MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 plasmid pTGRD1 DNA

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020420	TAA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020420	TGT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020420	CAG	2	6	1468	1473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_020420	AGC	2	6	1475	1480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020420	TTG	2	6	1861	1866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020420	ATA	2	6	2025	2030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020420	CTT	2	6	2071	2076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020420	TAT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020420	CAA	2	6	3035	3040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020420	TAA	3	9	4491	4499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020420	TGT	2	6	4653	4658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020420	ATG	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020420	ATT	2	6	5052	5057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020420	ATT	2	6	5284	5289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020420	CTT	2	6	5374	5379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020420	TAT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020420	ATA	3	9	5582	5590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020420	AAT	2	6	5729	5734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020420	ATT	2	6	5739	5744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020420	TTG	2	6	5789	5794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020420	GTA	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020420	AGT	2	6	5885	5890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020420	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020420	CTT	2	6	5939	5944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_020420	TAA	2	6	6088	6093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020420	TGT	2	6	6172	6177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020420	TTG	2	6	6651	6656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020420	ATA	2	6	6816	6821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020420	ACT	2	6	6861	6866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_020420	TAG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020420	TGT	2	6	6965	6970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020420	TAT	2	6	6988	6993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020420	CGT	2	6	7053	7058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_020420	TAA	2	6	7077	7082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020420	CGT	2	6	7132	7137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_020420	ATA	2	6	7164	7169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020420	AGT	2	6	9125	9130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020420	TAA	3	9	9748	9756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020420	TGT	2	6	9910	9915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020420	ATG	2	6	9979	9984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020420	ATT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020420	TAT	2	6	10460	10465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020420	GAA	2	6	10475	10480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020420	TAA	2	6	11563	11568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.