MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 2558

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020450	CA	3	6	1270	1275	50 %	0 %	0 %	50 %	459284226
2	NC_020450	TA	3	6	2783	2788	50 %	50 %	0 %	0 %	459284228
3	NC_020450	AT	3	6	4473	4478	50 %	50 %	0 %	0 %	459284228
4	NC_020450	AG	3	6	6460	6465	50 %	0 %	50 %	0 %	459284229
5	NC_020450	GA	3	6	7695	7700	50 %	0 %	50 %	0 %	459284229
6	NC_020450	AT	3	6	8177	8182	50 %	50 %	0 %	0 %	459284229
7	NC_020450	TC	3	6	8638	8643	0 %	50 %	0 %	50 %	459284229
8	NC_020450	AG	3	6	10171	10176	50 %	0 %	50 %	0 %	459284231
9	NC_020450	TC	3	6	11996	12001	0 %	50 %	0 %	50 %	459284233
10	NC_020450	TA	3	6	12677	12682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020450	TA	3	6	12938	12943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020450	CT	3	6	13972	13977	0 %	50 %	0 %	50 %	459284234
13	NC_020450	CT	3	6	15246	15251	0 %	50 %	0 %	50 %	459284236
14	NC_020450	AT	3	6	15518	15523	50 %	50 %	0 %	0 %	459284237
15	NC_020450	AT	3	6	16032	16037	50 %	50 %	0 %	0 %	459284237
16	NC_020450	AT	3	6	16136	16141	50 %	50 %	0 %	0 %	459284237
17	NC_020450	GA	3	6	17801	17806	50 %	0 %	50 %	0 %	459284237
18	NC_020450	TC	3	6	17809	17814	0 %	50 %	0 %	50 %	459284237
19	NC_020450	TA	3	6	18893	18898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020450	GA	3	6	19042	19047	50 %	0 %	50 %	0 %	459284238
21	NC_020450	AG	3	6	21134	21139	50 %	0 %	50 %	0 %	459284242
22	NC_020450	AT	3	6	21155	21160	50 %	50 %	0 %	0 %	459284242
23	NC_020450	AT	3	6	21924	21929	50 %	50 %	0 %	0 %	459284242
24	NC_020450	GA	3	6	23192	23197	50 %	0 %	50 %	0 %	459284243
25	NC_020450	TC	3	6	24508	24513	0 %	50 %	0 %	50 %	459284245
26	NC_020450	AT	3	6	24514	24519	50 %	50 %	0 %	0 %	459284245
27	NC_020450	AC	3	6	25697	25702	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
28	NC_020450	AC	3	6	25901	25906	50 %	0 %	0 %	50 %	459284245
29	NC_020450	TC	3	6	26051	26056	0 %	50 %	0 %	50 %	459284245
30	NC_020450	AT	3	6	28056	28061	50 %	50 %	0 %	0 %	459284246
31	NC_020450	AG	3	6	29936	29941	50 %	0 %	50 %	0 %	459284247
32	NC_020450	CT	3	6	30768	30773	0 %	50 %	0 %	50 %	459284247
33	NC_020450	AG	3	6	31022	31027	50 %	0 %	50 %	0 %	459284247
34	NC_020450	TA	3	6	31613	31618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020450	GA	3	6	32845	32850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020450	TA	3	6	33186	33191	50 %	50 %	0 %	0 %	459284250
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39	NC_020450	GA	4	8	42575	42582	50 %	0 %	50 %	0 %	459284258
40	NC_020450	GT	3	6	43374	43379	0 %	50 %	50 %	0 %	459284259
41	NC_020450	GA	3	6	45430	45435	50 %	0 %	50 %	0 %	459284261
42	NC_020450	GT	3	6	46405	46410	0 %	50 %	50 %	0 %	459284262
43	NC_020450	AG	3	6	47360	47365	50 %	0 %	50 %	0 %	459284263
44	NC_020450	TC	3	6	47372	47377	0 %	50 %	0 %	50 %	459284263
45	NC_020450	GT	3	6	48177	48182	0 %	50 %	50 %	0 %	459284264
46	NC_020450	TG	3	6	48310	48315	0 %	50 %	50 %	0 %	459284264
47	NC_020450	TG	3	6	48848	48853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020450	AG	3	6	49263	49268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020450	CT	3	6	50935	50940	0 %	50 %	0 %	50 %	459284266
50	NC_020450	TC	3	6	52723	52728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_020450	AG	3	6	53087	53092	50 %	0 %	50 %	0 %	459284268
52	NC_020450	AT	3	6	60607	60612	50 %	50 %	0 %	0 %	459284274
53	NC_020450	AC	3	6	61606	61611	50 %	0 %	0 %	50 %	459284275
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59	NC_020450	AT	3	6	73845	73850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020450	GA	3	6	75598	75603	50 %	0 %	50 %	0 %	459284290
61	NC_020450	AT	3	6	76234	76239	50 %	50 %	0 %	0 %	459284291
62	NC_020450	AG	4	8	76255	76262	50 %	0 %	50 %	0 %	459284291
