MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD1 DNA

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020420	GAAATA	2	12	355	366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485766
2	NC_020420	CCGTTG	2	12	2217	2228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020420	CAACTA	2	12	3843	3854	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	189485768
4	NC_020420	TAAAGA	2	12	4705	4716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020420	TCAACT	2	12	4730	4741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_020420	GCTTCA	2	12	4745	4756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020420	CCTACT	2	12	4760	4771	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020420	CCTACT	3	18	4778	4795	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_020420	CCTACG	2	12	4796	4807	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_020420	TTGGTA	2	12	4822	4833	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020420	CCTGCT	2	12	4850	4861	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
12	NC_020420	TAATGG	2	12	7576	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485770
13	NC_020420	CAACAG	2	12	8063	8074	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485770
14	NC_020420	CACAAG	2	12	8241	8252	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485770
15	NC_020420	AGAACA	2	12	8557	8568	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485770
16	NC_020420	TAAAGA	2	12	9962	9973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020420	TCAACT	2	12	9987	9998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020420	GCTTCA	2	12	10002	10013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020420	CCTACT	2	12	10017	10028	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_020420	CCTACT	2	12	10071	10082	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020420	GGTATC	2	12	10105	10116	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_020420	CCTGCT	2	12	10137	10148	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_020420	TCCCTG	2	12	10616	10627	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	189485773
24	NC_020420	TAAGCA	2	12	11150	11161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485774
25	NC_020420	CTCTAA	2	12	11545	11556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.