	2	10	34587	34596	80 %	0 %	20 %	0 %	459284252
20	NC_020450	GGAGA	2	10	34936	34945	40 %	0 %	60 %	0 %	459284252
21	NC_020450	ATTCA	2	10	35212	35221	40 %	40 %	0 %	20 %	459284252
22	NC_020450	AAATT	2	10	35565	35574	60 %	40 %	0 %	0 %	459284252
23	NC_020450	ATCAA	2	10	36541	36550	60 %	20 %	0 %	20 %	459284253
24	NC_020450	AATTA	2	10	37750	37759	60 %	40 %	0 %	0 %	459284254
25	NC_020450	GGATT	2	10	37855	37864	20 %	40 %	40 %	0 %	459284254
26	NC_020450	ATTAT	2	10	38023	38032	40 %	60 %	0 %	0 %	459284254
27	NC_020450	CTTAT	2	10	38216	38225	20 %	60 %	0 %	20 %	459284254
28	NC_020450	TATTG	2	10	40532	40541	20 %	60 %	20 %	0 %	459284257
29	NC_020450	TTTAA	2	10	40665	40674	40 %	60 %	0 %	0 %	459284257
30	NC_020450	TTAAT	2	10	41651	41660	40 %	60 %	0 %	0 %	459284258
31	NC_020450	CAAAA	2	10	42850	42859	80 %	0 %	0 %	20 %	459284259
32	NC_020450	TAGTA	2	10	43128	43137	40 %	40 %	20 %	0 %	459284259
33	NC_020450	GCTTG	2	10	43744	43753	0 %	40 %	40 %	20 %	459284260
34	NC_020450	TCCAT	2	10	44095	44104	20 %	40 %	0 %	40 %	459284260
35	NC_020450	GGCTT	2	10	46874	46883	0 %	40 %	40 %	20 %	459284262
36	NC_020450	AATTA	2	10	47378	47387	60 %	40 %	0 %	0 %	459284263
37	NC_020450	GACTT	2	10	47837	47846	20 %	40 %	20 %	20 %	459284264
38	NC_020450	GTTTT	2	10	47991	48000	0 %	80 %	20 %	0 %	459284264
39	NC_020450	TTTCA	2	10	48034	48043	20 %	60 %	0 %	20 %	459284264
40	NC_020450	AAATT	2	10	49631	49640	60 %	40 %	0 %	0 %	459284265
41	NC_020450	GGTTC	2	10	51054	51063	0 %	40 %	40 %	20 %	459284266
42	NC_020450	CTTTA	2	10	51089	51098	20 %	60 %	0 %	20 %	459284266
43	NC_020450	AGAAT	2	10	54162	54171	60 %	20 %	20 %	0 %	459284269
44	NC_020450	AATCA	2	10	56709	56718	60 %	20 %	0 %	20 %	459284270
45	NC_020450	CCATT	2	10	58798	58807	20 %	40 %	0 %	40 %	459284271
46	NC_020450	ATGAT	2	10	60533	60542	40 %	40 %	20 %	0 %	459284274
47	NC_020450	TGGTT	2	10	61529	61538	0 %	60 %	40 %	0 %	459284275
48	NC_020450	ATTTA	2	10	65294	65303	40 %	60 %	0 %	0 %	459284280
49	NC_020450	TTTTA	2	10	68120	68129	20 %	80 %	0 %	0 %	459284283
50	NC_020450	TCAAG	2	10	72917	72926	40 %	20 %	20 %	20 %	459284289
51	NC_020450	GTTTG	2	10	73555	73564	0 %	60 %	40 %	0 %	459284289
52	NC_020450	TAAAA	2	10	77795	77804	80 %	20 %	0 %	0 %	459284292
53	NC_020450	CAGGT	2	10	79629	79638	20 %	20 %	40 %	20 %	459284294
54	NC_020450	TCTGG	2	10	80169	80178	0 %	40 %	40 %	20 %	459284294
55	NC_020450	GTTTG	2	10	81222	81231	0 %	60 %	40 %	0 %	459284295
56	NC_020450	ACAAT	2	10	85122	85131	60 %	20 %	0 %	20 %	459284298
57	NC_020450	GATTT	2	10	85193	85202	20 %	60 %	20 %	0 %	459284298
58	NC_020450	TTACA	2	10	86171	86180	40 %	40 %	0 %	20 %	459284299
