MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Cloacamonas acidaminovorans str. Evry provisional genome sequence from WWE1 candidate division

Total Repeats: 913

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020449	AACGGA	2	12	2031	2042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960352
2	NC_020449	ACTCCT	2	12	6570	6581	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218960358
3	NC_020449	GAAACC	2	12	6822	6833	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218960358
4	NC_020449	AGAAAA	2	12	7355	7366	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218960358
5	NC_020449	TTCCGT	2	12	9708	9719	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218960361
6	NC_020449	CAGAAT	2	12	12021	12032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218960362
7	NC_020449	CGATCC	2	12	17313	17324	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218960365
8	NC_020449	AAGAAA	2	12	17368	17379	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218960365
9	NC_020449	GATTAT	2	12	20223	20234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218960368
10	NC_020449	GGAAAA	2	12	25720	25731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218960374
11	NC_020449	ATTCTT	2	12	30372	30383	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218960377
12	NC_020449	AAAGAC	2	12	32545	32556	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218960378
13	NC_020449	GGTTTT	2	12	37377	37388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218960381
14	NC_020449	GCAGAT	2	12	40731	40742	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960383
15	NC_020449	CCGGAA	2	12	42144	42155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218960384
16	NC_020449	ACATAA	2	12	45043	45054	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218960386
17	NC_020449	AGCCAA	2	12	45258	45269	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218960387
18	NC_020449	AAGATA	2	12	50000	50011	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218960393
19	NC_020449	TGCCTG	2	12	52681	52692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218960394
20	NC_020449	TTCAGT	2	12	54356	54367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218960395
21	NC_020449	CAATGG	2	12	55266	55277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960397
22	NC_020449	AACCCT	2	12	56503	56514	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218960398
23	NC_020449	AAAAGT	2	12	57756	57767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218960399
24	NC_020449	TCCCAA	2	12	59712	59723	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	218960401
25	NC_020449	GGAGGT	2	12	60938	60949	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	218960402
26	NC_020449	TGAAAA	2	12	61071	61082	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218960402
27	NC_020449	GTTGCA	2	12	62532	62543	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218960404
28	NC_020449	TTTCTC	2	12	64494	64505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218960404
29	NC_020449	TGCTTT	2	12	68398	68409	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218960407
30	NC_020449	TTTTGC	2	12	68542	68553	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218960407
31	NC_020449	GCACAG	2	12	70716	70727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218960407
32	NC_020449	TGAAAA	2	12	71562	71573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218960407
33	NC_020449	CTTATA	2	12	72029	72040	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218960408
34	NC_020449	AACTTA	2	12	74131	74142	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218960410
35	NC_020449	AGTTAA	2	12	76702	76713	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218960412
36	NC_020449	ATTATG	2	12	77447	77458	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	218960413
37	NC_020449	GGAATT	2	12	82817	82828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218960420
38	NC_020449	GGGCTT	2	12	83714	83725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218960420
39	NC_020449	ATGGCT	2	12	87445	87456	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218960424
40	NC_020449	CCAGCA	2	12	88598	88609	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218960424
41	NC_020449	ACTTCC	2	12	96979	96990	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	218960430
42	NC_020449	CCACTG	2	12	97834	97845	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218960431
43	NC_020449	TTTGGG	2	12	98125	98136	0 %	50 %	50 %	0 %	218960432
44	NC_020449	TTTGCC	2	12	98945	98956	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218960432
45	NC_020449	GTTCTG	2	12	99632	99643	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218960433
46	NC_020449	TTAAAG	2	12	99681	99692	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218960433
47	NC_020449	TCAAAA	2	12	99719	99730	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218960433
48	NC_020449	CATAAG	2	12	100176	100187	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218960433
49	NC_020449	GGATCA	2	12	102131	102142	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960435
50	NC_020449	AAAAAT	2	12	105827	105838	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	218960438
51	NC_020449	GAATAT	2	12	106232	106243	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218960438
52	NC_020449	TGGAAA	2	12	106507	106518	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218960439
53	NC_020449	ATAGTA	2	12	110770	110781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218960443
54	NC_020449	TGAGCT	2	12	113969	113980	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	218960445
55	NC_020449	AAAAGA	2	12	116236	116247	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	218960446
56	NC_020449	TTTTTA	2	12	130760	130771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	218960461
57	NC_020449	TTTCCT	2	12	135262	135273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218960464
58	NC_020449	ATCCGC	2	12	136136	136147	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	218960465
59	NC_020449	CCGGAA	2	12	139062	139073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218960468
60	NC_020449	ATCCTG	2	12	139167	139178	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218960468
61	NC_020449	GTGCCA	2	12	140364	140375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218960468
62	NC_020449	ATTCAT	2	12	151275	151286	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218960476
63	NC_020449	AGGTAA	2	12	152871	152882	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218960477
64	NC_020449	ATCCAA	2	12	156486	156497	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218960480
65	NC_020449	AGTAAG	2	12	158213	158224	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218960483
66	NC_020449	ATCTAC	2	12	162011	162022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218960487
67	NC_020449	TTTATA	2	12	163210	163221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218960490
68	NC_020449	CTTTAA	2	12	164965	164976	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218960491
69	NC_020449	AAACTC	2	12	165578	165589	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	218960491