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64	NC_020450	AG	3	6	77211	77216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020450	TC	3	6	77476	77481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_020450	GA	3	6	77499	77504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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70	NC_020450	TG	3	6	81313	81318	0 %	50 %	50 %	0 %	459284295
71	NC_020450	AT	3	6	82568	82573	50 %	50 %	0 %	0 %	459284297
72	NC_020450	TG	3	6	88875	88880	0 %	50 %	50 %	0 %	459284301
73	NC_020450	GA	3	6	89245	89250	50 %	0 %	50 %	0 %	459284302
74	NC_020450	AT	3	6	89481	89486	50 %	50 %	0 %	0 %	459284302
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84	NC_020450	TA	3	6	102075	102080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020450	GA	3	6	102153	102158	50 %	0 %	50 %	0 %	459284314
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88	NC_020450	TA	3	6	104450	104455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020450	CA	3	6	104477	104482	50 %	0 %	0 %	50 %	459284317
90	NC_020450	AT	3	6	104678	104683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020450	AT	3	6	106157	106162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_020450	AT	3	6	120724	120729	50 %	50 %	0 %	0 %	459284333
102	NC_020450	AT	3	6	121009	121014	50 %	50 %	0 %	0 %	459284333
103	NC_020450	AT	3	6	121839	121844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020450	AT	3	6	122482	122487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020450	TA	4	8	122586	122593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_020450	GA	3	6	122702	122707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020450	TA	3	6	123028	123033	50 %	50 %	0 %	0 %	459284334
109	NC_020450	CT	3	6	124172	124177	0 %	50 %	0 %	50 %	459284335
110	NC_020450	AT	4	8	124449	124456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020450	GA	3	6	125382	125387	50 %	0 %	50 %	0 %	459284337
112	NC_020450	AG	3	6	125565	125570	50 %	0 %	50 %	0 %	459284337
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114	NC_020450	AT	3	6	128164	128169	50 %	50 %	0 %	0 %	459284338
115	NC_020450	GA	4	8	128226	128233	50 %	0 %	50 %	0 %	459284338
116	NC_020450	GA	3	6	129762	129767	50 %	0 %	50 %	0 %	459284339
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119	NC_020450	AT	3	6	135738	135743	50 %	50 %	0 %	0 %	459284346
120	NC_020450	TG	3	6	137588	137593	0 %	50 %	50 %	0 %	459284348
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123	NC_020450	GA	3	6	140955	140960	50 %	0 %	50 %	0 %	459284351
124	NC_020450	GA	3	6	141021	141026	50 %	0 %	50 %	0 %	459284351
125	NC_020450	AT	3	6	141253	141258	50 %	50 %	0 %	0 %	459284351
126	NC_020450	GC	3	6	141664	141669	0 %	0 %	50 %	50 %	459284352
127	NC_020450	GC	3	6	142015	142020	0 %	0 %	50 %	50 %	459284352
128	NC_020450	AT	3	6	142928	142933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020450	CA	3	6	144712	144717	50 %	0 %	0 %	50 %	459284354
130	NC_020450	CT	3	6	154635	154640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_020450	AG	3	6	156598	156603	50 %	0 %	50 %	0 %	459284365
132	NC_020450	AG	3	6	157350	157355	50 %	0 %	50 %	0 %	459284366
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134	NC_020450	AG	3	6	162711	162716	50 %	0 %	50 %	0 %	459284371
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136	NC_020450	GA	3	6	163813	163818	50 %	0 %	50 %	0 %	459284373
137	NC_020450	GA	3	6	164255	164260	50 %	0 %	50 %	0 %	459284373
138	NC_020450	AG	3	6	164488	164493	50 %	0 %	50 %	0 %	459284373
139	NC_020450	AT	3	6	164540	164545	50 %	50 %	0 %	0 %	459284373
140	NC_020450	AG	3	6	165500	165505	50 %	0 %	50 %	0 %	459284373
141	NC_020450	AG	4	8	165828	165835	50 %	0 %	50 %	0 %	459284374
142	NC_020450	TA	3	6	170462	170467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020450	AC	3	6	171293	171298	50 %	0 %	0 %	50 %	459284380
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