MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Uncultured Termite group 1 bacterium phylotype Rs-D17 DNA

Total Repeats: 432

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020419	GGTTT	2	10	819	828	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020419	TCTTT	2	10	3202	3211	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_020419	GTGTT	2	10	3472	3481	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020419	GGTTT	2	10	3625	3634	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020419	GGTTT	2	10	3691	3700	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020419	GGTTT	2	10	3713	3722	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020419	GATGT	2	10	6587	6596	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020419	TCTTT	2	10	7179	7188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020419	ATATA	2	10	8021	8030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020419	CCCCT	2	10	12223	12232	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
11	NC_020419	TATTT	2	10	15706	15715	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020419	ATTAT	2	10	17841	17850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020419	TGGAA	2	10	18176	18185	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020419	TACTT	2	10	18286	18295	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020419	AAATA	2	10	18592	18601	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020419	GAGTA	2	10	23945	23954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020419	CAAAT	2	10	25977	25986	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020419	AATAT	2	10	27047	27056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020419	TATGA	2	10	27546	27555	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020419	TCAAA	2	10	31960	31969	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020419	ATTTT	2	10	34914	34923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020419	ATTTA	2	10	34954	34963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020419	TTTTC	2	10	38707	38716	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020419	TTCCT	2	10	39521	39530	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_020419	TTGAT	2	10	39791	39800	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020419	TCTGT	2	10	40215	40224	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020419	AAATT	2	10	40333	40342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020419	GCTTT	2	10	40821	40830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020419	TATCG	2	10	42346	42355	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020419	CAATT	2	10	43446	43455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020419	TCTCA	2	10	47133	47142	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020419	TAAAA	2	10	47764	47773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020419	TTTTA	2	10	47851	47860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020419	TGTAT	2	10	53123	53132	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020419	ATTTA	2	10	53144	53153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020419	ATATA	2	10	53534	53543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020419	GCTTA	2	10	54334	54343	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020419	AAAAT	2	10	58691	58700	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020419	ATTTT	2	10	64651	64660	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020419	AAAAC	2	10	66785	66794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020419	TGTTC	2	10	72211	72220	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020419	CTTTA	2	10	80700	80709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020419	TAAAT	2	10	87369	87378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020419	AGTAA	2	10	87387	87396	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020419	TCAAT	2	10	87804	87813	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020419	GTTAA	2	10	92467	92476	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020419	GAGAA	2	10	95572	95581	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020419	TAAAT	2	10	97142	97151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020419	TAATA	2	10	97474	97483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020419	AAAAT	2	10	100864	100873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020419	TACTA	2	10	107034	107043	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_020419	AAATA	2	10	112452	112461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020419	AATAA	2	10	112609	112618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020419	AGTAA	2	10	112632	112641	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020419	ATTTT	2	10	113860	113869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020419	GCTGA	2	10	113987	113996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_020419	GTTTT	2	10	118233	118242	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020419	TTGAC	2	10	118860	118869	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020419	ATATT	2	10	127949	127958	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020419	GACTT	2	10	127992	128001	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_020419	TCGTG	2	10	129321	129330	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020419	CATCC	2	10	132993	133002	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_020419	ATTTT	2	10	133752	133761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020419	TTATT	2	10	144288	144297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020419	TTAAT	2	10	149993	150002	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020419	TAAAA	2	10	151496	151505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020419	TGAAA	2	10	155444	155453	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020419	AGAAA	2	10	155892	155901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020419	ATAAA	2	10	158517	158526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020419	GGGAA	2	10	163044	163053	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020419	ATAGG	2	10	163772	163781	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020419	AAATA	2	10	163788	163797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020419	CATGC	2	10	169123	169132	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
74	NC_020419	AATGC	2	10	169382	169391	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020419	TTTGA	2	10	178912	178921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020419	AGAGA	2	10	181803	181812	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020419	GTTTT	2	10	184366	184375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020419	ATTGT	2	10	185634	185643	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020419	ATAAC	2	10	186042	186051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020419	TGATT	2	10	189459	189468	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020419	AACCT	2	10	195388	195397	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_020419	TTTTC	2	10	198179	198188	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020419	TAAAA	2	10	203779	203788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020419	AATTA	2	10	204267	204276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020419	TCTTT	2	10	208583	208592	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020419	CAAAA	2	10	212930	212939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020419	TAAAA	2	10	213171	213180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020419	