MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 1271

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020411	TCAAA	2	10	186	195	60 %	20 %	0 %	20 %	452943220
2	NC_020411	TGAAA	2	10	2204	2213	60 %	20 %	20 %	0 %	452943221
3	NC_020411	AAGTA	2	10	2326	2335	60 %	20 %	20 %	0 %	452943221
4	NC_020411	ATACC	2	10	2521	2530	40 %	20 %	0 %	40 %	452943222
5	NC_020411	ACATA	2	10	3335	3344	60 %	20 %	0 %	20 %	452943223
6	NC_020411	CAAAA	2	10	3751	3760	80 %	0 %	0 %	20 %	452943223
7	NC_020411	TTGAT	2	10	3766	3775	20 %	60 %	20 %	0 %	452943223
8	NC_020411	CAAAC	2	10	5047	5056	60 %	0 %	0 %	40 %	452943224
9	NC_020411	TTGGT	2	10	7486	7495	0 %	60 %	40 %	0 %	452943226
10	NC_020411	GTTTA	2	10	8228	8237	20 %	60 %	20 %	0 %	452943227
11	NC_020411	TGTAT	2	10	10447	10456	20 %	60 %	20 %	0 %	452943229
12	NC_020411	GTTTG	2	10	13114	13123	0 %	60 %	40 %	0 %	452943232
13	NC_020411	TATGT	2	10	14919	14928	20 %	60 %	20 %	0 %	452943233
14	NC_020411	AGCTT	2	10	17164	17173	20 %	40 %	20 %	20 %	452943235
15	NC_020411	TTATT	2	10	17904	17913	20 %	80 %	0 %	0 %	452943237
16	NC_020411	CAAGA	2	10	20420	20429	60 %	0 %	20 %	20 %	452943239
17	NC_020411	TGATA	2	10	20475	20484	40 %	40 %	20 %	0 %	452943239
18	NC_020411	ATATA	2	10	21072	21081	60 %	40 %	0 %	0 %	452943239
19	NC_020411	TAATC	2	10	21605	21614	40 %	40 %	0 %	20 %	452943240
20	NC_020411	TCTTT	2	10	22439	22448	0 %	80 %	0 %	20 %	452943241
21	NC_020411	ATTTA	2	10	23316	23325	40 %	60 %	0 %	0 %	452943243
22	NC_020411	CTTTT	2	10	24276	24285	0 %	80 %	0 %	20 %	452943243
23	NC_020411	TTTCT	2	10	24360	24369	0 %	80 %	0 %	20 %	452943243
24	NC_020411	AAAAG	2	10	25627	25636	80 %	0 %	20 %	0 %	452943245
25	NC_020411	TTTGG	2	10	28571	28580	0 %	60 %	40 %	0 %	452943249
26	NC_020411	ATATT	2	10	31886	31895	40 %	60 %	0 %	0 %	452943253
27	NC_020411	GTTTA	2	10	34653	34662	20 %	60 %	20 %	0 %	452943257
28	NC_020411	TTTCT	2	10	35135	35144	0 %	80 %	0 %	20 %	452943257
29	NC_020411	TATCT	2	10	35166	35175	20 %	60 %	0 %	20 %	452943257
30	NC_020411	TTATT	2	10	35977	35986	20 %	80 %	0 %	0 %	452943259
31	NC_020411	TTTTC	2	10	37202	37211	0 %	80 %	0 %	20 %	452943262
32	NC_020411	TTTAT	2	10	37480	37489	20 %	80 %	0 %	0 %	452943262
33	NC_020411	ATTTT	2	10	38322	38331	20 %	80 %	0 %	0 %	452943263
34	NC_020411	CTATT	2	10	39606	39615	20 %	60 %	0 %	20 %	452943264
35	NC_020411	CCTGT	2	10	40576	40585	0 %	40 %	20 %	40 %	452943265
36	NC_020411	TATCT	2	10	40673	40682	20 %	60 %	0 %	20 %	452943265
37	NC_020411	TTTAG	2	10	42483	42492	20 %	60 %	20 %	0 %	452943267
38	NC_020411	GTATG	2	10	43079	43088	20 %	40 %	40 %	0 %	452943267
39	NC_020411	ACCAA	2	10	43268	43277	60 %	0 %	0 %	40 %	452943267
40	NC_020411	GCTTT	2	10	44961	44970	0 %	60 %	20 %	20 %	452943270
41	NC_020411	CTATC	2	10	45711	45720	20 %	40 %	0 %	40 %	452943270
42	NC_020411	GCTTG	2	10	47655	47664	0 %	40 %	40 %	20 %	452943274
43	NC_020411	ATCTT	2	10	48711	48720	20 %	60 %	0 %	20 %	452943274
44	NC_020411	TTCTA	2	10	49202	49211	20 %	60 %	0 %	20 %	452943274
45	NC_020411	TTGGC	2	10	49801	49810	0 %	40 %	40 %	20 %	452943275
46	NC_020411	CTTGG	2	10	50163	50172	0 %	40 %	40 %	20 %	452943275
47	NC_020411	ATACG	2	10	51552	51561	40 %	20 %	20 %	20 %	452943277
