MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Beta proteobacterium CB

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020417	TCGTG	2	10	33995	34004	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_020417	GGGAG	2	10	35456	35465	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020417	CTCAT	2	10	37450	37459	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_020417	ATTTC	2	10	42297	42306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020417	AACTG	2	10	51502	51511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_020417	ATTAA	2	10	108501	108510	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020417	CAATA	2	10	162362	162371	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020417	TGATT	2	10	186178	186187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020417	AACCC	2	10	208710	208719	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_020417	TTGAT	2	10	215271	215280	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020417	AGATA	2	10	243130	243139	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020417	ATTGA	2	10	258483	258492	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020417	CAGAA	2	10	272025	272034	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020417	AAAGA	2	10	285738	285747	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020417	TCGCT	2	10	309266	309275	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020417	CTTGA	2	10	329882	329891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020417	ATTGC	2	10	329930	329939	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020417	CAAAC	2	10	336197	336206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_020417	AGCTG	2	10	346946	346955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_020417	GAAAA	2	10	362004	362013	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020417	ATTTA	2	10	371374	371383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020417	ATTAT	2	10	371388	371397	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020417	GCAAC	2	10	395561	395570	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_020417	AAATG	2	10	399600	399609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020417	AAATT	2	10	419404	419413	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020417	TGGCT	2	10	452610	452619	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020417	ATTGC	2	10	466496	466505	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020417	TTCGG	2	10	524716	524725	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020417	ATTTG	2	10	541274	541283	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020417	TAAAG	2	10	542015	542024	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020417	TATTG	2	10	577148	577157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020417	ATTGT	2	10	653054	653063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020417	TGTAT	2	10	653343	653352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020417	ATCTA	2	10	655277	655286	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020417	CTTAT	2	10	672981	672990	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_020417	GTTGC	2	10	675333	675342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020417	TCAGG	2	10	692138	692147	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020417	ATGAC	2	10	693899	693908	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_020417	CATTT	2	10	700619	700628	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020417	ACAGA	2	10	720595	720604	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020417	GTTAG	2	10	772256	772265	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020417	AGCCT	2	10	811958	811967	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_020417	TAGTT	2	10	816072	816081	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020417	AGTTG	2	10	876654	876663	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020417	AGAAA	2	10	877529	877538	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020417	CTAGC	2	10	905385	905394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_020417	TTGCA	2	10	907951	907960	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_020417	CTTGG	2	10	917153	917162	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020417	GCATG	2	10	940974	940983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020417	TCCGC	2	10	941258	941267	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_020417	GCCTT	2	10	976174	976183	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_020417	CACCC	2	10	976263	976272	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_020417	TTTTC	2	10	1017562	1017571	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020417	CCCTT	2	10	1045506	1045515	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_020417	AATTA	2	10	1054599	1054608	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020417	CTTGC	2	10	1055467	1055476	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_020417	TAAAT	2	10	1057753	1057762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020417	AGCTA	2	10	1072123	1072132	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020417	AATTC	2	10	1126260	1126269	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_020417	ATTGA	2	10	1126801	1126810	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020417	TTGGC	2	10	1141144	1141153	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020417	TTCTG	2	10	1142073	1142082	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020417	CCCCT	2	10	1157102	1157111	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
64	NC_020417	GCAAC	2	10	1172123	1172132	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_020417	AATTG	2	10	1192583	1192592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020417	TAAAT	2	10	1202757	1202766	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020417	TCATT	2	10	1215573	1215582	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020417	CCGAT	2	10	1219227	1219236	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_020417	GCTTA	2	10	1237433	1237442	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020417	CATTT	2	10	1270594	1270603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_020417	GTCCA	2	10	1279557	1279566	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_020417	TGGCA	2	10	1297465	1297474	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020417	AATTC	2	10	1305877	1305886	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020417	TTTTC	2	10	1322471	1322480	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020417	TAAAT	2	10	1348306	1348315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020417	TTCTA	2	10	1350755	1350764	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_020417	TTAAT	2	10	1366194	1366203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020417	AATCG	2	10	1373406	1373415	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_020417	AGCTC	2	10	1376452	1376461	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_020417	GTTTT	2	10	1404914	1404923	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020417	TAGAA	2	10	1420537	1420546	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020417	AGCGC	2	10	1423174	1423183	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_020417	GAAAT	2	10	1423998	1424007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020417	AACAA	2	10	1428130	1428139	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_020417	TAGAA	2	10	1428229	1428238	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020417	ATTGA	2	10	1438526	1438535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020417	TAAAT	2	10	1460270	1460279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020417	TTGAT	2	10	1460364	1460373	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020417	TTTAA	2	10	1462205	1462214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020417	TTAAA	2	10	1485674	1485683	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020417	AGCAT	2	10	1535424	1535433	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020417	TCAAC	2	10	1544694	1544703	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_020417	ATCAC	2	10	1553027	1553036	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_020417	CAAAC	2	10	1558162	1558171	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020417	CTTTT	2	10	1565779	1565788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_020417	CCTGG	2	10	1574332	1574341	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020417	AGGTG	2	10	1582622	1582631	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020417	AAAAG	2	10	1590201	1590210	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020417	TCAAT	2	10	1593521	1593530	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020417	ATCAC	2	10	1616112	1616121	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_020417	TCGAT	2	10	1663359	1663368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020417	ATCGG	2	10	1789991	1790000	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_020417	CGCTT	2	10	1793062	1793071	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_020417	CAATT	2	10	1799432	1799441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020417	ATTTA	2	10	1823541	1823550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020417	TTTGT	2	10	1864486	1864495	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020417	TATTG	2	10	1923911	1923920	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020417	TGCAC	2	10	1985639	1985648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020417	AGAAA	2	10	1999345	1999354	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020417	TGCGG	2	10	2001492	2001501	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
111	NC_020417	AGTTA	2	10	2003372	2003381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020417	TTGTT	2	10	2005245	2005254	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020417	AGAAA	2	10	2020607	2020616	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.