MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 139

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020411	CGCCT	2	10	52191	52200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_020411	TTTTA	2	10	54190	54199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020411	TAAAA	2	10	58683	58692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020411	ATAAA	2	10	62866	62875	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020411	TATAA	2	10	73590	73599	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020411	TATTT	2	10	81842	81851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020411	ACAAA	2	10	86554	86563	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020411	GATAA	2	10	87731	87740	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020411	TGATT	2	10	97496	97505	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020411	AACTT	2	10	111708	111717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020411	TTATA	2	10	115832	115841	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020411	TATTT	2	10	120291	120300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020411	TTTAT	2	10	128005	128014	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020411	ATATA	2	10	130489	130498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020411	ACTAA	2	10	138510	138519	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_020411	ATAAA	2	10	199788	199797	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020411	ATATA	2	10	219495	219504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020411	GTTTT	2	10	219761	219770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020411	ATATA	2	10	255341	255350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020411	ATTAT	2	10	262842	262851	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020411	TTTTC	2	10	269970	269979	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020411	TTTTC	2	10	270128	270137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_020411	TGGAA	2	10	274083	274092	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020411	TAGCA	2	10	277996	278005	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020411	TAATA	2	10	278608	278617	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020411	TAAAA	2	10	299161	299170	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020411	AAATC	2	10	338674	338683	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020411	ATATA	2	10	340993	341002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020411	TATCC	2	10	347550	347559	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_020411	AATCA	2	10	363998	364007	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020411	ACACA	2	10	364165	364174	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_020411	TTATA	2	10	393678	393687	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020411	TTAAA	2	10	394379	394388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020411	TTTTA	2	10	400277	400286	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020411	AAAGA	2	10	411680	411689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020411	GCTTG	2	10	411713	411722	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_020411	GAGAT	2	10	411876	411885	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020411	AATAT	2	10	430740	430749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020411	TATAA	2	10	435491	435500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020411	TTTTA	2	10	454244	454253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020411	TAAAA	2	10	460475	460484	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020411	ATAAA	2	10	460500	460509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020411	TTTTA	2	10	461900	461909	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020411	TAAAA	2	10	486157	486166	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020411	AAACC	2	10	490203	490212	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_020411	TATAA	2	10	514036	514045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020411	ATAAA	2	10	541488	541497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020411	ATTTT	2	10	565989	565998	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020411	ATAGT	2	10	577881	577890	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020411	AAATT	2	10	591834	591843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020411	ATTAT	2	10	620214	620223	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020411	TCTTA	2	10	623248	623257	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_020411	GATAT	2	10	626085	626094	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020411	TTTGC	2	10	631850	631859	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020411	AAAAT	2	10	631914	631923	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020411	AGGGG	2	10	634161	634170	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020411	GGGAT	2	10	637396	637405	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020411	TAATA	2	10	663342	663351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020411	ATTAA	2	10	730654	730663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020411	ATTTT	2	10	730734	730743	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020411	TATAA	2	10	742228	742237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020411	ATAAA	2	10	742888	742897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020411	TATAA	2	10	748734	748743	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020411	ATGAT	2	10	752691	752700	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020411	TTTAT	2	10	765477	765486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020411	TTTCC	2	10	775225	775234	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_020411	CTGAC	2	10	776066	776075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_020411	TTTTA	2	10	801368	801377	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020411	GAAAA	2	10	813507	813516	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020411	ATTTT	2	10	831949	831958	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020411	TATTT	2	10	847010	847019	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020411	TCTTT	2	10	869322	869331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020411	GATAT	2	10	869342	869351	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020411	AAAAG	2	10	874535	874544	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020411	AGATA	2	10	886789	886798	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020411	GAGAT	2	10	886983	886992	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020411	TATAA	2	10	916138	916147	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020411	GAAAA	2	10	928648	928657	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020411	TATAT	2	10	941434	941443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020411	ATATT	2	10	956081	956090	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020411	TATTT	2	10	970750	970759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020411	ATTAA	2	10	977852	977861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020411	TAAAT	2	10	989332	989341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020411	GTTAT	2	10	998134	998143	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020411	TTTAT	2	10	998154	998163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020411	TAAAG	2	10	1002406	1002415	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020411	ATATT	2	10	1015708	1015717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020411	ATCTG	2	10	1019467	1019476	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_020411	CCAAA	2	10	1021014	1021023	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_020411	TATAA	2	10	1024656	1024665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020411	AAAAT	2	10	1024883	1024892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020411	TAAAA	2	10	1036116	1036125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020411	TAAAA	2	10	1048997	1049006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020411	AATAT	2	10	1080574	1080583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020411	ATATA	2	10	1088445	1088454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020411	TATAT	2	10	1118841	1118850	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020411	TATAT	2	10	1126616	1126625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020411	TTTAT	2	10	1131415	1131424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020411	AAAAT	2	10	1146147	1146156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020411	TAAAA	2	10	1163811	1163820	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020411	ATTTT	2	10	1183834	1183843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020411	TTTGT	2	10	1187368	1187377	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020411	TTATA	2	10	1192731	1192740	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020411	AAAAT	2	10	1199146	1199155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020411	TTTAA	2	10	1215550	1215559	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020411	GCTTT	2	10	1231525	1231534	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020411	TTTTC	2	10	1234518	1234527	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020411	CTGAC	2	10	1244324	1244333	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020411	AGCAT	2	10	1245726	1245735	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020411	ATATA	2	10	1245747	1245756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020411	TTAAA	2	10	1249352	1249361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020411	TATAT	2	10	1254078	1254087	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020411	TAATA	2	10	1255904	1255913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020411	CAAAA	2	10	1261826	1261835	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020411	TAAAA	2	10	1271048	1271057	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020411	TAATA	2	10	1295045	1295054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020411	AAAAC	2	10	1305164	1305173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_020411	CATTT	2	10	1305477	1305486	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020411	AAATA	2	10	1305742	1305751	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020411	AAGAA	2	10	1306066	1306075	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020411	TTTTC	2	10	1317481	1317490	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_020411	TAAAT	2	10	1334689	1334698	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020411	GCAGA	2	10	1353767	1353776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020411	ATTTT	2	10	1353855	1353864	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020411	TCCTA	2	10	1355071	1355080	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020411	TTTAT	2	10	1370911	1370920	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020411	TATAA	2	10	1380683	1380692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020411	CTTAT	2	10	1393299	1393308	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_020411	GTTTT	2	10	1405579	1405588	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020411	CTCAC	2	10	1419942	1419951	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_020411	TAAAA	2	10	1419979	1419988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020411	GAGAT	2	10	1460559	1460568	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020411	CCCTT	2	10	1465065	1465074	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_020411	CTTTT	2	10	1475537	1475546	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020411	ATATC	2	10	1519316	1519325	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020411	ACTAT	2	10	1519753	1519762	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020411	ATTAT	2	10	1520463	1520472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020411	GTATA	2	10	1537429	1537438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020411	ATATT	2	10	1545829	1545838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.