MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Beta proteobacterium CB

Total Repeats: 450

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020417	TTAG	2	8	6122	6129	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020417	TTAT	2	8	7652	7659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020417	AGTA	2	8	18213	18220	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020417	TTTA	2	8	32630	32637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020417	TAAA	2	8	32833	32840	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020417	GTGA	2	8	33328	33335	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020417	TACC	2	8	33904	33911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_020417	GCGA	2	8	35214	35221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_020417	GACA	2	8	35906	35913	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_020417	AAAG	2	8	36047	36054	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020417	TTGA	2	8	36822	36829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020417	GTTT	2	8	37122	37129	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020417	TGAG	2	8	40984	40991	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020417	AAAG	2	8	50955	50962	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020417	AAGT	2	8	51424	51431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020417	AATT	2	8	55941	55948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020417	TTAA	2	8	66823	66830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020417	AAAG	2	8	67735	67742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020417	GATA	2	8	96637	96644	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020417	TCAA	2	8	99821	99828	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_020417	CAGA	2	8	102724	102731	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020417	AGTT	2	8	108478	108485	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020417	GGCT	2	8	108566	108573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_020417	CTTT	2	8	109137	109144	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020417	ACTT	2	8	109182	109189	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020417	AAAT	2	8	112154	112161	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020417	ATTT	2	8	124373	124380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020417	ATTA	2	8	144611	144618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020417	TTTA	2	8	144630	144637	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020417	GAAG	2	8	170501	170508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020417	AAAT	2	8	171680	171687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020417	CAAT	2	8	175188	175195	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020417	ATGT	2	8	175258	175265	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020417	GCCC	2	8	176780	176787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_020417	TGAT	2	8	176799	176806	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020417	CTGA	2	8	182973	182980	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020417	TCAA	2	8	184971	184978	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020417	GGTG	2	8	196186	196193	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020417	TTAA	2	8	200752	200759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020417	TGAT	2	8	212826	212833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020417	GTTA	2	8	215197	215204	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020417	TAAC	2	8	215209	215216	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020417	ATAA	2	8	215217	215224	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020417	CTAG	2	8	215946	215953	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020417	TAAT	2	8	216762	216769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020417	TTTA	2	8	218806	218813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020417	TTTC	2	8	221226	221233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020417	ATGA	2	8	239544	239551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020417	ATCT	2	8	245908	245915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_020417	TTGA	2	8	248096	248103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020417	GACT	2	8	249746	249753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020417	TTAA	2	8	261757	261764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020417	TTGA	2	8	268346	268353	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020417	TTAC	2	8	268470	268477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020417	ATCG	2	8	269940	269947	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020417	TCAA	2	8	273193	273200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020417	GTTT	2	8	278355	278362	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020417	TTTC	2	8	278436	278443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_020417	TTTA	2	8	278528	278535	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020417	AAAG	2	8	283308	283315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020417	ATTG	2	8	285277	285284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020417	TTAA	2	8	285285	285292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020417	GGGT	2	8	285638	285645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020417	ATAA	2	8	287738	287745	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020417	TGAA	2	8	300705	300712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020417	TGTC	2	8	300969	300976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020417	CTAT	2	8	302340	302347	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_020417	AAGC	2	8	302616	302623	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020417	ATTT	2	8	304359	304366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020417	TAAT	2	8	309097	309104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020417	CATT	2	8	309249	309256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_020417	CTTG	2	8	311264	311271	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020417	GCTT	2	8	311605	311612	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_020417	ATTT	2	8	317107	317114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020417	TGTT	2	8	322054	322061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020417	ATTT	2	8	323505	323512	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020417	TGGT	2	8	328061	328068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020417	AGTG	2	8	333704	333711	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020417	TGCG	2	8	333864	333871	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020417	GTGA	2	8	340969	340976	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020417	GTAA	2	8	342372	342379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020417	CTCG	2	8	343760	343767	