MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD3 DNA

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020422	GAC	2	6	82	87	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485780
2	NC_020422	TAA	2	6	164	169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
3	NC_020422	ACA	2	6	253	258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
4	NC_020422	TAA	2	6	272	277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
5	NC_020422	ATA	2	6	374	379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
6	NC_020422	CGT	2	6	420	425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485780
7	NC_020422	TAA	2	6	510	515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
8	NC_020422	AAC	2	6	585	590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
9	NC_020422	GTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485780
10	NC_020422	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485780
11	NC_020422	TTA	2	6	890	895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485780
12	NC_020422	AAC	2	6	911	916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
13	NC_020422	AAT	2	6	1008	1013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485780
14	NC_020422	ACA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485780
15	NC_020422	GTT	2	6	1407	1412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020422	TAA	2	6	1440	1445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020422	ATT	2	6	1461	1466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020422	ATA	2	6	1486	1491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485781
19	NC_020422	CTT	2	6	1499	1504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485781
20	NC_020422	ATG	2	6	1735	1740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485781
21	NC_020422	AAT	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020422	GAT	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020422	ATT	2	6	1881	1886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020422	TAT	2	6	2016	2021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020422	ATA	4	12	2053	2064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020422	AAT	2	6	2184	2189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020422	ATT	2	6	2194	2199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020422	GTT	2	6	2241	2246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020422	ATA	2	6	2302	2307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020422	AGT	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020422	AAT	2	6	2384	2389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020422	CTT	2	6	2395	2400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_020422	TAA	3	9	2541	2549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020422	TGT	2	6	2747	2752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020422	AGC	2	6	2794	2799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020422	TGT	2	6	2816	2821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020422	TTG	2	6	3225	3230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020422	ATA	2	6	3585	3590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020422	TAT	2	6	3669	3674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020422	ATG	2	6	3893	3898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020422	CTG	2	6	3975	3980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_020422	GCT	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020422	CGA	2	6	4132	4137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020422	TAG	2	6	4189	4194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020422	GTT	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020422	TGT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020422	ATG	2	6	4452	4457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020422	GTT	2	6	4597	4602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485782
49	NC_020422	CAT	2	6	4668	4673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485782
50	NC_020422	CAA	2	6	4695	4700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485782
51	NC_020422	TAA	2	6	5268	5273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020422	TAA	2	6	5278	5283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.