MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 DNA

Total Repeats: 347

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020419	ATAAAA	2	12	1339	1350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485004
2	NC_020419	ACGACA	2	12	6487	6498	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485006
3	NC_020419	GGCGTA	2	12	10041	10052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189485008
4	NC_020419	AAAAGA	2	12	10424	10435	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485008
5	NC_020419	TTTCAG	2	12	13565	13576	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485009
6	NC_020419	CAAAAG	2	12	16451	16462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485010
7	NC_020419	TTTGTA	2	12	21151	21162	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485011
8	NC_020419	CTTTAA	2	12	22164	22175	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485011
9	NC_020419	TTTTAA	2	12	22396	22407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485011
10	NC_020419	GTTTTT	2	12	28390	28401	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189485015
11	NC_020419	GAAAAA	2	12	33931	33942	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485019
12	NC_020419	TTTTAA	2	12	42834	42845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485020
13	NC_020419	GCTTAT	2	12	54918	54929	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485030
14	NC_020419	ATAAAA	2	12	55383	55394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485030
15	NC_020419	TTTAAA	2	12	61187	61198	50 %	50 %	0 %	0 %	189485036
16	NC_020419	GAAGCA	2	12	61984	61995	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	189485037
17	NC_020419	AAAATA	2	12	70328	70339	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485039
18	NC_020419	AAGACA	2	12	74175	74186	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485040
19	NC_020419	GAAGCT	2	12	75245	75256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485041
20	NC_020419	GTTCCT	2	12	75452	75463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189485041
21	NC_020419	AAAAGC	2	12	77358	77369	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485042
22	NC_020419	CTTGTT	2	12	79787	79798	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485043
23	NC_020419	CATAAG	2	12	81389	81400	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485044
24	NC_020419	TTATAT	2	12	82115	82126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485044
25	NC_020419	TGCCGC	2	12	82247	82258	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189485044
26	NC_020419	CCCAAG	2	12	86457	86468	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	189485045
27	NC_020419	AATTTT	2	12	90124	90135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485047
28	NC_020419	TTTAAA	2	12	90959	90970	50 %	50 %	0 %	0 %	189485047
29	NC_020419	TTAGAG	2	12	98025	98036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485055
30	NC_020419	ATATTG	2	12	99517	99528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485057
31	NC_020419	AAATAA	2	12	102532	102543	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485059
32	NC_020419	AGACAT	2	12	104677	104688	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485059
33	NC_020419	TAAAAA	2	12	106024	106035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485060
34	NC_020419	ATATTG	2	12	107154	107165	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485062
35	NC_020419	AGGCAT	2	12	108074	108085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485063
36	NC_020419	GTTTTA	2	12	108663	108674	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485063
37	NC_020419	TATGAA	2	12	109423	109434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485064
38	NC_020419	TCAATA	2	12	115345	115356	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485066
39	NC_020419	TTTTAT	2	12	122120	122131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485071
40	NC_020419	GGGGCT	2	12	135095	135106	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	189485076
41	NC_020419	GCAAAA	2	12	138072	138083	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485077
42	NC_020419	GAAAAA	2	12	138195	138206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485077
43	NC_020419	GCTAAA	2	12	138543	138554	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485077
44	NC_020419	TATTTC	2	12	141646	141657	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485078
45	NC_020419	CAAAAA	2	12	141708	141719	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485078
46	NC_020419	TTAAAG	2	12	143403	143414	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485078
47	NC_020419	CCGGTT	2	12	146676	146687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485082
48	NC_020419	GAGAGT	2	12	148282	148293	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	189485083
49	NC_020419	AAGCAA	2	12	152782	152793	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485090
50	NC_020419	AGTAAA	2	12	154759	154770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485094
51	NC_020419	AAATTG	2	12	156853	156864	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485099
52	NC_020419	GTTTTA	2	12	160261	160272	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485104
53	NC_020419	AGATAT	2	12	161698	161709	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485106
54	NC_020419	GACCCG	2	12	164079	164090	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	189485110
55	NC_020419	GAAAAA	2	12	164332	164343	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485111
56	NC_020419	TTTAAA	2	12	165202	165213	50 %	50 %	0 %	0 %	189485112