59	NC_020450	AATAG	2	10	90475	90484	60 %	20 %	20 %	0 %	459284304
60	NC_020450	TGGGT	2	10	91587	91596	0 %	40 %	60 %	0 %	459284305
61	NC_020450	AGCTT	2	10	92282	92291	20 %	40 %	20 %	20 %	459284305
62	NC_020450	TATTC	2	10	93150	93159	20 %	60 %	0 %	20 %	459284306
63	NC_020450	TTTTA	2	10	93883	93892	20 %	80 %	0 %	0 %	459284307
64	NC_020450	ATTTT	2	10	95825	95834	20 %	80 %	0 %	0 %	459284309
65	NC_020450	TTATT	2	10	96026	96035	20 %	80 %	0 %	0 %	459284309
66	NC_020450	AATTC	2	10	96499	96508	40 %	40 %	0 %	20 %	459284309
67	NC_020450	TATAA	2	10	96713	96722	60 %	40 %	0 %	0 %	459284309
68	NC_020450	TGGAT	2	10	97461	97470	20 %	40 %	40 %	0 %	459284310
69	NC_020450	ATCTT	2	10	98919	98928	20 %	60 %	0 %	20 %	459284311
70	NC_020450	GAAAA	2	10	100370	100379	80 %	0 %	20 %	0 %	459284312
71	NC_020450	CCAAA	2	10	101198	101207	60 %	0 %	0 %	40 %	459284312
72	NC_020450	TGGCT	2	10	102160	102169	0 %	40 %	40 %	20 %	459284314
73	NC_020450	GCCAT	2	10	102360	102369	20 %	20 %	20 %	40 %	459284314
74	NC_020450	CAAAT	2	10	102739	102748	60 %	20 %	0 %	20 %	459284315
75	NC_020450	TTTTA	2	10	103011	103020	20 %	80 %	0 %	0 %	459284315
76	NC_020450	GCTTG	2	10	107714	107723	0 %	40 %	40 %	20 %	459284322
77	NC_020450	TAAAA	2	10	109388	109397	80 %	20 %	0 %	0 %	459284325
78	NC_020450	TCTCT	2	10	111180	111189	0 %	60 %	0 %	40 %	459284329
79	NC_020450	CGTCG	2	10	113369	113378	0 %	20 %	40 %	40 %	459284331
80	NC_020450	ACCAA	2	10	114799	114808	60 %	0 %	0 %	40 %	459284332
81	NC_020450	ACAAA	2	10	117756	117765	80 %	0 %	0 %	20 %	459284333
82	NC_020450	AAATT	2	10	118605	118614	60 %	40 %	0 %	0 %	459284333
83	NC_020450	GCAAA	2	10	118827	118836	60 %	0 %	20 %	20 %	459284333
84	NC_020450	AATAC	2	10	119594	119603	60 %	20 %	0 %	20 %	459284333
85	NC_020450	AATAC	2	10	119879	119888	60 %	20 %	0 %	20 %	459284333
86	NC_020450	ATGGA	2	10	124340	124349	40 %	20 %	40 %	0 %	459284335
87	NC_020450	AATGT	2	10	125022	125031	40 %	40 %	20 %	0 %	459284336
88	NC_020450	AAGTC	2	10	129319	129328	40 %	20 %	20 %	20 %	459284339
89	NC_020450	TGTTT	2	10	130608	130617	0 %	80 %	20 %	0 %	459284340
90	NC_020450	GCTTT	2	10	134043	134052	0 %	60 %	20 %	20 %	459284345
91	NC_020450	CGTCA	2	10	134465	134474	20 %	20 %	20 %	40 %	459284346
92	NC_020450	TGTCA	2	10	135138	135147	20 %	40 %	20 %	20 %	459284346
93	NC_020450	TTTAT	2	10	135154	135163	20 %	80 %	0 %	0 %	459284346
94	NC_020450	TAATT	2	10	136691	136700	40 %	60 %	0 %	0 %	459284347
95	NC_020450	ACGGA	2	10	141702	141711	40 %	0 %	40 %	20 %	459284352
96	NC_020450	TTTTG	2	10	143156	143165	0 %	80 %	20 %	0 %	459284353
97	NC_020450	GAATT	2	10	143776	143785	40 %	40 %	20 %	0 %	459284353
