MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD1 DNA

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020420	TTG	2	6	209	214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485766
2	NC_020420	TAA	2	6	269	274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
3	NC_020420	TAA	2	6	422	427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
4	NC_020420	AAC	3	9	585	593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485766
5	NC_020420	TAC	2	6	681	686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485766
6	NC_020420	AAG	2	6	803	808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485766
7	NC_020420	ACG	2	6	830	835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485766
8	NC_020420	AGA	2	6	880	885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485766
9	NC_020420	AAT	2	6	1017	1022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485766
10	NC_020420	ACA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485766
11	NC_020420	TTA	2	6	1252	1257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485766
12	NC_020420	TAA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020420	TGT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020420	CAG	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_020420	AGC	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020420	TTG	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020420	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020420	CTT	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020420	TGC	2	6	2333	2338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485767
20	NC_020420	CCT	3	9	2398	2406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	189485767
21	NC_020420	TGT	2	6	2524	2529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485767
22	NC_020420	TAG	2	6	2633	2638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485767
23	NC_020420	TAT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020420	CAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020420	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485768
26	NC_020420	ATA	2	6	3334	3339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485768
27	NC_020420	AAT	2	6	3344	3349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485768
28	NC_020420	GTT	2	6	3396	3401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485768
29	NC_020420	CAA	2	6	3570	3575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
30	NC_020420	CAG	2	6	3615	3620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485768
31	NC_020420	ACA	2	6	3644	3649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
32	NC_020420	ACA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
33	NC_020420	CAA	3	9	3816	3824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485768
34	NC_020420	TAT	2	6	4082	4087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485769
35	NC_020420	CTG	2	6	4107	4112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485769
36	NC_020420	TTG	2	6	4169	4174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
37	NC_020420	TCG	2	6	4222	4227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485769
38	NC_020420	TGG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189485769
39	NC_020420	ATA	2	6	4254	4259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485769
40	NC_020420	TGT	2	6	4345	4350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
41	NC_020420	TGT	2	6	4384	4389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485769
42	NC_020420	AAT	2	6	4391	4396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485769
43	NC_020420	TAA	3	9	4491	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020420	TGT	2	6	4653	4658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020420	ATG	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020420	ATT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020420	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020420	CTT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_020420	TAT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020420	ATA	3	9	5582	5590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020420	AAT	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020420	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020420	TTG	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020420	GTA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020420	AGT	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020420	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020420	CTT	2	6	5939	5944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020420	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020420	TGT	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020420	TTG	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020420	ATA	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020420	ACT	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020420	TAG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020420	TGT	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020420	TAT	2	6	6988	6993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020420	CGT	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020420	TAA	2	6	7077	7082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020420	CGT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020420	ATA	2	6	7164	7169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020420	CAG	2	6	7481	7486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	189485770
71	NC_020420	TAA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485770
72	NC_020420	AAT	2	6	7519	7524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485770
73	NC_020420	GAA	2	6	7631	7636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485770
74	NC_020420	TGT	2	6	7726	7731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485770
75	NC_020420	AGT	2	6	7732	7737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485770
76	NC_020420	ACC	2	6	7801	7806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
77	NC_020420	ACC	2	6	7825	7830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
78	NC_020420	ACC	2	6	7849	7854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
79	NC_020420	ACC	2	6	7873	7878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
80	NC_020420	ACC	2	6	7897	7902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
81	NC_020420	ACC	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
82	NC_020420	ACC	2	6	7945	7950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
83	NC_020420	ACC	2	6	7969	7974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	189485770
84	NC_020420	CTA	2	6	7985	7990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
85	NC_020420	ACT	2	6	8002	8007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
86	NC_020420	ACA	2	6	8053	8058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
87	NC_020420	AGA	2	6	8083	8088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485770
88	NC_020420	CGC	2	6	8119	8124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	189485770
89	NC_020420	AAC	2	6	8220	8225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
90	NC_020420	AAC	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
91	NC_020420	TAC	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485770
92	NC_020420	ACA	2	6	8413	8418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
93	NC_020420	ATT	2	6	8419	8424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485770
94	NC_020420	CAA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
95	NC_020420	CAA	3	9	8435	8443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
96	NC_020420	ACA	2	6	8446	8451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
97	NC_020420	AAC	3	9	8460	8468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
98	NC_020420	CAA	2	6	8492	8497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
99	NC_020420	ACA	2	6	8500	8505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
100	NC_020420	AAC	3	9	8514	8522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
101	NC_020420	CAA	2	6	8546	8551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
102	NC_020420	ACA	3	9	8566	8574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
103	NC_020420	AAC	3	9	8577	8585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	189485770
104	NC_020420	ATT	2	6	8771	8776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485771
105	NC_020420	AAG	2	6	8931	8936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485771
106	NC_020420	AAG	2	6	8961	8966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	189485771
107	NC_020420	TGT	2	6	9074	9079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485771
108	NC_020420	TTG	2	6	9091	9096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485771
109	NC_020420	AGT	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020420	TAT	2	6	9339	9344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485772
111	NC_020420	CTG	2	6	9364	9369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485772
112	NC_020420	TTG	2	6	9426	9431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
113	NC_020420	TCG	2	6	9479	9484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485772
114	NC_020420	TGG	2	6	9494	9499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	189485772
115	NC_020420	ATA	2	6	9511	9516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485772
116	NC_020420	TGT	2	6	9602	9607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
117	NC_020420	TGT	2	6	9641	9646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485772
118	NC_020420	AAT	2	6	9648	9653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485772
119	NC_020420	TAA	3	9	9748	9756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020420	TGT	2	6	9910	9915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020420	ATG	2	6	9979	9984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020420	ATT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020420	TAT	2	6	10460	10465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020420	GAA	2	6	10475	10480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020420	GTT	2	6	10567	10572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485773
126	NC_020420	TAT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485773
127	NC_020420	AGG	2	6	10786	10791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	189485773
128	NC_020420	AAT	2	6	10831	10836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485773
129	NC_020420	TGT	2	6	10882	10887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485774
130	NC_020420	ATG	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485774
131	NC_020420	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485774
132	NC_020420	TTA	2	6	11084	11089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485774
133	NC_020420	TGA	3	9	11123	11131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485774
134	NC_020420	TTA	2	6	11184	11189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485774
135	NC_020420	TAA	2	6	11563	11568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.