TATAT	2	10	213315	213324	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020419	TTAGT	2	10	216995	217004	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020419	CTTTA	2	10	224297	224306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020419	AGAAA	2	10	225262	225271	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020419	ATGTT	2	10	225401	225410	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020419	GAAAT	2	10	228447	228456	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020419	AATAG	2	10	228842	228851	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020419	TGAAT	2	10	228941	228950	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020419	TTTCT	2	10	230359	230368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_020419	AAAAG	2	10	230436	230445	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020419	TTTTG	2	10	236875	236884	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020419	TAAAA	2	10	236988	236997	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020419	GGGAT	2	10	239021	239030	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020419	TGTTT	2	10	248933	248942	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020419	TGCGG	2	10	258867	258876	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020419	AAAGA	2	10	259366	259375	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020419	TTCCA	2	10	267922	267931	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_020419	AAAGA	2	10	270584	270593	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020419	TAAAA	2	10	271395	271404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020419	TGATA	2	10	281070	281079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020419	ATAAA	2	10	281262	281271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020419	CGCAG	2	10	284326	284335	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
110	NC_020419	AATTC	2	10	286425	286434	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020419	TTTTG	2	10	288163	288172	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020419	ATACT	2	10	291466	291475	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_020419	TATAA	2	10	293158	293167	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020419	TAAAA	2	10	296350	296359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020419	CTTTT	2	10	303825	303834	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020419	AAATC	2	10	334082	334091	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020419	CTGGT	2	10	335230	335239	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020419	AAATT	2	10	336986	336995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020419	TTCTT	2	10	338727	338736	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020419	TATAA	2	10	343589	343598	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020419	AGTTT	2	10	343690	343699	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020419	TTGTT	2	10	347200	347209	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020419	AAGGG	2	10	349649	349658	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020419	TTTTA	2	10	357452	357461	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020419	TTGAT	2	10	366950	366959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020419	ATATG	2	10	367840	367849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020419	GTTAG	2	10	368461	368470	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020419	AAGAA	2	10	368580	368589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020419	GGATT	2	10	369139	369148	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020419	TTCTT	2	10	374776	374785	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020419	AAAAC	2	10	375921	375930	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020419	AAAAT	2	10	376695	376704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020419	AAACA	2	10	376726	376735	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020419	TAACC	2	10	377245	377254	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_020419	ATTAA	2	10	377447	377456	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020419	TGTTT	2	10	385418	385427	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020419	GTGTT	2	10	388667	388676	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020419	ATTTT	2	10	391216	391225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020419	AAAAT	2	10	391436	391445	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020419	AAAGT	2	10	392958	392967	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020419	ATTTT	2	10	404608	404617	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020419	TAAAT	2	10	405656	405665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020419	AAGAG	2	10	406848	406857	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020419	TTTGT	2	10	407587	407596	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020419	TAAAC	2	10	407999	408008	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020419	GGTTC	2	10	411315	411324	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_020419	ATAAA	2	10	411378	411387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020419	AATTT	2	10	412202	412211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020419	TTTTA	2	10	413227	413236	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020419	CTATA	2	10	414667	414676	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_020419	TGTGA	2	10	414948	414957	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020419	ATATT	2	10	415272	415281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_020419	CTTTT	2	10	428068	428077	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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158	NC_020419	TATAG	2	10	434777	434786	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_020419	CTTGT	2	10	441677	441686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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165	NC_020419	TCAAT	2	10	447501	447510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_020419	TATGT	2	10	450248	450257	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020419	AAAAT	2	10	454408	454417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020419	AAAAT	2	10	455209	455218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_020419	GTTAT	2	10	468522	468531	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_020419	TTATT	2	10	499122	499131	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_020419	TGAGC	2	10	503670	503679	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_020419	TAAAA	2	10	507171	507180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_020419	TTTTA	2	10	510107	510116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_020419	TATAA	2	10	513382	513391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_020419	AAGAA	2	10	516909	516918	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_020419	ATTAT	2	10	523606	523615	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_020419	AAAAT	2	10	533035	533044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_020419	CTTTG	2	10	540563	540572	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_020419	TAATT	2	10	724320	724329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_020419	TCCAG	2	10	781503	781512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
292	NC_020419	AGTAC	2	10	781698	781707	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_020419	GATTT	2	10	786218	786227	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.