98	NC_020450	TGAAA	2	10	144851	144860	60 %	20 %	20 %	0 %	459284354
99	NC_020450	AATTT	2	10	146539	146548	40 %	60 %	0 %	0 %	459284356
100	NC_020450	TCTTT	2	10	147407	147416	0 %	80 %	0 %	20 %	459284357
101	NC_020450	CCAAA	2	10	151468	151477	60 %	0 %	0 %	40 %	459284361
102	NC_020450	GTAAA	2	10	153666	153675	60 %	20 %	20 %	0 %	459284363
103	NC_020450	AAATT	2	10	154818	154827	60 %	40 %	0 %	0 %	459284364
104	NC_020450	ATTCG	2	10	156375	156384	20 %	40 %	20 %	20 %	459284365
105	NC_020450	ATTTT	2	10	157899	157908	20 %	80 %	0 %	0 %	459284367
106	NC_020450	TCACA	2	10	158293	158302	40 %	20 %	0 %	40 %	459284367
107	NC_020450	TTGGT	2	10	159439	159448	0 %	60 %	40 %	0 %	459284368
108	NC_020450	CAAGA	2	10	160603	160612	60 %	0 %	20 %	20 %	459284369
109	NC_020450	AATTG	2	10	161033	161042	40 %	40 %	20 %	0 %	459284370
110	NC_020450	AAATT	2	10	162503	162512	60 %	40 %	0 %	0 %	459284371
111	NC_020450	ACAAT	2	10	163608	163617	60 %	20 %	0 %	20 %	459284373
112	NC_020450	AAATA	2	10	164769	164778	80 %	20 %	0 %	0 %	459284373
113	NC_020450	TCGAT	2	10	164840	164849	20 %	40 %	20 %	20 %	459284373
114	NC_020450	AGGAA	2	10	166556	166565	60 %	0 %	40 %	0 %	459284375
115	NC_020450	AAACC	2	10	168223	168232	60 %	0 %	0 %	40 %	459284376
116	NC_020450	TGATT	2	10	173289	173298	20 %	60 %	20 %	0 %	459284384
117	NC_020450	CTTAT	2	10	173531	173540	20 %	60 %	0 %	20 %	459284384
118	NC_020450	TGGAA	2	10	175742	175751	40 %	20 %	40 %	0 %	459284387
119	NC_020450	TGATT	2	10	175821	175830	20 %	60 %	20 %	0 %	459284387
120	NC_020450	AATTA	2	10	176713	176722	60 %	40 %	0 %	0 %	459284388
121	NC_020450	AAAGC	2	10	177365	177374	60 %	0 %	20 %	20 %	459284388
122	NC_020450	TTAAT	2	10	177821	177830	40 %	60 %	0 %	0 %	459284389
123	NC_020450	CCAAC	2	10	178157	178166	40 %	0 %	0 %	60 %	459284389
124	NC_020450	CATGA	2	10	178922	178931	40 %	20 %	20 %	20 %	459284390
125	NC_020450	AAAGA	2	10	179496	179505	80 %	0 %	20 %	0 %	459284390
126	NC_020450	AGTAA	2	10	179793	179802	60 %	20 %	20 %	0 %	459284391
127	NC_020450	ATCCA	2	10	180469	180478	40 %	20 %	0 %	40 %	459284391
128	NC_020450	TTAAT	2	10	181413	181422	40 %	60 %	0 %	0 %	459284392
129	NC_020450	TTCCT	2	10	182518	182527	0 %	60 %	0 %	40 %	459284393
130	NC_020450	GATTG	2	10	183000	183009	20 %	40 %	40 %	0 %	459284393
131	NC_020450	GAGAA	2	10	184747	184756	60 %	0 %	40 %	0 %	459284395
132	NC_020450	CAAAG	2	10	186698	186707	60 %	0 %	20 %	20 %	459284396
133	NC_020450	TAGTA	2	10	187205	187214	40 %	40 %	20 %	0 %	459284397
134	NC_020450	AGGAA	2	10	187338	187347	60 %	0 %	40 %	0 %	459284397
135	NC_020450	TGATT	2	10	191570	191579	20 %	60 %	20 %	0 %	459284400
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