48	NC_020411	CGCCT	2	10	52191	52200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_020411	AAGGC	2	10	53056	53065	40 %	0 %	40 %	20 %	452943278
50	NC_020411	TTTTA	2	10	54190	54199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020411	TAATA	2	10	55987	55996	60 %	40 %	0 %	0 %	452943280
52	NC_020411	TAAAA	2	10	58683	58692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020411	AGTAT	2	10	60195	60204	40 %	40 %	20 %	0 %	452943285
54	NC_020411	TGTTT	2	10	62656	62665	0 %	80 %	20 %	0 %	452943290
55	NC_020411	AAACC	2	10	62731	62740	60 %	0 %	0 %	40 %	452943290
56	NC_020411	ATAAA	2	10	62866	62875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020411	TTTTA	2	10	65060	65069	20 %	80 %	0 %	0 %	452943293
58	NC_020411	CTGCA	2	10	66371	66380	20 %	20 %	20 %	40 %	452943294
59	NC_020411	TTTAT	2	10	67688	67697	20 %	80 %	0 %	0 %	452943295
60	NC_020411	TTTCC	2	10	68388	68397	0 %	60 %	0 %	40 %	452943295
61	NC_020411	TTAAA	2	10	69265	69274	60 %	40 %	0 %	0 %	452943298
62	NC_020411	CTTTG	2	10	69379	69388	0 %	60 %	20 %	20 %	452943298
63	NC_020411	TAGAA	2	10	70158	70167	60 %	20 %	20 %	0 %	452943299
64	NC_020411	CCTAT	2	10	71378	71387	20 %	40 %	0 %	40 %	452943300
65	NC_020411	TATAA	2	10	73590	73599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020411	TACAA	2	10	81708	81717	60 %	20 %	0 %	20 %	452943308
67	NC_020411	TATTT	2	10	81842	81851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020411	ATACG	2	10	83266	83275	40 %	20 %	20 %	20 %	452943310
69	NC_020411	AGCTT	2	10	85358	85367	20 %	40 %	20 %	20 %	452943314
70	NC_020411	AAAAG	2	10	85696	85705	80 %	0 %	20 %	0 %	452943314
71	NC_020411	ACAAA	2	10	86554	86563	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_020411	GATAA	2	10	87731	87740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020411	GCTAA	2	10	90236	90245	40 %	20 %	20 %	20 %	452943318
74	NC_020411	TATCA	2	10	92811	92820	40 %	40 %	0 %	20 %	452943320
75	NC_020411	TAATT	2	10	96075	96084	40 %	60 %	0 %	0 %	452943322
76	NC_020411	ATTGG	2	10	96768	96777	20 %	40 %	40 %	0 %	452943323
77	NC_020411	TGATT	2	10	97496	97505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020411	TGTGT	2	10	98459	98468	0 %	60 %	40 %	0 %	452943324
79	NC_020411	ATTAT	2	10	98575	98584	40 %	60 %	0 %	0 %	452943324
80	NC_020411	CAAGG	2	10	98962	98971	40 %	0 %	40 %	20 %	452943325
81	NC_020411	CAAAG	2	10	99267	99276	60 %	0 %	20 %	20 %	452943326
82	NC_020411	AGAAA	2	10	101533	101542	80 %	0 %	20 %	0 %	452943326
83	NC_020411	GAAAT	2	10	102289	102298	60 %	20 %	20 %	0 %	452943326
84	NC_020411	AGTAA	2	10	102940	102949	60 %	20 %	20 %	0 %	452943327
85	NC_020411	GGATG	2	10	103750	103759	20 %	20 %	60 %	0 %	452943328
86	NC_020411	ACTAA	2	10	104133	104142	60 %	20 %	0 %	20 %	452943329
87	NC_020411	ACTAT	2	10	105562	105571	40 %	40 %	0 %	20 %	452943332
88	NC_020411	ATACA	2	10	107848	107857	60 %	20 %	0 %	20 %	452943334
89	NC_020411	AAAAC	2	10	108001	108010	80 %	0 %	0 %	20 %	452943334
90	NC_020411	ATCTG	2	10	109570	109579	20 %	40 %	20 %	20 %	452943336
91	NC_020411	TCTTT	2	10	110991	111000	0 %	80 %	0 %	20 %	452943338
92	NC_020411	AACTT	2	10	111708	111717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020411	AAGCC	2	10	114953	114962	40 %	0 %	20 %	40 %	452943344
