MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD2 DNA

Total Repeats: 64

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020421	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
2	NC_020421	TAA	2	6	396	401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
3	NC_020421	CTT	2	6	422	427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485776
4	NC_020421	GTT	2	6	517	522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
5	NC_020421	ATT	2	6	613	618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
6	NC_020421	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
7	NC_020421	GTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485776
8	NC_020421	ATT	2	6	747	752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
9	NC_020421	TCA	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485776
10	NC_020421	AGT	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485776
11	NC_020421	TAA	2	6	1020	1025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485776
12	NC_020421	ACA	2	6	1224	1229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485776
13	NC_020421	TTA	2	6	1243	1248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485776
14	NC_020421	TGT	2	6	1424	1429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020421	ATA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020421	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020421	ATA	2	6	2060	2065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020421	CTT	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020421	CAA	2	6	2167	2172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_020421	AAT	2	6	2173	2178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020421	TGT	2	6	2234	2239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020421	TAT	2	6	2257	2262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020421	ATA	2	6	2434	2439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020421	ATA	2	6	2798	2803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
25	NC_020421	AAT	2	6	2808	2813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
26	NC_020421	AAT	2	6	2857	2862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
27	NC_020421	ATA	2	6	2894	2899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
28	NC_020421	ATA	2	6	2960	2965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485777
29	NC_020421	TAG	2	6	2973	2978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
30	NC_020421	CAG	2	6	3185	3190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
31	NC_020421	CAG	2	6	3221	3226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
32	NC_020421	CAG	2	6	3257	3262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
33	NC_020421	CAG	2	6	3293	3298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
34	NC_020421	CAG	2	6	3329	3334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
35	NC_020421	CAG	2	6	3365	3370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
36	NC_020421	CAG	2	6	3401	3406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
37	NC_020421	CAG	2	6	3437	3442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
38	NC_020421	CAG	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
39	NC_020421	TAG	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
40	NC_020421	CTA	2	6	3682	3687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485777
41	NC_020421	CAG	2	6	3713	3718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485777
42	NC_020421	CAA	3	9	3736	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
43	NC_020421	CAA	2	6	3823	3828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
44	NC_020421	TGA	2	6	3897	3902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485777
45	NC_020421	ACC	3	9	4022	4030	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485777
46	NC_020421	AAC	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
47	NC_020421	CAA	2	6	4123	4128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
48	NC_020421	CAA	2	6	4144	4149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
49	NC_020421	CAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
50	NC_020421	CAA	2	6	4213	4218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485777
51	NC_020421	ATT	2	6	4281	4286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485777
52	NC_020421	CTG	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_020421	ACC	2	6	4457	4462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020421	ATA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020421	ATA	2	6	4584	4589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020421	GTT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020421	TGT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485778
58	NC_020421	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
59	NC_020421	TTA	2	6	5109	5114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485778
60	NC_020421	TGA	3	9	5148	5156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
61	NC_020421	TAG	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485778
62	NC_020421	TTA	3	9	5266	5274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020421	ACT	2	6	5597	5602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020421	TAC	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.