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_020417	AAGA	2	8	345741	345748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020417	TATG	2	8	351368	351375	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020417	GAGT	2	8	351504	351511	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020417	TATT	3	12	364347	364358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020417	ATTA	2	8	364380	364387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020417	TATT	2	8	364390	364397	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020417	AATG	2	8	371410	371417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020417	TGAT	2	8	371855	371862	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020417	TAAG	2	8	374766	374773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020417	TTAA	2	8	374890	374897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020417	TAAT	3	12	394947	394958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020417	GAAA	2	8	395658	395665	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020417	TTAT	2	8	395960	395967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020417	TTTA	2	8	396140	396147	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020417	TTGA	2	8	396246	396253	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020417	AGAT	2	8	399486	399493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020417	ACTT	2	8	400731	400738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_020417	AGGG	2	8	400867	400874	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020417	CATA	2	8	400924	400931	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020417	ATTA	2	8	410004	410011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020417	AGTT	2	8	413222	413229	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020417	TAAA	2	8	415914	415921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020417	TGCA	2	8	416850	416857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_020417	AGTA	2	8	417769	417776	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020417	ATTT	2	8	419591	419598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020417	ATTT	2	8	419828	419835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020417	ATTA	2	8	420592	420599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020417	ATGA	2	8	444428	444435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020417	ATAA	2	8	447004	447011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020417	TTAG	2	8	449164	449171	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020417	ATAG	2	8	452602	452609	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020417	CTCA	2	8	452628	452635	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_020417	GAAA	2	8	455735	455742	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020417	GTGA	2	8	463874	463881	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020417	TTCT	2	8	464053	464060	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020417	TTAC	2	8	466445	466452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_020417	AATT	2	8	475239	475246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020417	GCCT	2	8	475318	475325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_020417	AATT	2	8	488667	488674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020417	TATG	2	8	490097	490104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020417	GCAA	2	8	490105	490112	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020417	ATCC	2	8	492138	492145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_020417	GCAA	2	8	499271	499278	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_020417	ATTA	2	8	508449	508456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020417	TTGC	2	8	512182	512189	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_020417	GATA	2	8	514792	514799	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020417	TTGA	2	8	518614	518621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020417	TAAA	2	8	519233	519240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020417	TCCC	2	8	524797	524804	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_020417	TTGT	2	8	524889	524896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020417	AGCA	2	8	527260	527267	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020417	CCTT	2	8	532468	532475	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020417	ATCA	2	8	532524	532531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_020417	ATTA	2	8	549389	549396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020417	CATA	2	8	558483	558490	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_020417	ATCA	2	8	576193	576200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_020417	ATAG	2	8	594269	594276	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020417	CGGT	2	8	597537	597544	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_020417	CAAA	2	8	599962	599969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_020417	ATTA	2	8	600004	600011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020417	GTTT	2	8	602129	602136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020417	GGTA	2	8	602196	602203	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020417	CTAT	2	8	604407	604414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020417	TTGC	2	8	604446	604453	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_020417	AATT	2	8	609074	609081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020417	CAAG	2	8	611983	611990	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_020417	CTCG	2	8	618956	618963	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020417	ATTT	2	8	636829	636836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020417	ATTG	2	8	636974	636981	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_020417	AACC	2	8	2008774	2008781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
440	NC_020417	TTTG	2	8	2010320	2010327	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
441	NC_020417	AACC	2	8	2019328	2019335	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
442	NC_020417	TATC	2	8	2020875	2020882	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
443	NC_020417	TCAT	2	8	2021605	2021612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
444	NC_020417	ATGA	2	8	2021619	2021626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
445	NC_020417	TCTA	2	8	2021772	2021779	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
446	NC_020417	GTGA	2	8	2022766	2022773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
447	NC_020417	TAAT	2	8	2023078	2023085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_020417	CTAT	2	8	2023168	2023175	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
449	NC_020417	CTAT	2	8	2023930	2023937	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
450	NC_020417	ATCA	2	8	2025841	2025848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.