57	NC_020419	AAAATA	2	12	178993	179004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485123
58	NC_020419	TGCGAC	2	12	180092	180103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485124
59	NC_020419	CAAAAA	2	12	184052	184063	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485127
60	NC_020419	AAAAAT	2	12	185139	185150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485128
61	NC_020419	TTTTAA	2	12	190559	190570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485130
62	NC_020419	TAAAAA	2	12	191950	191961	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485130
63	NC_020419	TCCCTA	2	12	192329	192340	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485130
64	NC_020419	CTTTTT	2	12	197679	197690	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485133
65	NC_020419	TTACGT	2	12	199112	199123	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485134
66	NC_020419	CTTTTT	2	12	201953	201964	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485136
67	NC_020419	TTTTTC	2	12	203191	203202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485137
68	NC_020419	AATTTC	2	12	207664	207675	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485138
69	NC_020419	TATTTT	2	12	209061	209072	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485139
70	NC_020419	TCAAAT	2	12	210794	210805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485139
71	NC_020419	AAAGAT	2	12	211656	211667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485139
72	NC_020419	GTTTTC	2	12	211975	211986	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485140
73	NC_020419	TAATTT	2	12	215826	215837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485142
74	NC_020419	TAAATT	2	12	217268	217279	50 %	50 %	0 %	0 %	189485143
75	NC_020419	TGCTAT	2	12	217807	217818	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485144
76	NC_020419	TGCAGC	2	12	219479	219490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485146
77	NC_020419	TTAACA	2	12	221072	221083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485147
78	NC_020419	ATTAGG	2	12	229404	229415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485153
79	NC_020419	GTTTTG	2	12	230014	230025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	189485154
80	NC_020419	TAGATT	2	12	230282	230293	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485154
81	NC_020419	AGAAAA	2	12	231349	231360	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485155
82	NC_020419	AAAAAC	2	12	234058	234069	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485157
83	NC_020419	TGAAAC	2	12	237765	237776	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485160
84	NC_020419	ATGAAG	2	12	242808	242819	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	189485163
85	NC_020419	CAAAAA	2	12	246005	246016	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485166
86	NC_020419	AGTTAT	2	12	250149	250160	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485168
87	NC_020419	AAATGA	2	12	251214	251225	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	189485168
88	NC_020419	GATTTG	2	12	254387	254398	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189485170
89	NC_020419	CAAAAA	2	12	254538	254549	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485170
90	NC_020419	TGAAGC	2	12	254596	254607	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	189485170
91	NC_020419	AGTTAA	2	12	255871	255882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485170
92	NC_020419	AATTGA	2	12	255886	255897	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485170
93	NC_020419	TAAAAA	2	12	256701	256712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485172
94	NC_020419	TTTTTA	2	12	262522	262533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485175
95	NC_020419	CGACAA	2	12	263944	263955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	189485176
96	NC_020419	ATTCGT	2	12	267251	267262	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485180
97	NC_020419	TTTTGT	2	12	273100	273111	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	189485182
98	NC_020419	TCGGAT	2	12	274328	274339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	189485183
99	NC_020419	AGATTA	2	12	276161	276172	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485185
100	NC_020419	AAATTG	2	12	277827	277838	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485187
101	NC_020419	CTGAAA	2	12	279181	279192	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	189485188
102	NC_020419	TTAAAA	2	12	282180	282191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485189
103	NC_020419	TGACTT	2	12	286250	286261	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485191
104	NC_020419	CTTCAA	2	12	286742	286753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485192
105	NC_020419	TCCATA	2	12	286822	286833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485192
106	NC_020419	AAGTTG	2	12	286834	286845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	189485192
107	NC_020419	TTCAAC	2	12	287737	287748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485193
108	NC_020419	TTCAAC	2	12	288858	288869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485195
109	NC_020419	TCCCAT	2	12	293681	293692	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485198
110	NC_020419	ACAAAA	2	12	294388	294399	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485198
111	NC_020419	TATTGA	2	12	297210	297221	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485199
112	NC_020419	AGTTTT	2	12	307503	307514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485206