94	NC_020411	TTATA	2	10	115832	115841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020411	CTTTG	2	10	119000	119009	0 %	60 %	20 %	20 %	452943350
96	NC_020411	TAGCA	2	10	120187	120196	40 %	20 %	20 %	20 %	452943350
97	NC_020411	TATTT	2	10	120291	120300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020411	TGGTA	2	10	122269	122278	20 %	40 %	40 %	0 %	452943352
99	NC_020411	CATAT	2	10	123450	123459	40 %	40 %	0 %	20 %	452943354
100	NC_020411	TTGAT	2	10	123687	123696	20 %	60 %	20 %	0 %	452943354
101	NC_020411	AATTC	2	10	124135	124144	40 %	40 %	0 %	20 %	452943355
102	NC_020411	TTTTG	2	10	125895	125904	0 %	80 %	20 %	0 %	452943357
103	NC_020411	ATATT	2	10	127185	127194	40 %	60 %	0 %	0 %	452943359
104	NC_020411	TTTAT	2	10	128005	128014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020411	AAAAT	2	10	128073	128082	80 %	20 %	0 %	0 %	452943360
106	NC_020411	CAAAA	4	20	128854	128873	80 %	0 %	0 %	20 %	452943360
107	NC_020411	ATATA	2	10	130489	130498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020411	AACTT	2	10	130863	130872	40 %	40 %	0 %	20 %	452943362
109	NC_020411	AAGAA	2	10	132960	132969	80 %	0 %	20 %	0 %	452943363
110	NC_020411	TATCT	2	10	134466	134475	20 %	60 %	0 %	20 %	452943366
111	NC_020411	GTTTT	2	10	134916	134925	0 %	80 %	20 %	0 %	452943366
112	NC_020411	TCAAA	2	10	137369	137378	60 %	20 %	0 %	20 %	452943369
113	NC_020411	TCTTT	2	10	137541	137550	0 %	80 %	0 %	20 %	452943369
114	NC_020411	CATCT	2	10	137937	137946	20 %	40 %	0 %	40 %	452943369
115	NC_020411	ACTAA	2	10	138510	138519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020411	TTGTT	2	10	138767	138776	0 %	80 %	20 %	0 %	452943370
117	NC_020411	CTTGG	2	10	140832	140841	0 %	40 %	40 %	20 %	452943372
118	NC_020411	AGTTT	2	10	141282	141291	20 %	60 %	20 %	0 %	452943372
119	NC_020411	CTTTT	2	10	148973	148982	0 %	80 %	0 %	20 %	452943380
120	NC_020411	GATAT	2	10	150499	150508	40 %	40 %	20 %	0 %	452943381
121	NC_020411	TATCC	2	10	150555	150564	20 %	40 %	0 %	40 %	452943381
122	NC_020411	TACAA	2	10	152231	152240	60 %	20 %	0 %	20 %	452943384
123	NC_020411	AAGGT	2	10	153589	153598	40 %	20 %	40 %	0 %	452943386
124	NC_020411	AAAGT	2	10	154228	154237	60 %	20 %	20 %	0 %	452943386
125	NC_020411	TAAAC	2	10	157641	157650	60 %	20 %	0 %	20 %	452943391
126	NC_020411	GGCAA	2	10	157709	157718	40 %	0 %	40 %	20 %	452943391
127	NC_020411	TCCAT	2	10	158049	158058	20 %	40 %	0 %	40 %	452943391
128	NC_020411	AAATA	2	10	158316	158325	80 %	20 %	0 %	0 %	452943391
129	NC_020411	AAGAA	2	10	158640	158649	80 %	0 %	20 %	0 %	452943391
130	NC_020411	CCCAA	2	10	158977	158986	40 %	0 %	0 %	60 %	452943391
131	NC_020411	TGGTG	2	10	159748	159757	0 %	40 %	60 %	0 %	452943393
132	NC_020411	TATAG	2	10	161705	161714	40 %	40 %	20 %	0 %	452943395
133	NC_020411	ACAGT	2	10	164897	164906	40 %	20 %	20 %	20 %	452943399
134	NC_020411	CTATG	2	10	170069	170078	20 %	40 %	20 %	20 %	452943406
135	NC_020411	CTATC	2	10	171231	171240	20 %	40 %	0 %	40 %	452943408
136	NC_020411	TTCTT	2	10	172100	172109	0 %	80 %	0 %	20 %	452943410
137	NC_020411	CTTTA	2	10	175101	175110	20 %	60 %	0 %	20 %	452943415
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