70	NC_020449	TATCAA	2	12	166699	166710	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218960492
71	NC_020449	GGTAAA	2	12	170844	170855	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218960498
72	NC_020449	CTGCCT	2	12	171010	171021	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	218960498
73	NC_020449	CCCTTT	2	12	172411	172422	0 %	50 %	0 %	50 %	218960499
74	NC_020449	AAAGCG	2	12	173339	173350	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960500
75	NC_020449	CCAGAG	2	12	173728	173739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	218960500
76	NC_020449	CAATGG	2	12	176471	176482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960502
77	NC_020449	TAAACA	2	12	180243	180254	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218960506
78	NC_020449	GGCAAA	2	12	183062	183073	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960506
79	NC_020449	CAATAT	2	12	186373	186384	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218960509
80	NC_020449	CAGAAG	2	12	187357	187368	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960510
81	NC_020449	AGATAA	2	12	191055	191066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	218960513
82	NC_020449	TTCACT	2	12	193137	193148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218960514
83	NC_020449	TCAAAA	2	12	193282	193293	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218960514
84	NC_020449	AGATAT	2	12	196005	196016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	218960517
85	NC_020449	CAAAGC	2	12	196170	196181	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	218960517
86	NC_020449	AGATGA	2	12	197433	197444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	218960518
87	NC_020449	CAAAGG	2	12	202482	202493	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960523
88	NC_020449	AAGTGG	2	12	211535	211546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218960531
89	NC_020449	ATTTTC	2	12	215044	215055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218960534
90	NC_020449	TCAAAA	2	12	215648	215659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	218960534
91	NC_020449	TTGTTA	2	12	216378	216389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218960534
92	NC_020449	AGCCAC	2	12	220479	220490	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	218960535
93	NC_020449	AGATAC	2	12	226212	226223	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218960535
94	NC_020449	GCTTCA	2	12	232856	232867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218960539
95	NC_020449	ATCAAT	2	12	233800	233811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218960541
96	NC_020449	GCTCAT	2	12	234756	234767	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218960541
97	NC_020449	AGCTTC	2	12	236322	236333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218960542
98	NC_020449	GACGAG	2	12	237942	237953	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218960542
99	NC_020449	ACGGAT	2	12	241624	241635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960551
100	NC_020449	CAGTGG	2	12	241989	242000	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218960551
101	NC_020449	GTAGTT	2	12	247324	247335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	218960557
102	NC_020449	GGAATT	2	12	249002	249013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218960558
103	NC_020449	ACTGGA	2	12	250215	250226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960560
104	NC_020449	AGCAGA	2	12	251185	251196	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	218960560
105	NC_020449	CTTTAT	2	12	252099	252110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218960561
106	NC_020449	GGCTTT	2	12	256512	256523	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218960564
107	NC_020449	GGCGAT	2	12	259093	259104	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	218960566
108	NC_020449	TACTCA	2	12	259281	259292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218960566
109	NC_020449	TTGATT	2	12	261983	261994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	218960572
110	NC_020449	GGCTTT	2	12	263336	263347	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218960572
111	NC_020449	GAACTG	2	12	267801	267812	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960577
112	NC_020449	TCATTT	2	12	268754	268765	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218960577
113	NC_020449	GAAGTG	2	12	268944	268955	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	218960577
114	NC_020449	CTATCT	2	12	269324	269335	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218960577
115	NC_020449	GTTTTG	2	12	269569	269580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218960577
116	NC_020449	AGCAGG	2	12	272467	272478	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	218960578
117	NC_020449	TCTCCT	2	12	272879	272890	0 %	50 %	0 %	50 %	218960578
118	NC_020449	CTTATT	2	12	273350	273361	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218960578
119	NC_020449	TTCATA	2	12	276043	276054	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	218960579
120	NC_020449	ATTTCC	2	12	280136	280147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	218960583
121	NC_020449	AACATT	2	12	288527	288538	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	218960588
122	NC_020449	GCTTTT	2	12	289507	289518	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218960589
123	NC_020449	AAGGAG	2	12	289658	289669	50 %	0 %	50 %	0 %	218960589
124	NC_020449	TGGCAC	2	12	290634	290645	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	218960590
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230	NC_020449	CTTTTT	2	12	578539	578550	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	218960848
231	NC_020449	CTGTTC	2	12	582174	582185	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	218960849
232	NC_020449	TGCGTT	2	12	585170	585181	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218960850
233	NC_020449	CTGGAA	2	12	585286	585297	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	218960850
234	NC_020449	ATTGGG	2	12	585491	585502	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	218960850
235	NC_020449	GTTTTG	2	12	586667	586678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218960851
236	NC_020449	TCGGTT	2	12	586982	586993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	218960851
237	NC_020449	CTGCTA	2	12	594240	594251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	218960854
238	NC_020449	CTTTTG	2	12	595066	595077	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	218960855
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251	NC_020449	AAAGCA	2	12	624868	624879	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	218960880
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333	NC_020449	TGATCT	2	12	807915	807926	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	218961016
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343	NC_020449	TGGCTG	2	12	833869	833880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	218961043
344	NC_020449	TTATTC	2	12	837171	837182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	218961046
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