113	NC_020419	ATGTTT	2	12	310368	310379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485207
114	NC_020419	TAAATT	2	12	317404	317415	50 %	50 %	0 %	0 %	189485213
115	NC_020419	ACAAAA	2	12	317830	317841	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	189485213
116	NC_020419	GTCGGT	2	12	319905	319916	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	189485215
117	NC_020419	TTAAAC	2	12	320209	320220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	189485215
118	NC_020419	TGATTT	2	12	321195	321206	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485215
119	NC_020419	TAAAAA	2	12	321796	321807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485216
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235	NC_020419	GCTACT	2	12	659757	659768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189485455
236	NC_020419	TTTGAT	2	12	666122	666133	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485460
237	NC_020419	TTCTTT	2	12	676236	676247	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485471
238	NC_020419	AAATAA	2	12	676397	676408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485471
239	NC_020419	ATGCCG	2	12	681805	681816	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485477
240	NC_020419	TATTTG	2	12	695191	695202	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	189485482
241	NC_020419	GAATAT	2	12	698823	698834	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485484
242	NC_020419	TTCATT	2	12	703791	703802	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485487
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245	NC_020419	TCATTT	2	12	718831	718842	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	189485495
246	NC_020419	GCGCTG	2	12	720025	720036	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	189485496
247	NC_020419	TCGGCA	2	12	731952	731963	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	189485504
248	NC_020419	GCTGGA	2	12	732041	732052	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	189485504
249	NC_020419	TGTTAA	2	12	735150	735161	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485508
250	NC_020419	TCATAT	2	12	742387	742398	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485511
251	NC_020419	TAATAT	2	12	745024	745035	50 %	50 %	0 %	0 %	189485513
252	NC_020419	TCCGGC	2	12	749636	749647	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	189485517
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255	NC_020419	CTTTTC	2	12	769363	769374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485530
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257	NC_020419	CCTTTT	2	12	773410	773421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	189485534
258	NC_020419	CGTATT	2	12	775318	775329	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485535
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260	NC_020419	GCAAAA	2	12	777803	777814	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	189485539
261	NC_020419	TCAATC	2	12	778559	778570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485539
262	NC_020419	GCTTTT	2	12	788834	788845	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	189485545
263	NC_020419	TTCTTT	2	12	795569	795580	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485550
264	NC_020419	TTTTAA	2	12	800071	800082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	189485552
265	NC_020419	TGCAAC	2	12	803548	803559	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	189485557
266	NC_020419	CATCTT	2	12	805464	805475	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	189485558
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268	NC_020419	CTTTTT	2	12	817057	817068	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	189485565
269	NC_020419	TTAAAA	2	12	826344	826355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	189485572
270	NC_020419	ATTTTT	2	12	835818	835829	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	189485576
271	NC_020419	CCTAAT	2	12	841851	841862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	189485580
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332	NC_020419	CTTGTA	2	12	1086800	1086811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	189485735
333	NC_020419	ATTGCC	2	12	1087559	1087570	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	189485735
334	NC_020419	ATCTCC	2	12	1088598	1088609	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	189485736
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336	NC_020419	AAATAA	2	12	1095817	1095828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	189485741
337	NC_020419	TGTCGC	2	12	1099514	1099525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	189485744
338	NC_020419	GTATTA	2	12	1105359	1105370	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	189485750
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340	NC_020419	ATCTAT	2	12	1113305	1113316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485756
341	NC_020419	TTTCAA	2	12	1115296	1115307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	189485756
342	NC_020419	TATAAG	2	12	1116223	1116234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	189485758
343	NC_020419	AAAAGA	2	12	1120987	1120998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	189485761
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346	NC_020419	TTGGAT	2	12	1123853	1123864	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	189485763
347	NC_020419	CTTTCG	2	12	1123931	1123942	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	189485763

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.